EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000015300 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9397 bases
Position: chrGL873587.1:5563580-5572976
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000013702	LSM	PF01423.22	2.3e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000015303	-	219	-	ENSOGAP00000013702	73 (aa)	-	H0XCZ8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000015300	-	82	35.294	ENSOGAG00000024373	-	67	35.294
ENSOGAG00000015300	-	82	36.765	ENSOGAG00000000144	-	67	36.765

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSG00000143977	SNRPG	97	90.323	Homo_sapiens
ENSOGAG00000015300	-	81	83.051	ENSAPOG00000013277	snrpg	77	83.051	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000015300	-	100	79.730	ENSAPOG00000009068	snrpg	97	79.730	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSAMEG00000016000	SNRPG	97	89.189	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000015300	-	84	62.295	ENSACIG00000006560	snrpg	85	62.295	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000015300	-	100	79.730	ENSAOCG00000006447	snrpg	97	79.730	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000015300	-	100	79.730	ENSAPEG00000017249	snrpg	97	79.730	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000015300	-	100	79.730	ENSATEG00000023229	snrpg	97	79.730	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000015300	-	78	73.684	ENSAPLG00000003951	-	70	73.684	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000015300	-	93	81.159	ENSACAG00000007878	SNRPG	91	81.159	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000015300	-	100	86.486	ENSANAG00000006710	-	97	86.486	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015300	-	85	85.484	ENSANAG00000019847	-	97	85.484	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015300	-	85	85.484	ENSANAG00000019989	-	97	85.484	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015300	-	96	80.282	ENSANAG00000023461	-	96	80.282	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015300	-	88	85.938	ENSANAG00000036971	-	89	85.938	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015300	-	100	86.486	ENSANAG00000005705	-	97	86.486	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015300	-	100	87.838	ENSANAG00000019882	-	97	87.838	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015300	-	100	86.486	ENSANAG00000019432	-	97	86.486	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSANAG00000028737	SNRPG	97	89.189	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015300	-	79	93.103	ENSANAG00000017661	-	67	93.103	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015300	-	99	68.493	ENSANAG00000020869	-	94	68.493	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015300	-	100	79.730	ENSACLG00000006323	snrpg	97	79.730	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015300	-	100	79.730	ENSAMXG00000030568	snrpg	97	79.730	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSBTAG00000034506	-	97	89.189	Bos_taurus
ENSOGAG00000015300	-	96	84.507	ENSBTAG00000049132	-	96	84.507	Bos_taurus
ENSOGAG00000015300	-	85	88.710	ENSBTAG00000014104	-	97	88.710	Bos_taurus
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSBTAG00000053210	SNRPG	97	89.189	Bos_taurus
ENSOGAG00000015300	-	85	83.871	ENSBTAG00000050695	-	97	83.871	Bos_taurus
ENSOGAG00000015300	-	100	87.838	ENSBTAG00000038368	-	97	87.838	Bos_taurus
ENSOGAG00000015300	-	100	87.838	ENSCJAG00000022419	-	97	87.838	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000015300	-	100	86.486	ENSCJAG00000042327	-	97	86.486	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000015300	-	100	86.486	ENSCJAG00000045138	-	97	86.486	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000015300	-	100	86.486	ENSCJAG00000040628	-	97	86.486	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSCJAG00000019313	SNRPG	97	89.189	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000015300	-	85	83.871	ENSCJAG00000046709	-	97	83.871	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000015300	-	100	88.000	ENSCJAG00000019624	-	97	88.000	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSCAFG00000032595	SNRPG	97	89.189	Canis_familiaris
ENSOGAG00000015300	-	73	90.566	ENSCAFG00020023429	-	83	86.207	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000015300	-	88	82.812	ENSCAFG00020007381	-	79	82.812	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSCAFG00020001862	-	97	89.189	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000015300	-	100	85.135	ENSCHIG00000002486	-	97	85.135	Capra_hircus
ENSOGAG00000015300	-	99	59.722	ENSCHIG00000014762	-	76	59.722	Capra_hircus
ENSOGAG00000015300	-	100	85.135	ENSCHIG00000009012	-	97	85.135	Capra_hircus
ENSOGAG00000015300	-	99	56.164	ENSCHIG00000022682	-	95	56.164	Capra_hircus
ENSOGAG00000015300	-	100	86.486	ENSCHIG00000012507	-	97	86.486	Capra_hircus
ENSOGAG00000015300	-	79	89.655	ENSTSYG00000026369	-	92	89.655	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000015300	-	100	74.324	ENSTSYG00000005729	-	100	74.324	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSTSYG00000034550	SNRPG	97	90.323	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000015300	-	75	100.000	ENSCAPG00000002047	-	96	100.000	Cavia_aperea
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSCPOG00000036891	-	97	89.189	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSCCAG00000030474	SNRPG	97	89.189	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000015300	-	96	87.324	ENSCATG00000031023	-	96	87.324	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSCATG00000020914	SNRPG	97	89.189	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000015300	-	75	94.545	ENSCATG00000016774	-	83	94.545	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000015300	-	100	63.514	ENSCATG00000000492	-	100	63.514	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000015300	-	100	73.973	ENSCATG00000044172	-	100	73.973	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000015300	-	79	93.103	ENSCATG00000030279	-	85	93.103	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSCLAG00000012216	-	97	89.189	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSCSAG00000015147	-	97	89.189	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000015300	-	100	87.838	ENSCSAG00000000372	-	97	87.838	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSCHOG00000000130	-	97	89.189	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000015300	-	100	85.135	ENSCPBG00000003642	SNRPG	97	85.135	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000015300	-	100	70.270	ENSCANG00000027827	-	97	70.270	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000015300	-	100	64.865	ENSCANG00000032309	-	97	64.865	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSCANG00000008822	SNRPG	97	89.189	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSOGAG00000015300	-	100	77.027	ENSCGRG00001000446	-	97	77.027	Cricetulus_griseus_chok1gshd
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ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSCGRG00001011831	-	97	89.189	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSCGRG00000002261	Snrpg	97	89.189	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000015300	-	100	75.676	ENSCGRG00000000133	-	97	75.676	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000015300	-	89	83.077	ENSCGRG00000011028	-	94	83.077	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000015300	-	100	72.973	ENSCGRG00000008511	-	97	72.973	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000015300	-	100	72.289	ENSCSEG00000003401	snrpg	98	72.289	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000015300	-	100	79.730	ENSCVAG00000012770	snrpg	97	79.730	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000015300	-	100	78.378	ENSDARG00000099667	snrpg	97	78.378	Danio_rerio
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSDNOG00000019446	-	97	89.189	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000015300	-	97	64.789	ENSDNOG00000045718	-	95	64.789	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000015300	-	89	86.154	ENSDORG00000005623	-	96	86.154	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000015300	-	85	79.032	ENSDORG00000030093	-	97	79.032	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSDORG00000023335	-	97	89.189	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000015300	-	100	66.216	FBgn0261791	SNRPG	97	66.216	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSETEG00000010028	-	99	89.189	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000015300	-	85	81.818	ENSEASG00005007399	SNRPG	56	81.818	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000015300	-	85	69.355	ENSEASG00005011820	-	97	69.355	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000015300	-	88	78.125	ENSEASG00005008384	-	91	78.125	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000015300	-	85	69.355	ENSECAG00000038646	-	97	69.355	Equus_caballus
ENSOGAG00000015300	-	88	78.125	ENSECAG00000001370	-	91	78.125	Equus_caballus
ENSOGAG00000015300	-	85	81.818	ENSECAG00000019989	SNRPG	56	81.818	Equus_caballus
ENSOGAG00000015300	-	85	88.710	ENSEEUG00000001932	-	95	88.710	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000015300	-	100	87.838	ENSEEUG00000006991	-	100	87.838	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000015300	-	100	77.027	ENSELUG00000013944	snrpg	97	77.027	Esox_lucius
ENSOGAG00000015300	-	96	67.606	ENSFCAG00000035486	-	95	67.606	Felis_catus
ENSOGAG00000015300	-	84	77.049	ENSFCAG00000028363	-	91	77.049	Felis_catus
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSFCAG00000045921	-	97	89.189	Felis_catus
ENSOGAG00000015300	-	84	57.377	ENSFCAG00000008118	-	85	57.377	Felis_catus
ENSOGAG00000015300	-	100	86.486	ENSFCAG00000024033	-	97	86.486	Felis_catus
ENSOGAG00000015300	-	93	80.882	ENSFALG00000008384	SNRPG	97	80.882	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSFDAG00000012567	-	97	89.189	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000015300	-	100	79.730	ENSFDAG00000005075	-	80	79.730	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000015300	-	100	72.603	ENSFDAG00000009371	-	97	72.603	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000015300	-	100	78.378	ENSFHEG00000012063	snrpg	97	78.378	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000015300	-	56	76.190	ENSGMOG00000006239	snrpg	100	76.190	Gadus_morhua
ENSOGAG00000015300	-	100	86.486	ENSGALG00000028409	SNRPG	97	86.486	Gallus_gallus
ENSOGAG00000015300	-	100	79.730	ENSGAFG00000000100	snrpg	97	79.730	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000015300	-	58	76.744	ENSGACG00000013201	snrpg	100	76.744	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000015300	-	100	85.135	ENSGAGG00000007536	SNRPG	97	85.135	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSGGOG00000039645	SNRPG	97	90.323	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000015300	-	85	82.258	ENSGGOG00000040381	-	93	82.258	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000015300	-	78	84.211	ENSGGOG00000022169	-	89	84.211	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000015300	-	100	78.378	ENSGGOG00000036639	-	97	78.378	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000015300	-	100	68.493	ENSGGOG00000036975	-	100	68.493	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000015300	-	100	79.730	ENSHBUG00000006405	snrpg	97	79.730	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000015300	-	93	81.159	ENSHGLG00000018568	-	92	81.159	Heterocephalus_glaber_female
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ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSHGLG00000005767	SNRPG	97	89.189	Heterocephalus_glaber_female
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ENSOGAG00000015300	-	66	81.250	ENSMEUG00000005457	-	98	81.250	Notamacropus_eugenii
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ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSRNOG00000016507	LOC687679	97	89.189	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000015300	-	100	77.027	ENSRNOG00000058521	AABR07042226.1	97	77.027	Rattus_norvegicus
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ENSOGAG00000015300	-	96	87.324	ENSRBIG00000026802	-	96	87.324	Rhinopithecus_bieti
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ENSOGAG00000015300	-	100	77.027	ENSSBOG00000020739	-	97	77.027	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSSBOG00000023307	SNRPG	97	89.189	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSOGAG00000015300	-	88	79.688	ENSSBOG00000022826	-	70	79.688	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000015300	-	100	86.486	ENSSHAG00000012395	SNRPG	97	86.486	Sarcophilus_harrisii
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ENSOGAG00000015300	-	100	87.671	ENSTGUG00000004149	SNRPG	97	87.671	Taeniopygia_guttata
ENSOGAG00000015300	-	100	78.205	ENSTRUG00000004040	snrpg	98	78.205	Takifugu_rubripes
ENSOGAG00000015300	-	100	78.378	ENSTNIG00000003506	snrpg	97	78.378	Tetraodon_nigroviridis
ENSOGAG00000015300	-	100	83.784	ENSTBEG00000017381	-	97	83.784	Tupaia_belangeri
ENSOGAG00000015300	-	99	72.973	ENSTBEG00000000061	-	99	72.973	Tupaia_belangeri
ENSOGAG00000015300	-	85	90.323	ENSTTRG00000001197	-	95	90.323	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000015300	-	85	74.603	ENSUAMG00000008324	-	60	74.603	Ursus_americanus
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSUAMG00000025835	-	97	89.189	Ursus_americanus
ENSOGAG00000015300	-	100	56.757	ENSUAMG00000020319	-	100	56.757	Ursus_americanus
ENSOGAG00000015300	-	81	70.000	ENSUMAG00000003604	-	59	70.000	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000015300	-	82	72.131	ENSUMAG00000005603	-	65	72.131	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSUMAG00000021476	-	97	89.189	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000015300	-	100	58.108	ENSUMAG00000016465	-	100	58.108	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000015300	-	100	89.189	ENSVPAG00000007452	-	97	89.189	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000015300	-	56	100.000	ENSVPAG00000007454	-	100	100.000	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000015300	-	68	92.000	ENSVVUG00000005535	-	80	87.273	Vulpes_vulpes
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ENSOGAG00000015300	-	85	87.097	ENSVVUG00000000415	-	100	87.097	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000015300	-	100	79.730	ENSXETG00000008512	snrpg	97	79.730	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000015300	-	100	77.922	ENSXCOG00000000088	snrpg	97	77.922	Xiphophorus_couchianus
ENSOGAG00000015300	-	100	79.730	ENSXMAG00000004353	snrpg	97	79.730	Xiphophorus_maculatus