EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000010031 (Gene tree)
Gene ID: 100955264
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: chromodomain helicase DNA binding protein 4
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 42839 bases
Position: chrGL873623.1:2173270-2216108
Accession: 100955264
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000008965	ResIII	PF04851.15	3.2e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000010037	-	6582	XM_012809343	ENSOGAP00000008965	1940 (aa)	XP_012664797	H0X1S9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000010031	-	93	70.165	ENSOGAG00000005703	CHD5	91	70.328
ENSOGAG00000010031	-	95	68.877	ENSOGAG00000003216	CHD3	91	70.103

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000010031	-	100	99.124	ENSG00000111642	CHD4	100	99.153	Homo_sapiens
ENSOGAG00000010031	-	92	78.746	ENSAPOG00000008935	chd4a	99	77.497	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000010031	-	92	69.705	ENSAPOG00000020502	-	93	69.323	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000010031	-	99	98.915	ENSAMEG00000014179	-	100	98.915	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000010031	-	92	75.359	ENSACIG00000012387	-	89	86.345	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000010031	-	95	76.770	ENSACIG00000019310	chd4a	90	92.825	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000010031	-	92	78.687	ENSAOCG00000016412	-	98	79.254	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000010031	-	98	73.942	ENSAOCG00000000507	-	95	76.044	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000010031	-	77	81.332	ENSAPEG00000001757	chd4a	99	75.693	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000010031	-	92	69.912	ENSAPEG00000020306	-	88	83.019	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000010031	-	95	73.803	ENSAPEG00000005957	-	98	73.323	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000010031	-	85	73.842	ENSATEG00000021141	-	96	74.411	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000010031	-	92	71.098	ENSATEG00000000976	-	94	71.041	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000010031	-	90	83.004	ENSATEG00000016428	chd4a	95	86.192	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000010031	-	99	86.896	ENSAPLG00000014146	-	100	86.837	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000010031	-	99	88.262	ENSACAG00000006231	-	100	87.843	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000010031	-	100	99.072	ENSANAG00000035685	-	100	99.072	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000010031	-	94	76.183	ENSACLG00000015837	chd4a	96	76.059	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000010031	-	95	75.386	ENSACLG00000024468	-	95	77.097	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000010031	-	95	79.523	ENSAMXG00000019969	chd4a	98	78.461	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000010031	-	95	77.063	ENSAMXG00000010614	-	78	80.569	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000010031	-	100	97.320	ENSBTAG00000014734	CHD4	100	97.320	Bos_taurus
ENSOGAG00000010031	-	100	97.733	ENSCJAG00000008114	-	100	97.733	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000010031	-	100	97.938	ENSCAFG00000014929	CHD4	100	97.938	Canis_familiaris
ENSOGAG00000010031	-	100	96.907	ENSCAFG00020002892	-	100	96.907	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000010031	-	100	96.907	ENSCHIG00000020766	-	100	96.907	Capra_hircus
ENSOGAG00000010031	-	98	98.844	ENSTSYG00000006069	-	98	98.844	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000010031	-	98	97.535	ENSCPOG00000008504	-	99	97.535	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000010031	-	100	97.887	ENSCCAG00000009686	-	100	97.887	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000010031	-	100	97.680	ENSCATG00000006345	-	100	97.680	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000010031	-	100	97.320	ENSCLAG00000012244	-	100	97.320	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000010031	-	100	97.683	ENSCSAG00000010429	-	100	97.683	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000010031	-	84	99.200	ENSCHOG00000000277	-	85	99.200	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000010031	-	99	88.872	ENSCPBG00000027716	-	96	89.008	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000010031	-	92	53.990	ENSCSAVG00000004448	-	99	59.960	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000010031	-	100	94.536	ENSCANG00000035317	-	100	98.448	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000010031	-	100	96.306	ENSCGRG00001020662	Chd4	100	96.306	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000010031	-	99	96.612	ENSCGRG00000015920	Chd4	100	96.612	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000010031	-	89	88.235	ENSCSEG00000017173	chd4a	92	88.235	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000010031	-	95	76.778	ENSCSEG00000019943	-	98	76.214	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000010031	-	92	69.515	ENSCSEG00000018096	-	92	68.914	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000010031	-	95	76.196	ENSCVAG00000001128	-	96	76.923	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000010031	-	89	93.151	ENSCVAG00000004940	chd4a	90	92.727	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000010031	-	92	70.331	ENSCVAG00000016412	-	94	70.116	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000010031	-	96	76.756	ENSDARG00000063535	chd4a	93	77.453	Danio_rerio
ENSOGAG00000010031	-	100	97.166	ENSDNOG00000001134	-	100	97.166	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000010031	-	99	95.715	ENSDORG00000001847	Chd4	98	95.715	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000010031	-	76	72.067	ENSEBUG00000012670	chd4a	92	74.187	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000010031	-	100	97.835	ENSEASG00005016150	-	100	97.835	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000010031	-	100	97.784	ENSECAG00000022005	CHD4	100	97.784	Equus_caballus
ENSOGAG00000010031	-	94	77.187	ENSELUG00000018086	-	97	78.047	Esox_lucius
ENSOGAG00000010031	-	92	77.857	ENSELUG00000021276	chd4a	95	77.833	Esox_lucius
ENSOGAG00000010031	-	100	98.041	ENSFCAG00000006877	-	100	98.041	Felis_catus
ENSOGAG00000010031	-	81	92.089	ENSFALG00000004785	-	97	92.167	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000010031	-	100	95.487	ENSFDAG00000020219	-	100	95.487	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000010031	-	95	75.469	ENSFHEG00000002013	chd4a	95	75.814	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000010031	-	87	76.940	ENSFHEG00000012736	-	97	77.461	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000010031	-	92	70.360	ENSFHEG00000003253	-	92	80.531	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000010031	-	50	88.259	ENSGMOG00000003394	-	78	88.259	Gadus_morhua
ENSOGAG00000010031	-	54	82.476	ENSGMOG00000015722	chd4a	99	78.976	Gadus_morhua
ENSOGAG00000010031	-	69	97.561	ENSGMOG00000017923	-	77	93.939	Gadus_morhua
ENSOGAG00000010031	-	60	91.199	ENSGALG00000013565	-	98	91.458	Gallus_gallus
ENSOGAG00000010031	-	95	75.288	ENSGAFG00000002778	chd4a	93	76.178	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000010031	-	83	91.743	ENSGAFG00000014337	-	96	88.462	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000010031	-	96	73.977	ENSGACG00000018705	chd4a	99	74.785	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000010031	-	53	79.869	ENSGACG00000010099	-	92	79.867	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000010031	-	99	88.511	ENSGAGG00000001416	-	97	88.753	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000010031	-	100	97.732	ENSGGOG00000001930	CHD4	100	97.732	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000010031	-	94	74.275	ENSHBUG00000019146	chd4a	95	74.107	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000010031	-	95	75.386	ENSHBUG00000016000	-	95	76.987	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000010031	-	100	97.062	ENSHGLG00000003093	-	100	97.062	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000010031	-	100	97.371	ENSHGLG00100007450	-	100	97.371	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000010031	-	88	73.291	ENSHCOG00000017525	-	95	85.946	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000010031	-	82	68.044	ENSHCOG00000014308	-	88	72.302	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000010031	-	95	78.675	ENSIPUG00000005694	chd4	96	79.688	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000010031	-	99	97.623	ENSSTOG00000007601	-	99	97.623	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000010031	-	100	96.443	ENSJJAG00000012394	Chd4	100	96.443	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000010031	-	92	69.486	ENSKMAG00000017827	-	90	79.736	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000010031	-	99	73.284	ENSKMAG00000007932	-	92	76.278	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000010031	-	95	75.785	ENSKMAG00000019286	chd4a	95	75.824	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000010031	-	79	72.366	ENSLBEG00000026652	-	95	72.222	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000010031	-	95	74.678	ENSLBEG00000012434	CHD4	92	74.801	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000010031	-	99	73.861	ENSLOCG00000007438	chd4a	95	75.211	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000010031	-	78	91.163	ENSLAFG00000022842	-	100	94.691	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000010031	-	100	97.784	ENSMFAG00000003188	-	100	97.784	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000010031	-	100	99.072	ENSMMUG00000018685	-	100	99.072	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000010031	-	100	97.216	ENSMNEG00000044776	-	100	97.216	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000010031	-	100	97.113	ENSMLEG00000024661	-	100	97.113	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000010031	-	95	73.940	ENSMAMG00000002584	-	89	85.714	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000010031	-	92	69.441	ENSMAMG00000002137	-	91	69.104	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000010031	-	98	76.534	ENSMAMG00000018954	chd4a	96	76.668	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000010031	-	95	75.333	ENSMZEG00005017761	-	95	76.932	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000010031	-	94	77.024	ENSMZEG00005001706	chd4a	96	76.046	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000010031	-	99	89.598	ENSMGAG00000014084	-	100	89.366	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000010031	-	100	98.144	ENSMICG00000006588	-	100	98.144	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000010031	-	100	96.513	ENSMOCG00000020624	Chd4	100	96.513	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000010031	-	95	76.629	ENSMMOG00000000073	chd4a	99	75.847	Mola_mola
ENSOGAG00000010031	-	74	74.396	ENSMMOG00000013429	-	86	73.943	Mola_mola
ENSOGAG00000010031	-	95	74.280	ENSMMOG00000015971	-	95	75.290	Mola_mola
ENSOGAG00000010031	-	82	97.249	ENSMODG00000018094	-	100	97.249	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000010031	-	95	76.656	ENSMALG00000005766	chd4a	93	76.715	Monopterus_albus
ENSOGAG00000010031	-	95	74.522	ENSMALG00000022494	-	95	75.525	Monopterus_albus
ENSOGAG00000010031	-	100	96.462	ENSMUSG00000063870	Chd4	100	96.462	Mus_musculus
ENSOGAG00000010031	-	100	96.465	MGP_SPRETEiJ_G0029911	Chd4	100	96.465	Mus_spretus
ENSOGAG00000010031	-	100	97.990	ENSMPUG00000016859	-	100	97.990	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000010031	-	100	97.629	ENSMLUG00000014343	-	99	97.629	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000010031	-	100	95.825	ENSNGAG00000016920	Chd4	100	95.825	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000010031	-	95	75.226	ENSNBRG00000021576	-	95	76.271	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000010031	-	99	98.076	ENSNLEG00000004330	-	96	98.076	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000010031	-	82	99.200	ENSMEUG00000015294	-	83	99.200	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000010031	-	87	99.531	ENSOPRG00000003477	-	84	99.531	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000010031	-	99	97.057	ENSODEG00000003114	-	99	97.057	Octodon_degus
ENSOGAG00000010031	-	99	74.923	ENSONIG00000012953	-	94	77.467	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000010031	-	94	77.590	ENSONIG00000006992	chd4a	93	78.105	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000010031	-	100	95.206	ENSOCUG00000008215	-	99	95.206	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000010031	-	95	76.310	ENSORLG00000006310	chd4a	93	76.283	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000010031	-	96	69.626	ENSORLG00000017190	-	90	82.273	Oryzias_latipes
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ENSOGAG00000010031	-	74	73.673	ENSORLG00020011739	-	86	73.564	Oryzias_latipes_hni
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ENSOGAG00000010031	-	95	76.071	ENSORLG00020006529	chd4a	93	76.283	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000010031	-	95	77.426	ENSORLG00015019674	chd4a	96	77.157	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000010031	-	95	77.062	ENSORLG00015010692	-	96	76.813	Oryzias_latipes_hsok
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ENSOGAG00000010031	-	64	85.127	ENSXETG00000026410	chd4	99	89.381	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000010031	-	95	75.337	ENSXCOG00000019269	-	96	75.152	Xiphophorus_couchianus
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ENSOGAG00000010031	-	77	81.595	ENSXMAG00000001037	chd4a	88	82.014	Xiphophorus_maculatus