EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000024088 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1161 bases
Position: chrGL873564.1:2635631-2636791
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000021630	Ribosomal_L30_N	PF08079.12	5.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000029346	-	756	-	ENSOGAP00000021630	251 (aa)	-	H0XZT7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000024088	-	83	54.185	ENSOGAG00000030191	-	100	54.185
ENSOGAG00000024088	-	64	33.333	ENSOGAG00000029637	-	99	33.624
ENSOGAG00000024088	-	92	57.430	ENSOGAG00000033477	-	100	57.430
ENSOGAG00000024088	-	92	44.813	ENSOGAG00000033158	-	100	44.813
ENSOGAG00000024088	-	99	53.358	ENSOGAG00000031172	-	96	53.358
ENSOGAG00000024088	-	92	52.209	ENSOGAG00000024431	-	100	52.209
ENSOGAG00000024088	-	90	57.959	ENSOGAG00000003903	-	98	57.959
ENSOGAG00000024088	-	92	53.815	ENSOGAG00000030962	-	100	53.815
ENSOGAG00000024088	-	79	49.091	ENSOGAG00000009944	-	98	49.091
ENSOGAG00000024088	-	90	33.871	ENSOGAG00000012671	-	99	33.871
ENSOGAG00000024088	-	90	50.410	ENSOGAG00000030290	-	99	50.410
ENSOGAG00000024088	-	92	57.430	ENSOGAG00000033059	-	100	57.430
ENSOGAG00000024088	-	92	58.065	ENSOGAG00000027148	-	100	58.065
ENSOGAG00000024088	-	91	51.230	ENSOGAG00000008370	-	99	51.230

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000024088	-	90	32.389	ENSG00000146223	RPL7L1	96	32.389	Homo_sapiens
ENSOGAG00000024088	-	92	58.635	ENSG00000147604	RPL7	100	58.635	Homo_sapiens
ENSOGAG00000024088	-	58	39.394	ENSAPOG00000006262	rpl7l1	65	39.394	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000024088	-	90	45.714	ENSAPOG00000002965	rpl7	99	45.714	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000024088	-	90	32.389	ENSAMEG00000012791	RPL7L1	99	32.389	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000024088	-	76	49.515	ENSAMEG00000001370	-	98	49.515	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000024088	-	90	58.367	ENSAMEG00000001821	-	95	58.367	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000024088	-	93	55.556	ENSAMEG00000002828	-	94	55.556	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000024088	-	90	46.531	ENSACIG00000000602	rpl7	99	49.519	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000024088	-	58	39.634	ENSACIG00000010957	rpl7l1	65	39.634	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000024088	-	90	32.283	ENSAOCG00000013813	rpl7l1	98	32.283	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000024088	-	90	45.714	ENSAOCG00000013452	rpl7	99	48.325	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000024088	-	90	45.714	ENSAPEG00000021581	RPL7	98	47.926	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000024088	-	90	45.714	ENSAPEG00000022091	rpl7	98	47.926	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000024088	-	90	32.283	ENSAPEG00000004499	rpl7l1	98	32.283	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000024088	-	90	31.200	ENSATEG00000014469	rpl7l1	98	31.200	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000024088	-	90	45.902	ENSATEG00000013417	rpl7	99	45.902	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000024088	-	89	33.333	ENSAPLG00000013503	RPL7L1	93	33.333	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000024088	-	79	51.152	ENSAPLG00000005601	-	99	48.571	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000024088	-	88	32.510	ENSACAG00000029623	RPL7L1	96	32.510	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000024088	-	93	48.810	ENSACAG00000014396	RPL7	95	48.810	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000024088	-	88	30.453	ENSANAG00000024327	-	96	30.453	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000024088	-	83	52.968	ENSANAG00000034346	-	91	52.968	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000024088	-	92	57.261	ENSANAG00000035228	-	100	57.261	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000024088	-	91	53.333	ENSANAG00000023767	-	94	53.333	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000024088	-	89	58.264	ENSANAG00000023865	-	97	58.264	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000024088	-	50	38.806	ENSANAG00000037202	-	61	38.806	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000024088	-	90	53.061	ENSANAG00000032525	-	84	53.061	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000024088	-	94	32.296	ENSANAG00000024167	-	99	32.296	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000024088	-	58	36.646	ENSANAG00000037180	-	67	36.646	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000024088	-	76	53.589	ENSANAG00000028144	-	100	53.589	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000024088	-	92	56.800	ENSANAG00000036501	-	100	56.800	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000024088	-	92	45.817	ENSACLG00000024449	rpl7	96	51.232	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000024088	-	96	31.852	ENSACLG00000017975	rpl7l1	92	31.852	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000024088	-	90	31.452	ENSAMXG00000042591	rpl7l1	98	33.065	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000024088	-	88	46.025	ENSAMXG00000008499	rpl7	100	44.882	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000024088	-	92	57.831	ENSBTAG00000020139	RPL7	100	57.831	Bos_taurus
ENSOGAG00000024088	-	89	55.696	ENSBTAG00000006397	-	93	55.696	Bos_taurus
ENSOGAG00000024088	-	51	35.915	ENSBTAG00000054190	-	91	35.915	Bos_taurus
ENSOGAG00000024088	-	90	31.579	ENSBTAG00000018478	RPL7L1	99	32.653	Bos_taurus
ENSOGAG00000024088	-	89	53.909	ENSBTAG00000019994	-	97	53.909	Bos_taurus
ENSOGAG00000024088	-	89	56.067	ENSBTAG00000005395	-	98	56.067	Bos_taurus
ENSOGAG00000024088	-	92	57.028	ENSBTAG00000020550	-	100	57.028	Bos_taurus
ENSOGAG00000024088	-	87	31.799	WBGene00004418	rpl-7	97	31.799	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000024088	-	92	58.233	ENSCJAG00000045387	-	100	58.233	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000024088	-	86	30.380	ENSCJAG00000023295	-	84	30.380	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000024088	-	91	53.226	ENSCJAG00000016367	-	99	53.226	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000024088	-	90	58.130	ENSCJAG00000048312	-	98	58.130	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000024088	-	94	31.907	ENSCJAG00000004637	-	99	31.907	Callithrix_jacchus
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ENSOGAG00000024088	-	92	58.233	ENSCAFG00000008021	RPL7	100	58.233	Canis_familiaris
ENSOGAG00000024088	-	89	50.826	ENSCAFG00000001592	-	100	50.826	Canis_familiaris
ENSOGAG00000024088	-	90	56.557	ENSCAFG00000012624	-	98	56.557	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000024088	-	74	42.929	ENSCAFG00000003536	-	97	42.929	Canis_familiaris
ENSOGAG00000024088	-	89	53.086	ENSCAFG00020020086	-	87	53.086	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000024088	-	93	57.937	ENSCAFG00020017800	-	97	57.937	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000024088	-	93	56.746	ENSCAFG00020008863	-	90	56.746	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000024088	-	90	31.301	ENSCHIG00000010307	-	99	32.114	Capra_hircus
ENSOGAG00000024088	-	51	35.036	ENSCHIG00000021712	-	66	35.036	Capra_hircus
ENSOGAG00000024088	-	91	56.452	ENSCHIG00000017520	-	98	56.911	Capra_hircus
ENSOGAG00000024088	-	88	58.159	ENSCHIG00000020888	-	96	57.787	Capra_hircus
ENSOGAG00000024088	-	91	54.772	ENSCHIG00000019636	-	90	54.772	Capra_hircus
ENSOGAG00000024088	-	90	56.911	ENSCHIG00000012399	-	99	56.911	Capra_hircus
ENSOGAG00000024088	-	92	55.422	ENSCHIG00000004863	-	100	55.422	Capra_hircus
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ENSOGAG00000024088	-	94	53.937	ENSCHIG00000021291	-	94	53.937	Capra_hircus
ENSOGAG00000024088	-	90	57.787	ENSTSYG00000006100	-	99	57.787	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000024088	-	58	31.818	ENSCAPG00000012737	RPL7L1	76	31.818	Cavia_aperea
ENSOGAG00000024088	-	75	54.455	ENSCAPG00000012202	-	97	54.455	Cavia_aperea
ENSOGAG00000024088	-	75	56.585	ENSCPOG00000004140	-	97	56.585	Cavia_porcellus
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ENSOGAG00000024088	-	58	39.355	ENSCCAG00000027169	-	100	39.355	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000024088	-	75	55.500	ENSCCAG00000000389	-	88	55.500	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000024088	-	85	48.246	ENSCCAG00000027303	-	100	48.571	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000024088	-	90	57.724	ENSTTRG00000009074	-	95	57.724	Tursiops_truncatus
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ENSOGAG00000024088	-	90	58.537	ENSUAMG00000007593	-	99	58.537	Ursus_americanus
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ENSOGAG00000024088	-	90	31.579	ENSVPAG00000008894	RPL7L1	99	31.984	Vicugna_pacos
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ENSOGAG00000024088	-	92	47.200	ENSXETG00000025457	rpl7	100	47.200	Xenopus_tropicalis
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