EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000016969 (Gene tree)
Gene ID: 100956671
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: RAB13%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6448 bases
Position: chrGL873763.1:1460570-1467017
Accession: 100956671
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000015194	MMR_HSR1	PF01926.23	7.8e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000016973	-	624	-	ENSOGAP00000015194	201 (aa)	XP_003802320	H0XGI5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000016969	-	90	33.493	ENSOGAG00000000096	RAB36	78	33.493
ENSOGAG00000016969	-	85	52.326	ENSOGAG00000028002	RAB12	82	52.326
ENSOGAG00000016969	-	77	33.125	ENSOGAG00000024221	REM1	62	31.383
ENSOGAG00000016969	-	93	44.776	ENSOGAG00000007642	RAB11A	93	44.776
ENSOGAG00000016969	-	58	30.252	ENSOGAG00000034868	ARL4C	61	30.252
ENSOGAG00000016969	-	97	42.308	ENSOGAG00000003227	RAB11B	95	42.308
ENSOGAG00000016969	-	92	35.676	ENSOGAG00000028680	NRAS	97	35.676
ENSOGAG00000016969	-	95	37.629	ENSOGAG00000009456	RAB5C	90	37.629
ENSOGAG00000016969	-	85	52.047	ENSOGAG00000002443	RAB15	80	52.047
ENSOGAG00000016969	-	92	35.676	ENSOGAG00000014812	KRAS	85	38.889
ENSOGAG00000016969	-	85	30.726	ENSOGAG00000033920	ARL14	89	30.726
ENSOGAG00000016969	-	81	40.476	ENSOGAG00000015082	RAB9B	83	40.476
ENSOGAG00000016969	-	66	30.075	ENSOGAG00000012034	ARF4	71	30.075
ENSOGAG00000016969	-	82	37.195	ENSOGAG00000005675	RAB23	69	37.195
ENSOGAG00000016969	-	81	38.095	ENSOGAG00000002868	RAB9A	83	38.095
ENSOGAG00000016969	-	82	41.818	ENSOGAG00000012973	RAB14	77	41.818
ENSOGAG00000016969	-	92	42.162	ENSOGAG00000016955	RAB25	86	42.162
ENSOGAG00000016969	-	80	36.196	ENSOGAG00000004034	MRAS	78	36.196
ENSOGAG00000016969	-	88	43.316	ENSOGAG00000033299	RAB33A	79	43.316
ENSOGAG00000016969	-	80	39.752	ENSOGAG00000014855	RAB31	83	39.752
ENSOGAG00000016969	-	81	38.323	ENSOGAG00000007885	RAB7A	81	38.323
ENSOGAG00000016969	-	81	49.383	ENSOGAG00000033189	RAB30	80	49.383
ENSOGAG00000016969	-	58	30.508	ENSOGAG00000034816	-	61	30.508
ENSOGAG00000016969	-	98	40.394	ENSOGAG00000006778	RAB33B	87	40.394
ENSOGAG00000016969	-	84	48.810	ENSOGAG00000002728	-	78	48.810
ENSOGAG00000016969	-	79	43.671	ENSOGAG00000027043	RAB6A	76	43.671
ENSOGAG00000016969	-	79	42.405	ENSOGAG00000005245	RAB6B	76	42.405
ENSOGAG00000016969	-	92	36.508	ENSOGAG00000028133	RAB21	84	36.316
ENSOGAG00000016969	-	84	57.988	ENSOGAG00000026181	RAB1A	82	57.988
ENSOGAG00000016969	-	89	38.764	ENSOGAG00000015779	RAB22A	88	38.764
ENSOGAG00000016969	-	96	36.082	ENSOGAG00000024846	HRAS	98	36.082
ENSOGAG00000016969	-	80	41.176	ENSOGAG00000006951	-	77	41.176
ENSOGAG00000016969	-	96	52.551	ENSOGAG00000028013	RAB1B	98	52.551
ENSOGAG00000016969	-	87	43.182	ENSOGAG00000028015	RAB18	85	43.182
ENSOGAG00000016969	-	63	30.496	ENSOGAG00000026673	ARFRP1	68	30.496
ENSOGAG00000016969	-	67	30.882	ENSOGAG00000013336	ARF5	72	30.882
ENSOGAG00000016969	-	87	47.191	ENSOGAG00000025424	RAB39B	84	47.191

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSG00000143545	RAB13	99	94.059	Homo_sapiens
ENSOGAG00000016969	-	96	77.083	ENSACIG00000008584	rab13	92	77.083	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000016969	-	99	92.574	ENSANAG00000030247	-	99	92.574	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000016969	-	99	78.218	ENSAMXG00000030712	rab13	99	78.218	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000016969	-	100	93.103	ENSBTAG00000017604	RAB13	100	93.103	Bos_taurus
ENSOGAG00000016969	-	81	47.239	WBGene00019317	K02E10.1	75	47.239	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000016969	-	94	94.709	ENSCJAG00000009933	-	99	93.069	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000016969	-	100	92.611	ENSCHIG00000022271	-	100	92.611	Capra_hircus
ENSOGAG00000016969	-	100	88.177	ENSCPOG00000011491	-	100	88.177	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000016969	-	99	93.564	ENSCCAG00000028502	-	99	93.564	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSCATG00000041779	-	99	94.059	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000016969	-	99	88.119	ENSCLAG00000006603	-	99	88.119	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSCANG00000036573	-	99	94.059	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000016969	-	99	91.584	ENSCGRG00001021505	Rab13	99	91.584	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000016969	-	99	91.584	ENSCGRG00000012126	Rab13	99	91.584	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000016969	-	99	76.000	ENSCSEG00000002358	rab13	99	76.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000016969	-	99	77.723	ENSDARG00000034771	rab13	99	77.723	Danio_rerio
ENSOGAG00000016969	-	99	89.604	ENSDORG00000001591	Rab13	99	89.604	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSEASG00005000683	-	99	94.059	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSECAG00000016551	RAB13	99	94.059	Equus_caballus
ENSOGAG00000016969	-	99	86.634	ENSEEUG00000001233	-	99	86.634	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000016969	-	99	75.000	ENSELUG00000012801	rab13	99	75.000	Esox_lucius
ENSOGAG00000016969	-	99	89.109	ENSFCAG00000045269	-	99	89.109	Felis_catus
ENSOGAG00000016969	-	66	94.697	ENSFDAG00000014469	-	100	94.697	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000016969	-	99	74.500	ENSFHEG00000021221	rab13	95	83.815	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000016969	-	99	75.000	ENSGACG00000011925	rab13	99	75.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000016969	-	86	90.173	ENSGAGG00000000742	-	99	79.902	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSGGOG00000023693	RAB13	99	94.059	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000016969	-	99	88.557	ENSHGLG00000008749	RAB13	99	88.557	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000016969	-	99	88.557	ENSHGLG00100013608	RAB13	99	88.557	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000016969	-	99	73.267	ENSHCOG00000007440	rab13	97	83.523	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000016969	-	99	76.263	ENSIPUG00000003199	rab13	99	76.263	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000016969	-	99	92.079	ENSSTOG00000011222	-	99	92.079	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000016969	-	99	89.109	ENSJJAG00000010575	Rab13	99	89.109	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000016969	-	93	78.610	ENSKMAG00000001908	rab13	90	81.657	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000016969	-	99	75.758	ENSLBEG00000026779	rab13	99	75.758	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000016969	-	86	78.488	ENSLACG00000008103	-	97	78.488	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSMFAG00000041018	RAB13	99	94.059	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSMNEG00000028951	-	99	94.059	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSMLEG00000042247	-	99	94.059	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000016969	-	99	74.500	ENSMAMG00000014602	rab13	99	74.500	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000016969	-	99	90.594	ENSMAUG00000015713	Rab13	99	90.594	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000016969	-	99	93.035	ENSMICG00000010340	-	99	93.035	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000016969	-	99	91.584	ENSMOCG00000021448	Rab13	99	91.584	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000016969	-	99	89.109	ENSMODG00000017295	-	84	89.109	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000016969	-	99	88.614	MGP_CAROLIEiJ_G0025227	Rab13	99	88.614	Mus_caroli
ENSOGAG00000016969	-	99	88.060	ENSMUSG00000027935	Rab13	99	88.060	Mus_musculus
ENSOGAG00000016969	-	99	88.557	MGP_PahariEiJ_G0026671	Rab13	99	88.557	Mus_pahari
ENSOGAG00000016969	-	99	91.045	ENSNGAG00000010309	Rab13	99	91.045	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000016969	-	99	75.124	ENSNBRG00000004124	rab13	99	75.124	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSNLEG00000028944	-	99	94.059	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000016969	-	99	90.640	ENSMEUG00000009667	-	99	90.640	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000016969	-	99	86.139	ENSODEG00000010443	-	99	86.139	Octodon_degus
ENSOGAG00000016969	-	63	96.063	ENSODEG00000012634	-	100	96.063	Octodon_degus
ENSOGAG00000016969	-	99	74.627	ENSONIG00000006340	rab13	99	74.627	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000016969	-	88	94.350	ENSOCUG00000006286	-	99	94.350	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000016969	-	96	79.688	ENSOMEG00000008210	rab13	99	76.500	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSPPAG00000028435	-	99	94.059	Pan_paniscus
ENSOGAG00000016969	-	99	89.109	ENSPPRG00000008865	-	99	89.109	Panthera_pardus
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSPTRG00000001370	RAB13	99	94.059	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSPANG00000004479	-	99	94.059	Papio_anubis
ENSOGAG00000016969	-	99	74.500	ENSPMGG00000007680	rab13	99	74.500	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOGAG00000016969	-	54	97.222	ENSPEMG00000017353	-	81	97.222	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000016969	-	99	89.655	ENSPCIG00000029350	-	99	89.655	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000016969	-	86	82.659	ENSPLAG00000005832	RAB13	93	82.659	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000016969	-	91	79.235	ENSPREG00000017567	rab13	99	73.500	Poecilia_reticulata
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSPPYG00000000790	-	99	94.059	Pongo_abelii
ENSOGAG00000016969	-	99	94.030	ENSPCOG00000012189	-	99	94.030	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000016969	-	99	91.045	ENSPVAG00000011095	-	99	91.045	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000016969	-	88	83.523	ENSPNAG00000004189	rab13	93	83.523	Pygocentrus_nattereri
ENSOGAG00000016969	-	99	88.614	ENSRNOG00000016733	Rab13	99	88.614	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000016969	-	99	93.564	ENSRBIG00000008552	-	99	93.564	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000016969	-	99	93.564	ENSRROG00000036885	-	99	93.564	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000016969	-	99	94.030	ENSSBOG00000020342	-	99	94.030	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000016969	-	99	89.655	ENSSHAG00000011866	-	99	89.655	Sarcophilus_harrisii
ENSOGAG00000016969	-	99	93.564	ENSSSCG00000006564	-	99	93.564	Sus_scrofa
ENSOGAG00000016969	-	99	76.000	ENSTRUG00000024177	rab13	99	76.000	Takifugu_rubripes
ENSOGAG00000016969	-	99	91.089	ENSTBEG00000012734	-	99	91.089	Tupaia_belangeri
ENSOGAG00000016969	-	99	94.059	ENSTTRG00000011183	-	99	94.059	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000016969	-	67	82.222	ENSXETG00000020729	rab13	99	75.155	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000016969	-	86	81.503	ENSXCOG00000019533	rab13	93	81.503	Xiphophorus_couchianus