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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000004399 (Gene tree)
Gene ID: 100963648
Gene Symbol: SMARCA1
Alias: -
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 1
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 89615 bases
Position: chrGL873628.1:1135518-1225132
Accession: 100963648
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000003929	ResIII	PF04851.15	6.5e-13	1	1
ENSOGAP00000003929	DEAD	PF00270.29	7.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000004403	SMARCA1-201	4089	XM_023517363	ENSOGAP00000003929	1054 (aa)	XP_023373131	H0WPT9

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	50	46.388	ENSOGAG00000017145	HELLS	66	46.388
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	86.283	ENSOGAG00000009702	SMARCA5	91	86.157
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	55	43.373	ENSOGAG00000008775	CHD1L	61	43.373

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	98.387	ENSG00000102038	SMARCA1	100	98.387	Homo_sapiens
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.089	ENSAPOG00000016035	smarca5	96	84.351	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	96.657	ENSAMEG00000015218	SMARCA1	98	96.657	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	83	84.589	ENSACIG00000016982	smarca5	97	84.598	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.089	ENSAOCG00000015578	smarca5	93	83.265	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.089	ENSAPEG00000011117	smarca5	97	84.431	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	95	80.200	ENSATEG00000012894	smarca5	95	82.401	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	93.082	ENSAPLG00000013149	SMARCA1	97	92.776	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	97	89.391	ENSACAG00000011376	SMARCA1	93	91.287	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	97	93.087	ENSANAG00000023098	SMARCA1	96	93.087	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	94	81.552	ENSACLG00000025356	smarca5	93	83.676	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	95	81.213	ENSAMXG00000005709	smarca5	92	84.304	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	86	88.449	ENSAMXG00000011227	smarca1	99	88.863	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	97.241	ENSBTAG00000002292	SMARCA1	100	97.241	Bos_taurus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	92	63.951	WBGene00002169	isw-1	95	63.951	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.185	ENSCJAG00000002868	SMARCA1	98	98.185	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	88.224	ENSCAFG00000018673	SMARCA1	98	88.224	Canis_familiaris
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	97.135	ENSCAFG00020001751	SMARCA1	98	97.135	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	97.256	ENSCHIG00000009837	SMARCA1	100	97.256	Capra_hircus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	96	96.624	ENSTSYG00000004240	SMARCA1	99	96.503	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	95.541	ENSCPOG00000013601	SMARCA1	95	97.387	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	95.129	ENSCCAG00000030817	SMARCA1	98	95.129	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.376	ENSCATG00000015921	SMARCA1	100	97.343	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	96.584	ENSCLAG00000002171	SMARCA1	100	96.584	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	97.421	ENSCSAG00000008460	SMARCA1	98	97.421	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	94	92.012	ENSCPBG00000001146	SMARCA1	92	92.097	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	73.717	ENSCING00000004110	swi/snf	95	73.717	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	73.478	ENSCSAVG00000004620	-	100	73.516	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.281	ENSCANG00000007183	SMARCA1	98	98.281	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	94.028	ENSCGRG00001010776	Smarca1	98	94.879	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	95	95.309	ENSCGRG00000015301	Smarca1	98	95.779	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	83.878	ENSCSEG00000000328	smarca5	93	83.162	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	83.455	ENSCVAG00000008668	smarca5	97	83.971	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	93	85.274	ENSDARG00000012776	smarca1	96	85.274	Danio_rerio
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	94	81.332	ENSDARG00000052348	smarca5	92	83.888	Danio_rerio
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	94.752	ENSDNOG00000004315	SMARCA1	100	94.752	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	94.687	ENSDORG00000009270	Smarca1	98	94.778	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	93	72.194	FBgn0011604	Iswi	94	73.469	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	79	92.857	ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	92.857	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	81.568	ENSEBUG00000001239	smarca5	95	80.884	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	95	93.241	ENSEASG00005008218	SMARCA1	97	93.394	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	96.381	ENSECAG00000012106	SMARCA1	98	96.381	Equus_caballus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	77	97.351	ENSEEUG00000014927	SMARCA1	84	97.351	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	92	87.024	ENSELUG00000010515	smarca1	96	86.405	Esox_lucius
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.281	ENSFCAG00000018496	SMARCA1	98	98.281	Felis_catus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	88	92.649	ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	92.649	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	95	97.796	ENSFDAG00000009818	SMARCA1	98	97.796	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	83.874	ENSFHEG00000007687	smarca5	91	84.544	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	97	90.098	ENSGALG00000008431	SMARCA1	97	92.012	Gallus_gallus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	83.874	ENSGAFG00000017731	smarca5	93	83.470	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	92.604	ENSGAGG00000023575	SMARCA1	98	92.604	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	71	96.000	ENSGGOG00000012841	-	95	96.000	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	96.869	ENSHGLG00000003080	SMARCA1	100	96.869	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	93	97.056	ENSHGLG00100001102	SMARCA1	98	97.056	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	83.912	ENSHCOG00000005458	smarca5	93	83.368	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	94	81.288	ENSIPUG00000005229	SMARCA5	95	83.248	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	95	85.329	ENSIPUG00000016905	Smarca1	98	86.934	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	97.533	ENSSTOG00000014524	SMARCA1	100	97.533	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	95.066	ENSJJAG00000002593	Smarca1	100	95.066	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.122	ENSKMAG00000003777	smarca5	93	83.573	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	89	83.191	ENSLBEG00000013295	SMARCA1	100	83.811	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	83.125	ENSLBEG00000018112	smarca5	93	83.060	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	95	88.657	ENSLACG00000016697	SMARCA1	96	89.596	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	92	89.463	ENSLOCG00000014591	smarca1	95	89.409	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	94	95.276	ENSLAFG00000000896	SMARCA1	99	95.291	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.376	ENSMFAG00000002117	SMARCA1	100	97.343	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.376	ENSMMUG00000008818	SMARCA1	100	97.343	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.376	ENSMNEG00000041768	SMARCA1	100	97.343	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.376	ENSMLEG00000043198	SMARCA1	98	98.376	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	84.084	ENSMAMG00000014294	smarca5	92	83.676	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	94	81.552	ENSMZEG00005009369	smarca5	93	83.676	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	93	92.410	ENSMGAG00000007042	SMARCA1	97	92.292	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	95.920	ENSMAUG00000008133	Smarca1	100	95.920	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.376	ENSMICG00000015768	SMARCA1	98	98.376	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	95.541	ENSMOCG00000009464	Smarca1	100	95.541	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	81.667	ENSMMOG00000005547	smarca5	97	81.622	Mola_mola
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	97	88.780	ENSMODG00000013187	-	97	88.770	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	83.701	ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.947	Monopterus_albus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	94.240	MGP_CAROLIEiJ_G0033034	Smarca1	100	94.798	Mus_caroli
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	94.240	ENSMUSG00000031099	Smarca1	100	94.798	Mus_musculus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	94.145	MGP_PahariEiJ_G0031579	Smarca1	100	94.798	Mus_pahari
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	94.334	MGP_SPRETEiJ_G0034192	Smarca1	100	94.928	Mus_spretus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	97.899	ENSMPUG00000017423	SMARCA1	92	97.899	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	98	94.369	ENSMLUG00000029614	SMARCA1	96	94.169	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	96.774	ENSNGAG00000006492	Smarca1	100	96.774	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	84.188	ENSNBRG00000004463	smarca5	97	83.778	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	97.517	ENSNLEG00000015179	SMARCA1	98	97.517	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	82.353	ENSMEUG00000008819	SMARCA1	99	82.334	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	96.395	ENSODEG00000012163	SMARCA1	100	96.395	Octodon_degus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	94	81.653	ENSONIG00000009993	smarca5	93	83.778	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	93.132	ENSOANG00000002862	SMARCA1	98	93.132	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	95.320	ENSOCUG00000001047	SMARCA1	98	95.320	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.122	ENSORLG00000021998	smarca5	92	83.573	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.227	ENSORLG00020017679	smarca5	93	83.676	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.122	ENSORLG00015017210	smarca5	93	83.470	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.122	ENSOMEG00000000086	smarca5	93	83.470	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	94	96.768	ENSOARG00000014638	SMARCA1	98	97.110	Ovis_aries
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.376	ENSPPAG00000034647	SMARCA1	98	98.376	Pan_paniscus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.281	ENSPPRG00000008929	SMARCA1	98	98.281	Panthera_pardus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	94	96.583	ENSPTIG00000000915	SMARCA1	96	96.583	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.376	ENSPTRG00000049876	SMARCA1	100	97.343	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	99	98.376	ENSPANG00000003871	SMARCA1	98	98.376	Papio_anubis
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	98	82.461	ENSPKIG00000013411	smarca1	98	85.729	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	94	92.315	ENSPSIG00000010101	SMARCA1	98	92.396	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	100	96.395	ENSPEMG00000017503	Smarca1	100	96.395	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	97	89.474	ENSPCIG00000015460	SMARCA1	97	91.423	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.122	ENSPFOG00000007649	smarca5	93	83.470	Poecilia_formosa
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.122	ENSPLAG00000003363	smarca5	93	83.470	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.017	ENSPMEG00000019849	smarca5	93	83.368	Poecilia_mexicana
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	84.017	ENSPREG00000023250	smarca5	93	83.368	Poecilia_reticulata
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ENSOGAG00000004399	SMARCA1	92	89.773	ENSXETG00000001526	smarca1	97	89.613	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	83.770	ENSXCOG00000011170	smarca5	95	83.368	Xiphophorus_couchianus
ENSOGAG00000004399	SMARCA1	91	83.770	ENSXMAG00000009678	smarca5	98	83.763	Xiphophorus_maculatus