EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000004867 (Gene tree)
Gene ID: 100961641
Gene Symbol: RPUSD2
Alias: -
Full Name: RNA pseudouridine synthase domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6528 bases
Position: chrGL873569.1:7272386-7278913
Accession: 24180
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000004347	PseudoU_synth_2	PF00849.22	2.2e-32	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000004869	RPUSD2-201	1569	-	ENSOGAP00000004347	522 (aa)	-	H0WQT8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.824	ENSG00000166133	RPUSD2	96	85.824	Homo_sapiens
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	96	53.920	ENSAPOG00000000817	rpusd2	90	54.064	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	85.797	ENSAMEG00000016996	RPUSD2	96	85.797	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	59.865	ENSACIG00000024029	rpusd2	91	59.091	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	98	52.908	ENSAOCG00000015237	rpusd2	92	53.061	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	98	52.533	ENSAPEG00000021763	rpusd2	92	52.690	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	56.842	ENSATEG00000015242	rpusd2	82	56.352	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	81	65.802	ENSAPLG00000004723	RPUSD2	100	65.802	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	66.441	ENSACAG00000013893	RPUSD2	99	62.917	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	86.207	ENSANAG00000009691	RPUSD2	96	86.207	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	58.351	ENSACLG00000019531	rpusd2	83	57.652	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	57.231	ENSAMXG00000013376	rpusd2	96	51.993	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	81.682	ENSBTAG00000003193	RPUSD2	96	83.712	Bos_taurus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	77	34.913	WBGene00019498	K07E8.7	97	34.913	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.249	ENSCJAG00000020841	RPUSD2	96	85.249	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	85.795	ENSCAFG00000009165	RPUSD2	96	85.795	Canis_familiaris
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	85.985	ENSCAFG00020005849	RPUSD2	96	85.985	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	83.144	ENSCHIG00000006152	RPUSD2	96	83.144	Capra_hircus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	86.398	ENSTSYG00000012844	RPUSD2	96	86.398	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	55	88.502	ENSCAPG00000006895	-	100	88.502	Cavia_aperea
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	82.476	ENSCPOG00000013201	RPUSD2	96	82.476	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	86.015	ENSCCAG00000024378	RPUSD2	96	86.015	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.632	ENSCATG00000043734	RPUSD2	96	85.632	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	85.029	ENSCLAG00000011862	RPUSD2	96	85.029	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	98	86.301	ENSCSAG00000007538	RPUSD2	100	86.301	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	66	89.796	ENSCHOG00000004834	RPUSD2	63	89.796	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	89	62.768	ENSCPBG00000013419	RPUSD2	95	62.768	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	86.398	ENSCANG00000003659	RPUSD2	96	86.398	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	78.692	ENSCGRG00001009839	Rpusd2	93	78.692	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	78.692	ENSCGRG00000012348	Rpusd2	96	78.692	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	90	55.123	ENSCSEG00000001953	rpusd2	84	55.123	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	59.375	ENSCVAG00000010848	rpusd2	82	58.621	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	57.826	ENSDARG00000060992	rpusd2	80	57.203	Danio_rerio
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	82.950	ENSDNOG00000047745	RPUSD2	96	82.950	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	83	86.897	ENSDORG00000009092	Rpusd2	100	86.897	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	82	47.447	FBgn0051719	RluA-1	63	47.447	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	81	49.420	FBgn0032256	RluA-2	78	49.420	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	79.310	ENSETEG00000008581	RPUSD2	96	79.310	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	80	35.731	ENSEBUG00000012149	rpusd2	84	35.731	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.633	ENSEASG00005016463	RPUSD2	95	85.633	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.822	ENSECAG00000024178	RPUSD2	95	85.822	Equus_caballus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	70.250	ENSEEUG00000005132	RPUSD2	95	70.250	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	86	58.065	ENSELUG00000016786	rpusd2	84	58.065	Esox_lucius
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	85.932	ENSFCAG00000040796	RPUSD2	95	85.932	Felis_catus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	82	70.345	ENSFALG00000001122	RPUSD2	96	70.429	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	98	81.996	ENSFDAG00000003070	RPUSD2	100	81.996	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	86	57.143	ENSFHEG00000007518	rpusd2	84	57.143	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	59.333	ENSGMOG00000011014	rpusd2	99	57.113	Gadus_morhua
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	90	63.469	ENSGALG00000041216	RPUSD2	99	63.469	Gallus_gallus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	86	58.643	ENSGAFG00000003390	rpusd2	81	58.643	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	86	54.927	ENSGACG00000008656	rpusd2	91	54.927	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	90	65.281	ENSGAGG00000013098	RPUSD2	93	65.281	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.441	ENSGGOG00000006684	RPUSD2	96	85.441	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	58.134	ENSHBUG00000023777	rpusd2	83	57.442	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	82.375	ENSHGLG00000012765	RPUSD2	96	82.375	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	82.375	ENSHGLG00100006653	RPUSD2	96	82.375	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	90	55.738	ENSHCOG00000015587	rpusd2	84	55.738	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	85	59.179	ENSIPUG00000021006	rpusd2	79	59.179	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	82.642	ENSSTOG00000025619	RPUSD2	96	82.642	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	98	80.934	ENSJJAG00000023160	Rpusd2	95	81.907	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	57.759	ENSKMAG00000006618	rpusd2	87	54.894	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	57.174	ENSLBEG00000021571	rpusd2	91	53.084	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	83	64.629	ENSLACG00000017338	RPUSD2	100	64.629	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	61.937	ENSLOCG00000014755	rpusd2	92	61.304	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	84.069	ENSLAFG00000015588	RPUSD2	97	84.069	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.632	ENSMFAG00000045062	RPUSD2	96	85.632	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.632	ENSMMUG00000001483	RPUSD2	96	85.632	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	75.665	ENSMNEG00000041429	RPUSD2	96	75.665	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	77	90.962	ENSMLEG00000036551	RPUSD2	94	90.962	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	54.490	ENSMAMG00000001077	rpusd2	81	54.167	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	58.351	ENSMZEG00005006947	rpusd2	91	57.652	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	88	67.467	ENSMGAG00000003058	RPUSD2	100	67.467	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	79.439	ENSMAUG00000020467	Rpusd2	96	79.439	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	89.464	ENSMICG00000028637	RPUSD2	96	89.464	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	78.505	ENSMOCG00000020061	Rpusd2	96	78.505	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	60.310	ENSMMOG00000012020	rpusd2	91	54.717	Mola_mola
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	90	77.637	ENSMODG00000000300	RPUSD2	87	77.637	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	55.579	ENSMALG00000010024	rpusd2	82	55.193	Monopterus_albus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	77.840	MGP_CAROLIEiJ_G0024130	Rpusd2	96	77.840	Mus_caroli
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	77.654	ENSMUSG00000027324	Rpusd2	96	77.654	Mus_musculus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	78.318	MGP_PahariEiJ_G0025573	Rpusd2	96	78.318	Mus_pahari
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	77.903	MGP_SPRETEiJ_G0025046	Rpusd2	96	77.903	Mus_spretus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	84.848	ENSMPUG00000008517	RPUSD2	96	84.848	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	98	87.329	ENSMLUG00000007971	RPUSD2	100	87.329	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	79.468	ENSNGAG00000014126	Rpusd2	96	79.468	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	59.417	ENSNBRG00000010070	rpusd2	82	58.658	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.632	ENSNLEG00000035735	RPUSD2	96	85.632	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	93	75.665	ENSMEUG00000008500	RPUSD2	93	75.665	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	79.885	ENSOPRG00000014177	-	96	79.885	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	84.291	ENSODEG00000017193	RPUSD2	97	84.291	Octodon_degus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	60.091	ENSONIG00000020102	rpusd2	90	59.300	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	84.866	ENSOCUG00000015745	RPUSD2	93	84.866	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	88	58.458	ENSORLG00000015516	rpusd2	84	58.458	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	88	57.996	ENSORLG00020010533	rpusd2	84	57.996	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	88	58.422	ENSORLG00015009206	rpusd2	84	58.422	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	58.998	ENSOMEG00000007355	rpusd2	78	56.809	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	82.252	ENSOARG00000020235	RPUSD2	96	81.629	Ovis_aries
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.824	ENSPPAG00000032874	RPUSD2	96	85.824	Pan_paniscus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	87.332	ENSPPRG00000010446	RPUSD2	96	87.332	Panthera_pardus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	87.332	ENSPTIG00000013316	RPUSD2	96	87.332	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.824	ENSPTRG00000006924	RPUSD2	96	85.824	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.441	ENSPANG00000019339	RPUSD2	96	85.441	Papio_anubis
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	91	57.494	ENSPKIG00000023017	rpusd2	76	58.389	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	66	64.957	ENSPSIG00000012680	RPUSD2	99	64.957	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	84	58.219	ENSPMGG00000018165	rpusd2	80	57.456	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	80.806	ENSPEMG00000012878	Rpusd2	95	80.806	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	99	71.267	ENSPCIG00000023199	RPUSD2	96	71.267	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	86	58.568	ENSPFOG00000006829	rpusd2	83	58.568	Poecilia_formosa
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	86	58.785	ENSPLAG00000022914	rpusd2	94	58.785	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	86	58.351	ENSPMEG00000009835	rpusd2	94	58.351	Poecilia_mexicana
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	86	59.471	ENSPREG00000016441	rpusd2	79	59.471	Poecilia_reticulata
ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	86.015	ENSPPYG00000006355	RPUSD2	96	86.015	Pongo_abelii
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ENSOGAG00000004867	RPUSD2	100	85.441	ENSPVAG00000001837	RPUSD2	96	85.441	Pteropus_vampyrus
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