EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000006259 (Gene tree)
Gene ID: 100945429
Gene Symbol: PUF60
Alias: -
Full Name: poly(U) binding splicing factor 60
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7740 bases
Position: chrGL873764.1:1070447-1078186
Accession: 17042
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000005592	RRM_1	PF00076.22	8.1e-44	1	2
ENSOGAP00000005592	RRM_1	PF00076.22	8.1e-44	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000006263	PUF60-201	1729	-	ENSOGAP00000005592	559 (aa)	-	H0WTU0

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.387	ENSG00000179950	PUF60	100	99.419	Homo_sapiens
ENSOGAG00000006259	PUF60	94	85.795	ENSAPOG00000001713	puf60b	99	85.795	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.641	ENSAMEG00000006406	PUF60	99	97.641	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	77.351	ENSACIG00000003263	-	99	77.778	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	85.605	ENSACIG00000021705	puf60b	100	85.605	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	85.769	ENSAOCG00000005395	puf60b	100	86.564	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000006259	PUF60	96	80.037	ENSAOCG00000015558	-	99	81.939	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000006259	PUF60	94	80.303	ENSAPEG00000011923	puf60b	99	80.303	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	72.745	ENSAPEG00000001836	-	99	74.194	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000006259	PUF60	94	85.606	ENSATEG00000001730	puf60b	99	85.606	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	81.143	ENSATEG00000006303	-	99	81.524	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	98.659	ENSAPLG00000010150	PUF60	100	98.659	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000006259	PUF60	94	96.395	ENSACAG00000001645	PUF60	97	96.395	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000006259	PUF60	100	96.786	ENSANAG00000018626	PUF60	100	99.419	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	85.605	ENSACLG00000004462	puf60b	100	85.605	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	76.449	ENSAMXG00000041030	puf60b	100	74.719	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	84.299	ENSAMXG00000036570	puf60a	100	81.455	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.039	ENSBTAG00000037493	PUF60	99	99.617	Bos_taurus
ENSOGAG00000006259	PUF60	74	50.667	WBGene00004389	rnp-6	83	51.485	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.691	ENSCJAG00000021485	PUF60	98	99.617	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000006259	PUF60	100	99.107	ENSCAFG00000001400	PUF60	100	99.107	Canis_familiaris
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.569	ENSCAFG00020018754	PUF60	98	99.808	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000006259	PUF60	100	99.106	ENSCHIG00000001618	PUF60	93	99.106	Capra_hircus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.691	ENSTSYG00000011912	PUF60	100	99.806	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	93.537	ENSCPOG00000014613	PUF60	95	94.195	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.687	ENSCCAG00000007744	PUF60	98	99.425	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.387	ENSCATG00000035405	PUF60	98	99.425	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.046	ENSCLAG00000009154	PUF60	99	98.046	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	99.419	ENSCSAG00000008878	PUF60	100	99.419	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	98.659	ENSCPBG00000005595	PUF60	98	98.659	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000006259	PUF60	59	59.882	ENSCING00000002156	-	87	59.882	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	48.237	ENSCING00000008436	-	98	48.218	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000006259	PUF60	90	49.703	ENSCSAVG00000004765	-	97	49.304	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000006259	PUF60	90	55.556	ENSCSAVG00000001385	-	99	55.192	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000006259	PUF60	81	95.796	ENSCANG00000041843	PUF60	100	99.520	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.336	ENSCGRG00001017442	Puf60	99	97.336	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.683	ENSCGRG00000003717	Puf60	99	97.683	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	85.009	ENSCSEG00000019887	puf60b	93	84.820	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	72.467	ENSCSEG00000014845	-	89	74.761	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	84.645	ENSCVAG00000009386	puf60b	100	85.797	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000006259	PUF60	84	80.000	ENSCVAG00000001560	-	98	79.747	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	78.947	ENSDARG00000001241	puf60b	99	96.032	Danio_rerio
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	86.932	ENSDARG00000032175	puf60a	99	94.043	Danio_rerio
ENSOGAG00000006259	PUF60	100	81.705	ENSDNOG00000043278	PUF60	100	81.705	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	99.819	ENSDORG00000004585	Puf60	100	99.819	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000006259	PUF60	78	62.034	FBgn0028577	hfp	99	46.346	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000006259	PUF60	90	70.179	ENSEBUG00000005470	-	88	69.781	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000006259	PUF60	94	60.535	ENSEBUG00000014291	puf60b	85	63.851	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	99.638	ENSEASG00005009695	PUF60	99	99.638	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	99.458	ENSECAG00000024681	PUF60	99	99.458	Equus_caballus
ENSOGAG00000006259	PUF60	96	83.853	ENSELUG00000018443	-	98	85.417	Esox_lucius
ENSOGAG00000006259	PUF60	94	83.681	ENSELUG00000006507	puf60b	99	80.586	Esox_lucius
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.513	ENSFCAG00000001045	PUF60	100	99.419	Felis_catus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	86.015	ENSFALG00000001136	PUF60	98	87.165	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.691	ENSFDAG00000017177	PUF60	99	97.691	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	84.250	ENSFHEG00000020046	puf60b	100	86.180	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000006259	PUF60	88	79.317	ENSFHEG00000021687	PUF60	100	80.164	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	71.992	ENSGMOG00000006392	puf60b	100	71.241	Gadus_morhua
ENSOGAG00000006259	PUF60	62	98.547	ENSGALG00000039901	PUF60	94	98.547	Gallus_gallus
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	79.537	ENSGAFG00000004334	-	99	78.776	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	83.491	ENSGAFG00000021040	puf60b	100	85.605	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	73.535	ENSGACG00000004717	puf60b	98	72.865	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	70.385	ENSGACG00000001484	-	100	69.423	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	98.654	ENSGAGG00000013289	PUF60	92	98.659	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.387	ENSGGOG00000004646	PUF60	98	99.425	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	84.820	ENSHBUG00000015118	puf60b	100	85.605	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	81.784	ENSHBUG00000009634	-	99	81.784	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.691	ENSHGLG00000006111	PUF60	99	97.691	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.691	ENSHGLG00100012362	PUF60	99	97.691	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000006259	PUF60	91	66.798	ENSHCOG00000000378	-	99	65.038	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	82.320	ENSHCOG00000015541	puf60b	100	81.919	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	82.420	ENSIPUG00000002453	puf60a	99	82.798	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	78.759	ENSIPUG00000004660	puf60b	99	78.531	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.746	ENSSTOG00000025037	PUF60	99	98.746	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.039	ENSJJAG00000001076	Puf60	99	98.039	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	78.450	ENSKMAG00000010106	-	100	75.933	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	85.029	ENSKMAG00000016745	puf60b	100	86.180	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000006259	PUF60	96	84.416	ENSLBEG00000012505	puf60b	100	84.416	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000006259	PUF60	65	90.909	ENSLACG00000005456	PUF60	99	90.634	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000006259	PUF60	94	90.684	ENSLOCG00000010106	puf60b	99	89.544	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000006259	PUF60	100	96.959	ENSLAFG00000022929	PUF60	100	97.312	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.387	ENSMFAG00000043373	PUF60	99	99.425	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.211	ENSMMUG00000013558	PUF60	98	99.425	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.387	ENSMNEG00000031099	PUF60	98	99.425	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	99.419	ENSMLEG00000040009	PUF60	100	99.419	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000006259	PUF60	94	85.150	ENSMAMG00000010394	puf60b	100	83.925	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	82.732	ENSMAMG00000019476	-	99	82.163	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	81.973	ENSMZEG00005019425	-	99	81.973	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	85.605	ENSMZEG00005018515	puf60b	100	85.605	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	98.659	ENSMGAG00000013070	PUF60	98	98.659	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000006259	PUF60	88	80.561	ENSMAUG00000018549	-	95	80.800	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000006259	PUF60	71	98.000	ENSMAUG00000014267	-	98	98.000	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.387	ENSMICG00000012226	PUF60	99	99.808	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.561	ENSMOCG00000018780	Puf60	99	98.561	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000006259	PUF60	92	85.988	ENSMMOG00000004217	puf60b	100	85.988	Mola_mola
ENSOGAG00000006259	PUF60	94	72.952	ENSMMOG00000018059	-	99	76.712	Mola_mola
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	96.774	ENSMODG00000009161	PUF60	99	96.774	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	80.455	ENSMALG00000000200	-	99	79.245	Monopterus_albus
ENSOGAG00000006259	PUF60	94	78.030	ENSMALG00000006797	puf60b	99	78.030	Monopterus_albus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.336	MGP_CAROLIEiJ_G0019910	Puf60	99	97.336	Mus_caroli
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.336	ENSMUSG00000002524	Puf60	99	97.336	Mus_musculus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.336	MGP_PahariEiJ_G0019920	Puf60	99	97.336	Mus_pahari
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.336	MGP_SPRETEiJ_G0020812	Puf60	99	97.336	Mus_spretus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	99.275	ENSMPUG00000008137	PUF60	98	99.275	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000006259	PUF60	100	98.569	ENSMLUG00000000238	-	99	98.569	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	92.529	ENSMLUG00000013032	-	98	92.529	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	97.691	ENSNGAG00000000712	Puf60	100	99.612	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	82.443	ENSNBRG00000017223	-	99	82.129	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000006259	PUF60	75	84.235	ENSNBRG00000013047	puf60b	97	84.235	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000006259	PUF60	99	98.387	ENSNLEG00000002156	PUF60	98	99.425	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000006259	PUF60	69	99.659	ENSOPRG00000002147	PUF60	75	99.659	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000006259	PUF60	90	74.359	ENSODEG00000015513	-	99	71.563	Octodon_degus
ENSOGAG00000006259	PUF60	74	100.000	ENSODEG00000014024	-	99	100.000	Octodon_degus
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ENSOGAG00000006259	PUF60	92	81.766	ENSXCOG00000012355	puf60b	100	82.917	Xiphophorus_couchianus
ENSOGAG00000006259	PUF60	94	77.905	ENSXMAG00000010507	-	99	77.143	Xiphophorus_maculatus
ENSOGAG00000006259	PUF60	93	84.250	ENSXMAG00000001862	puf60b	100	86.180	Xiphophorus_maculatus