EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000009962 (Gene tree)
Gene ID: 100960011
Gene Symbol: SYF2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 12350 bases
Position: chrGL873675.1:1520143-1532492
Accession: 100960011
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000008903	SYF2	PF08231.12	3.5e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000009967	SYF2-201	735	-	ENSOGAP00000008903	244 (aa)	XP_003799891	H0X1M4

Gene Model

Click here to download ENSOGAG00000009962's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOGAG00000009962's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.802	ENSG00000117614	SYF2	99	93.802	Homo_sapiens
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	84.685	ENSAPOG00000001174	syf2	99	81.702	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000009962	SYF2	96	93.671	ENSAMEG00000010115	-	98	93.671	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000009962	SYF2	80	95.897	ENSAMEG00000010134	-	100	95.897	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000009962	SYF2	95	78.723	ENSACIG00000023688	syf2	94	78.723	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000009962	SYF2	95	82.833	ENSAOCG00000022046	syf2	98	82.833	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000009962	SYF2	88	81.279	ENSAOCG00000010912	syf2	68	81.279	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000009962	SYF2	95	82.627	ENSAPEG00000018858	syf2	91	82.627	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000009962	SYF2	89	83.871	ENSATEG00000007745	syf2	99	80.000	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000009962	SYF2	82	88.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000009962	SYF2	68	75.449	ENSACAG00000026777	-	94	75.796	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000009962	SYF2	84	85.294	ENSACAG00000013653	-	100	85.294	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.802	ENSANAG00000032473	SYF2	99	93.802	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	81.532	ENSACLG00000019916	syf2	99	79.149	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	77.459	ENSAMXG00000004051	syf2	100	77.459	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.061	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	94.068	Bos_taurus
ENSOGAG00000009962	SYF2	85	50.952	WBGene00019402	syf-2	99	47.210	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	94.215	ENSCJAG00000046570	SYF2	99	94.215	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000009962	SYF2	89	90.278	ENSCAFG00000030331	-	92	90.278	Canis_familiaris
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.276	ENSCAFG00000012895	-	100	92.276	Canis_familiaris
ENSOGAG00000009962	SYF2	74	87.912	ENSCAFG00020021094	-	83	96.154	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.276	ENSCAFG00020021091	-	100	92.276	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.623	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.623	Capra_hircus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	94.262	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	94.262	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000009962	SYF2	81	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.443	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	93.443	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	94.215	ENSCCAG00000022459	SYF2	99	94.215	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.388	ENSCATG00000026917	SYF2	99	93.388	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	95.492	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	95.492	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.388	ENSCSAG00000000948	SYF2	99	93.388	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000009962	SYF2	74	76.796	ENSCHOG00000005273	-	100	76.796	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000009962	SYF2	92	89.286	ENSCPBG00000025073	SYF2	99	83.401	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000009962	SYF2	86	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000009962	SYF2	86	51.174	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.174	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	80.165	ENSCANG00000037322	SYF2	99	80.165	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.623	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	92.623	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000009962	SYF2	82	96.482	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	96.482	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000009962	SYF2	89	78.899	ENSCSEG00000000117	syf2	100	74.059	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	82.353	ENSCVAG00000019543	syf2	99	78.151	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	83.408	ENSDARG00000004706	syf2	94	83.408	Danio_rerio
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.878	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	93.878	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	94.262	ENSDORG00000001274	Syf2	100	94.262	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000009962	SYF2	93	56.522	FBgn0033556	CG12343	99	56.522	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	78.733	ENSETEG00000015729	SYF2	100	79.130	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000009962	SYF2	81	60.406	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.406	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	81.148	ENSEASG00005004232	-	100	81.148	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.061	ENSEASG00005004224	-	100	93.061	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000009962	SYF2	98	92.857	ENSECAG00000010440	-	99	92.857	Equus_caballus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.061	ENSECAG00000012023	-	100	93.061	Equus_caballus
ENSOGAG00000009962	SYF2	75	80.328	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	80.328	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	80.498	ENSELUG00000003465	syf2	99	80.498	Esox_lucius
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.089	ENSFCAG00000043095	-	100	93.089	Felis_catus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.089	ENSFCAG00000010324	-	85	93.089	Felis_catus
ENSOGAG00000009962	SYF2	84	85.294	ENSFALG00000000460	SYF2	89	84.404	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.852	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.852	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	60.484	ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.411	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000009962	SYF2	89	83.945	ENSGMOG00000019138	syf2	97	83.945	Gadus_morhua
ENSOGAG00000009962	SYF2	92	87.946	ENSGALG00000013639	SYF2	100	81.349	Gallus_gallus
ENSOGAG00000009962	SYF2	95	77.682	ENSGAFG00000019435	syf2	97	77.682	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000009962	SYF2	88	84.186	ENSGACG00000007305	syf2	96	80.519	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000009962	SYF2	92	89.732	ENSGAGG00000010670	SYF2	99	83.806	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	94.215	ENSGGOG00000012796	SYF2	99	94.215	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	81.532	ENSHBUG00000020477	syf2	99	79.149	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000009962	SYF2	93	84.513	ENSHGLG00000004304	-	100	79.098	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	94.672	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	94.672	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	94.672	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	94.672	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	78.689	ENSHCOG00000012904	syf2	78	78.689	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000009962	SYF2	90	84.545	ENSIPUG00000019859	syf2	92	84.545	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000009962	SYF2	60	96.575	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	96.575	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000009962	SYF2	82	97.990	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.990	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000009962	SYF2	95	78.481	ENSKMAG00000013856	syf2	99	78.481	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000009962	SYF2	90	84.018	ENSLBEG00000014425	syf2	100	78.279	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000009962	SYF2	92	84.375	ENSLACG00000012064	SYF2	94	84.375	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	80.738	ENSLOCG00000002728	syf2	95	80.738	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.878	ENSLAFG00000023150	-	100	93.878	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000009962	SYF2	75	64.674	ENSLAFG00000030814	-	100	64.674	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.802	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	93.802	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.388	ENSMMUG00000002968	SYF2	99	93.388	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.802	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	93.802	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.388	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	93.388	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000009962	SYF2	89	82.488	ENSMAMG00000010403	syf2	98	77.824	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000009962	SYF2	95	78.723	ENSMZEG00005006429	syf2	99	78.723	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000009962	SYF2	82	88.945	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.213	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	92.213	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000009962	SYF2	82	99.497	ENSMICG00000016191	SYF2	100	99.497	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.852	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	93.852	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	79.821	ENSMMOG00000002396	syf2	93	79.821	Mola_mola
ENSOGAG00000009962	SYF2	93	89.520	ENSMODG00000013951	-	100	89.520	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000009962	SYF2	95	78.571	ENSMALG00000010706	syf2	99	78.992	Monopterus_albus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.033	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	93.033	Mus_caroli
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.033	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	93.033	Mus_musculus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.033	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	93.033	Mus_pahari
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.033	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	93.033	Mus_spretus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.089	ENSMPUG00000015802	-	100	93.089	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	91.870	ENSMPUG00000015801	-	100	91.870	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000009962	SYF2	94	95.197	ENSMLUG00000001885	SYF2	94	95.197	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.276	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.276	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000009962	SYF2	95	72.034	ENSNBRG00000010720	syf2	99	72.034	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	94.215	ENSNLEG00000035185	SYF2	99	94.215	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.213	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.213	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	83.197	ENSODEG00000014338	-	99	84.255	Octodon_degus
ENSOGAG00000009962	SYF2	95	94.850	ENSODEG00000017664	-	98	94.850	Octodon_degus
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	81.532	ENSONIG00000008213	syf2	99	79.149	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000009962	SYF2	83	91.089	ENSOANG00000009552	SYF2	100	91.089	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	94.672	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	94.672	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	81.532	ENSORLG00000028820	syf2	95	81.532	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	81.532	ENSORLG00020018333	syf2	94	81.532	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000009962	SYF2	89	82.569	ENSORLG00015014665	syf2	92	82.569	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	82.432	ENSOMEG00000013911	syf2	93	82.432	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000009962	SYF2	80	66.667	ENSOARG00000006269	-	100	66.667	Ovis_aries
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.308	ENSOARG00000006348	-	100	92.308	Ovis_aries
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	94.215	ENSPPAG00000036579	SYF2	99	94.215	Pan_paniscus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.089	ENSPPRG00000001651	-	100	93.089	Panthera_pardus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.276	ENSPPRG00000001638	-	100	92.276	Panthera_pardus
ENSOGAG00000009962	SYF2	93	96.018	ENSPTIG00000005711	-	82	96.018	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.089	ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	94.215	ENSPTRG00000000352	SYF2	99	94.215	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.802	ENSPANG00000008139	SYF2	99	93.802	Papio_anubis
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	79.508	ENSPKIG00000008130	syf2	100	79.508	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000009962	SYF2	97	85.593	ENSPSIG00000011816	SYF2	92	85.593	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	82.805	ENSPMGG00000008755	syf2	86	82.805	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.443	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	93.443	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000009962	SYF2	92	93.778	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	88.400	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000009962	SYF2	96	78.205	ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.205	Poecilia_formosa
ENSOGAG00000009962	SYF2	96	78.205	ENSPLAG00000006691	syf2	99	78.205	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000009962	SYF2	96	75.641	ENSPMEG00000011684	syf2	99	75.431	Poecilia_mexicana
ENSOGAG00000009962	SYF2	89	81.944	ENSPREG00000003009	syf2	97	78.632	Poecilia_reticulata
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	94.215	ENSPPYG00000001713	SYF2	99	94.215	Pongo_abelii
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	65.984	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	65.574	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	82.041	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	82.041	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	81.532	ENSPNYG00000004979	syf2	98	79.060	Pundamilia_nyererei
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	80.328	ENSPNAG00000015570	syf2	100	80.328	Pygocentrus_nattereri
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.033	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	93.033	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	91.322	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	91.322	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	93.802	ENSRROG00000001347	SYF2	99	93.802	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000009962	SYF2	99	92.975	ENSSBOG00000020184	SYF2	99	92.975	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000009962	SYF2	84	94.175	ENSSHAG00000007152	-	100	94.175	Sarcophilus_harrisii
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	86.747	ENSSHAG00000015630	-	100	86.747	Sarcophilus_harrisii
ENSOGAG00000009962	SYF2	98	80.252	ENSSFOG00015023647	syf2	99	80.252	Scleropages_formosus
ENSOGAG00000009962	SYF2	95	77.637	ENSSMAG00000009867	syf2	99	77.637	Scophthalmus_maximus
ENSOGAG00000009962	SYF2	89	83.945	ENSSDUG00000013072	syf2	98	81.116	Seriola_dumerili
ENSOGAG00000009962	SYF2	89	83.945	ENSSLDG00000012677	syf2	98	81.116	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	74.286	ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.286	Sorex_araneus
ENSOGAG00000009962	SYF2	97	82.927	ENSSPUG00000005251	SYF2	97	82.927	Sphenodon_punctatus
ENSOGAG00000009962	SYF2	95	80.000	ENSSPAG00000009626	syf2	99	80.000	Stegastes_partitus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.653	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.653	Sus_scrofa
ENSOGAG00000009962	SYF2	61	59.603	ENSTGUG00000001126	SYF2	100	56.500	Taeniopygia_guttata
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	76.230	ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.349	Takifugu_rubripes
ENSOGAG00000009962	SYF2	91	80.180	ENSTNIG00000016912	syf2	99	80.180	Tetraodon_nigroviridis
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	71.721	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	71.311	Tupaia_belangeri
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.245	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	93.469	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	91.463	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	91.463	Ursus_americanus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	91.870	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	91.870	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.061	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	93.061	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	88.710	ENSVVUG00000027181	-	100	88.710	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.276	ENSVVUG00000027175	-	100	92.276	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000009962	SYF2	97	81.857	ENSXETG00000022797	syf2	95	81.857	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000009962	SYF2	88	81.860	ENSXMAG00000022698	syf2	93	79.730	Xiphophorus_maculatus