EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000017242 (Gene tree)
Gene ID: 100965558
Gene Symbol: SRRT
Alias: -
Full Name: serrate%2C RNA effector molecule
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14022 bases
Position: chrGL873661.1:135234-149255
Accession: 100965558
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000015446	ARS2	PF04959.13	1.1e-90	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000017247	SRRT-201	2660	-	ENSOGAP00000015446	876 (aa)	XP_012666287	H0XH56

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.973	ENSG00000087087	SRRT	99	100.000	Homo_sapiens
ENSOGAG00000017242	SRRT	53	75.914	ENSAPOG00000002304	srrt	51	75.914	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	94.358	ENSAMEG00000014506	SRRT	100	94.358	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000017242	SRRT	79	75.699	ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000017242	SRRT	84	76.129	ENSAOCG00000009693	srrt	83	76.129	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000017242	SRRT	93	55.847	ENSAOCG00000009189	-	52	65.539	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000017242	SRRT	84	75.699	ENSAPEG00000003646	srrt	85	75.699	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000017242	SRRT	93	55.847	ENSAPEG00000020016	-	52	65.539	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000017242	SRRT	55	61.723	ENSATEG00000003652	-	85	64.092	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000017242	SRRT	81	73.548	ENSATEG00000014425	srrt	83	74.409	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000017242	SRRT	95	77.370	ENSACAG00000001014	SRRT	96	77.712	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.402	ENSANAG00000031718	SRRT	100	98.402	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000017242	SRRT	93	52.364	ENSACLG00000009423	-	52	63.636	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000017242	SRRT	53	74.409	ENSACLG00000013156	srrt	50	74.409	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000017242	SRRT	52	75.381	ENSAMXG00000016671	srrt	50	75.870	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.489	ENSBTAG00000001134	SRRT	100	97.489	Bos_taurus
ENSOGAG00000017242	SRRT	60	48.438	WBGene00017085	E01A2.2	80	48.333	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.059	ENSCJAG00000014917	SRRT	100	98.059	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.630	ENSCAFG00000023538	SRRT	100	98.630	Canis_familiaris
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.059	ENSCAFG00020013358	SRRT	100	98.059	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.603	ENSCHIG00000010495	SRRT	100	97.603	Capra_hircus
ENSOGAG00000017242	SRRT	96	93.929	ENSTSYG00000036426	SRRT	99	94.258	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000017242	SRRT	95	96.287	ENSCAPG00000013586	SRRT	100	96.287	Cavia_aperea
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.290	ENSCPOG00000001739	SRRT	100	98.290	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.516	ENSCCAG00000015877	SRRT	100	98.516	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.288	ENSCATG00000036306	SRRT	100	98.288	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.516	ENSCLAG00000007568	SRRT	100	98.516	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.630	ENSCSAG00000017996	SRRT	100	98.630	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000017242	SRRT	67	80.169	ENSCHOG00000007815	SRRT	67	94.706	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000017242	SRRT	74	81.298	ENSCPBG00000011553	SRRT	83	81.273	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	42.857	ENSCING00000003506	-	54	52.075	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	40.194	ENSCSAVG00000008394	-	81	54.039	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.945	ENSCANG00000034556	SRRT	100	97.945	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.494	ENSCGRG00001001594	Srrt	100	97.494	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	89.773	ENSCGRG00000007292	Srrt	100	89.773	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000017242	SRRT	53	67.452	ENSCSEG00000017878	srrt	50	67.666	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000017242	SRRT	95	65.435	ENSCVAG00000019848	srrt	96	64.923	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000017242	SRRT	90	55.190	ENSCVAG00000017344	-	51	62.670	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000017242	SRRT	95	66.590	ENSDARG00000017762	srrt	51	77.253	Danio_rerio
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.516	ENSDNOG00000003851	SRRT	100	98.516	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	96.246	ENSDORG00000005584	Srrt	100	96.246	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000017242	SRRT	96	45.748	FBgn0033062	Ars2	67	53.066	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000017242	SRRT	86	94.737	ENSETEG00000016175	SRRT	82	94.737	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000017242	SRRT	62	62.500	ENSEBUG00000008517	-	76	63.889	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.516	ENSEASG00005016956	SRRT	100	98.516	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.630	ENSECAG00000012292	SRRT	100	98.630	Equus_caballus
ENSOGAG00000017242	SRRT	85	97.727	ENSEEUG00000009117	SRRT	85	97.727	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000017242	SRRT	93	56.184	ENSELUG00000021216	-	53	64.449	Esox_lucius
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.858	ENSFCAG00000006855	SRRT	100	98.858	Felis_catus
ENSOGAG00000017242	SRRT	58	53.205	ENSFALG00000007524	-	79	75.342	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000017242	SRRT	98	93.341	ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.808	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000017242	SRRT	55	54.786	ENSFHEG00000004105	-	93	55.720	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000017242	SRRT	74	75.109	ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000017242	SRRT	95	60.529	ENSGMOG00000018619	srrt	51	70.299	Gadus_morhua
ENSOGAG00000017242	SRRT	53	74.624	ENSGAFG00000005423	srrt	51	74.624	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000017242	SRRT	93	52.927	ENSGAFG00000020383	-	54	61.229	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000017242	SRRT	95	63.479	ENSGACG00000020387	srrt	51	74.359	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000017242	SRRT	93	51.939	ENSGACG00000001100	-	53	61.345	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.973	ENSGGOG00000001508	SRRT	99	98.973	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000017242	SRRT	53	74.624	ENSHBUG00000002942	srrt	50	74.624	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.494	ENSHGLG00000008344	Srrt	100	97.494	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.603	ENSHGLG00100018857	Srrt	100	97.603	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000017242	SRRT	98	62.821	ENSHCOG00000005403	srrt	56	71.398	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000017242	SRRT	93	52.439	ENSHCOG00000008904	-	56	60.722	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000017242	SRRT	53	75.161	ENSIPUG00000021150	srrt	51	76.017	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.288	ENSSTOG00000013776	SRRT	100	98.288	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	95.890	ENSJJAG00000010446	Srrt	100	95.890	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000017242	SRRT	95	64.482	ENSKMAG00000013599	srrt	54	74.409	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000017242	SRRT	93	54.255	ENSKMAG00000008468	-	53	62.551	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000017242	SRRT	53	74.893	ENSLBEG00000016308	srrt	54	76.445	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000017242	SRRT	95	64.328	ENSLACG00000001089	SRRT	96	65.176	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000017242	SRRT	67	81.346	ENSLOCG00000013658	srrt	52	69.032	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.402	ENSLAFG00000007725	SRRT	100	98.402	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.059	ENSMFAG00000033745	SRRT	100	98.059	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.630	ENSMMUG00000021255	SRRT	100	98.630	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.630	ENSMNEG00000041864	SRRT	100	98.630	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.059	ENSMLEG00000029479	SRRT	100	98.059	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000017242	SRRT	93	54.363	ENSMAMG00000010681	-	52	65.328	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000017242	SRRT	53	73.333	ENSMAMG00000014311	srrt	51	74.409	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000017242	SRRT	53	74.409	ENSMZEG00005016135	srrt	50	74.409	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000017242	SRRT	93	52.364	ENSMZEG00005028002	-	52	63.636	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	96.918	ENSMAUG00000011386	Srrt	100	96.918	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	99.429	ENSMICG00000009471	SRRT	100	99.429	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.146	ENSMOCG00000001971	Srrt	100	97.146	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000017242	SRRT	87	55.456	ENSMMOG00000011137	-	55	65.672	Mola_mola
ENSOGAG00000017242	SRRT	95	65.721	ENSMMOG00000016399	srrt	54	74.359	Mola_mola
ENSOGAG00000017242	SRRT	54	89.144	ENSMODG00000004862	SRRT	90	90.249	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000017242	SRRT	90	62.271	ENSMALG00000018604	srrt	80	71.398	Monopterus_albus
ENSOGAG00000017242	SRRT	57	50.297	ENSMALG00000005567	-	84	52.043	Monopterus_albus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.717	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	100	97.717	Mus_caroli
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.717	ENSMUSG00000037364	Srrt	100	97.717	Mus_musculus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.260	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	100	97.260	Mus_pahari
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.717	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	100	97.717	Mus_spretus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.744	ENSMPUG00000015839	SRRT	100	98.744	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.174	ENSMLUG00000009975	SRRT	100	98.174	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.489	ENSNGAG00000023715	Srrt	100	97.489	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000017242	SRRT	53	72.903	ENSNBRG00000019100	srrt	52	72.903	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000017242	SRRT	95	87.846	ENSNLEG00000011987	SRRT	99	86.740	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000017242	SRRT	98	74.246	ENSMEUG00000011941	SRRT	98	73.898	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000017242	SRRT	62	100.000	ENSOPRG00000002502	-	67	100.000	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.032	ENSODEG00000016856	SRRT	100	97.032	Octodon_degus
ENSOGAG00000017242	SRRT	93	54.255	ENSONIG00000016080	-	52	62.869	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000017242	SRRT	53	74.839	ENSONIG00000004242	srrt	52	74.624	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000017242	SRRT	96	65.323	ENSORLG00000008120	srrt	52	73.978	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000017242	SRRT	96	65.589	ENSORLG00020003058	srrt	52	73.763	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000017242	SRRT	96	65.593	ENSORLG00015008062	srrt	52	73.763	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000017242	SRRT	93	56.083	ENSOMEG00000006963	-	53	64.331	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000017242	SRRT	96	66.086	ENSOMEG00000003155	srrt	85	74.569	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.032	ENSOARG00000015645	SRRT	100	97.032	Ovis_aries
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.288	ENSPPAG00000041090	SRRT	100	98.288	Pan_paniscus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	97.945	ENSPPRG00000009557	SRRT	100	97.945	Panthera_pardus
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.744	ENSPTIG00000014355	SRRT	100	98.744	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000017242	SRRT	100	98.288	ENSPTRG00000019511	SRRT	100	98.288	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000017242	SRRT	97	96.163	ENSPANG00000020763	SRRT	98	96.163	Papio_anubis
ENSOGAG00000017242	SRRT	94	67.344	ENSPKIG00000022212	-	52	76.344	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000017242	SRRT	96	69.601	ENSPKIG00000005434	srrt	54	79.015	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000017242	SRRT	95	79.478	ENSPSIG00000016311	SRRT	96	80.992	Pelodiscus_sinensis
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ENSOGAG00000017242	SRRT	93	53.228	ENSXMAG00000002090	-	54	61.277	Xiphophorus_maculatus