EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000024538 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6225 bases
Position: chrGL873542.1:8525673-8531897
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000017360	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-46	1	9
ENSOGAP00000017360	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-46	2	9
ENSOGAP00000017360	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-46	3	9
ENSOGAP00000017360	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-46	4	9
ENSOGAP00000017360	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-46	5	9
ENSOGAP00000017360	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-46	6	9
ENSOGAP00000017360	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-46	7	9
ENSOGAP00000017360	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-46	8	9
ENSOGAP00000017360	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-46	9	9
ENSOGAP00000017360	zf-met	PF12874.7	1.4e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000033547	-	1962	-	ENSOGAP00000017360	654 (aa)	-	H0XML9

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000024538	-	59	36.620	ENSOGAG00000003269	ZNF319	88	34.384
ENSOGAG00000024538	-	74	41.237	ENSOGAG00000014983	ZNF81	89	41.237
ENSOGAG00000024538	-	69	46.032	ENSOGAG00000029163	-	51	46.032
ENSOGAG00000024538	-	59	37.500	ENSOGAG00000027487	ZNF236	66	37.500
ENSOGAG00000024538	-	61	42.078	ENSOGAG00000001907	-	89	41.775
ENSOGAG00000024538	-	59	39.485	ENSOGAG00000034730	ZNF628	58	39.224
ENSOGAG00000024538	-	59	42.857	ENSOGAG00000008879	GFI1B	53	42.857
ENSOGAG00000024538	-	59	31.905	ENSOGAG00000029101	ZNF784	89	31.905
ENSOGAG00000024538	-	58	38.182	ENSOGAG00000029813	ZNF423	64	38.182
ENSOGAG00000024538	-	56	53.061	ENSOGAG00000001902	ZFP1	86	53.061
ENSOGAG00000024538	-	61	31.073	ENSOGAG00000009996	PRDM5	85	31.161
ENSOGAG00000024538	-	73	39.316	ENSOGAG00000001912	ZNF233	72	39.286
ENSOGAG00000024538	-	66	52.083	ENSOGAG00000002111	-	95	52.083
ENSOGAG00000024538	-	69	51.852	ENSOGAG00000011129	ZNF317	74	37.783
ENSOGAG00000024538	-	98	37.143	ENSOGAG00000012069	ZNF225	98	37.143
ENSOGAG00000024538	-	65	38.889	ENSOGAG00000004779	ZNF564	97	38.889
ENSOGAG00000024538	-	98	45.259	ENSOGAG00000025289	-	99	43.073
ENSOGAG00000024538	-	61	42.228	ENSOGAG00000007268	ZSCAN2	70	43.048
ENSOGAG00000024538	-	59	36.538	ENSOGAG00000025131	ZNF121	88	36.538
ENSOGAG00000024538	-	58	34.507	ENSOGAG00000027905	PATZ1	55	34.940
ENSOGAG00000024538	-	59	46.341	ENSOGAG00000033980	ZNF768	56	46.341
ENSOGAG00000024538	-	70	47.222	ENSOGAG00000014360	ZNF829	100	47.205
ENSOGAG00000024538	-	59	44.196	ENSOGAG00000013758	ZNF774	69	41.916
ENSOGAG00000024538	-	69	35.294	ENSOGAG00000001561	ZNF425	76	37.273
ENSOGAG00000024538	-	99	36.634	ENSOGAG00000029772	-	98	36.386
ENSOGAG00000024538	-	61	46.552	ENSOGAG00000015980	-	99	46.552
ENSOGAG00000024538	-	73	43.158	ENSOGAG00000029343	-	99	43.158

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000024538	-	59	42.945	ENSAMXG00000034096	-	88	42.945	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000024538	-	59	47.826	ENSAMXG00000043019	-	95	47.826	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000024538	-	61	43.466	ENSAMXG00000000353	-	97	43.182	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000024538	-	59	42.254	ENSAMXG00000044028	-	98	44.240	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000024538	-	63	48.402	ENSAMXG00000029783	-	88	48.387	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000024538	-	59	46.154	ENSBTAG00000040358	-	100	46.119	Bos_taurus
ENSOGAG00000024538	-	76	36.755	ENSBTAG00000014593	-	91	40.367	Bos_taurus
ENSOGAG00000024538	-	59	41.470	ENSCSAG00000000471	-	99	43.429	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000024538	-	70	50.000	ENSCPBG00000002430	-	93	50.230	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000024538	-	74	45.494	ENSCPBG00000009609	-	88	45.614	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000024538	-	72	37.931	ENSDNOG00000047529	-	85	39.865	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000024538	-	59	38.462	ENSDNOG00000042588	-	85	38.462	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000024538	-	59	38.189	ENSEBUG00000016164	-	76	38.189	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000024538	-	62	39.640	ENSEBUG00000013221	-	85	40.000	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000024538	-	59	38.431	ENSEBUG00000016969	-	78	34.347	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000024538	-	70	48.214	ENSELUG00000019008	-	88	43.689	Esox_lucius
ENSOGAG00000024538	-	59	46.835	ENSFCAG00000043966	-	98	39.216	Felis_catus
ENSOGAG00000024538	-	59	39.640	ENSGAFG00000013048	-	68	38.974	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000024538	-	59	40.373	ENSGAFG00000021131	-	77	40.373	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000024538	-	59	43.333	ENSGGOG00000042802	-	99	43.333	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000024538	-	60	40.491	ENSHCOG00000014713	-	99	34.884	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000024538	-	59	38.671	ENSHCOG00000019512	-	83	38.671	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000024538	-	59	43.333	ENSMFAG00000008648	-	99	43.333	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000024538	-	59	43.333	ENSMNEG00000001556	-	99	43.333	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000024538	-	59	41.379	ENSMLEG00000007035	-	99	41.667	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000024538	-	88	41.379	ENSMAUG00000015263	-	75	41.379	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000024538	-	90	37.500	ENSMOCG00000003394	-	76	38.855	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000024538	-	99	35.797	ENSMODG00000028916	-	91	36.292	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000024538	-	70	47.701	ENSMPUG00000006562	-	69	47.701	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000024538	-	59	44.503	ENSNBRG00000010194	-	70	44.910	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000024538	-	59	43.333	ENSNLEG00000018988	-	99	43.333	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000024538	-	99	41.418	ENSMEUG00000012153	-	98	45.909	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000024538	-	59	43.793	ENSMEUG00000006978	-	82	41.118	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000024538	-	59	43.333	ENSPPAG00000014496	-	99	43.333	Pan_paniscus
ENSOGAG00000024538	-	59	41.470	ENSPANG00000030207	-	99	41.667	Papio_anubis
ENSOGAG00000024538	-	70	42.188	ENSPSIG00000002565	-	55	42.188	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000024538	-	59	42.692	ENSPSIG00000009650	-	70	39.429	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000024538	-	59	44.118	ENSPSIG00000010405	-	99	44.785	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000024538	-	90	36.620	ENSPEMG00000010242	-	78	39.077	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000024538	-	59	43.750	ENSPLAG00000021062	-	83	44.091	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000024538	-	65	42.604	ENSPLAG00000010389	-	72	40.690	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000024538	-	59	39.640	ENSPLAG00000020710	-	69	40.092	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000024538	-	69	43.548	ENSPCAG00000009106	-	89	43.548	Procavia_capensis
ENSOGAG00000024538	-	59	35.949	ENSPNYG00000024243	-	91	36.095	Pundamilia_nyererei
ENSOGAG00000024538	-	67	44.595	ENSPNAG00000018644	-	93	41.593	Pygocentrus_nattereri
ENSOGAG00000024538	-	72	46.591	ENSSHAG00000001415	-	98	46.591	Sarcophilus_harrisii
ENSOGAG00000024538	-	59	48.889	ENSSDUG00000009534	-	67	42.453	Seriola_dumerili
ENSOGAG00000024538	-	59	50.602	ENSSLDG00000013760	-	94	48.889	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOGAG00000024538	-	59	48.214	ENSSPUG00000007147	-	95	48.214	Sphenodon_punctatus
ENSOGAG00000024538	-	59	43.922	ENSTRUG00000006896	-	87	39.333	Takifugu_rubripes
ENSOGAG00000024538	-	59	42.520	ENSVPAG00000011867	-	89	42.520	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000024538	-	59	35.593	ENSXCOG00000009794	-	86	36.269	Xiphophorus_couchianus