EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000010179 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 447 bases
Position: chrGL873587.1:5457950-5458396
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000018351	Ribosomal_L21e	PF01157.18	2.5e-43	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000010179	-	447	-	ENSOGAP00000018351	148 (aa)	-	H0XQF9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000010179	-	100	86.486	ENSOGAG00000030812	-	93	86.486
ENSOGAG00000010179	-	100	87.838	ENSOGAG00000026698	-	92	87.838
ENSOGAG00000010179	-	100	81.757	ENSOGAG00000032866	-	92	81.757
ENSOGAG00000010179	-	100	68.421	ENSOGAG00000000555	-	93	68.421
ENSOGAG00000010179	-	100	77.027	ENSOGAG00000033936	-	92	77.027
ENSOGAG00000010179	-	100	86.486	ENSOGAG00000026636	-	93	86.486
ENSOGAG00000010179	-	100	78.378	ENSOGAG00000034390	-	95	78.378
ENSOGAG00000010179	-	99	72.603	ENSOGAG00000012452	-	91	72.603
ENSOGAG00000010179	-	100	86.486	ENSOGAG00000034076	-	93	86.486
ENSOGAG00000010179	-	100	89.189	ENSOGAG00000024836	-	93	89.189
ENSOGAG00000010179	-	100	79.054	ENSOGAG00000025213	-	100	79.054
ENSOGAG00000010179	-	100	92.568	ENSOGAG00000033479	-	93	92.568
ENSOGAG00000010179	-	100	79.054	ENSOGAG00000034423	-	92	79.054
ENSOGAG00000010179	-	99	88.435	ENSOGAG00000000212	-	100	88.435
ENSOGAG00000010179	-	100	76.351	ENSOGAG00000033882	-	100	76.351
ENSOGAG00000010179	-	100	85.811	ENSOGAG00000030115	-	93	85.811
ENSOGAG00000010179	-	90	71.429	ENSOGAG00000032000	-	87	71.852
ENSOGAG00000010179	-	100	75.817	ENSOGAG00000032711	-	100	75.817
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSOGAG00000029441	-	93	91.892
ENSOGAG00000010179	-	100	83.108	ENSOGAG00000030151	-	91	83.108
ENSOGAG00000010179	-	100	89.865	ENSOGAG00000027159	-	93	89.865
ENSOGAG00000010179	-	92	66.176	ENSOGAG00000031179	-	83	66.176
ENSOGAG00000010179	-	100	87.838	ENSOGAG00000027182	-	93	87.838
ENSOGAG00000010179	-	86	86.719	ENSOGAG00000034285	-	100	86.719
ENSOGAG00000010179	-	80	94.958	ENSOGAG00000008181	-	91	94.958

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000010179	-	100	93.243	ENSG00000122026	RPL21	93	93.243	Homo_sapiens
ENSOGAG00000010179	-	100	79.730	ENSAPOG00000024402	rpl21	93	79.730	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSAMEG00000018663	RPL21	91	91.892	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000010179	-	55	88.889	ENSAMEG00000016455	-	96	88.235	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000010179	-	100	75.839	ENSAMEG00000004710	-	93	75.839	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000010179	-	100	59.732	ENSAMEG00000004632	-	92	59.732	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000010179	-	100	81.757	ENSACIG00000021885	rpl21	93	81.757	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000010179	-	100	79.730	ENSAOCG00000017829	rpl21	93	79.730	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000010179	-	100	79.730	ENSAPEG00000019936	rpl21	93	79.730	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000010179	-	100	81.757	ENSATEG00000010524	rpl21	93	81.757	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000010179	-	100	87.162	ENSAPLG00000005641	RPL21	91	87.162	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000010179	-	100	87.838	ENSACAG00000003169	RPL21	93	87.838	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000010179	-	100	89.189	ENSANAG00000019962	-	93	89.189	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000010179	-	100	91.216	ENSANAG00000031513	-	93	91.216	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000010179	-	97	93.007	ENSANAG00000012283	-	92	93.007	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000010179	-	100	90.541	ENSANAG00000020005	-	93	90.541	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSANAG00000006331	-	93	91.892	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000010179	-	100	93.243	ENSANAG00000023031	-	93	93.243	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSANAG00000031230	-	93	91.892	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000010179	-	100	81.757	ENSACLG00000026444	rpl21	93	81.757	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000010179	-	100	79.054	ENSAMXG00000041892	rpl21	93	79.054	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSBTAG00000001648	RPL21	93	91.892	Bos_taurus
ENSOGAG00000010179	-	100	91.216	ENSBTAG00000038379	-	93	91.216	Bos_taurus
ENSOGAG00000010179	-	100	58.389	WBGene00004433	rpl-21	93	58.389	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000010179	-	100	86.486	ENSCJAG00000019734	-	93	86.486	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000010179	-	99	92.517	ENSCJAG00000039102	-	100	92.517	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000010179	-	64	74.737	ENSCJAG00000041707	-	87	74.737	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000010179	-	86	89.062	ENSCJAG00000044684	-	90	89.062	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000010179	-	100	93.919	ENSCJAG00000043116	-	93	93.919	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000010179	-	100	73.649	ENSCJAG00000044730	-	91	73.649	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSCJAG00000038205	-	93	91.892	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000010179	-	100	64.189	ENSCJAG00000044477	-	91	64.189	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000010179	-	100	69.595	ENSCAFG00000024055	-	92	69.595	Canis_familiaris
ENSOGAG00000010179	-	82	87.705	ENSCAFG00000015533	-	88	87.705	Canis_familiaris
ENSOGAG00000010179	-	99	86.395	ENSCAFG00000001564	-	92	86.395	Canis_familiaris
ENSOGAG00000010179	-	100	92.568	ENSCAFG00000015987	-	93	92.568	Canis_familiaris
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSCAFG00000028744	-	93	91.892	Canis_familiaris
ENSOGAG00000010179	-	79	88.889	ENSCAFG00000029659	-	99	88.889	Canis_familiaris
ENSOGAG00000010179	-	100	61.486	ENSCAFG00000018881	-	93	61.486	Canis_familiaris
ENSOGAG00000010179	-	100	92.568	ENSCAFG00000008805	-	93	92.568	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSCAFG00000032537	-	93	91.892	Canis_familiaris
ENSOGAG00000010179	-	100	92.568	ENSCAFG00020024181	-	93	92.568	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000010179	-	100	93.243	ENSCAFG00020004535	-	93	93.243	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSCAFG00020012834	-	93	91.892	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSCAFG00020008146	-	93	91.892	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000010179	-	100	92.568	ENSCAFG00020005317	-	93	92.568	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000010179	-	100	93.243	ENSCAFG00020024203	-	93	93.243	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSCAFG00020026205	-	93	91.892	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSCAFG00020012095	-	93	91.892	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSCAFG00020011527	-	93	91.892	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000010179	-	100	91.216	ENSCAFG00020020914	-	92	91.216	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000010179	-	100	91.216	ENSCHIG00000006564	-	93	91.216	Capra_hircus
ENSOGAG00000010179	-	100	85.135	ENSCHIG00000008368	-	92	85.135	Capra_hircus
ENSOGAG00000010179	-	100	90.541	ENSCHIG00000010112	-	93	90.541	Capra_hircus
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSCHIG00000019833	-	93	91.892	Capra_hircus
ENSOGAG00000010179	-	100	91.892	ENSCHIG00000021720	RPL21	93	91.892	Capra_hircus
ENSOGAG00000010179	-	54	85.000	ENSCHIG00000012074	-	64	85.000	Capra_hircus
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ENSOGAG00000010179	-	99	89.116	ENSTSYG00000028179	-	92	89.116	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000010179	-	100	80.405	ENSTSYG00000029069	-	92	80.405	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000010179	-	100	88.514	ENSTSYG00000030129	-	92	88.514	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000010179	-	100	81.757	ENSCAPG00000009066	-	92	81.757	Cavia_aperea
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ENSOGAG00000010179	-	96	87.324	ENSCPOG00000023041	-	92	85.235	Cavia_porcellus
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ENSOGAG00000010179	-	95	90.714	ENSCCAG00000033290	-	96	90.714	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000010179	-	100	93.243	ENSCCAG00000031101	-	93	93.243	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000010179	-	99	92.517	ENSCCAG00000009412	-	89	92.517	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000010179	-	100	89.189	ENSCATG00000005782	-	93	89.189	Cercocebus_atys
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ENSOGAG00000010179	-	100	84.459	ENSCATG00000038195	-	92	84.459	Cercocebus_atys
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ENSOGAG00000010179	-	99	72.789	ENSCLAG00000001174	-	90	72.789	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000010179	-	100	76.351	ENSCLAG00000009584	-	92	76.351	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000010179	-	100	93.243	ENSCSAG00000019017	-	93	93.243	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000010179	-	100	60.135	ENSCHOG00000007867	-	92	60.135	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000010179	-	58	94.186	ENSCHOG00000009484	-	99	94.186	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000010179	-	100	87.162	ENSCPBG00000020481	RPL21	93	87.162	Chrysemys_picta_bellii
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ENSOGAG00000010179	-	100	86.486	ENSMNEG00000035457	-	92	86.486	Macaca_nemestrina
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ENSOGAG00000010179	-	100	83.108	ENSXETG00000009802	rpl21	93	83.108	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000010179	-	100	81.757	ENSXCOG00000010007	rpl21	93	81.757	Xiphophorus_couchianus
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