EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000016496 (Gene tree)
Gene ID: 100959689
Gene Symbol: OVOL1
Alias: -
Full Name: ovo like transcriptional repressor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9317 bases
Position: chrGL873659.1:2651175-2660491
Accession: 100959689
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000014764	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-14	1	3
ENSOGAP00000014764	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-14	2	3
ENSOGAP00000014764	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-14	3	3
ENSOGAP00000014764	zf-met	PF12874.7	0.00015	1	2
ENSOGAP00000014764	zf-met	PF12874.7	0.00015	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000016501	OVOL1-201	804	-	ENSOGAP00000014764	267 (aa)	XP_003798719	H0XFH3

Gene Model

Click here to download ENSOGAG00000016496's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOGAG00000016496's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000016496	OVOL1	52	38.655	ENSOGAG00000001902	ZFP1	55	38.655
ENSOGAG00000016496	OVOL1	100	49.117	ENSOGAG00000030325	OVOL2	97	49.117
ENSOGAG00000016496	OVOL1	72	50.943	ENSOGAG00000027487	ZNF236	54	50.943
ENSOGAG00000016496	OVOL1	53	41.176	ENSOGAG00000029343	-	54	41.176
ENSOGAG00000016496	OVOL1	61	33.696	ENSOGAG00000004779	ZNF564	91	33.696
ENSOGAG00000016496	OVOL1	61	38.235	ENSOGAG00000012069	ZNF225	78	38.235
ENSOGAG00000016496	OVOL1	57	44.304	ENSOGAG00000011129	ZNF317	68	44.304
ENSOGAG00000016496	OVOL1	54	36.145	ENSOGAG00000009996	PRDM5	54	36.145
ENSOGAG00000016496	OVOL1	75	37.895	ENSOGAG00000025131	ZNF121	81	37.895
ENSOGAG00000016496	OVOL1	53	40.000	ENSOGAG00000014983	ZNF81	54	40.000
ENSOGAG00000016496	OVOL1	54	37.500	ENSOGAG00000002111	-	84	37.500
ENSOGAG00000016496	OVOL1	72	39.773	ENSOGAG00000001907	-	74	39.773
ENSOGAG00000016496	OVOL1	64	34.783	ENSOGAG00000001561	ZNF425	66	34.783
ENSOGAG00000016496	OVOL1	55	37.179	ENSOGAG00000029772	-	78	37.179
ENSOGAG00000016496	OVOL1	60	37.209	ENSOGAG00000027908	BCL6B	50	37.209

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000016496	OVOL1	100	96.255	ENSG00000172818	OVOL1	100	96.255	Homo_sapiens
ENSOGAG00000016496	OVOL1	88	94.068	ENSCLAG00000016426	OVOL1	79	94.068	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000016496	OVOL1	99	71.212	ENSCPBG00000023411	OVOL1	99	71.212	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000016496	OVOL1	89	88.655	ENSDNOG00000024062	OVOL1	98	88.655	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000016496	OVOL1	100	95.131	ENSDORG00000028510	Ovol1	100	95.131	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000016496	OVOL1	59	96.835	ENSEEUG00000010161	OVOL1	99	96.835	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000016496	OVOL1	51	76.642	ENSGALG00000049996	OVOL1	64	74.324	Gallus_gallus
ENSOGAG00000016496	OVOL1	100	71.161	ENSGAGG00000008199	OVOL1	100	71.161	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000016496	OVOL1	100	96.255	ENSJJAG00000024400	Ovol1	100	96.255	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000016496	OVOL1	100	94.382	MGP_CAROLIEiJ_G0022558	Ovol1	100	94.382	Mus_caroli
ENSOGAG00000016496	OVOL1	100	94.382	ENSMUSG00000024922	Ovol1	100	94.382	Mus_musculus
ENSOGAG00000016496	OVOL1	100	93.633	MGP_PahariEiJ_G0014055	Ovol1	100	93.633	Mus_pahari
ENSOGAG00000016496	OVOL1	100	94.757	MGP_SPRETEiJ_G0023472	Ovol1	100	94.757	Mus_spretus
ENSOGAG00000016496	OVOL1	96	64.388	ENSPSIG00000002913	OVOL1	100	64.388	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000016496	OVOL1	100	93.258	ENSRNOG00000020669	Ovol1	100	93.258	Rattus_norvegicus