EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000009011 (Gene tree)
Gene ID: 100951053
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: SBDS%2C ribosome maturation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6770 bases
Position: chrGL873596.1:8309044-8315813
Accession: 100951053
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000008078	SBDS	PF01172.18	2.6e-33	1	1
ENSOGAP00000008078	SBDS_C	PF09377.10	2e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000009013	-	753	-	ENSOGAP00000008078	250 (aa)	XP_012663332	H0WZP8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000009011	-	100	83.200	ENSOGAG00000015036	-	100	83.200

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSG00000126524	SBDS	100	98.400	Homo_sapiens
ENSOGAG00000009011	-	99	83.534	ENSAPOG00000014285	sbds	100	83.534	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000009011	-	100	98.000	ENSAMEG00000018167	SBDS	100	98.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000009011	-	99	83.333	ENSACIG00000007308	sbds	100	83.333	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000009011	-	99	83.534	ENSAOCG00000016770	sbds	100	83.534	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000009011	-	99	83.936	ENSAPEG00000015897	sbds	100	83.936	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000009011	-	99	83.936	ENSATEG00000006901	sbds	100	83.936	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000009011	-	83	98.068	ENSANAG00000037501	-	100	98.068	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000009011	-	92	90.909	ENSANAG00000024342	-	97	90.909	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000009011	-	99	84.739	ENSACLG00000018750	sbds	100	84.739	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000009011	-	100	84.800	ENSAMXG00000005361	sbds	100	84.800	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000009011	-	100	98.000	ENSBTAG00000004051	SBDS	100	98.000	Bos_taurus
ENSOGAG00000009011	-	98	57.317	WBGene00021063	sbds-1	97	57.317	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000009011	-	100	97.200	ENSCJAG00000041007	SBDS	100	97.200	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000009011	-	100	95.238	ENSCAFG00000010797	SBDS	100	95.238	Canis_familiaris
ENSOGAG00000009011	-	100	97.600	ENSCAFG00020005357	SBDS	100	97.600	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000009011	-	100	98.800	ENSCHIG00000026854	SBDS	100	98.800	Capra_hircus
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSTSYG00000033822	SBDS	100	98.400	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000009011	-	66	98.171	ENSCAPG00000006634	SBDS	100	98.171	Cavia_aperea
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSCPOG00000036143	SBDS	100	98.400	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000009011	-	100	98.000	ENSCCAG00000020671	SBDS	100	98.000	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSCATG00000039026	SBDS	100	98.400	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000009011	-	99	71.371	ENSCLAG00000002113	-	99	71.371	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000009011	-	100	98.000	ENSCLAG00000005721	-	100	98.000	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSCSAG00000018275	SBDS	100	98.400	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000009011	-	100	94.000	ENSCHOG00000003795	SBDS	100	94.000	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000009011	-	100	89.600	ENSCPBG00000014893	SBDS	100	89.600	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000009011	-	99	66.800	ENSCSAVG00000011811	-	100	66.800	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000009011	-	100	98.000	ENSCANG00000032368	SBDS	100	98.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000009011	-	66	95.732	ENSCGRG00001019886	Sbds	100	95.732	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000009011	-	83	96.618	ENSCGRG00000009211	Sbds	100	96.618	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000009011	-	99	81.928	ENSCSEG00000005798	sbds	100	81.928	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000009011	-	99	82.329	ENSCVAG00000001053	sbds	100	82.329	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000009011	-	100	84.400	ENSDARG00000027803	sbds	100	84.400	Danio_rerio
ENSOGAG00000009011	-	100	98.000	ENSDNOG00000041174	SBDS	100	98.000	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000009011	-	100	96.800	ENSDORG00000026218	Sbds	100	96.800	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000009011	-	90	59.211	FBgn0035714	CG8549	99	59.438	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000009011	-	93	58.798	ENSEBUG00000015780	sbds	100	58.798	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000009011	-	100	98.800	ENSEASG00005008821	SBDS	100	98.800	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000009011	-	100	98.800	ENSECAG00000008202	SBDS	100	98.800	Equus_caballus
ENSOGAG00000009011	-	83	75.000	ENSEEUG00000004768	SBDS	100	75.000	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000009011	-	100	82.800	ENSELUG00000008382	sbds	100	82.800	Esox_lucius
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSFCAG00000022142	SBDS	100	98.400	Felis_catus
ENSOGAG00000009011	-	100	89.200	ENSFALG00000013808	SBDS	100	89.200	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSFDAG00000018947	-	100	98.400	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000009011	-	99	79.116	ENSFHEG00000000708	sbds	100	79.116	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000009011	-	100	84.400	ENSGMOG00000018356	sbds	99	84.400	Gadus_morhua
ENSOGAG00000009011	-	100	89.200	ENSGALG00000027989	SBDS	100	89.200	Gallus_gallus
ENSOGAG00000009011	-	92	79.130	ENSGAFG00000014204	sbds	100	79.130	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000009011	-	99	82.731	ENSGACG00000012697	sbds	100	82.731	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000009011	-	86	90.187	ENSGAGG00000022402	SBDS	100	90.187	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000009011	-	96	78.008	ENSGGOG00000040023	-	92	78.008	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000009011	-	99	84.739	ENSHBUG00000002660	sbds	100	84.739	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000009011	-	100	96.800	ENSHGLG00000009671	SBDS	100	96.800	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000009011	-	100	96.800	ENSHGLG00100011332	SBDS	100	96.800	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000009011	-	99	81.124	ENSHCOG00000018606	sbds	100	81.124	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000009011	-	100	85.600	ENSIPUG00000006536	sbds	100	85.600	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000009011	-	100	93.600	ENSJJAG00000012033	-	100	93.600	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000009011	-	100	69.170	ENSJJAG00000003934	-	100	69.170	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000009011	-	99	83.133	ENSKMAG00000018542	sbds	100	83.133	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000009011	-	99	81.124	ENSLBEG00000016687	sbds	100	81.124	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000009011	-	100	70.866	ENSLACG00000018916	SBDS	100	70.866	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000009011	-	100	88.000	ENSLOCG00000004073	sbds	100	88.000	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000009011	-	100	96.800	ENSLAFG00000008763	SBDS	100	96.800	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSMFAG00000032620	SBDS	100	98.400	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSMMUG00000045653	SBDS	100	98.400	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSMNEG00000031523	SBDS	100	98.400	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000009011	-	100	74.803	ENSMLEG00000036826	SBDS	100	74.803	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000009011	-	99	83.534	ENSMAMG00000016062	sbds	100	83.534	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000009011	-	99	84.739	ENSMZEG00005024385	sbds	100	84.739	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000009011	-	100	89.200	ENSMGAG00000002119	SBDS	100	89.200	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000009011	-	99	76.707	ENSMAUG00000022214	-	100	76.707	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000009011	-	100	98.800	ENSMICG00000014366	SBDS	100	98.800	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000009011	-	100	97.600	ENSMOCG00000011739	Sbds	100	97.600	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000009011	-	99	74.000	ENSMMOG00000005061	sbds	100	73.600	Mola_mola
ENSOGAG00000009011	-	100	96.400	ENSMODG00000006644	SBDS	100	96.400	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000009011	-	99	83.534	ENSMALG00000010219	sbds	100	83.534	Monopterus_albus
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	MGP_CAROLIEiJ_G0027800	Sbds	100	100.000	Mus_caroli
ENSOGAG00000009011	-	100	98.000	ENSMUSG00000025337	Sbds	100	100.000	Mus_musculus
ENSOGAG00000009011	-	100	98.000	MGP_PahariEiJ_G0024384	Sbds	100	100.000	Mus_pahari
ENSOGAG00000009011	-	100	98.000	MGP_SPRETEiJ_G0028798	Sbds	100	100.000	Mus_spretus
ENSOGAG00000009011	-	67	92.262	ENSMPUG00000016192	SBDS	97	92.262	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000009011	-	73	96.154	ENSMLUG00000013575	SBDS	100	96.154	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000009011	-	100	97.600	ENSNGAG00000012093	Sbds	100	97.600	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000009011	-	99	84.739	ENSNBRG00000017027	sbds	100	84.739	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSNLEG00000013288	SBDS	100	98.400	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000009011	-	100	95.200	ENSOPRG00000008721	SBDS	100	95.200	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000009011	-	99	77.108	ENSODEG00000001116	-	99	77.108	Octodon_degus
ENSOGAG00000009011	-	99	72.691	ENSODEG00000000137	-	85	76.000	Octodon_degus
ENSOGAG00000009011	-	100	88.000	ENSODEG00000019253	-	84	88.000	Octodon_degus
ENSOGAG00000009011	-	99	83.936	ENSONIG00000005874	sbds	100	83.936	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000009011	-	83	92.271	ENSOANG00000007674	-	100	92.271	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000009011	-	100	96.000	ENSOCUG00000003170	SBDS	100	96.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000009011	-	99	81.124	ENSORLG00000023489	sbds	100	81.124	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000009011	-	99	80.723	ENSORLG00020019282	sbds	100	80.723	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000009011	-	99	80.723	ENSORLG00015008005	sbds	100	80.723	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000009011	-	99	81.526	ENSOMEG00000022747	sbds	100	81.526	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000009011	-	100	98.800	ENSOARG00000010609	SBDS	100	98.800	Ovis_aries
ENSOGAG00000009011	-	100	97.600	ENSPPAG00000043889	-	100	97.600	Pan_paniscus
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSPPRG00000002307	SBDS	100	98.400	Panthera_pardus
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSPTIG00000021308	SBDS	100	98.400	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000009011	-	100	83.600	ENSPTRG00000050835	-	100	83.600	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000009011	-	87	95.392	ENSPTRG00000048174	-	96	95.392	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000009011	-	100	83.200	ENSPTRG00000047744	-	100	83.200	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSPTRG00000019254	SBDS	100	98.400	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000009011	-	100	98.000	ENSPANG00000004078	SBDS	100	98.000	Papio_anubis
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ENSOGAG00000009011	-	99	82.329	ENSPMGG00000004246	sbds	100	82.329	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSOGAG00000009011	-	99	84.337	ENSPNYG00000022403	sbds	100	84.337	Pundamilia_nyererei
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ENSOGAG00000009011	-	100	98.400	ENSRROG00000040842	-	100	98.400	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000009011	-	96	43.673	YLR022C	-	96	42.915	Saccharomyces_cerevisiae
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ENSOGAG00000009011	-	99	81.928	ENSXMAG00000006065	sbds	100	81.928	Xiphophorus_maculatus