EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000015980 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22934 bases
Position: chrGL873671.1:1512678-1535611
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSOGAP00000014310	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-165	7	28
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ENSOGAP00000014310	zf-met	PF12874.7	2.1e-26	1	3
ENSOGAP00000014310	zf-met	PF12874.7	2.1e-26	2	3
ENSOGAP00000014310	zf-met	PF12874.7	2.1e-26	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000015985	-	2553	-	ENSOGAP00000014310	851 (aa)	-	H0XEE2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000015980	-	99	54.332	ENSOGAG00000029343	-	82	54.332
ENSOGAG00000015980	-	97	53.061	ENSOGAG00000001902	ZFP1	80	53.061
ENSOGAG00000015980	-	99	53.957	ENSOGAG00000033980	ZNF768	66	53.737
ENSOGAG00000015980	-	97	53.061	ENSOGAG00000013799	SALL4	60	53.061
ENSOGAG00000015980	-	99	54.955	ENSOGAG00000003693	ZNF205	60	54.271
ENSOGAG00000015980	-	98	40.310	ENSOGAG00000010500	-	54	40.310
ENSOGAG00000015980	-	99	35.361	ENSOGAG00000014589	GTF3A	72	35.741
ENSOGAG00000015980	-	99	42.883	ENSOGAG00000001561	ZNF425	81	42.883
ENSOGAG00000015980	-	99	61.397	ENSOGAG00000001907	-	89	61.397
ENSOGAG00000015980	-	99	47.254	ENSOGAG00000029772	-	95	47.254
ENSOGAG00000015980	-	99	60.000	ENSOGAG00000007268	ZSCAN2	70	60.000
ENSOGAG00000015980	-	99	56.126	ENSOGAG00000012069	ZNF225	80	55.396
ENSOGAG00000015980	-	99	46.584	ENSOGAG00000008879	GFI1B	56	46.584
ENSOGAG00000015980	-	99	57.031	ENSOGAG00000025289	-	92	57.031
ENSOGAG00000015980	-	99	45.865	ENSOGAG00000011129	ZNF317	75	45.865
ENSOGAG00000015980	-	99	49.153	ENSOGAG00000031681	SALL3	60	49.153
ENSOGAG00000015980	-	98	50.000	ENSOGAG00000009683	ZBTB14	53	50.000
ENSOGAG00000015980	-	99	39.071	ENSOGAG00000003269	ZNF319	93	37.895
ENSOGAG00000015980	-	99	36.905	ENSOGAG00000029813	ZNF423	99	36.905
ENSOGAG00000015980	-	98	43.396	ENSOGAG00000030111	SNAI1	50	43.396
ENSOGAG00000015980	-	100	33.521	ENSOGAG00000030944	ZNF574	93	35.000
ENSOGAG00000015980	-	99	36.522	ENSOGAG00000031877	ZNF526	82	37.288
ENSOGAG00000015980	-	99	43.293	ENSOGAG00000003836	ZBTB47	50	43.293
ENSOGAG00000015980	-	99	59.639	ENSOGAG00000014360	ZNF829	100	59.639
ENSOGAG00000015980	-	99	42.069	ENSOGAG00000027487	ZNF236	84	44.681
ENSOGAG00000015980	-	99	48.746	ENSOGAG00000025131	ZNF121	99	48.746
ENSOGAG00000015980	-	99	37.580	ENSOGAG00000034730	ZNF628	60	38.862
ENSOGAG00000015980	-	99	38.735	ENSOGAG00000009996	PRDM5	83	38.735
ENSOGAG00000015980	-	99	38.095	ENSOGAG00000000419	SNAI3	53	38.095
ENSOGAG00000015980	-	99	46.552	ENSOGAG00000024538	-	61	46.552
ENSOGAG00000015980	-	99	48.387	ENSOGAG00000004779	ZNF564	99	48.387
ENSOGAG00000015980	-	99	50.201	ENSOGAG00000002111	-	89	50.201
ENSOGAG00000015980	-	99	48.148	ENSOGAG00000029406	ZNF865	83	37.826
ENSOGAG00000015980	-	99	47.024	ENSOGAG00000027913	GFI1	51	47.024
ENSOGAG00000015980	-	99	53.314	ENSOGAG00000001912	ZNF233	70	54.930
ENSOGAG00000015980	-	99	53.799	ENSOGAG00000013758	ZNF774	74	53.799
ENSOGAG00000015980	-	76	55.357	ENSOGAG00000031464	SALL2	61	55.357
ENSOGAG00000015980	-	99	35.526	ENSOGAG00000029101	ZNF784	76	35.526
ENSOGAG00000015980	-	99	52.941	ENSOGAG00000027316	SALL1	56	52.941
ENSOGAG00000015980	-	99	49.873	ENSOGAG00000014983	ZNF81	89	49.873
ENSOGAG00000015980	-	98	31.761	ENSOGAG00000027905	PATZ1	53	31.761

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000015980	-	99	56.335	ENSG00000267041	ZNF850	91	56.335	Homo_sapiens
ENSOGAG00000015980	-	99	40.767	ENSAPOG00000004417	-	94	40.767	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000015980	-	99	56.134	ENSAPOG00000004628	-	99	51.741	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000015980	-	99	42.896	ENSAPOG00000008386	-	98	42.896	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000015980	-	99	52.679	ENSAPOG00000003666	-	98	50.831	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000015980	-	99	44.300	ENSAPOG00000007629	-	90	44.300	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000015980	-	99	42.536	ENSAPOG00000022113	-	83	42.977	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000015980	-	99	45.354	ENSAPOG00000007596	-	99	45.354	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000015980	-	99	58.038	ENSAMEG00000007611	-	100	58.038	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000015980	-	99	52.703	ENSACIG00000006172	-	97	51.852	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000015980	-	99	41.137	ENSACIG00000023313	-	93	41.137	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000015980	-	99	44.444	ENSACIG00000021986	-	93	44.444	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000015980	-	99	50.270	ENSACIG00000019710	-	74	49.051	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000015980	-	99	49.563	ENSACIG00000013604	-	99	49.370	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000015980	-	99	38.073	ENSACIG00000006377	-	72	38.073	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000015980	-	99	40.118	ENSAOCG00000001327	-	90	40.118	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000015980	-	99	43.243	ENSAOCG00000001615	-	82	43.243	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000015980	-	99	40.712	ENSAOCG00000001341	-	94	40.313	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000015980	-	99	54.967	ENSAOCG00000022675	-	94	53.846	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000015980	-	99	44.258	ENSAOCG00000004559	-	90	44.258	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000015980	-	99	42.391	ENSAOCG00000012653	-	83	42.050	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000015980	-	99	46.365	ENSAOCG00000022079	-	80	46.365	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000015980	-	99	43.974	ENSAOCG00000004564	-	82	43.974	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000015980	-	99	44.600	ENSAOCG00000022283	-	88	44.600	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000015980	-	99	44.444	ENSAPEG00000002558	-	88	44.444	Amphiprion_percula
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ENSOGAG00000015980	-	99	51.205	ENSAPEG00000004189	-	75	47.085	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000015980	-	99	42.522	ENSAPEG00000002661	-	91	42.522	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000015980	-	99	42.815	ENSAPEG00000002888	-	96	42.815	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000015980	-	99	42.369	ENSAPEG00000012599	-	94	42.369	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000015980	-	99	54.676	ENSAPEG00000004486	-	99	52.294	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000015980	-	99	44.444	ENSAPEG00000002585	-	94	44.444	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000015980	-	97	49.476	ENSAPEG00000012926	-	78	48.858	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000015980	-	99	52.266	ENSATEG00000018051	-	97	52.318	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000015980	-	99	48.619	ENSATEG00000001815	-	99	48.221	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000015980	-	99	47.361	ENSACAG00000013623	-	100	47.727	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000015980	-	99	54.945	ENSACAG00000022421	-	100	54.147	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000015980	-	99	48.881	ENSACLG00000001045	-	98	45.848	Astatotilapia_calliptera
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ENSOGAG00000015980	-	99	46.739	ENSACLG00000015843	-	86	46.930	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	58.228	ENSACLG00000019424	-	96	50.794	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	46.215	ENSACLG00000022383	-	97	46.215	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	47.971	ENSACLG00000023963	-	96	47.971	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	44.658	ENSACLG00000022475	-	93	44.658	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	44.093	ENSACLG00000017336	-	96	44.093	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	45.098	ENSACLG00000023941	-	90	44.124	Astatotilapia_calliptera
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ENSOGAG00000015980	-	99	46.667	ENSACLG00000006528	-	97	46.667	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	49.286	ENSACLG00000019499	-	92	49.286	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	54.706	ENSACLG00000017939	-	96	53.667	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	45.545	ENSACLG00000013454	-	72	45.545	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	45.952	ENSACLG00000007749	-	76	45.952	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	100	40.995	ENSACLG00000022360	-	98	40.995	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	47.477	ENSACLG00000018701	-	76	47.477	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	45.946	ENSACLG00000022302	-	96	45.946	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	47.368	ENSACLG00000014600	-	91	47.368	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	49.725	ENSACLG00000000537	-	98	49.020	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	42.029	ENSACLG00000001003	-	93	41.596	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	44.732	ENSACLG00000003229	-	92	44.905	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000015980	-	99	47.148	ENSACLG00000021846	-	86	47.148	Astatotilapia_calliptera
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