EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000003227 (Gene tree)
Gene ID: 100941990
Gene Symbol: RAB11B
Alias: -
Full Name: RAB11B%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11131 bases
Position: chrGL873590.1:497692-508822
Accession: 9761
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000002883	MMR_HSR1	PF01926.23	2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000003230	RAB11B-201	721	-	ENSOGAP00000002883	220 (aa)	-	H0WMC8

Gene Model

Click here to download ENSOGAG00000003227's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOGAG00000003227's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000003227	RAB11B	71	38.217	ENSOGAG00000027043	RAB6A	75	38.217
ENSOGAG00000003227	RAB11B	94	49.758	ENSOGAG00000002728	-	94	49.758
ENSOGAG00000003227	RAB11B	93	33.803	ENSOGAG00000000096	RAB36	79	33.803
ENSOGAG00000003227	RAB11B	95	39.524	ENSOGAG00000033189	RAB30	97	39.524
ENSOGAG00000003227	RAB11B	54	30.894	ENSOGAG00000007283	ARL4A	60	30.894
ENSOGAG00000003227	RAB11B	79	49.425	ENSOGAG00000012973	RAB14	81	49.425
ENSOGAG00000003227	RAB11B	75	41.916	ENSOGAG00000028002	RAB12	97	37.264
ENSOGAG00000003227	RAB11B	98	45.581	ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	45.581
ENSOGAG00000003227	RAB11B	71	43.949	ENSOGAG00000015779	RAB22A	81	43.949
ENSOGAG00000003227	RAB11B	79	40.223	ENSOGAG00000033299	RAB33A	74	40.223
ENSOGAG00000003227	RAB11B	76	41.040	ENSOGAG00000015082	RAB9B	86	41.040
ENSOGAG00000003227	RAB11B	73	35.404	ENSOGAG00000005245	RAB6B	77	35.404
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	91.284	ENSOGAG00000007642	RAB11A	100	91.284
ENSOGAG00000003227	RAB11B	69	36.129	ENSOGAG00000028680	NRAS	87	37.126
ENSOGAG00000003227	RAB11B	74	46.951	ENSOGAG00000028015	RAB18	78	47.531
ENSOGAG00000003227	RAB11B	95	48.095	ENSOGAG00000028013	RAB1B	99	48.095
ENSOGAG00000003227	RAB11B	71	42.038	ENSOGAG00000014855	RAB31	81	42.038
ENSOGAG00000003227	RAB11B	73	31.481	ENSOGAG00000004034	MRAS	82	32.955
ENSOGAG00000003227	RAB11B	80	39.560	ENSOGAG00000002868	RAB9A	87	39.560
ENSOGAG00000003227	RAB11B	78	47.126	ENSOGAG00000025424	RAB39B	82	47.126
ENSOGAG00000003227	RAB11B	68	36.000	ENSOGAG00000024846	HRAS	85	37.037
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	60.092	ENSOGAG00000016955	RAB25	99	60.092
ENSOGAG00000003227	RAB11B	89	37.056	ENSOGAG00000028133	RAB21	83	37.056
ENSOGAG00000003227	RAB11B	87	35.079	ENSOGAG00000005675	RAB23	80	35.079
ENSOGAG00000003227	RAB11B	64	30.282	ENSOGAG00000030870	ARL8A	72	30.282
ENSOGAG00000003227	RAB11B	80	39.773	ENSOGAG00000002443	RAB15	82	39.773
ENSOGAG00000003227	RAB11B	94	42.512	ENSOGAG00000009456	RAB5C	90	42.512
ENSOGAG00000003227	RAB11B	95	42.308	ENSOGAG00000016969	-	97	42.308
ENSOGAG00000003227	RAB11B	69	35.484	ENSOGAG00000014812	KRAS	85	35.802
ENSOGAG00000003227	RAB11B	90	36.634	ENSOGAG00000006778	RAB33B	85	36.634
ENSOGAG00000003227	RAB11B	93	35.814	ENSOGAG00000006951	-	82	39.106
ENSOGAG00000003227	RAB11B	71	36.646	ENSOGAG00000024221	REM1	57	34.911
ENSOGAG00000003227	RAB11B	71	36.306	ENSOGAG00000009123	-	67	36.306
ENSOGAG00000003227	RAB11B	72	40.491	ENSOGAG00000007885	RAB7A	78	40.491

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSG00000185236	RAB11B	100	100.000	Homo_sapiens
ENSOGAG00000003227	RAB11B	98	98.630	ENSAMEG00000004955	RAB11B	99	98.630	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000003227	RAB11B	82	92.265	ENSACIG00000024374	rab11ba	70	97.059	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.495	ENSAOCG00000018050	rab11ba	100	94.495	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.037	ENSAPEG00000009177	rab11ba	100	94.037	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	95.413	ENSATEG00000023730	rab11ba	100	95.413	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSANAG00000037616	RAB11B	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	93.119	ENSACLG00000005420	rab11ba	100	93.119	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000003227	RAB11B	92	87.685	ENSACLG00000018852	-	92	87.685	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000003227	RAB11B	98	80.556	WBGene00004274	rab-11.1	99	80.556	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSCJAG00000010778	RAB11B	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSCAFG00000032060	RAB11B	100	100.000	Canis_familiaris
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSCAFG00020022184	RAB11B	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSTSYG00000014758	RAB11B	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	99.541	ENSCPOG00000030154	RAB11B	100	99.541	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSCCAG00000031042	RAB11B	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSCLAG00000003207	RAB11B	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSCSAG00000008024	RAB11B	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	85.780	ENSCHOG00000013525	RAB11B	100	85.780	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	84.475	ENSCING00000009526	-	100	84.475	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSCANG00000040517	RAB11B	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSCGRG00001013827	Rab11b	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSCGRG00000010967	Rab11b	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.495	ENSCSEG00000007121	rab11ba	84	94.495	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	96.330	ENSDARG00000041878	rab11ba	100	96.330	Danio_rerio
ENSOGAG00000003227	RAB11B	100	100.000	ENSDNOG00000014618	RAB11B	98	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	98.165	ENSDNOG00000004134	-	100	98.165	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	99.083	ENSDORG00000006304	Rab11b	100	99.083	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	81.651	ENSEBUG00000015447	-	100	81.651	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.037	ENSEBUG00000011775	rab11ba	99	94.146	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000003227	RAB11B	65	100.000	ENSEEUG00000009165	-	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	88	92.784	ENSELUG00000019240	-	99	92.784	Esox_lucius
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	99.541	ENSFCAG00000015216	RAB11B	100	99.541	Felis_catus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	99.541	ENSFDAG00000019872	RAB11B	100	99.541	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.037	ENSFHEG00000022642	rab11ba	100	94.037	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	92.661	ENSGMOG00000007390	rab11ba	99	92.661	Gadus_morhua
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.495	ENSGAFG00000005679	rab11ba	100	94.495	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	99.083	ENSGAGG00000012557	-	100	99.083	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSHGLG00000014984	RAB11B	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	99.541	ENSHGLG00100003638	RAB11B	100	99.541	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSSTOG00000031571	RAB11B	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSJJAG00000018891	Rab11b	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.954	ENSKMAG00000006082	-	100	94.954	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.954	ENSLBEG00000006087	rab11ba	100	94.954	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000003227	RAB11B	77	99.412	ENSLACG00000016974	RAB11B	99	99.412	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSLAFG00000013598	RAB11B	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSMNEG00000039759	-	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.495	ENSMAMG00000018556	rab11ba	100	94.495	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	93.119	ENSMZEG00005010947	rab11ba	100	93.119	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000003227	RAB11B	92	87.685	ENSMZEG00005019251	-	92	87.685	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	99.541	ENSMAUG00000021579	Rab11b	100	99.541	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	99.541	ENSMOCG00000012667	Rab11b	100	99.541	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	92.202	ENSMALG00000021949	rab11ba	100	92.202	Monopterus_albus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0021415	Rab11b	100	100.000	Mus_caroli
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	99.083	ENSMUSG00000077450	Rab11b	100	99.083	Mus_musculus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	MGP_PahariEiJ_G0020420	Rab11b	100	100.000	Mus_pahari
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0022327	Rab11b	100	100.000	Mus_spretus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	99.541	ENSMPUG00000007263	RAB11B	100	99.541	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	95.475	ENSMLUG00000002308	-	100	95.475	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSNGAG00000015757	Rab11b	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	93.578	ENSNBRG00000023898	rab11ba	84	93.578	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSNLEG00000001733	RAB11B	100	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSODEG00000011371	RAB11B	100	100.000	Octodon_degus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.037	ENSONIG00000002535	rab11ba	100	94.037	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	73	98.137	ENSOCUG00000028208	RAB11B	64	98.137	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	95.853	ENSORLG00000015307	rab11ba	99	95.853	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	95.853	ENSORLG00020020816	rab11ba	99	95.853	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000003227	RAB11B	98	96.296	ENSORLG00015016946	rab11ba	81	96.296	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	95.853	ENSOMEG00000002581	rab11ba	99	95.853	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000003227	RAB11B	100	100.000	ENSOARG00000003801	RAB11B	98	100.000	Ovis_aries
ENSOGAG00000003227	RAB11B	82	95.556	ENSPPRG00000010160	RAB11B	88	95.556	Panthera_pardus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSPEMG00000014536	Rab11b	100	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000003227	RAB11B	93	80.952	ENSPMAG00000009335	-	100	80.952	Petromyzon_marinus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.954	ENSPFOG00000006159	rab11ba	100	94.954	Poecilia_formosa
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.954	ENSPLAG00000014243	rab11ba	100	94.954	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.954	ENSPMEG00000007917	rab11ba	75	94.954	Poecilia_mexicana
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.954	ENSPREG00000006357	rab11ba	78	94.954	Poecilia_reticulata
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSPPYG00000009504	RAB11B	100	100.000	Pongo_abelii
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	91.284	ENSPCAG00000016118	RAB11B	100	91.284	Procavia_capensis
ENSOGAG00000003227	RAB11B	66	97.945	ENSPCOG00000008655	-	100	97.945	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSPCOG00000028053	RAB11B	100	100.000	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSPVAG00000009645	RAB11B	100	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	92	78.537	ENSPNYG00000023810	-	90	78.537	Pundamilia_nyererei
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	93.119	ENSPNYG00000019644	rab11ba	100	93.119	Pundamilia_nyererei
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	97.248	ENSPNAG00000020475	rab11ba	100	97.248	Pygocentrus_nattereri
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	97.706	ENSPNAG00000006431	-	100	97.706	Pygocentrus_nattereri
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSRNOG00000007648	Rab11b	100	100.000	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSSBOG00000035094	RAB11B	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.954	ENSSDUG00000002965	rab11ba	100	94.954	Seriola_dumerili
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.954	ENSSLDG00000005221	rab11ba	100	94.954	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.037	ENSSPAG00000017313	rab11ba	100	94.037	Stegastes_partitus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSSSCG00000013600	RAB11B	100	100.000	Sus_scrofa
ENSOGAG00000003227	RAB11B	59	100.000	ENSTBEG00000014750	-	100	100.000	Tupaia_belangeri
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSTTRG00000009758	RAB11B	100	100.000	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	93	80.488	ENSUMAG00000014594	RAB11B	97	80.488	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	100.000	ENSVVUG00000025210	RAB11B	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000003227	RAB11B	100	95.000	ENSXETG00000021890	rab11b.2	100	95.000	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000003227	RAB11B	60	97.744	ENSXCOG00000009194	-	98	97.744	Xiphophorus_couchianus
ENSOGAG00000003227	RAB11B	99	94.495	ENSXMAG00000013416	rab11ba	100	94.495	Xiphophorus_maculatus