EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000008922 (Gene tree)
Gene ID: 100942725
Gene Symbol: RPUSD4
Alias: -
Full Name: RNA pseudouridine synthase D4
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8784 bases
Position: chrGL873616.1:373090-381873
Accession: 100942725
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000007997	PseudoU_synth_2	PF00849.22	1.5e-32	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000008924	RPUSD4-201	1137	-	ENSOGAP00000007997	378 (aa)	XP_003795934	H0WZH8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	71	30.034	ENSOGAG00000012592	RPUSD3	87	30.034

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	81.217	ENSG00000165526	RPUSD4	100	81.217	Homo_sapiens
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	88	52.199	ENSAPOG00000011024	rpusd4	81	53.870	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	81	78.873	ENSAMEG00000005953	-	97	78.873	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	98	81.183	ENSAMEG00000000127	-	98	81.183	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	86	50.751	ENSACIG00000003533	rpusd4	89	53.947	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	89	51.884	ENSAOCG00000015409	rpusd4	81	53.354	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	89	52.174	ENSAPEG00000018935	rpusd4	81	53.659	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	86	51.360	ENSATEG00000008059	rpusd4	76	53.571	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	73	62.724	ENSAPLG00000013250	RPUSD4	99	61.695	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	95	59.452	ENSACAG00000000189	RPUSD4	88	64.596	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	99	79.893	ENSANAG00000024050	RPUSD4	100	79.893	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	88	52.212	ENSACLG00000020996	rpusd4	83	53.374	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	84	52.038	ENSAMXG00000031479	rpusd4	89	52.038	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	78.892	ENSBTAG00000020900	RPUSD4	100	78.628	Bos_taurus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	98	79.784	ENSCJAG00000042850	RPUSD4	93	79.784	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	80.418	ENSCAFG00000010488	RPUSD4	100	80.418	Canis_familiaris
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	80.418	ENSCAFG00020010621	RPUSD4	100	80.418	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	78.947	ENSCHIG00000009975	RPUSD4	100	78.684	Capra_hircus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	84.127	ENSTSYG00000008456	RPUSD4	100	84.127	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	68	80.233	ENSCAPG00000006040	RPUSD4	100	80.233	Cavia_aperea
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	79.365	ENSCPOG00000014971	RPUSD4	100	79.365	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	99	79.625	ENSCCAG00000027838	RPUSD4	100	79.625	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	80.952	ENSCATG00000041570	RPUSD4	100	80.952	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	82.804	ENSCLAG00000016553	RPUSD4	100	82.804	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	80.952	ENSCSAG00000002274	RPUSD4	100	80.952	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	75	85.159	ENSCHOG00000010249	RPUSD4	100	85.159	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	76	69.896	ENSCPBG00000011175	RPUSD4	99	69.896	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	74	42.907	ENSCSAVG00000000872	-	56	42.907	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	79.630	ENSCANG00000039684	RPUSD4	100	79.630	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	79.101	ENSCGRG00001024141	Rpusd4	100	79.101	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	79.101	ENSCGRG00000014415	Rpusd4	100	79.101	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	51	44.615	ENSCSEG00000006462	-	76	48.295	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	86	52.266	ENSCVAG00000008761	rpusd4	83	52.454	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	86	52.568	ENSCVAG00000000392	rpusd4	92	52.761	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	89	48.974	ENSDARG00000012674	rpusd4	89	50.784	Danio_rerio
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	97	78.904	ENSDNOG00000020026	RPUSD4	97	78.904	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	80.159	ENSDORG00000016717	Rpusd4	100	80.159	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	98	77.027	ENSETEG00000013953	RPUSD4	98	77.027	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	82.804	ENSEASG00005022982	RPUSD4	100	82.804	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	82.275	ENSECAG00000000557	RPUSD4	100	82.275	Equus_caballus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	82	81.053	ENSEEUG00000014036	RPUSD4	82	81.053	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	90	54.420	ENSELUG00000008075	rpusd4	80	59.804	Esox_lucius
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	79.894	ENSFCAG00000029789	RPUSD4	100	79.894	Felis_catus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	89	59.763	ENSFALG00000005171	RPUSD4	99	59.763	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	80.688	ENSFDAG00000014307	RPUSD4	100	80.688	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	88	52.381	ENSFHEG00000004329	rpusd4	83	52.941	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	85	51.077	ENSGMOG00000017726	rpusd4	95	51.250	Gadus_morhua
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	87	59.701	ENSGALG00000024326	RPUSD4	93	61.145	Gallus_gallus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	89	48.555	ENSGAFG00000021559	rpusd4	84	49.394	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	77	54.209	ENSGACG00000001657	rpusd4	97	53.047	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	89	65.294	ENSGAGG00000000132	RPUSD4	94	65.294	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	81.481	ENSGGOG00000016494	RPUSD4	100	81.481	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	88	52.212	ENSHBUG00000022838	rpusd4	83	53.374	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	80.952	ENSHGLG00000002285	RPUSD4	100	80.952	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	80.952	ENSHGLG00100006385	RPUSD4	100	80.952	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	86	52.568	ENSHCOG00000006612	rpusd4	82	52.923	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	95	49.315	ENSIPUG00000023879	rusd4	83	52.960	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	96	82.692	ENSSTOG00000025280	RPUSD4	99	82.692	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	99	81.769	ENSJJAG00000018673	Rpusd4	100	81.769	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	86	53.776	ENSKMAG00000021805	rpusd4	84	53.988	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	93	48.739	ENSLBEG00000020394	rpusd4	90	52.308	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	85	63.272	ENSLACG00000011028	RPUSD4	80	63.636	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	86	49.697	ENSLOCG00000003124	rpusd4	85	50.156	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	79.365	ENSLAFG00000005211	RPUSD4	100	79.365	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	81.481	ENSMFAG00000039513	RPUSD4	100	81.481	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	81.481	ENSMMUG00000007933	RPUSD4	100	81.481	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	81.481	ENSMNEG00000027414	RPUSD4	100	81.481	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	80.688	ENSMLEG00000042461	RPUSD4	100	80.688	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	93	47.778	ENSMAMG00000023839	rpusd4	85	50.152	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	88	52.212	ENSMZEG00005011999	rpusd4	83	53.374	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	74	64.286	ENSMGAG00000000840	RPUSD4	99	61.111	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	79.365	ENSMAUG00000010280	Rpusd4	100	79.365	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	84.127	ENSMICG00000015979	RPUSD4	100	84.127	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	99	77.212	ENSMOCG00000000661	Rpusd4	99	77.212	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	78	55.853	ENSMMOG00000021731	rpusd4	88	55.853	Mola_mola
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	86	75.926	ENSMODG00000004521	RPUSD4	83	75.926	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	80	54.072	ENSMALG00000005839	rpusd4	96	52.830	Monopterus_albus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	77.249	MGP_CAROLIEiJ_G0031954	Rpusd4	100	77.249	Mus_caroli
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	99	77.273	ENSMUSG00000032044	Rpusd4	99	77.273	Mus_musculus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	78.571	MGP_PahariEiJ_G0014819	Rpusd4	100	78.571	Mus_pahari
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	93	81.481	MGP_SPRETEiJ_G0033078	Rpusd4	99	77.540	Mus_spretus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	99	78.457	ENSMPUG00000006608	RPUSD4	99	78.457	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	90	83.090	ENSMLUG00000017328	-	97	78.630	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	67	85.771	ENSMLUG00000029348	-	99	85.771	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	98	81.183	ENSNGAG00000020847	Rpusd4	98	81.183	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	86	53.495	ENSNBRG00000005207	rpusd4	94	53.681	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	81.217	ENSNLEG00000007465	RPUSD4	100	81.217	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	96	68.871	ENSMEUG00000004370	RPUSD4	99	67.647	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	67	60.714	ENSOPRG00000013141	-	95	60.714	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	82.011	ENSODEG00000004577	RPUSD4	100	82.011	Octodon_degus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	89	52.187	ENSONIG00000018879	rpusd4	87	53.374	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	77	70.508	ENSOANG00000007247	RPUSD4	95	70.370	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	81.003	ENSOCUG00000017039	RPUSD4	100	81.003	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	79	52.787	ENSORLG00000002750	rpusd4	84	52.787	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	79	52.459	ENSORLG00020002044	rpusd4	76	52.459	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	79	52.787	ENSORLG00015020034	rpusd4	76	52.787	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	88	52.381	ENSOMEG00000004861	rpusd4	80	52.568	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	97	80.654	ENSOARG00000012238	RPUSD4	98	79.412	Ovis_aries
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	81.481	ENSPPAG00000042883	RPUSD4	93	81.481	Pan_paniscus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	79.894	ENSPPRG00000003081	RPUSD4	100	79.894	Panthera_pardus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	79.894	ENSPTIG00000012059	RPUSD4	100	79.894	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	97	83.014	ENSPTRG00000004454	RPUSD4	97	83.014	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	81.481	ENSPANG00000015040	RPUSD4	100	81.481	Papio_anubis
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	89	57.522	ENSPKIG00000023986	rpusd4	82	58.696	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	79	68.333	ENSPSIG00000014268	RPUSD4	95	68.333	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	85	51.064	ENSPMGG00000002806	rpusd4	89	51.084	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	100	72.487	ENSPEMG00000000278	Rpusd4	100	72.487	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	82	44.477	ENSPMAG00000008183	rpusd4	99	44.477	Petromyzon_marinus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	90	74.926	ENSPCIG00000010212	RPUSD4	93	74.926	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000008922	RPUSD4	89	50.143	ENSPFOG00000019030	rpusd4	87	51.051	Poecilia_formosa
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ENSOGAG00000008922	RPUSD4	89	49.568	ENSPMEG00000017534	rpusd4	84	50.453	Poecilia_mexicana
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