EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000015036 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2168 bases
Position: chrGL873723.1:394424-396591
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000019743	SBDS	PF01172.18	6.3e-23	1	1
ENSOGAP00000019743	SBDS_C	PF09377.10	6.2e-34	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000015040	-	750	-	ENSOGAP00000019743	249 (aa)	-	H0XUF1

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000015036	-	100	83.200	ENSOGAG00000009011	-	100	83.200

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSG00000126524	SBDS	100	82.000	Homo_sapiens
ENSOGAG00000015036	-	99	71.888	ENSAPOG00000014285	sbds	100	71.888	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSAMEG00000018167	SBDS	100	82.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000015036	-	99	71.825	ENSACIG00000007308	sbds	100	71.825	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000015036	-	99	72.289	ENSAOCG00000016770	sbds	100	72.289	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000015036	-	99	72.691	ENSAPEG00000015897	sbds	100	72.691	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000015036	-	99	71.888	ENSATEG00000006901	sbds	100	71.888	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000015036	-	83	89.855	ENSANAG00000037501	-	100	89.855	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015036	-	92	74.459	ENSANAG00000024342	-	97	74.459	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015036	-	99	72.289	ENSACLG00000018750	sbds	100	72.289	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015036	-	100	72.000	ENSAMXG00000005361	sbds	100	72.000	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000015036	-	100	81.600	ENSBTAG00000004051	SBDS	100	81.600	Bos_taurus
ENSOGAG00000015036	-	94	49.789	WBGene00021063	sbds-1	94	49.789	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000015036	-	100	80.800	ENSCJAG00000041007	SBDS	100	80.800	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000015036	-	100	79.762	ENSCAFG00000010797	SBDS	100	79.762	Canis_familiaris
ENSOGAG00000015036	-	100	81.600	ENSCAFG00020005357	SBDS	100	81.600	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000015036	-	100	82.400	ENSCHIG00000026854	SBDS	100	82.400	Capra_hircus
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSTSYG00000033822	SBDS	100	82.000	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000015036	-	65	88.344	ENSCAPG00000006634	SBDS	99	88.344	Cavia_aperea
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSCPOG00000036143	SBDS	100	82.000	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000015036	-	100	81.600	ENSCCAG00000020671	SBDS	100	81.600	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSCATG00000039026	SBDS	100	82.000	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000015036	-	89	65.022	ENSCLAG00000002113	-	89	65.022	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000015036	-	100	81.600	ENSCLAG00000005721	-	100	81.600	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSCSAG00000018275	SBDS	100	82.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000015036	-	100	78.400	ENSCHOG00000003795	SBDS	100	78.400	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000015036	-	100	74.400	ENSCPBG00000014893	SBDS	100	74.400	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000015036	-	99	57.258	ENSCSAVG00000011811	-	99	57.258	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000015036	-	100	81.600	ENSCANG00000032368	SBDS	100	81.600	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000015036	-	65	85.890	ENSCGRG00001019886	Sbds	99	85.890	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000015036	-	83	88.406	ENSCGRG00000009211	Sbds	100	88.406	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000015036	-	99	69.880	ENSCSEG00000005798	sbds	100	69.880	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000015036	-	99	71.084	ENSCVAG00000001053	sbds	100	71.084	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000015036	-	100	72.400	ENSDARG00000027803	sbds	100	72.400	Danio_rerio
ENSOGAG00000015036	-	100	81.600	ENSDNOG00000041174	SBDS	100	81.600	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000015036	-	100	81.200	ENSDORG00000026218	Sbds	100	81.200	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000015036	-	90	47.368	FBgn0035714	CG8549	98	48.583	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000015036	-	83	60.386	ENSEBUG00000015780	sbds	92	60.386	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000015036	-	100	82.400	ENSEASG00005008821	SBDS	100	82.400	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000015036	-	100	82.400	ENSECAG00000008202	SBDS	100	82.400	Equus_caballus
ENSOGAG00000015036	-	83	56.731	ENSEEUG00000004768	SBDS	100	56.731	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000015036	-	100	70.800	ENSELUG00000008382	sbds	100	70.800	Esox_lucius
ENSOGAG00000015036	-	100	82.400	ENSFCAG00000022142	SBDS	100	82.400	Felis_catus
ENSOGAG00000015036	-	100	74.800	ENSFALG00000013808	SBDS	100	74.800	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSFDAG00000018947	-	100	82.000	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000015036	-	99	67.470	ENSFHEG00000000708	sbds	100	67.470	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000015036	-	100	70.800	ENSGMOG00000018356	sbds	99	70.800	Gadus_morhua
ENSOGAG00000015036	-	100	75.600	ENSGALG00000027989	SBDS	100	75.600	Gallus_gallus
ENSOGAG00000015036	-	90	74.107	ENSGAFG00000014204	sbds	97	74.107	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000015036	-	99	69.076	ENSGACG00000012697	sbds	100	69.076	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000015036	-	86	82.243	ENSGAGG00000022402	SBDS	100	82.243	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000015036	-	96	65.546	ENSGGOG00000040023	-	92	65.546	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000015036	-	99	72.289	ENSHBUG00000002660	sbds	100	72.289	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000015036	-	100	80.400	ENSHGLG00000009671	SBDS	100	80.400	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000015036	-	100	80.400	ENSHGLG00100011332	SBDS	100	80.400	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000015036	-	99	69.880	ENSHCOG00000018606	sbds	100	69.880	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000015036	-	100	70.800	ENSIPUG00000006536	sbds	100	70.800	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000015036	-	100	57.540	ENSJJAG00000003934	-	100	57.540	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000015036	-	99	78.629	ENSJJAG00000012033	-	99	78.629	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000015036	-	99	72.289	ENSKMAG00000018542	sbds	100	72.289	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000015036	-	99	69.076	ENSLBEG00000016687	sbds	100	69.076	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000015036	-	100	58.268	ENSLACG00000018916	SBDS	100	58.268	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000015036	-	100	72.800	ENSLOCG00000004073	sbds	100	72.800	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000015036	-	100	81.600	ENSLAFG00000008763	SBDS	100	81.600	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSMFAG00000032620	SBDS	100	82.000	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSMMUG00000045653	SBDS	100	82.000	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSMNEG00000031523	SBDS	100	82.000	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000015036	-	100	62.205	ENSMLEG00000036826	SBDS	100	62.205	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000015036	-	99	71.486	ENSMAMG00000016062	sbds	100	71.486	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000015036	-	99	72.289	ENSMZEG00005024385	sbds	100	72.289	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000015036	-	100	75.600	ENSMGAG00000002119	SBDS	100	75.600	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000015036	-	99	62.097	ENSMAUG00000022214	-	100	62.097	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000015036	-	100	82.400	ENSMICG00000014366	SBDS	100	82.400	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000015036	-	100	81.200	ENSMOCG00000011739	Sbds	100	81.200	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000015036	-	99	62.000	ENSMMOG00000005061	sbds	99	61.847	Mola_mola
ENSOGAG00000015036	-	100	80.400	ENSMODG00000006644	SBDS	100	80.400	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000015036	-	99	70.281	ENSMALG00000010219	sbds	100	70.281	Monopterus_albus
ENSOGAG00000015036	-	100	81.600	MGP_CAROLIEiJ_G0027800	Sbds	97	88.024	Mus_caroli
ENSOGAG00000015036	-	100	81.200	ENSMUSG00000025337	Sbds	96	88.554	Mus_musculus
ENSOGAG00000015036	-	100	81.200	MGP_PahariEiJ_G0024384	Sbds	96	87.952	Mus_pahari
ENSOGAG00000015036	-	100	81.200	MGP_SPRETEiJ_G0028798	Sbds	96	88.554	Mus_spretus
ENSOGAG00000015036	-	67	85.714	ENSMPUG00000016192	SBDS	97	85.714	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000015036	-	73	87.363	ENSMLUG00000013575	SBDS	100	87.363	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSNGAG00000012093	Sbds	100	82.000	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000015036	-	99	72.289	ENSNBRG00000017027	sbds	100	72.289	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSNLEG00000013288	SBDS	100	82.000	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000015036	-	100	78.800	ENSOPRG00000008721	SBDS	100	78.800	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000015036	-	100	75.200	ENSODEG00000019253	-	84	75.200	Octodon_degus
ENSOGAG00000015036	-	99	61.446	ENSODEG00000000137	-	84	64.659	Octodon_degus
ENSOGAG00000015036	-	90	70.536	ENSODEG00000001116	-	89	70.536	Octodon_degus
ENSOGAG00000015036	-	99	71.888	ENSONIG00000005874	sbds	100	71.888	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000015036	-	83	85.507	ENSOANG00000007674	-	100	85.507	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000015036	-	100	80.000	ENSOCUG00000003170	SBDS	100	80.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000015036	-	99	68.675	ENSORLG00000023489	sbds	100	68.675	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000015036	-	99	68.273	ENSORLG00020019282	sbds	100	68.273	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000015036	-	99	68.273	ENSORLG00015008005	sbds	100	68.273	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000015036	-	99	70.281	ENSOMEG00000022747	sbds	100	70.281	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000015036	-	100	82.400	ENSOARG00000010609	SBDS	100	82.400	Ovis_aries
ENSOGAG00000015036	-	100	81.200	ENSPPAG00000043889	-	100	81.200	Pan_paniscus
ENSOGAG00000015036	-	100	82.400	ENSPPRG00000002307	SBDS	100	82.400	Panthera_pardus
ENSOGAG00000015036	-	100	82.400	ENSPTIG00000021308	SBDS	100	82.400	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000015036	-	87	76.959	ENSPTRG00000048174	-	96	76.959	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSPTRG00000019254	SBDS	100	82.000	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000015036	-	100	68.400	ENSPTRG00000047744	-	100	68.400	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000015036	-	100	68.800	ENSPTRG00000050835	-	100	68.800	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSPANG00000004078	SBDS	100	82.000	Papio_anubis
ENSOGAG00000015036	-	100	71.200	ENSPKIG00000006489	sbds	100	71.200	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000015036	-	83	83.092	ENSPSIG00000014603	SBDS	99	83.092	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000015036	-	99	70.281	ENSPMGG00000004246	sbds	100	70.281	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOGAG00000015036	-	100	81.600	ENSPEMG00000008728	Sbds	100	81.600	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSOGAG00000015036	-	100	73.600	ENSPNAG00000001120	sbds	100	73.600	Pygocentrus_nattereri
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ENSOGAG00000015036	-	100	82.000	ENSRROG00000040842	-	97	89.778	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000015036	-	91	37.607	YLR022C	-	92	37.607	Saccharomyces_cerevisiae
ENSOGAG00000015036	-	90	88.889	ENSSBOG00000022460	SBDS	97	88.889	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSOGAG00000015036	-	100	71.200	ENSXETG00000010093	sbds	100	71.200	Xenopus_tropicalis
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ENSOGAG00000015036	-	99	69.880	ENSXMAG00000006065	sbds	100	69.880	Xiphophorus_maculatus