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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000004031 (Gene tree)
Gene ID: 100951185
Gene Symbol: POLR1A
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 84437 bases
Position: chrGL873666.1:2120557-2204993
Accession: 100951185
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000003596	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	7.9e-103	1	1
ENSOGAP00000003596	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	1.2e-25	1	1
ENSOGAP00000003596	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	2.7e-69	1	1
ENSOGAP00000003596	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	7.2e-38	1	1
ENSOGAP00000003596	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	9.3e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000004038	POLR1A-201	5229	-	ENSOGAP00000003596	1720 (aa)	XP_003799250	H0WP08

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000004031	POLR1A	69	33.636	ENSOGAG00000033608	-	59	33.636
ENSOGAG00000004031	POLR1A	60	33.898	ENSOGAG00000010995	POLR3A	68	33.898

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000004031	POLR1A	97	95.385	ENSG00000068654	POLR1A	100	91.047	Homo_sapiens
ENSOGAG00000004031	POLR1A	69	67.875	ENSAPOG00000017945	polr1a	99	67.875	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	89.709	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	90.779	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000004031	POLR1A	96	66.644	ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.781	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	66.068	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	67.530	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	66.010	ENSAPEG00000016105	polr1a	98	74.306	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	65.954	ENSATEG00000016773	polr1a	100	65.742	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	86	72.260	ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.290	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000004031	POLR1A	99	69.440	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	69.382	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	90.000	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	90.000	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	62.073	ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.783	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	89.186	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	89.186	Bos_taurus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	99	38.220	WBGene00012999	rpoa-1	98	38.453	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	89.709	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	89.709	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	90.116	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	90.116	Canis_familiaris
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	89.913	ENSCAFG00020014752	POLR1A	100	89.913	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	87.370	ENSCHIG00000018204	POLR1A	99	88.342	Capra_hircus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.030	ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	88.263	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000004031	POLR1A	97	83.900	ENSCAPG00000010132	POLR1A	100	83.990	Cavia_aperea
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.328	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	88.560	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	90.523	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	90.523	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	91.337	ENSCATG00000029786	POLR1A	100	91.337	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.754	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	88.754	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	91.395	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	91.395	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	99	74.638	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	74.565	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000004031	POLR1A	99	47.019	ENSCSAVG00000007184	-	99	48.556	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.379	ENSCANG00000031785	POLR1A	100	88.379	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	84.134	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	84.366	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000004031	POLR1A	60	88.298	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	88.685	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	62.065	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	62.065	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	63.808	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	64.122	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	66.937	ENSDARG00000098375	polr1a	100	66.763	Danio_rerio
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	82.609	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	82.667	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.086	ENSDORG00000008298	Polr1a	100	88.433	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000004031	POLR1A	80	44.452	FBgn0019938	RpI1	99	43.445	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000004031	POLR1A	72	100.000	ENSETEG00000000412	-	72	100.000	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000004031	POLR1A	89	47.992	ENSEBUG00000005667	-	99	48.285	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	90.988	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	90.988	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	91.047	ENSECAG00000030510	-	100	92.412	Equus_caballus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	91.047	ENSECAG00000010092	POLR1A	100	92.412	Equus_caballus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	91.047	ENSECAG00000036306	-	100	92.412	Equus_caballus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	81	96.809	ENSEEUG00000000676	POLR1A	81	96.667	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	67.015	ENSELUG00000012769	polr1a	99	66.378	Esox_lucius
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	90.465	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	90.523	Felis_catus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	99	70.757	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	70.826	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.201	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	88.086	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	61.391	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	61.391	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	60.221	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	60.372	Gadus_morhua
ENSOGAG00000004031	POLR1A	90	69.660	ENSGALG00000038160	-	99	69.610	Gallus_gallus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	64.368	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	64.108	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	64.397	ENSGACG00000018791	polr1a	100	64.278	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	89	75.777	ENSGAGG00000004984	-	96	80.580	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	91.105	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	91.105	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000004031	POLR1A	90	64.076	ENSHBUG00000020021	polr1a	98	64.274	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.805	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	88.966	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.477	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	88.709	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	62.312	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	61.918	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	65.914	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	65.665	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	86.876	ENSSTOG00000012580	POLR1A	100	87.166	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.399	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	88.573	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	65.041	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	65.041	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	95	67.877	ENSLBEG00000015401	polr1a	99	68.226	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000004031	POLR1A	53	76.931	ENSLACG00000003218	polr1a	100	76.931	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	70.312	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	70.486	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.368	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	88.484	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	91.453	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	91.453	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	91.453	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	91.453	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	91.453	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	91.453	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	90.756	ENSMLEG00000042428	POLR1A	100	90.756	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	65.932	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	65.681	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	65.547	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	65.489	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000004031	POLR1A	99	69.084	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	69.258	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000004031	POLR1A	92	88.250	ENSMAUG00000008497	Polr1a	100	88.503	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	92.969	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	92.795	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	87.898	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	88.188	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	64.846	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	64.679	Mola_mola
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	75.115	ENSMODG00000009335	POLR1A	100	75.115	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	65.411	ENSMALG00000013363	polr1a	100	65.260	Monopterus_albus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	86.450	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	86.798	Mus_caroli
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	86.682	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	87.030	Mus_musculus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	87.087	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	87.435	Mus_pahari
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	85.023	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	85.967	Mus_spretus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	90.291	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	90.291	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.664	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	88.606	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	87.847	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	88.079	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	65.547	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	65.280	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	89.178	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	89.178	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000004031	POLR1A	75	93.701	ENSMEUG00000011665	-	76	93.701	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000004031	POLR1A	99	82.460	ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.460	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	89.315	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	89.315	Octodon_degus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	65.721	ENSONIG00000015895	polr1a	100	65.779	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	90.296	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	90.296	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	64.621	ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.150	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	63.463	ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.212	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000004031	POLR1A	95	74.468	ENSORLG00015016071	polr1a	98	74.444	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.850	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.850	Ovis_aries
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	90.988	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	90.988	Pan_paniscus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	90.465	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	90.407	Panthera_pardus
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	89.803	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	89.861	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	90.930	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	90.930	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	91.512	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	91.512	Papio_anubis
ENSOGAG00000004031	POLR1A	94	75.000	ENSPKIG00000005468	polr1a	99	75.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000004031	POLR1A	63	71.651	ENSPSIG00000009321	-	99	71.927	Pelodiscus_sinensis
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ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.361	ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.593	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	67.395	ENSXETG00000001952	polr1a	100	69.161	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	64.893	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	64.446	Xiphophorus_maculatus