EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000014589 (Gene tree)
Gene ID: 100957979
Gene Symbol: GTF3A
Alias: -
Full Name: general transcription factor IIIA
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11986 bases
Position: chrGL873639.1:5061546-5073531
Accession: 4662
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000013071	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-33	1	6
ENSOGAP00000013071	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-33	2	6
ENSOGAP00000013071	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-33	3	6
ENSOGAP00000013071	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-33	4	6
ENSOGAP00000013071	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-33	5	6
ENSOGAP00000013071	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-33	6	6
ENSOGAP00000013071	zf-met	PF12874.7	0.00016	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000014596	GTF3A-201	1101	-	ENSOGAP00000013071	366 (aa)	-	H0XBI8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000014589	GTF3A	82	34.737	ENSOGAG00000029343	-	72	35.769
ENSOGAG00000014589	GTF3A	72	35.741	ENSOGAG00000015980	-	99	35.361
ENSOGAG00000014589	GTF3A	55	41.860	ENSOGAG00000029101	ZNF784	52	41.860
ENSOGAG00000014589	GTF3A	74	41.860	ENSOGAG00000027487	ZNF236	53	41.860
ENSOGAG00000014589	GTF3A	77	35.407	ENSOGAG00000034730	ZNF628	60	35.407
ENSOGAG00000014589	GTF3A	73	37.500	ENSOGAG00000033980	ZNF768	52	33.750
ENSOGAG00000014589	GTF3A	73	38.255	ENSOGAG00000013758	ZNF774	68	38.255
ENSOGAG00000014589	GTF3A	73	36.207	ENSOGAG00000001902	ZFP1	61	36.207
ENSOGAG00000014589	GTF3A	84	38.028	ENSOGAG00000001907	-	88	38.028
ENSOGAG00000014589	GTF3A	71	36.517	ENSOGAG00000014360	ZNF829	100	36.517
ENSOGAG00000014589	GTF3A	80	33.218	ENSOGAG00000011129	ZNF317	61	33.333
ENSOGAG00000014589	GTF3A	74	30.970	ENSOGAG00000004779	ZNF564	95	31.559
ENSOGAG00000014589	GTF3A	73	31.203	ENSOGAG00000029772	-	91	32.389
ENSOGAG00000014589	GTF3A	82	34.400	ENSOGAG00000025131	ZNF121	64	38.462
ENSOGAG00000014589	GTF3A	83	33.594	ENSOGAG00000012069	ZNF225	73	33.594
ENSOGAG00000014589	GTF3A	74	34.014	ENSOGAG00000030944	ZNF574	60	33.913
ENSOGAG00000014589	GTF3A	74	34.188	ENSOGAG00000007268	ZSCAN2	65	34.188
ENSOGAG00000014589	GTF3A	69	35.345	ENSOGAG00000010500	-	50	35.345
ENSOGAG00000014589	GTF3A	82	31.410	ENSOGAG00000003269	ZNF319	80	30.116
ENSOGAG00000014589	GTF3A	73	32.830	ENSOGAG00000001561	ZNF425	67	32.576
ENSOGAG00000014589	GTF3A	80	30.798	ENSOGAG00000025289	-	83	37.063
ENSOGAG00000014589	GTF3A	76	40.789	ENSOGAG00000014983	ZNF81	63	40.789
ENSOGAG00000014589	GTF3A	82	33.094	ENSOGAG00000009996	PRDM5	83	32.414
ENSOGAG00000014589	GTF3A	81	34.831	ENSOGAG00000002111	-	81	33.761
ENSOGAG00000014589	GTF3A	66	35.833	ENSOGAG00000030111	SNAI1	50	36.207

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	84.153	ENSAMEG00000015824	GTF3A	100	83.607	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000014589	GTF3A	98	79.944	ENSBTAG00000012600	GTF3A	99	79.666	Bos_taurus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	97	82.633	ENSCAFG00000006794	GTF3A	97	81.793	Canis_familiaris
ENSOGAG00000014589	GTF3A	98	79.944	ENSCHIG00000010341	-	99	79.109	Capra_hircus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	98	79.666	ENSCHIG00000021040	-	84	78.830	Capra_hircus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	92	83.086	ENSTSYG00000004206	GTF3A	98	83.333	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000014589	GTF3A	81	81.853	ENSCAPG00000015862	GTF3A	98	86.638	Cavia_aperea
ENSOGAG00000014589	GTF3A	90	80.967	ENSCPOG00000010143	GTF3A	98	84.539	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	85	85.209	ENSCLAG00000003912	GTF3A	93	85.197	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000014589	GTF3A	99	81.370	ENSDNOG00000037405	-	86	81.370	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	82	76.923	ENSETEG00000003225	GTF3A	77	77.447	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	82.240	ENSEASG00005022495	-	81	81.967	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	90	74.085	ENSEASG00005013216	-	87	72.866	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	90	80.243	ENSECAG00000024825	-	76	80.243	Equus_caballus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	83.060	ENSECAG00000014803	GTF3A	86	85.284	Equus_caballus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	99	80.274	ENSEEUG00000004307	GTF3A	89	79.726	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	84.426	ENSFCAG00000006982	GTF3A	84	84.426	Felis_catus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	85	86.495	ENSFDAG00000016841	GTF3A	94	86.513	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000014589	GTF3A	85	86.218	ENSHGLG00000004173	GTF3A	94	86.513	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000014589	GTF3A	85	86.218	ENSHGLG00100011561	GTF3A	94	86.513	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000014589	GTF3A	85	84.936	ENSSTOG00000013853	GTF3A	97	84.868	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	90	79.677	ENSJJAG00000011501	Gtf3a	99	79.677	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	77.628	ENSLAFG00000027315	GTF3A	100	77.628	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000014589	GTF3A	92	81.845	ENSMAUG00000016253	Gtf3a	98	76.648	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	87.158	ENSMICG00000014763	GTF3A	99	87.158	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	99	77.260	MGP_CAROLIEiJ_G0028031	Gtf3a	99	76.712	Mus_caroli
ENSOGAG00000014589	GTF3A	99	77.534	ENSMUSG00000016503	Gtf3a	99	76.986	Mus_musculus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	99	77.869	MGP_PahariEiJ_G0024597	Gtf3a	99	77.322	Mus_pahari
ENSOGAG00000014589	GTF3A	99	77.534	MGP_SPRETEiJ_G0029029	Gtf3a	99	76.986	Mus_spretus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	83.333	ENSMPUG00000005835	GTF3A	98	82.787	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000014589	GTF3A	91	85.542	ENSMLUG00000002158	GTF3A	99	85.542	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	85.519	ENSNLEG00000000331	GTF3A	100	85.519	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000014589	GTF3A	90	60.790	ENSMEUG00000010089	GTF3A	95	60.976	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000014589	GTF3A	99	72.853	ENSOPRG00000000854	-	89	72.853	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	82.514	ENSODEG00000006725	GTF3A	86	82.514	Octodon_degus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	99	82.967	ENSOCUG00000011713	GTF3A	82	82.418	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	98	76.045	ENSOARG00000012551	GTF3A	98	75.209	Ovis_aries
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	84.699	ENSPPRG00000002368	GTF3A	100	84.153	Panthera_pardus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	82	85.619	ENSPTIG00000018958	GTF3A	82	85.619	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000014589	GTF3A	90	53.232	ENSPSIG00000011722	GTF3A	99	53.232	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000014589	GTF3A	98	86.072	ENSPPYG00000005235	GTF3A	99	86.072	Pongo_abelii
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	86.612	ENSPCOG00000016742	GTF3A	83	86.612	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	79.235	ENSPVAG00000012837	GTF3A	86	77.596	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	77.869	ENSRROG00000043264	GTF3A	100	77.869	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000014589	GTF3A	90	79.635	ENSSHAG00000016965	GTF3A	93	79.635	Sarcophilus_harrisii
ENSOGAG00000014589	GTF3A	85	73.955	ENSSARG00000010692	GTF3A	84	74.013	Sorex_araneus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	90	69.184	ENSSPUG00000005307	GTF3A	88	69.184	Sphenodon_punctatus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	73	47.388	ENSTRUG00000005241	gtf3ab	84	47.388	Takifugu_rubripes
ENSOGAG00000014589	GTF3A	78	87.500	ENSTBEG00000012075	GTF3A	61	87.500	Tupaia_belangeri
ENSOGAG00000014589	GTF3A	99	74.725	ENSTTRG00000008538	GTF3A	87	74.725	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	84.426	ENSUAMG00000019189	GTF3A	100	83.880	Ursus_americanus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	92	85.460	ENSUMAG00000016941	GTF3A	98	85.801	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000014589	GTF3A	89	83.165	ENSVPAG00000004995	GTF3A	99	83.165	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000014589	GTF3A	100	81.744	ENSVVUG00000009197	GTF3A	100	80.926	Vulpes_vulpes