EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000003847 (Gene tree)
Gene ID: 100941566
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 21805 bases
Position: chrGL873557.1:8293492-8315296
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000003421	RRM_1	PF00076.22	3.8e-34	1	2
ENSOGAP00000003421	RRM_1	PF00076.22	3.8e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000003850	MSI1-201	1098	-	ENSOGAP00000003421	365 (aa)	-	H0WNL3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000003847	MSI1	51	31.016	ENSOGAG00000025284	-	75	31.034
ENSOGAG00000003847	MSI1	52	37.824	ENSOGAG00000025948	-	67	35.417
ENSOGAG00000003847	MSI1	95	65.507	ENSOGAG00000005621	MSI2	99	66.957
ENSOGAG00000003847	MSI1	53	37.113	ENSOGAG00000024995	-	64	37.113
ENSOGAG00000003847	MSI1	53	41.232	ENSOGAG00000000232	DAZAP1	51	41.627
ENSOGAG00000003847	MSI1	50	38.798	ENSOGAG00000029974	-	75	35.345
ENSOGAG00000003847	MSI1	74	36.842	ENSOGAG00000029136	RBM38	58	36.842
ENSOGAG00000003847	MSI1	50	41.279	ENSOGAG00000032165	-	65	40.642
ENSOGAG00000003847	MSI1	51	41.711	ENSOGAG00000030687	-	75	39.256

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.604	ENSG00000135097	MSI1	99	95.604	Homo_sapiens
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSAPOG00000003191	MSI1	99	82.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSAPOG00000023458	-	99	82.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	82.152	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	82.152	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000003847	MSI1	94	81.928	ENSACIG00000017754	-	78	81.928	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSAOCG00000003804	MSI1	99	82.143	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	76.812	ENSAOCG00000009031	-	95	77.101	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSAPEG00000006857	-	84	82.143	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSAPEG00000003245	MSI1	99	82.143	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	76.776	ENSATEG00000023779	-	99	76.776	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	84.084	ENSATEG00000017059	MSI1	95	84.084	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	92.603	ENSACAG00000002762	MSI1	99	92.603	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.604	ENSANAG00000027151	MSI1	99	95.604	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000003847	MSI1	82	91.000	ENSANAG00000027901	-	92	91.000	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.593	ENSACLG00000011230	MSI1	99	81.593	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	84.593	ENSACLG00000000117	-	100	84.593	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	82.985	ENSAMXG00000038960	msi1	76	82.985	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.128	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	99.128	Bos_taurus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.604	ENSCJAG00000008578	MSI1	99	95.604	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.330	ENSCAFG00000010283	MSI1	99	95.330	Canis_familiaris
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.045	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	99.045	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	90.296	ENSCHIG00000024304	MSI1	99	90.296	Capra_hircus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.091	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	99.091	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	98.913	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	98.913	Cavia_aperea
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.130	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	99.130	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.604	ENSCCAG00000035567	MSI1	99	95.604	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.604	ENSCATG00000030019	MSI1	99	95.604	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.133	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	99.130	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000003847	MSI1	74	91.667	ENSCSAG00000002265	MSI1	95	91.667	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	93.539	ENSCPBG00000011349	MSI1	99	92.033	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.094	ENSCANG00000040651	MSI1	100	99.094	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.604	ENSCGRG00001018883	Msi1	99	95.604	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.096	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	99.096	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	77.616	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	77.616	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.044	ENSCSEG00000008352	-	99	81.044	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.868	ENSCSEG00000005834	-	99	81.868	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.868	ENSCVAG00000009100	MSI1	99	81.868	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	64	67.521	ENSCVAG00000017463	-	89	67.521	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	80.665	ENSDARG00000010710	msi1	100	83.913	Danio_rerio
ENSOGAG00000003847	MSI1	80	81.034	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	81.034	Danio_rerio
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	89.157	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.157	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	98.220	ENSDORG00000005610	Msi1	94	98.220	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	94.864	ENSETEG00000004756	MSI1	100	94.864	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.604	ENSEASG00005004736	MSI1	99	95.604	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.130	ENSECAG00000017526	MSI1	99	95.604	Equus_caballus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	79.726	ENSELUG00000023219	MSI1	92	79.726	Esox_lucius
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	80.523	ENSELUG00000023280	-	100	80.233	Esox_lucius
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.604	ENSFCAG00000011007	MSI1	99	95.604	Felis_catus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	94.904	ENSFALG00000007574	MSI1	100	94.904	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	98.792	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	98.792	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSFHEG00000022446	MSI1	99	82.143	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSFHEG00000003560	-	99	82.143	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	74.247	ENSGMOG00000017838	-	99	74.247	Gadus_morhua
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	79.945	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	79.670	Gadus_morhua
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	94.203	ENSGALG00000007227	MSI1	98	85.128	Gallus_gallus
ENSOGAG00000003847	MSI1	92	67.262	ENSGAFG00000005860	-	90	67.262	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	84.638	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	84.638	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000003847	MSI1	96	80.571	ENSGACG00000008674	-	99	78.297	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.319	ENSGACG00000012679	MSI1	99	81.319	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	92.033	ENSGAGG00000016037	MSI1	99	92.033	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.054	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	99.054	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.868	ENSHBUG00000011841	-	99	81.868	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.593	ENSHBUG00000021921	MSI1	99	81.593	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.330	ENSHGLG00000012782	MSI1	99	95.330	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	98.792	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	98.792	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	76.630	ENSHCOG00000012067	-	99	76.630	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	80.233	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	80.233	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	80.220	ENSIPUG00000001976	msi1	99	80.220	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.045	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.045	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.604	ENSJJAG00000010463	Msi1	99	95.604	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	80.220	ENSJJAG00000010643	-	99	79.945	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	82.849	ENSKMAG00000019877	-	100	82.849	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.593	ENSKMAG00000011251	MSI1	99	81.593	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000003847	MSI1	96	84.000	ENSLBEG00000008789	MSI1	99	81.593	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.593	ENSLBEG00000001375	-	99	81.593	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	86.957	ENSLACG00000018287	MSI1	100	86.957	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000003847	MSI1	91	88.623	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	88.623	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.130	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	99.130	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	98.000	ENSMMUG00000031527	MSI1	96	98.000	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.604	ENSMNEG00000040034	MSI1	99	95.604	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.094	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	99.094	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.319	ENSMAMG00000002279	MSI1	99	81.319	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	97	83.898	ENSMAMG00000018426	-	99	82.143	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.593	ENSMZEG00005026892	MSI1	99	81.593	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.868	ENSMZEG00005000340	-	99	81.868	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000003847	MSI1	63	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000003847	MSI1	70	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.604	ENSMICG00000033181	MSI1	99	95.604	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.330	ENSMOCG00000002286	Msi1	99	95.330	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	75.652	ENSMMOG00000010492	MSI1	94	75.652	Mola_mola
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	80.838	ENSMMOG00000012265	-	97	80.838	Mola_mola
ENSOGAG00000003847	MSI1	91	67.463	ENSMODG00000003189	-	100	67.463	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	84.302	ENSMALG00000001426	-	100	84.302	Monopterus_albus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.868	ENSMALG00000017889	MSI1	99	81.868	Monopterus_albus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.055	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	99	95.055	Mus_caroli
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.055	ENSMUSG00000054256	Msi1	99	95.266	Mus_musculus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	94.780	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	99	94.780	Mus_pahari
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.055	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	99	95.055	Mus_spretus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.045	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	99.045	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	91.071	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	91.071	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.096	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	99.096	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000003847	MSI1	88	76.538	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	76.538	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.868	ENSNBRG00000000841	-	99	81.868	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000003847	MSI1	91	88.822	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	88.822	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	77.039	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	77.039	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000003847	MSI1	94	91.195	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.195	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.094	ENSODEG00000006328	MSI1	100	99.094	Octodon_degus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSONIG00000019452	-	99	82.143	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.868	ENSONIG00000011182	MSI1	99	81.868	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	98.726	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	98.726	Oryctolagus_cuniculus
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ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSORLG00000019978	-	99	82.143	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	85.217	ENSORLG00020008266	MSI1	99	82.319	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSORLG00020001208	-	71	82.143	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSORLG00015013672	-	75	78.846	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	85.217	ENSORLG00015003916	MSI1	99	82.319	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	85.714	ENSOMEG00000002272	-	98	85.714	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000003847	MSI1	96	84.571	ENSOMEG00000017536	MSI1	100	82.267	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	95.783	ENSOARG00000012097	MSI1	100	95.783	Ovis_aries
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ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.330	ENSPANG00000006335	MSI1	99	95.330	Papio_anubis
ENSOGAG00000003847	MSI1	96	85.143	ENSPKIG00000016497	MSI1	99	82.418	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000003847	MSI1	96	84.286	ENSPKIG00000023575	-	99	81.593	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	91.304	ENSPSIG00000011608	-	93	91.304	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000003847	MSI1	80	91.810	ENSPSIG00000009621	-	100	91.810	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000003847	MSI1	94	81.024	ENSPMGG00000000514	MSI1	97	81.024	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	69.828	ENSPMGG00000007743	-	99	62.192	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	95	97.353	ENSPEMG00000010491	Msi1	95	97.353	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSPLAG00000012431	-	96	82.143	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.868	ENSPMEG00000012796	MSI1	99	81.868	Poecilia_mexicana
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.593	ENSPMEG00000007025	-	93	77.391	Poecilia_mexicana
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ENSOGAG00000003847	MSI1	99	94.780	ENSPPYG00000005027	MSI1	99	94.780	Pongo_abelii
ENSOGAG00000003847	MSI1	76	100.000	ENSPCAG00000002300	MSI1	72	100.000	Procavia_capensis
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	95.604	ENSPCOG00000017341	MSI1	99	95.604	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	82.175	ENSPVAG00000002225	MSI1	100	82.175	Pteropus_vampyrus
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ENSOGAG00000003847	MSI1	99	80.769	ENSPNAG00000019337	msi1	99	80.769	Pygocentrus_nattereri
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ENSOGAG00000003847	MSI1	98	98.799	ENSRROG00000041076	MSI1	93	98.799	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	99.130	ENSSBOG00000030259	MSI1	98	99.130	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	88.235	ENSSHAG00000006834	MSI1	100	88.235	Sarcophilus_harrisii
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	86.087	ENSSFOG00015014964	-	95	86.087	Scleropages_formosus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	86.744	ENSSFOG00015005350	MSI1	100	83.140	Scleropages_formosus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	81.024	ENSSMAG00000018824	MSI1	97	81.024	Scophthalmus_maximus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	84.892	ENSSMAG00000009156	-	71	84.892	Scophthalmus_maximus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.868	ENSSDUG00000022697	-	99	81.868	Seriola_dumerili
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ENSOGAG00000003847	MSI1	99	82.143	ENSSLDG00000016832	MSI1	99	82.143	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	91.484	ENSSPUG00000015741	MSI1	100	91.484	Sphenodon_punctatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	62	65.639	ENSSPAG00000014085	-	100	65.639	Stegastes_partitus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	85.465	ENSSPAG00000013098	-	100	85.465	Stegastes_partitus
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	98.726	ENSSSCG00000029365	MSI1	100	98.726	Sus_scrofa
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ENSOGAG00000003847	MSI1	81	79.915	ENSTRUG00000016249	MSI1	100	72.963	Takifugu_rubripes
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	76.839	ENSTNIG00000011469	MSI1	99	76.839	Tetraodon_nigroviridis
ENSOGAG00000003847	MSI1	98	61.813	ENSTNIG00000019814	-	97	61.813	Tetraodon_nigroviridis
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ENSOGAG00000003847	MSI1	99	87.123	ENSXETG00000012216	msi1	99	87.671	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000003847	MSI1	95	71.304	ENSXCOG00000017605	MSI1	89	71.304	Xiphophorus_couchianus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.868	ENSXMAG00000027103	MSI1	90	77.381	Xiphophorus_maculatus
ENSOGAG00000003847	MSI1	99	81.868	ENSXMAG00000018237	-	99	81.868	Xiphophorus_maculatus