EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000003399 (Gene tree)
Gene ID: 100958566
Gene Symbol: DKC1
Alias: -
Full Name: dyskerin pseudouridine synthase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18594 bases
Position: chrGL873778.1:194751-213344
Accession: 100958566
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000003034	TruB_N	PF01509.18	4.1e-20	1	1
ENSOGAP00000003034	PUA	PF01472.20	5.9e-18	1	1
ENSOGAP00000003034	DKCLD	PF08068.12	2.5e-31	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000003403	DKC1-201	1596	-	ENSOGAP00000003034	523 (aa)	XP_012668754	B5FWA0

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.794	ENSG00000130826	DKC1	99	98.049	Homo_sapiens
ENSOGAG00000003399	DKC1	86	79.778	ENSAPOG00000007799	dkc1	84	79.778	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000003399	DKC1	89	92.094	ENSAMEG00000002776	DKC1	97	90.316	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000003399	DKC1	86	78.936	ENSACIG00000022614	dkc1	86	78.936	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000003399	DKC1	90	77.215	ENSAOCG00000013159	dkc1	80	86.111	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000003399	DKC1	92	75.574	ENSAPEG00000002284	dkc1	89	77.293	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000003399	DKC1	77	84.185	ENSATEG00000013682	dkc1	80	84.185	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000003399	DKC1	87	82.826	ENSACAG00000015600	DKC1	80	81.667	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000003399	DKC1	96	90.837	ENSANAG00000022732	DKC1	100	90.267	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000003399	DKC1	76	87.121	ENSACLG00000015605	dkc1	93	78.166	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000003399	DKC1	80	84.524	ENSAMXG00000017108	dkc1	79	87.218	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000003399	DKC1	99	89.575	ENSBTAG00000013045	DKC1	97	90.119	Bos_taurus
ENSOGAG00000003399	DKC1	79	66.344	WBGene00010478	K01G5.5	98	63.371	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.238	ENSCJAG00000004210	DKC1	100	90.857	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000003399	DKC1	89	80.819	ENSCAFG00000009311	-	90	81.034	Canis_familiaris
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	90.730	ENSCAFG00000019620	-	97	90.909	Canis_familiaris
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	90.730	ENSCAFG00020008918	-	97	90.909	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000003399	DKC1	89	79.957	ENSCAFG00020009379	-	86	80.172	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	90.119	ENSCHIG00000017392	DKC1	97	90.119	Capra_hircus
ENSOGAG00000003399	DKC1	99	92.131	ENSTSYG00000007681	DKC1	99	92.322	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000003399	DKC1	85	89.663	ENSCAPG00000003342	DKC1	99	89.663	Cavia_aperea
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	90.335	ENSCPOG00000008825	DKC1	97	90.335	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	83.015	ENSCCAG00000027418	DKC1	100	82.634	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.412	ENSCATG00000033602	DKC1	100	91.031	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000003399	DKC1	99	89.961	ENSCLAG00000000720	DKC1	96	91.000	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.412	ENSCSAG00000006706	DKC1	100	91.031	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000003399	DKC1	96	77.821	ENSCPBG00000005858	DKC1	100	79.213	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000003399	DKC1	78	77.206	ENSCING00000004599	-	85	72.707	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000003399	DKC1	78	76.585	ENSCSAVG00000010047	-	88	78.481	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.412	ENSCANG00000027987	DKC1	100	91.031	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	89.152	ENSCGRG00001014574	-	97	89.152	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000003399	DKC1	96	64.143	ENSCGRG00001016789	-	98	63.147	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	89.152	ENSCGRG00000016075	-	97	89.152	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000003399	DKC1	98	63.743	ENSCGRG00000014809	-	96	63.043	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000003399	DKC1	77	85.856	ENSCSEG00000012633	dkc1	96	79.295	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000003399	DKC1	75	86.294	ENSCVAG00000010155	dkc1	83	78.348	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000003399	DKC1	77	85.679	ENSDARG00000016484	dkc1	79	86.717	Danio_rerio
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	90.119	ENSDNOG00000004218	DKC1	97	90.335	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000003399	DKC1	57	83.333	ENSDORG00000013566	-	100	83.333	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000003399	DKC1	76	73.935	FBgn0259937	Nop60B	89	68.473	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000003399	DKC1	91	85.954	ENSETEG00000016095	DKC1	95	85.954	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000003399	DKC1	65	77.811	ENSEBUG00000015962	dkc1	99	82.253	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	92.292	ENSEASG00005007484	DKC1	97	92.292	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	92.292	ENSECAG00000023524	DKC1	97	92.292	Equus_caballus
ENSOGAG00000003399	DKC1	83	87.816	ENSEEUG00000003323	DKC1	99	87.816	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000003399	DKC1	90	77.637	ENSELUG00000014538	dkc1	89	80.269	Esox_lucius
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	90.316	ENSFCAG00000006577	DKC1	97	90.316	Felis_catus
ENSOGAG00000003399	DKC1	85	82.340	ENSFALG00000011496	DKC1	85	81.779	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000003399	DKC1	96	89.841	ENSFDAG00000002516	DKC1	100	89.403	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000003399	DKC1	86	77.827	ENSFHEG00000004627	dkc1	85	77.827	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000003399	DKC1	75	83.632	ENSGMOG00000017277	dkc1	100	83.632	Gadus_morhua
ENSOGAG00000003399	DKC1	85	84.753	ENSGALG00000005054	DKC1	85	83.921	Gallus_gallus
ENSOGAG00000003399	DKC1	86	78.222	ENSGAFG00000011486	dkc1	74	78.222	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000003399	DKC1	76	87.121	ENSGACG00000004373	dkc1	96	89.362	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000003399	DKC1	96	78.210	ENSGAGG00000011330	DKC1	100	79.588	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.794	ENSGGOG00000001045	DKC1	100	91.412	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000003399	DKC1	90	77.378	ENSHBUG00000012436	dkc1	89	77.590	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	89.804	ENSHGLG00000000649	DKC1	97	90.196	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000003399	DKC1	96	89.683	ENSHGLG00100001153	DKC1	97	90.079	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000003399	DKC1	76	86.582	ENSHCOG00000021099	dkc1	91	77.322	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000003399	DKC1	86	79.688	ENSIPUG00000010309	dkc1	88	77.612	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	82.643	ENSSTOG00000020149	-	97	82.446	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000003399	DKC1	91	92.227	ENSSTOG00000001074	-	96	92.227	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	81.065	ENSSTOG00000011904	-	93	81.262	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000003399	DKC1	57	83.333	ENSJJAG00000010086	-	100	83.333	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000003399	DKC1	87	77.042	ENSKMAG00000008010	dkc1	86	77.212	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000003399	DKC1	86	78.842	ENSLBEG00000019122	dkc1	92	77.215	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000003399	DKC1	88	80.174	ENSLACG00000014025	DKC1	91	88.442	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000003399	DKC1	87	80.568	ENSLOCG00000013713	dkc1	87	83.182	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	89.941	ENSLAFG00000000221	DKC1	97	90.138	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.221	ENSMFAG00000032398	DKC1	86	91.412	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.412	ENSMMUG00000005768	DKC1	100	91.031	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.412	ENSMNEG00000034503	DKC1	100	91.031	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.412	ENSMLEG00000034422	DKC1	100	91.031	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000003399	DKC1	78	86.207	ENSMAMG00000005427	dkc1	90	86.816	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000003399	DKC1	90	77.590	ENSMZEG00005014503	dkc1	89	77.801	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000003399	DKC1	78	85.049	ENSMGAG00000009238	DKC1	87	83.933	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000003399	DKC1	57	83.333	ENSMAUG00000016454	-	100	83.333	Mesocricetus_auratus
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ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.794	ENSMICG00000038751	-	97	92.688	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000003399	DKC1	57	80.333	ENSMOCG00000001169	-	100	80.333	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000003399	DKC1	76	86.364	ENSMMOG00000020348	dkc1	86	86.364	Mola_mola
ENSOGAG00000003399	DKC1	89	84.483	ENSMODG00000009243	DKC1	78	84.301	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000003399	DKC1	76	85.965	ENSMALG00000009454	dkc1	79	85.965	Monopterus_albus
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	78.794	MGP_CAROLIEiJ_G0033191	Dkc1	100	92.568	Mus_caroli
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	88.538	ENSMUSG00000031403	Dkc1	97	89.328	Mus_musculus
ENSOGAG00000003399	DKC1	99	88.100	MGP_PahariEiJ_G0031735	Dkc1	99	88.100	Mus_pahari
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	88.538	MGP_SPRETEiJ_G0034351	Dkc1	97	88.933	Mus_spretus
ENSOGAG00000003399	DKC1	96	88.645	ENSMPUG00000016136	DKC1	93	89.526	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000003399	DKC1	90	85.532	ENSMLUG00000011918	DKC1	97	82.812	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000003399	DKC1	57	83.333	ENSNGAG00000015724	-	100	83.333	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000003399	DKC1	76	87.626	ENSNBRG00000005638	dkc1	80	87.626	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.412	ENSNLEG00000014323	DKC1	100	91.031	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000003399	DKC1	79	86.131	ENSMEUG00000001066	DKC1	95	81.179	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000003399	DKC1	86	90.164	ENSOPRG00000005248	DKC1	87	90.164	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000003399	DKC1	57	84.333	ENSODEG00000000549	-	100	84.333	Octodon_degus
ENSOGAG00000003399	DKC1	83	95.172	ENSODEG00000011816	-	91	91.789	Octodon_degus
ENSOGAG00000003399	DKC1	86	80.752	ENSONIG00000013889	dkc1	86	80.752	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000003399	DKC1	66	64.266	ENSOANG00000022295	-	95	63.533	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000003399	DKC1	93	85.540	ENSOANG00000008713	-	96	85.774	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	91.502	ENSOCUG00000012646	DKC1	96	91.304	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000003399	DKC1	75	86.957	ENSORLG00000018748	dkc1	90	77.560	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000003399	DKC1	77	84.864	ENSOMEG00000005786	dkc1	82	85.356	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000003399	DKC1	97	89.328	ENSOARG00000003047	DKC1	97	89.328	Ovis_aries
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ENSOGAG00000003399	DKC1	90	92.340	ENSPPRG00000009104	DKC1	97	90.514	Panthera_pardus
ENSOGAG00000003399	DKC1	89	89.032	ENSPTIG00000017469	DKC1	96	87.425	Panthera_tigris_altaica
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ENSOGAG00000003399	DKC1	97	92.110	ENSPTRG00000043416	-	84	92.308	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000003399	DKC1	100	91.412	ENSPANG00000011978	DKC1	100	91.031	Papio_anubis
ENSOGAG00000003399	DKC1	85	80.587	ENSPKIG00000008443	dkc1	86	85.294	Paramormyrops_kingsleyae
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