EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000025900 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 483 bases
Position: chrGL873523.1:31630976-31631458
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000022009	Ribosomal_L29e	PF01779.17	4.1e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000026787	-	483	-	ENSOGAP00000022009	160 (aa)	-	H0Y0W6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000025900	-	100	81.875	ENSOGAG00000034723	-	100	81.875
ENSOGAG00000025900	-	100	88.554	ENSOGAG00000027259	-	100	88.554
ENSOGAG00000025900	-	100	88.554	ENSOGAG00000013766	-	100	88.554
ENSOGAG00000025900	-	100	87.805	ENSOGAG00000028514	-	100	87.805
ENSOGAG00000025900	-	100	77.439	ENSOGAG00000031859	-	100	77.439

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000025900	-	100	83.537	ENSG00000162244	RPL29	100	83.125	Homo_sapiens
ENSOGAG00000025900	-	89	55.245	ENSAMEG00000007743	-	94	56.391	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000025900	-	98	75.625	ENSAMEG00000009163	-	98	75.625	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000025900	-	95	59.211	ENSAMEG00000014527	-	91	59.211	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000025900	-	75	81.667	ENSAMEG00000001632	-	99	71.429	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000025900	-	100	83.333	ENSANAG00000001414	-	100	82.716	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000025900	-	100	85.802	ENSANAG00000031383	-	100	85.185	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000025900	-	100	85.802	ENSANAG00000030967	-	100	85.185	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000025900	-	100	85.802	ENSANAG00000024147	-	100	85.185	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000025900	-	81	83.077	ENSBTAG00000018628	RPL29	100	77.500	Bos_taurus
ENSOGAG00000025900	-	100	80.723	ENSCJAG00000045328	-	100	80.120	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.927	ENSCJAG00000049849	-	100	82.317	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.707	ENSCJAG00000050429	-	100	81.098	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.098	ENSCJAG00000051100	-	100	80.488	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.317	ENSCJAG00000051102	-	100	81.707	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	80.000	ENSCJAG00000021791	-	100	80.488	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.250	ENSCJAG00000050175	-	100	81.707	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.317	ENSCJAG00000048831	-	100	81.707	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.707	ENSCJAG00000047188	-	100	81.098	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.317	ENSCJAG00000050901	-	100	81.707	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.098	ENSCJAG00000049728	-	100	80.488	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.098	ENSCJAG00000050695	-	100	80.488	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.317	ENSCJAG00000040218	-	100	81.707	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.927	ENSCJAG00000050336	-	100	82.317	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.927	ENSCJAG00000048570	-	100	82.317	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.317	ENSCJAG00000049487	-	100	81.707	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.707	ENSCJAG00000049632	-	100	81.098	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.927	ENSCJAG00000039348	-	100	82.317	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.927	ENSCJAG00000042339	-	100	82.317	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.716	ENSCJAG00000040719	-	100	82.716	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.098	ENSCJAG00000038247	-	100	80.488	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.927	ENSCJAG00000050190	-	100	82.317	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	83.333	ENSCJAG00000038450	-	100	82.099	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.317	ENSCJAG00000050097	-	100	81.707	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.317	ENSCJAG00000050779	-	100	81.707	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.707	ENSCJAG00000049199	-	100	81.098	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	78.916	ENSCJAG00000047525	-	100	78.313	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.928	ENSCJAG00000043495	-	100	81.325	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.707	ENSCJAG00000044698	-	100	81.098	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.927	ENSCJAG00000051073	-	100	82.317	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.707	ENSCJAG00000047348	-	100	81.098	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.875	ENSCJAG00000049259	-	100	81.875	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.927	ENSCJAG00000050545	-	100	82.317	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.927	ENSCJAG00000049823	-	100	82.317	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.716	ENSCJAG00000022024	-	100	82.099	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.927	ENSCJAG00000049716	-	100	82.317	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.927	ENSCJAG00000050305	-	100	82.317	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.212	ENSCJAG00000045788	-	100	80.606	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	100	84.146	ENSCJAG00000050025	-	100	83.537	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025900	-	99	79.012	ENSCAFG00000018628	-	99	77.160	Canis_familiaris
ENSOGAG00000025900	-	99	77.160	ENSCAFG00000000263	-	99	77.160	Canis_familiaris
ENSOGAG00000025900	-	75	83.333	ENSCAFG00000009746	-	83	83.459	Canis_familiaris
ENSOGAG00000025900	-	99	75.926	ENSCAFG00000013592	-	99	74.074	Canis_familiaris
ENSOGAG00000025900	-	68	53.704	ENSCAFG00000013082	-	90	49.664	Canis_familiaris
ENSOGAG00000025900	-	99	72.500	ENSCAFG00020006295	-	99	71.069	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000025900	-	99	77.160	ENSCAFG00020022772	-	99	77.160	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000025900	-	99	77.246	ENSCAFG00020019951	-	74	75.449	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000025900	-	99	79.012	ENSCAFG00020018007	-	99	77.160	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000025900	-	78	82.400	ENSCHIG00000003692	-	100	75.625	Capra_hircus
ENSOGAG00000025900	-	100	69.375	ENSCHIG00000008135	-	100	70.000	Capra_hircus
ENSOGAG00000025900	-	78	84.677	ENSCHIG00000013811	-	100	77.500	Capra_hircus
ENSOGAG00000025900	-	82	71.756	ENSCHIG00000009503	-	85	71.970	Capra_hircus
ENSOGAG00000025900	-	100	76.543	ENSTSYG00000007004	-	100	70.000	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000025900	-	100	82.716	ENSTSYG00000035178	-	100	82.099	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000025900	-	100	70.000	ENSTSYG00000029312	-	100	71.875	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000025900	-	79	71.756	ENSCAPG00000010882	RPL29	100	71.141	Cavia_aperea
ENSOGAG00000025900	-	99	70.857	ENSCPOG00000011738	RPL29	100	69.143	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000025900	-	98	82.500	ENSCCAG00000022429	-	97	81.875	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000025900	-	100	84.049	ENSCCAG00000020116	-	100	83.436	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.209	ENSCCAG00000016109	-	100	81.595	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000025900	-	100	78.261	ENSCCAG00000020090	-	100	78.261	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000025900	-	100	81.595	ENSCCAG00000020636	-	100	80.982	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000025900	-	100	78.882	ENSCCAG00000031259	-	100	79.503	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000025900	-	100	84.049	ENSCCAG00000027980	-	100	83.436	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000025900	-	99	83.851	ENSCCAG00000035323	-	83	83.230	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000025900	-	100	82.927	ENSCATG00000035485	-	100	82.500	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000025900	-	100	75.625	ENSCATG00000036873	-	100	75.625	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000025900	-	90	77.778	ENSCLAG00000011185	RPL29	81	73.750	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000025900	-	100	70.909	ENSCSAG00000008076	-	100	71.515	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000025900	-	100	83.951	ENSCSAG00000019016	-	100	83.333	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000025900	-	100	83.951	ENSCSAG00000013884	-	100	83.333	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000025900	-	100	76.875	ENSCSAG00000019419	-	100	76.250	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000025900	-	66	83.019	ENSCSAG00000017871	-	94	83.019	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000025900	-	100	77.500	ENSCSAG00000019023	-	100	76.875	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000025900	-	100	70.625	ENSCSAG00000004652	-	100	70.625	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000025900	-	100	85.000	ENSCANG00000012194	-	100	84.375	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000025900	-	100	84.375	ENSCANG00000008958	-	100	83.750	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000025900	-	100	85.000	ENSCANG00000011673	-	100	84.375	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000025900	-	100	85.000	ENSCANG00000038427	-	100	84.375	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000025900	-	100	83.125	ENSCANG00000012001	-	100	82.500	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000025900	-	100	85.000	ENSCANG00000009798	-	100	84.375	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000025900	-	100	85.000	ENSCANG00000038432	-	100	84.375	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000025900	-	100	83.750	ENSCANG00000003596	-	100	83.125	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000025900	-	100	83.125	ENSCANG00000001103	-	100	82.500	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000025900	-	100	84.375	ENSCANG00000009743	-	100	83.750	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000025900	-	85	87.500	ENSCANG00000043082	-	97	87.970	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000025900	-	99	75.472	ENSCGRG00001010274	-	100	75.472	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000025900	-	99	76.101	ENSCGRG00001010247	-	100	76.101	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000025900	-	99	73.585	ENSCGRG00001006936	-	100	73.585	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000025900	-	98	76.282	ENSCGRG00000018733	-	100	76.282	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000025900	-	99	73.585	ENSCGRG00000019352	-	100	73.585	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000025900	-	99	73.585	ENSCGRG00000014780	-	100	73.585	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000025900	-	89	73.944	ENSCGRG00000007247	-	85	73.944	Cricetulus_griseus_crigri
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