EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000017140 (Gene tree)
Gene ID: 100960500
Gene Symbol: URB1
Alias: -
Full Name: URB1 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 74423 bases
Position: chrGL873630.1:3367592-3442014
Accession: 100960500
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000015353	Npa1	PF11707.8	2.9e-87	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000017145	URB1-201	6792	XM_003797104	ENSOGAP00000015353	2264 (aa)	XP_003797152	H0XGX7

Gene Model

Click here to download ENSOGAG00000017140's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOGAG00000017140's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000017140	URB1	99	85.411	ENSG00000142207	URB1	99	85.374	Homo_sapiens
ENSOGAG00000017140	URB1	99	42.764	ENSAPOG00000020308	urb1	100	42.895	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000017140	URB1	100	80.352	ENSAMEG00000011998	URB1	99	80.529	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000017140	URB1	95	45.007	ENSACIG00000003248	urb1	97	44.915	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	40.925	ENSAOCG00000010364	urb1	100	40.969	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000017140	URB1	97	52.447	ENSAPEG00000010758	urb1	99	52.447	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000017140	URB1	99	43.881	ENSATEG00000011790	urb1	99	43.881	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000017140	URB1	97	56.377	ENSAPLG00000012791	URB1	100	56.377	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000017140	URB1	99	54.003	ENSACAG00000002817	URB1	98	53.758	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000017140	URB1	100	84.676	ENSANAG00000024617	URB1	99	84.808	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000017140	URB1	99	45.370	ENSACLG00000024865	urb1	100	44.972	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000017140	URB1	99	39.877	ENSAMXG00000012306	urb1	99	39.956	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000017140	URB1	100	76.316	ENSBTAG00000012412	URB1	99	76.404	Bos_taurus
ENSOGAG00000017140	URB1	100	83.817	ENSCJAG00000009118	URB1	99	83.949	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000017140	URB1	100	80.676	ENSCAFG00000008892	URB1	99	80.676	Canis_familiaris
ENSOGAG00000017140	URB1	100	80.441	ENSCAFG00020025987	-	99	80.441	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000017140	URB1	100	79.471	ENSCAFG00020025994	-	99	79.427	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000017140	URB1	100	75.658	ENSCHIG00000015645	URB1	99	75.746	Capra_hircus
ENSOGAG00000017140	URB1	100	84.398	ENSTSYG00000013286	URB1	99	84.398	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000017140	URB1	98	78.308	ENSCAPG00000015589	URB1	99	78.308	Cavia_aperea
ENSOGAG00000017140	URB1	100	79.348	ENSCPOG00000006748	URB1	99	79.348	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000017140	URB1	100	84.449	ENSCCAG00000021299	URB1	99	84.449	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000017140	URB1	100	85.066	ENSCATG00000042630	URB1	99	85.066	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000017140	URB1	99	79.974	ENSCLAG00000005262	URB1	99	79.974	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000017140	URB1	100	83.253	ENSCSAG00000009584	URB1	99	83.253	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	58.628	ENSCPBG00000006454	URB1	99	58.592	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000017140	URB1	100	85.066	ENSCANG00000031088	URB1	99	85.066	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	75.894	ENSCGRG00001010616	Urb1	99	76.115	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000017140	URB1	98	75.890	ENSCGRG00000015840	Urb1	99	75.890	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000017140	URB1	97	47.644	ENSCSEG00000012616	urb1	99	47.644	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000017140	URB1	96	51.420	ENSCVAG00000009076	urb1	98	51.848	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	43.415	ENSDARG00000060308	urb1	99	43.791	Danio_rerio
ENSOGAG00000017140	URB1	85	79.855	ENSDNOG00000015586	URB1	99	79.855	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	79.233	ENSDORG00000006735	Urb1	99	79.233	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000017140	URB1	92	79.455	ENSETEG00000009080	URB1	92	79.455	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000017140	URB1	100	80.441	ENSEASG00005007711	URB1	99	80.441	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000017140	URB1	97	87.968	ENSECAG00000013206	URB1	99	87.968	Equus_caballus
ENSOGAG00000017140	URB1	58	88.333	ENSEEUG00000003626	-	58	88.333	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	45.398	ENSELUG00000020516	urb1	98	45.161	Esox_lucius
ENSOGAG00000017140	URB1	99	80.494	ENSFCAG00000002177	URB1	99	80.583	Felis_catus
ENSOGAG00000017140	URB1	98	51.683	ENSFALG00000004636	URB1	99	51.770	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000017140	URB1	100	79.613	ENSFDAG00000007288	URB1	95	79.613	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000017140	URB1	99	41.402	ENSFHEG00000000202	urb1	99	41.955	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000017140	URB1	93	46.880	ENSGMOG00000001838	urb1	94	46.880	Gadus_morhua
ENSOGAG00000017140	URB1	99	56.756	ENSGALG00000015887	URB1	99	56.668	Gallus_gallus
ENSOGAG00000017140	URB1	93	52.220	ENSGAFG00000020694	urb1	97	52.043	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000017140	URB1	99	44.829	ENSGACG00000011703	urb1	99	44.785	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	58.035	ENSGAGG00000022544	URB1	99	57.998	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000017140	URB1	100	85.419	ENSGGOG00000000285	URB1	99	85.419	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000017140	URB1	99	45.326	ENSHBUG00000001904	urb1	100	44.919	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000017140	URB1	100	77.927	ENSHGLG00000004907	URB1	99	77.927	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000017140	URB1	100	78.471	ENSHGLG00100010749	URB1	99	78.471	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000017140	URB1	75	48.330	ENSHCOG00000018683	urb1	98	53.191	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000017140	URB1	99	41.056	ENSIPUG00000014721	urb1	99	41.143	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	81.409	ENSSTOG00000004539	URB1	99	81.057	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	41.113	ENSKMAG00000006001	urb1	99	46.822	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000017140	URB1	94	50.527	ENSLBEG00000027208	urb1	98	50.264	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000017140	URB1	99	48.466	ENSLACG00000017059	URB1	99	48.554	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000017140	URB1	99	46.609	ENSLOCG00000009190	urb1	99	46.435	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	77.578	ENSLAFG00000010407	URB1	100	77.578	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000017140	URB1	100	85.066	ENSMFAG00000034391	URB1	97	85.066	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000017140	URB1	100	84.758	ENSMMUG00000010295	URB1	99	84.758	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000017140	URB1	100	83.656	ENSMNEG00000032981	URB1	99	83.656	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000017140	URB1	100	85.110	ENSMLEG00000041435	URB1	99	85.110	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	43.412	ENSMAMG00000011238	urb1	99	43.325	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	40.639	ENSMZEG00005011862	urb1	100	40.346	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000017140	URB1	98	57.225	ENSMGAG00000014512	URB1	99	57.137	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000017140	URB1	94	79.326	ENSMAUG00000010516	Urb1	99	79.472	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000017140	URB1	100	87.472	ENSMICG00000016424	URB1	99	87.472	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	74.348	ENSMOCG00000012613	Urb1	99	74.348	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000017140	URB1	99	63.795	ENSMODG00000021076	URB1	100	63.708	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000017140	URB1	93	52.034	ENSMALG00000017411	urb1	96	51.820	Monopterus_albus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	74.736	MGP_CAROLIEiJ_G0020948	Urb1	99	74.736	Mus_caroli
ENSOGAG00000017140	URB1	99	75.088	ENSMUSG00000039929	Urb1	99	75.088	Mus_musculus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	74.824	MGP_PahariEiJ_G0016653	Urb1	99	74.615	Mus_pahari
ENSOGAG00000017140	URB1	99	75.044	MGP_SPRETEiJ_G0021854	Urb1	99	75.044	Mus_spretus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	79.365	ENSMPUG00000001123	URB1	99	79.365	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000017140	URB1	99	76.642	ENSNGAG00000001905	Urb1	99	76.509	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000017140	URB1	82	46.308	ENSNBRG00000001049	urb1	99	46.345	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000017140	URB1	99	83.599	ENSNLEG00000026872	URB1	99	83.568	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000017140	URB1	93	66.730	ENSMEUG00000010828	URB1	94	66.858	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000017140	URB1	99	73.789	ENSOPRG00000013482	URB1	100	73.789	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000017140	URB1	100	78.223	ENSODEG00000002587	URB1	99	78.223	Octodon_degus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	45.379	ENSONIG00000005599	urb1	100	45.447	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	79.665	ENSOCUG00000009381	URB1	99	79.665	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	43.734	ENSORLG00000003429	urb1	99	43.734	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000017140	URB1	99	43.679	ENSORLG00020013785	urb1	99	43.679	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000017140	URB1	99	42.527	ENSORLG00015019421	urb1	98	46.349	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000017140	URB1	77	50.881	ENSOMEG00000002094	urb1	98	51.834	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000017140	URB1	97	76.636	ENSOARG00000013679	URB1	99	76.720	Ovis_aries
ENSOGAG00000017140	URB1	100	85.639	ENSPPAG00000003423	URB1	99	85.639	Pan_paniscus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	80.618	ENSPPRG00000023131	URB1	99	80.618	Panthera_pardus
ENSOGAG00000017140	URB1	92	79.202	ENSPTIG00000016125	URB1	98	79.202	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000017140	URB1	100	85.507	ENSPTRG00000013852	URB1	99	85.507	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000017140	URB1	100	85.110	ENSPANG00000021964	URB1	99	85.110	Papio_anubis
ENSOGAG00000017140	URB1	99	45.605	ENSPKIG00000003683	urb1	99	45.790	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000017140	URB1	99	75.827	ENSPEMG00000021205	Urb1	99	75.607	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000017140	URB1	80	33.634	ENSPMAG00000009733	URB1	99	34.027	Petromyzon_marinus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	63.688	ENSPCIG00000016350	URB1	100	63.688	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000017140	URB1	96	43.516	ENSPLAG00000004371	urb1	99	43.379	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000017140	URB1	98	44.053	ENSPMEG00000006634	urb1	98	43.920	Poecilia_mexicana
ENSOGAG00000017140	URB1	99	44.395	ENSPREG00000013453	urb1	98	44.262	Poecilia_reticulata
ENSOGAG00000017140	URB1	99	84.748	ENSPPYG00000011359	URB1	99	84.714	Pongo_abelii
ENSOGAG00000017140	URB1	99	67.107	ENSPCAG00000007430	URB1	99	67.107	Procavia_capensis
ENSOGAG00000017140	URB1	100	88.394	ENSPCOG00000022695	URB1	99	88.394	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000017140	URB1	100	78.502	ENSPVAG00000000889	URB1	99	78.238	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	43.866	ENSPNYG00000010589	urb1	100	43.586	Pundamilia_nyererei
ENSOGAG00000017140	URB1	99	40.219	ENSPNAG00000019324	urb1	99	40.351	Pygocentrus_nattereri
ENSOGAG00000017140	URB1	99	74.879	ENSRNOG00000002080	Urb1	99	74.967	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000017140	URB1	100	84.493	ENSRBIG00000033122	URB1	99	84.493	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000017140	URB1	100	84.581	ENSRROG00000040237	URB1	99	84.581	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000017140	URB1	100	83.972	ENSSBOG00000027672	URB1	99	83.972	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000017140	URB1	99	63.680	ENSSHAG00000005140	URB1	100	63.680	Sarcophilus_harrisii
ENSOGAG00000017140	URB1	91	46.502	ENSSFOG00015000339	urb1	98	46.549	Scleropages_formosus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	44.474	ENSSMAG00000003782	urb1	99	43.970	Scophthalmus_maximus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	44.682	ENSSDUG00000012313	urb1	99	44.672	Seriola_dumerili
ENSOGAG00000017140	URB1	99	44.682	ENSSLDG00000023179	urb1	99	44.672	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOGAG00000017140	URB1	99	55.599	ENSSPUG00000012447	URB1	99	55.580	Sphenodon_punctatus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	44.357	ENSSPAG00000006325	urb1	99	44.488	Stegastes_partitus
ENSOGAG00000017140	URB1	100	77.959	ENSSSCG00000032024	URB1	99	77.959	Sus_scrofa
ENSOGAG00000017140	URB1	74	58.458	ENSTGUG00000013442	URB1	100	58.458	Taeniopygia_guttata
ENSOGAG00000017140	URB1	99	43.570	ENSTRUG00000009372	urb1	99	43.414	Takifugu_rubripes
ENSOGAG00000017140	URB1	99	42.384	ENSTNIG00000016277	urb1	100	42.360	Tetraodon_nigroviridis
ENSOGAG00000017140	URB1	81	84.638	ENSTBEG00000010044	URB1	81	84.638	Tupaia_belangeri
ENSOGAG00000017140	URB1	91	79.686	ENSTTRG00000007712	URB1	92	80.000	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000017140	URB1	100	80.220	ENSUAMG00000012231	URB1	99	80.220	Ursus_americanus
ENSOGAG00000017140	URB1	92	81.584	ENSUMAG00000017419	URB1	98	81.733	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000017140	URB1	68	90.476	ENSVPAG00000001164	URB1	68	90.476	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000017140	URB1	100	80.326	ENSVVUG00000000551	URB1	99	80.326	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000017140	URB1	99	50.677	ENSXETG00000009895	urb1	99	50.590	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000017140	URB1	99	41.619	ENSXCOG00000005500	urb1	97	46.366	Xiphophorus_couchianus
ENSOGAG00000017140	URB1	99	41.446	ENSXMAG00000007253	urb1	99	41.358	Xiphophorus_maculatus