EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000005352 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PRPF3
Alias: -
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 35322 bases
Position: chrGL873693.1:2813789-2849110
Accession: 17348
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000004788	PRP3	PF08572.10	8.3e-66	1	1
ENSOGAP00000004788	PWI	PF01480.17	2.1e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000005356	PRPF3-201	2140	-	ENSOGAP00000004788	682 (aa)	-	H0WRW0

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSG00000117360	PRPF3	100	93.860	Homo_sapiens
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	67.887	ENSAPOG00000015584	prpf3	99	68.451	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.713	ENSAMEG00000001630	PRPF3	100	93.713	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.414	ENSACIG00000007876	prpf3	99	67.422	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	67.183	ENSAOCG00000011449	prpf3	99	68.369	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	67.188	ENSATEG00000023583	prpf3	99	67.614	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	89.635	ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	89.635	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	87.209	ENSACAG00000003176	PRPF3	100	87.500	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	93.860	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.497	ENSACLG00000020127	prpf3	99	68.208	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	69.620	ENSAMXG00000007306	prpf3	99	69.198	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSBTAG00000013946	PRPF3	100	93.860	Bos_taurus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	81	36.185	WBGene00010844	prp-3	82	36.007	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	93.860	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSCAFG00000011820	PRPF3	100	93.860	Canis_familiaris
ENSOGAG00000005352	PRPF3	80	92.336	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	92.336	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSCHIG00000015434	PRPF3	100	93.860	Capra_hircus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.421	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	93.421	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000005352	PRPF3	93	76.138	ENSCAPG00000017812	PRPF3	95	76.295	Cavia_aperea
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.567	ENSCPOG00000008068	PRPF3	100	93.567	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSCCAG00000026380	PRPF3	100	93.860	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	78.665	ENSCATG00000041778	PRPF3	83	98.925	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSCLAG00000015009	PRPF3	100	93.860	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000005352	PRPF3	77	98.587	ENSCHOG00000011645	PRPF3	77	98.587	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	90.657	ENSCPBG00000008216	PRPF3	100	90.657	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000005352	PRPF3	61	55.000	ENSCING00000003312	-	99	54.524	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000005352	PRPF3	83	50.963	ENSCSAVG00000008720	-	94	51.625	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.567	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	93.567	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSCGRG00001019100	Prpf3	100	93.860	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSCGRG00000007322	Prpf3	100	93.860	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.724	ENSCSEG00000002532	prpf3	99	67.321	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	69.307	ENSCVAG00000009318	prpf3	99	69.024	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.892	ENSDARG00000086425	prpf3	99	68.608	Danio_rerio
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	83.772	ENSDNOG00000005904	PRPF3	100	84.795	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	93	93.071	ENSDORG00000008664	Prpf3	100	93.071	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000005352	PRPF3	80	49.476	FBgn0036915	Prp3	99	49.550	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	92.544	ENSETEG00000019124	PRPF3	100	92.544	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	60.627	ENSEBUG00000011680	prpf3	99	60.627	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.713	ENSEASG00005001566	PRPF3	100	93.713	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSECAG00000019840	PRPF3	100	93.860	Equus_caballus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	85	100.000	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	63.233	ENSELUG00000013624	prpf3	99	63.662	Esox_lucius
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSFCAG00000013940	PRPF3	100	93.860	Felis_catus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.421	ENSFDAG00000010365	PRPF3	100	93.421	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	69.484	ENSFHEG00000021746	prpf3	99	69.341	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	67.514	ENSGMOG00000008535	prpf3	99	67.373	Gadus_morhua
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	89.489	ENSGALG00000028205	PRPF3	100	89.489	Gallus_gallus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.376	ENSGAFG00000012671	prpf3	99	68.091	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	67.185	ENSGACG00000011792	prpf3	99	67.468	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	90.365	ENSGAGG00000013765	PRPF3	100	88.909	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000005352	PRPF3	85	98.374	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	98.374	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.876	ENSHBUG00000003493	prpf3	99	68.588	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	69.941	ENSHGLG00000016033	-	100	69.941	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.567	ENSHGLG00000016569	PRPF3	100	93.567	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	69.941	ENSHGLG00100008951	-	95	90.909	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.567	ENSHGLG00100007590	PRPF3	100	93.567	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	64.965	ENSHCOG00000014058	prpf3	99	64.681	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	69.362	ENSIPUG00000000902	PRPF3	99	69.688	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSSTOG00000001889	PRPF3	100	93.860	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	67.139	ENSKMAG00000001390	prpf3	99	66.856	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	66.387	ENSLBEG00000026310	prpf3	99	67.278	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000005352	PRPF3	93	77.429	ENSLACG00000010541	PRPF3	100	77.273	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.713	ENSLAFG00000004713	PRPF3	100	93.713	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	93.860	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000005352	PRPF3	90	93.171	ENSMMUG00000016301	PRPF3	98	93.160	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	93.860	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000005352	PRPF3	99	64.993	ENSMLEG00000041065	-	98	63.959	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	85	97.967	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	97.967	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.406	ENSMAMG00000014968	prpf3	99	68.265	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	67.367	ENSMZEG00005015970	prpf3	99	67.227	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	89.489	ENSMGAG00000000707	PRPF3	100	89.489	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.567	ENSMAUG00000017112	Prpf3	100	93.567	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.713	ENSMICG00000015386	PRPF3	100	93.713	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.713	ENSMOCG00000000242	Prpf3	100	93.713	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	62.921	ENSMMOG00000016131	prpf3	99	63.881	Mola_mola
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	92.836	ENSMODG00000018774	PRPF3	100	92.836	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	67.094	ENSMALG00000007257	prpf3	99	67.094	Monopterus_albus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.421	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	93.421	Mus_caroli
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.421	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	93.421	Mus_musculus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.275	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	93.275	Mus_pahari
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.421	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	93.421	Mus_spretus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	90.497	ENSMPUG00000005080	PRPF3	100	90.511	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.139	ENSMLUG00000004646	-	100	93.139	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSNGAG00000000910	Prpf3	100	93.860	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	66.806	ENSNBRG00000003462	prpf3	99	66.527	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000005352	PRPF3	90	93.171	ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	93.160	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000005352	PRPF3	83	99.558	ENSMEUG00000008733	PRPF3	89	99.558	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.275	ENSOPRG00000010139	PRPF3	100	93.275	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	70.247	ENSODEG00000014412	-	100	70.247	Octodon_degus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.275	ENSODEG00000011363	-	100	93.275	Octodon_degus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	66.947	ENSONIG00000006394	prpf3	99	66.807	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	61.714	ENSOANG00000015441	PRPF3	100	61.429	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSOCUG00000011760	PRPF3	100	93.860	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	69.132	ENSORLG00000010330	prpf3	99	68.234	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	69.132	ENSORLG00020009054	prpf3	99	68.234	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.848	ENSORLG00015015016	prpf3	99	67.949	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.091	ENSOMEG00000000940	prpf3	99	67.806	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSOARG00000020798	PRPF3	100	93.860	Ovis_aries
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.713	ENSPPAG00000030983	PRPF3	100	93.713	Pan_paniscus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	99	70.667	ENSPPAG00000043769	-	99	70.222	Pan_paniscus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSPPRG00000000731	PRPF3	100	93.860	Panthera_pardus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSPTIG00000005516	PRPF3	100	93.860	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000005352	PRPF3	99	69.926	ENSPTRG00000047819	-	99	69.481	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	93.860	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.713	ENSPANG00000000499	PRPF3	100	93.713	Papio_anubis
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	70.370	ENSPKIG00000010501	prpf3	99	70.513	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	90.511	ENSPSIG00000014877	PRPF3	100	90.365	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	63.295	ENSPMGG00000007776	prpf3	99	62.283	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	93.860	ENSPEMG00000011672	Prpf3	100	93.860	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000005352	PRPF3	63	67.352	ENSPMAG00000005588	prpf3	99	65.121	Petromyzon_marinus
ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	92.836	ENSPCIG00000008795	PRPF3	100	92.836	Phascolarctos_cinereus
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