EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000017053 (Gene tree)
Gene ID: 100953405
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: -
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 166718 bases
Position: chrGL873525.1:24562606-24729323
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000015276	ResIII	PF04851.15	1.5e-08	1	1
ENSOGAP00000015276	BRK	PF07533.16	1.7e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000017063	SMARCA2-201	4926	-	ENSOGAP00000015276	1588 (aa)	-	H0XGQ9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	69	81.495	ENSOGAG00000016148	SMARCA4	77	82.056

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	94.312	ENSG00000080503	SMARCA2	100	99.408	Homo_sapiens
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.156	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	79	85.851	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	91	89.202	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	97.806	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	77.917	ENSACIG00000015607	SMARCA2	80	84.822	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.408	ENSAOCG00000009647	-	79	85.851	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.219	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	79	85.851	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	80.063	ENSATEG00000006916	SMARCA2	78	86.736	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	88.403	ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	87.641	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	94.302	ENSANAG00000026498	SMARCA2	99	94.121	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.267	ENSACLG00000004248	SMARCA2	81	86.396	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	81.409	ENSAMXG00000012404	smarca2	96	78.378	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	94.221	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	99	94.036	Bos_taurus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	100	94.448	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	93.728	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	94.922	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	99	94.922	Canis_familiaris
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	77	94.823	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	98	94.823	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	94.221	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	99	94.036	Capra_hircus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.672	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	93.371	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	89.818	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	100	90.321	Cavia_aperea
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.723	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	99	93.723	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	94.493	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	99	94.188	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	94.671	ENSCATG00000031470	SMARCA2	99	94.483	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	80	99.209	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	93.213	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	94	94.259	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	93.933	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	86	88.077	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	88.077	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	88.952	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	99	96.367	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	94.483	ENSCANG00000039597	SMARCA2	99	94.177	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	87.024	ENSCGRG00001002323	Smarca2	99	79.589	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	75.914	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	97	75.176	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	65	86.479	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	75	86.346	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	80.088	ENSDARG00000008904	smarca2	80	87.639	Danio_rerio
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.438	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	99	93.922	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.691	ENSDORG00000014832	Smarca2	99	92.942	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	74	67.771	ENSEBUG00000002449	-	84	68.631	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	95	69.554	ENSEBUG00000011442	-	77	77.553	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	94.221	ENSEASG00005010312	SMARCA2	99	94.162	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	66	97.222	ENSEEUG00000015540	-	69	97.222	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	93	79.078	ENSELUG00000010318	smarca2	77	87.280	Esox_lucius
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	94.473	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	99	93.726	Felis_catus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	90.095	ENSFALG00000010416	SMARCA2	87	96.919	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	100	92.122	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	99	92.289	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.912	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	78.250	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	98	76.673	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	81	84.248	Gadus_morhua
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	88.279	ENSGALG00000010164	SMARCA2	82	96.288	Gallus_gallus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	75	80.901	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	75	80.570	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	78.531	ENSGACG00000014488	SMARCA2	80	84.738	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	89.014	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	81	96.367	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	92	99.344	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	99	97.063	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.146	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	80	86.338	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	100	92.613	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	99	92.618	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	100	92.462	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	99	93.409	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	89	73.916	ENSHCOG00000015348	-	88	86.449	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.221	ENSIPUG00000011060	smarca2	97	79.117	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.953	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	99	93.404	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.750	ENSJJAG00000010867	Smarca2	99	93.571	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.349	ENSKMAG00000015844	-	78	85.782	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	96	82.161	ENSLOCG00000011499	smarca2	80	88.681	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	91.156	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	92.915	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.989	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	99	94.051	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	94.173	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	93.746	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.985	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	99	93.816	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	95	99.362	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	92.807	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	80.740	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	79	86.651	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.267	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	80	86.259	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	77	77.955	ENSMGAG00000005160	-	81	87.442	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	95.794	ENSMICG00000005162	SMARCA2	99	95.794	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	92.942	ENSMOCG00000001611	Smarca2	99	92.567	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	90.621	ENSMODG00000003578	SMARCA2	80	97.781	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.241	ENSMALG00000009611	SMARCA2	80	85.056	Monopterus_albus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.041	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	99	92.002	Mus_caroli
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	92.723	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	99.441	Mus_musculus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	92.830	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	99	92.226	Mus_pahari
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	92.727	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	93	98.227	Mus_spretus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	79	97.654	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	97.654	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	90.118	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	89.516	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	92.576	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	92.389	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	94	66.689	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	95	98.728	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	82	98.887	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	83.478	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	99	83.302	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	80	93.518	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	80	93.518	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	92.217	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	92.719	Octodon_degus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.800	ENSONIG00000014163	SMARCA2	79	86.798	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	80	99.289	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	80	99.289	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	78.580	ENSORLG00000020820	SMARCA2	99	78.034	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	78.643	ENSORLG00015006289	SMARCA2	99	77.909	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	78.957	ENSOMEG00000009736	-	81	86.034	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.283	ENSOARG00000013265	SMARCA2	99	93.605	Ovis_aries
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	95	99.436	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	99	97.799	Pan_paniscus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	94.536	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	99	93.789	Panthera_pardus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.974	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	98	94.877	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	88.541	ENSPANG00000025121	SMARCA2	99	88.217	Papio_anubis
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	81.537	ENSPKIG00000018469	-	82	88.827	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	88.659	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	81	95.896	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	72.934	ENSPMGG00000013696	-	93	79.430	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	92.140	ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	91.890	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	94	71.891	ENSPMAG00000005337	-	94	70.836	Petromyzon_marinus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	91.646	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	99	91.463	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.146	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	79	85.083	Poecilia_formosa
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	78.970	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	80	82.520	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.146	ENSPMEG00000001815	-	79	85.083	Poecilia_mexicana
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.159	ENSPREG00000013800	SMARCA2	79	85.320	Poecilia_reticulata
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.985	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	99	93.750	Pongo_abelii
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	79	81.605	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	77	80.788	Procavia_capensis
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.166	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	99	92.732	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	91	97.093	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	94	97.093	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	76.088	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	96	74.447	Pundamilia_nyererei
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	82.708	ENSPNAG00000014635	smarca2	96	81.386	Pygocentrus_nattereri
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	91.574	ENSRNOG00000011931	Smarca2	99	91.082	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	93.546	ENSRBIG00000038618	SMARCA2	99	96.183	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	92.960	ENSRROG00000019271	SMARCA2	99	94.402	Rhinopithecus_roxellana
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