EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000005621 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI2
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 404174 bases
Position: chrGL873613.1:1505780-1909953
Accession: 18585
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000005024	RRM_1	PF00076.22	2.7e-27	1	2
ENSOGAP00000005024	RRM_1	PF00076.22	2.7e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000005623	MSI2-201	921	-	ENSOGAP00000005024	307 (aa)	-	H0WSG3

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000005621	MSI2	53	40.606	ENSOGAG00000032165	-	95	33.452
ENSOGAG00000005621	MSI2	57	45.055	ENSOGAG00000031703	-	73	47.059
ENSOGAG00000005621	MSI2	55	34.503	ENSOGAG00000033209	-	58	32.597
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	66.957	ENSOGAG00000003847	MSI1	95	65.507
ENSOGAG00000005621	MSI2	57	40.449	ENSOGAG00000030687	-	83	33.916
ENSOGAG00000005621	MSI2	58	35.165	ENSOGAG00000029974	-	57	34.066
ENSOGAG00000005621	MSI2	55	36.471	ENSOGAG00000026163	-	59	34.444
ENSOGAG00000005621	MSI2	55	48.555	ENSOGAG00000030251	HNRNPAB	55	47.312
ENSOGAG00000005621	MSI2	54	45.349	ENSOGAG00000004075	HNRNPD	64	38.889
ENSOGAG00000005621	MSI2	50	36.774	ENSOGAG00000031644	-	53	36.774
ENSOGAG00000005621	MSI2	54	40.000	ENSOGAG00000025754	HNRNPA0	77	37.912
ENSOGAG00000005621	MSI2	55	46.821	ENSOGAG00000002501	-	54	41.667
ENSOGAG00000005621	MSI2	60	36.126	ENSOGAG00000024995	-	62	35.829

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	ENSG00000153944	MSI2	100	90.123	Homo_sapiens
ENSOGAG00000005621	MSI2	97	89.565	ENSAPOG00000001658	msi2a	98	85.714	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000005621	MSI2	100	90.184	ENSAMEG00000002697	MSI2	100	90.184	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000005621	MSI2	100	64.516	ENSACIG00000009475	msi2a	99	64.516	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000005621	MSI2	100	85.714	ENSAPEG00000007706	msi2a	98	85.714	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000005621	MSI2	97	89.565	ENSATEG00000010498	msi2a	98	85.714	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	88.489	ENSATEG00000003301	-	100	88.489	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000005621	MSI2	95	91.549	ENSACAG00000005452	MSI2	74	95.455	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	ENSANAG00000037827	MSI2	94	95.440	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000005621	MSI2	97	89.130	ENSACLG00000007752	msi2a	98	85.390	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000005621	MSI2	100	91.558	ENSAMXG00000010474	msi2b	95	91.558	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	90.584	ENSAMXG00000032796	msi2a	94	88.636	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000005621	MSI2	100	95.130	ENSBTAG00000004406	MSI2	95	95.130	Bos_taurus
ENSOGAG00000005621	MSI2	69	58.772	WBGene00003423	msi-1	71	58.772	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	ENSCJAG00000013998	MSI2	94	95.440	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	88.715	ENSCAFG00020025620	MSI2	81	88.715	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.114	ENSCHIG00000016580	MSI2	94	95.114	Capra_hircus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	90.426	ENSCPOG00000034042	MSI2	99	90.426	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	ENSCCAG00000033927	MSI2	94	95.440	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	ENSCATG00000040879	MSI2	94	95.440	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	90.154	ENSCLAG00000014325	MSI2	94	90.154	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	ENSCSAG00000005633	MSI2	94	95.440	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000005621	MSI2	95	69.643	ENSCHOG00000008660	MSI2	100	68.571	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	92.958	ENSCPBG00000009942	MSI2	95	86.517	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000005621	MSI2	93	48.293	ENSCING00000018579	-	97	47.085	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000005621	MSI2	68	61.261	ENSCSAVG00000010397	-	71	60.262	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	93.333	ENSCANG00000036414	MSI2	100	90.123	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.130	ENSCGRG00001013330	Msi2	94	95.130	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000005621	MSI2	100	89.908	ENSCGRG00000003141	Msi2	98	89.908	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	84.459	ENSCSEG00000003266	-	92	84.459	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000005621	MSI2	78	74.576	ENSCSEG00000013557	msi2a	83	72.254	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000005621	MSI2	58	73.292	ENSCSEG00000013549	msi2a	67	90.678	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	83.062	ENSCVAG00000017075	msi2a	97	85.034	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000005621	MSI2	97	90.870	ENSDARG00000032614	msi2b	100	96.429	Danio_rerio
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	73.025	ENSDARG00000033901	msi2a	95	73.025	Danio_rerio
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.139	ENSDNOG00000014501	MSI2	100	95.139	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000005621	MSI2	78	87.778	ENSDORG00000005394	Msi2	84	86.364	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	54.467	FBgn0260943	Rbp6	88	61.111	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000005621	MSI2	72	68.421	ENSETEG00000012450	-	64	68.421	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000005621	MSI2	94	64.839	ENSEBUG00000006732	msi2a	87	63.226	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	91.262	ENSEASG00005002965	MSI2	96	83.476	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	92.609	ENSECAG00000011435	MSI2	94	87.688	Equus_caballus
ENSOGAG00000005621	MSI2	87	79.842	ENSEEUG00000007810	MSI2	100	79.842	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	84.026	ENSELUG00000001361	msi2b	93	84.026	Esox_lucius
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	90.411	ENSELUG00000011747	msi2a	93	90.411	Esox_lucius
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	ENSFCAG00000041686	MSI2	94	95.440	Felis_catus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	90.154	ENSFDAG00000016118	MSI2	100	90.154	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000005621	MSI2	97	89.565	ENSFHEG00000000084	msi2a	98	85.390	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000005621	MSI2	52	96.386	ENSGMOG00000007596	-	80	96.386	Gadus_morhua
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	88.615	ENSGALG00000005567	MSI2	94	88.615	Gallus_gallus
ENSOGAG00000005621	MSI2	96	76.000	ENSGAFG00000006974	msi2a	97	76.254	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	92.958	ENSGAGG00000016542	MSI2	100	85.526	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	93.333	ENSGGOG00000013182	MSI2	100	90.123	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000005621	MSI2	97	89.130	ENSHBUG00000020800	msi2a	98	85.390	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	81.173	ENSHGLG00000012444	MSI2	93	80.556	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000005621	MSI2	76	90.256	ENSHGLG00100003744	MSI2	100	90.256	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000005621	MSI2	97	89.130	ENSHCOG00000000266	msi2a	91	81.703	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000005621	MSI2	94	81.385	ENSHCOG00000017241	-	64	81.991	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	89.384	ENSIPUG00000021097	msi2a	93	88.014	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000005621	MSI2	95	91.156	ENSIPUG00000003732	msi2b	93	86.986	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	90.426	ENSSTOG00000007884	MSI2	99	90.426	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000005621	MSI2	76	84.492	ENSJJAG00000006292	-	100	84.153	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000005621	MSI2	95	88.435	ENSKMAG00000009494	msi2a	89	88.737	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000005621	MSI2	97	89.565	ENSLBEG00000007061	msi2a	98	85.714	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	60.704	ENSLBEG00000026223	-	100	60.704	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000005621	MSI2	54	96.471	ENSLACG00000016798	MSI2	84	96.471	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	75.410	ENSLOCG00000004675	msi2b	95	75.683	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	93.333	ENSMFAG00000003775	MSI2	100	90.123	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	93.333	ENSMMUG00000002069	MSI2	100	90.123	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	ENSMNEG00000045275	MSI2	94	95.440	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	93.333	ENSMLEG00000033888	MSI2	100	90.123	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000005621	MSI2	96	89.231	ENSMAMG00000002488	-	88	85.959	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000005621	MSI2	97	89.565	ENSMAMG00000010503	msi2a	98	83.495	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	89.577	ENSMZEG00005007676	msi2a	94	89.577	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	89.877	ENSMAUG00000003862	Msi2	94	89.877	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	ENSMICG00000013598	-	94	95.440	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	73.077	ENSMICG00000032913	-	93	74.038	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	90.154	ENSMOCG00000005820	Msi2	94	90.154	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000005621	MSI2	96	81.017	ENSMMOG00000008348	msi2a	91	81.447	Mola_mola
ENSOGAG00000005621	MSI2	76	88.718	ENSMODG00000014790	MSI2	100	88.718	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000005621	MSI2	100	82.468	ENSMALG00000000071	msi2a	98	82.468	Monopterus_albus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	MGP_CAROLIEiJ_G0016948	Msi2	100	100.000	Mus_caroli
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	ENSMUSG00000069769	Msi2	100	100.000	Mus_musculus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	MGP_PahariEiJ_G0018079	Msi2	100	100.000	Mus_pahari
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	MGP_SPRETEiJ_G0017795	Msi2	100	100.000	Mus_spretus
ENSOGAG00000005621	MSI2	100	95.455	ENSMPUG00000015377	MSI2	95	95.455	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000005621	MSI2	100	95.130	ENSMLUG00000007865	MSI2	95	95.130	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	90.154	ENSNGAG00000017807	Msi2	94	90.154	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000005621	MSI2	100	85.390	ENSNBRG00000014596	msi2a	98	85.390	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	93.333	ENSNLEG00000008059	MSI2	100	89.711	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000005621	MSI2	72	79.605	ENSOPRG00000000872	-	64	79.605	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	90.154	ENSODEG00000011974	MSI2	94	90.154	Octodon_degus
ENSOGAG00000005621	MSI2	55	91.057	ENSONIG00000001972	msi2a	68	91.803	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000005621	MSI2	94	92.857	ENSOANG00000005667	MSI2	70	92.857	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000005621	MSI2	100	95.455	ENSOCUG00000010440	MSI2	95	95.455	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	89.384	ENSORLG00000009671	msi2a	94	89.384	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	89.384	ENSORLG00020021556	msi2a	94	89.384	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	89.384	ENSORLG00015004592	msi2a	94	89.384	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	88.040	ENSOMEG00000000146	msi2a	98	88.040	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	90.123	ENSPPAG00000037697	MSI2	100	90.123	Pan_paniscus
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	ENSPPRG00000001848	MSI2	94	95.440	Panthera_pardus
ENSOGAG00000005621	MSI2	72	77.523	ENSPTIG00000021873	-	84	77.523	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	89.711	ENSPTIG00000021678	MSI2	96	89.711	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	93.333	ENSPTRG00000009437	MSI2	100	90.123	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.440	ENSPANG00000022319	MSI2	94	95.440	Papio_anubis
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ENSOGAG00000005621	MSI2	99	88.217	ENSPCIG00000006063	MSI2	94	86.486	Phascolarctos_cinereus
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ENSOGAG00000005621	MSI2	97	89.565	ENSSMAG00000018484	msi2a	98	85.714	Scophthalmus_maximus
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ENSOGAG00000005621	MSI2	99	95.189	ENSVVUG00000011783	MSI2	94	90.154	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000005621	MSI2	95	87.500	ENSXCOG00000006113	msi2a	83	87.500	Xiphophorus_couchianus
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