EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000015983 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PPARGC1B
Alias: -
Full Name: PPARG coactivator 1 beta
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 28969 bases
Position: chrGL873522.1:26218573-26247541
Accession: 30022
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000014313	RRM_1	PF00076.22	3e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000015989	PPARGC1B-201	2985	-	ENSOGAP00000014313	994 (aa)	-	H0XEE4

Gene Model

Click here to download ENSOGAG00000015983's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOGAG00000015983's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.825	ENSG00000155846	PPARGC1B	98	80.915	Homo_sapiens
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.572	ENSAMEG00000005287	PPARGC1B	98	79.563	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	98	48.126	ENSAPLG00000009977	PPARGC1B	99	49.205	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	44.004	ENSACAG00000015737	PPARGC1B	97	44.267	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.649	ENSANAG00000021830	PPARGC1B	98	80.735	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	76.923	ENSBTAG00000012943	PPARGC1B	98	78.054	Bos_taurus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.280	ENSCJAG00000021113	PPARGC1B	98	78.730	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.300	ENSCAFG00000018275	PPARGC1B	98	79.386	Canis_familiaris
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	76.176	ENSCAFG00020023524	PPARGC1B	97	76.800	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	76.070	ENSCHIG00000004409	PPARGC1B	98	77.183	Capra_hircus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	72.400	ENSTSYG00000034354	PPARGC1B	100	72.600	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	98	73.518	ENSCAPG00000008859	PPARGC1B	99	73.658	Cavia_aperea
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	75.435	ENSCPOG00000001958	PPARGC1B	98	76.430	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.825	ENSCCAG00000026909	PPARGC1B	98	81.312	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	78.794	ENSCATG00000030402	PPARGC1B	98	79.324	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	73.475	ENSCLAG00000015452	PPARGC1B	99	74.012	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	81.474	ENSCSAG00000011792	PPARGC1B	100	81.574	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	61	69.620	ENSCHOG00000005517	-	66	83.051	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	46.505	ENSCPBG00000007891	PPARGC1B	97	46.110	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.864	ENSCANG00000037487	PPARGC1B	98	80.952	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	98	73.413	ENSCGRG00001017949	Ppargc1b	96	74.229	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	98	73.340	ENSCGRG00000008387	Ppargc1b	98	73.658	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	59	67.464	ENSDNOG00000005985	PPARGC1B	64	68.558	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	69.501	ENSDORG00000012605	Ppargc1b	97	71.585	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	76.039	ENSEASG00005002826	PPARGC1B	98	76.946	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	77.444	ENSECAG00000019769	PPARGC1B	81	78.480	Equus_caballus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	76	79.111	ENSEEUG00000014903	PPARGC1B	84	79.111	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	50	48.598	ENSEEUG00000009219	PPARGC1A	60	49.265	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	56	48.182	ENSELUG00000014929	ppargc1b	70	42.188	Esox_lucius
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	47.535	ENSFALG00000008858	PPARGC1B	99	47.732	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	73.096	ENSFDAG00000008719	PPARGC1B	99	73.248	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	91	61.842	ENSGAGG00000012870	PPARGC1B	97	75.000	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	79.502	ENSGGOG00000009505	PPARGC1B	100	80.697	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	73.735	ENSHGLG00000005967	PPARGC1B	98	75.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	69.599	ENSHGLG00100010588	PPARGC1B	97	71.286	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	77.488	ENSSTOG00000024758	PPARGC1B	98	78.529	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	72.336	ENSJJAG00000018633	Ppargc1b	98	73.930	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	36.108	ENSLACG00000011232	PPARGC1B	100	36.479	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	82	43.827	ENSLOCG00000012195	ppargc1b	87	43.396	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	98	76.892	ENSLAFG00000012339	PPARGC1B	98	76.992	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	80.604	ENSMFAG00000042269	PPARGC1B	98	81.710	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	80.604	ENSMMUG00000004749	PPARGC1B	98	81.710	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	80.409	ENSMNEG00000034121	PPARGC1B	98	81.511	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	81.393	ENSMLEG00000040973	PPARGC1B	100	81.493	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	45.526	ENSMGAG00000003134	PPARGC1B	100	46.063	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	71.109	ENSMAUG00000014191	Ppargc1b	98	73.016	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	83.744	ENSMICG00000002702	PPARGC1B	98	85.126	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	72.524	ENSMOCG00000014885	Ppargc1b	98	73.465	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	55.988	ENSMODG00000009891	PPARGC1B	99	55.891	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	72.190	MGP_CAROLIEiJ_G0022323	Ppargc1b	98	73.123	Mus_caroli
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	72.039	ENSMUSG00000033871	Ppargc1b	98	72.970	Mus_musculus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	70.395	MGP_PahariEiJ_G0019053	Ppargc1b	98	72.370	Mus_pahari
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	72.276	MGP_SPRETEiJ_G0023235	Ppargc1b	98	73.313	Mus_spretus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	78.696	ENSMPUG00000014245	PPARGC1B	98	79.067	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	90	73.936	ENSMLUG00000013169	PPARGC1B	97	74.892	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	73.235	ENSNGAG00000016998	Ppargc1b	97	74.100	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	78.655	ENSNLEG00000010193	PPARGC1B	98	79.245	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	70.477	ENSOPRG00000010017	PPARGC1B	99	71.074	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	70.939	ENSODEG00000004901	PPARGC1B	97	71.756	Octodon_degus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	88	56.589	ENSOANG00000009368	PPARGC1B	99	51.545	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	73.498	ENSOCUG00000013833	PPARGC1B	100	73.990	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	98	76.680	ENSOARG00000005658	PPARGC1B	98	76.710	Ovis_aries
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	80.697	ENSPPAG00000035226	PPARGC1B	100	80.796	Pan_paniscus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.049	ENSPPRG00000004608	PPARGC1B	98	79.327	Panthera_pardus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.630	ENSPTIG00000007391	PPARGC1B	98	79.113	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.727	ENSPTRG00000017403	PPARGC1B	98	80.815	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	80.507	ENSPANG00000009512	PPARGC1B	98	81.610	Papio_anubis
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	47.070	ENSPSIG00000008358	PPARGC1B	97	47.476	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	50	48.148	ENSPSIG00000011790	PPARGC1A	59	51.471	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	72.763	ENSPEMG00000018822	Ppargc1b	98	73.611	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	89	55.367	ENSPCIG00000020102	PPARGC1B	99	55.260	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	80.117	ENSPPYG00000015938	PPARGC1B	98	81.213	Pongo_abelii
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	73	80.814	ENSPCAG00000012171	PPARGC1B	71	82.171	Procavia_capensis
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	85.123	ENSPCOG00000024059	PPARGC1B	98	86.332	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	78.516	ENSPVAG00000001308	PPARGC1B	97	79.620	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	72.222	ENSRNOG00000017503	Ppargc1b	99	73.161	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.552	ENSRBIG00000036724	PPARGC1B	98	80.636	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	80.619	ENSRROG00000029594	PPARGC1B	97	80.915	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.337	ENSSBOG00000028738	PPARGC1B	98	80.616	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	98	57.564	ENSSHAG00000016400	PPARGC1B	97	57.327	Sarcophilus_harrisii
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	98	48.016	ENSSPUG00000019271	PPARGC1B	99	47.525	Sphenodon_punctatus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	70.821	ENSSSCG00000014437	PPARGC1B	98	72.315	Sus_scrofa
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	46.344	ENSTGUG00000000232	PPARGC1B	100	47.581	Taeniopygia_guttata
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	78.480	ENSTTRG00000008430	PPARGC1B	99	78.921	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	50	48.598	ENSTTRG00000005327	PPARGC1A	58	51.908	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	98	80.099	ENSUMAG00000005361	PPARGC1B	98	79.031	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	99	79.009	ENSVVUG00000014358	PPARGC1B	99	79.584	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000015983	PPARGC1B	97	40.594	ENSXETG00000012711	ppargc1b	99	40.594	Xenopus_tropicalis