EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000025950 (Gene tree)
Gene ID: 100963540
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: serine and arginine rich splicing factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3660 bases
Position: chrGL873613.1:2215957-2219616
Accession: 100963540
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000020636	RRM_1	PF00076.22	9.3e-34	1	2
ENSOGAP00000020636	RRM_1	PF00076.22	9.3e-34	2	2
ENSOGAP00000020655	RRM_1	PF00076.22	1e-33	1	2
ENSOGAP00000020655	RRM_1	PF00076.22	1e-33	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000024474	-	858	-	ENSOGAP00000020655	256 (aa)	-	H0XX12
ENSOGAT00000025680	-	2735	XM_003795567	ENSOGAP00000020636	248 (aa)	XP_003795615	H0XWZ3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000025950	-	65	46.988	ENSOGAG00000015122	SRSF5	75	42.308
ENSOGAG00000025950	-	78	41.148	ENSOGAG00000014468	SRSF6	57	41.262
ENSOGAG00000025950	-	77	69.792	ENSOGAG00000003852	SRSF9	88	68.750

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSG00000136450	SRSF1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSOGAG00000025950	-	79	91.133	ENSAPOG00000008542	-	86	90.187	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000025950	-	78	91.710	ENSAPOG00000002748	-	82	89.706	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000025950	-	100	97.177	ENSAMEG00000002635	SRSF1	100	97.177	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000025950	-	78	91.710	ENSACIG00000008091	srsf1a	87	90.196	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000025950	-	79	91.133	ENSAOCG00000000337	-	86	90.187	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000025950	-	78	92.228	ENSAOCG00000010671	-	87	90.686	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000025950	-	78	92.228	ENSAPEG00000009915	-	87	90.686	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000025950	-	79	91.133	ENSAPEG00000023352	-	85	90.187	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000025950	-	82	87.192	ENSATEG00000021567	-	86	88.942	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000025950	-	78	92.228	ENSATEG00000022403	-	82	90.686	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000025950	-	100	98.387	ENSACAG00000005542	-	100	98.387	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSANAG00000020583	-	99	98.611	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000025950	-	81	73.500	ENSANAG00000025417	-	80	72.596	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000025950	-	54	78.065	ENSAMXG00000024373	-	86	70.430	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000025950	-	94	91.632	ENSAMXG00000035996	srsf1a	83	93.333	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSBTAG00000014766	SRSF1	100	100.000	Bos_taurus
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSCJAG00000041713	-	99	98.611	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025950	-	79	91.837	ENSCJAG00000008111	-	92	91.787	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSCAFG00000017430	SRSF1	97	100.000	Canis_familiaris
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSCAFG00020025632	-	97	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSCHIG00000010787	SRSF1	100	100.000	Capra_hircus
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSTSYG00000013899	-	99	98.611	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSCPOG00000032681	-	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSCCAG00000029484	-	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSCATG00000042294	-	99	98.611	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSCLAG00000014707	-	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000025950	-	99	99.187	ENSCSAG00000005642	-	97	99.187	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSCHOG00000001899	SRSF1	100	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000025950	-	100	98.790	ENSCPBG00000009851	-	100	98.790	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSCANG00000029726	-	99	98.611	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSCGRG00001000670	Srsf1	97	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSCGRG00000005590	Srsf1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000025950	-	78	91.327	ENSCSEG00000014272	-	86	87.255	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000025950	-	79	83.962	ENSCSEG00000009973	-	93	77.366	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000025950	-	78	89.744	ENSCVAG00000005458	-	91	89.617	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000025950	-	78	92.228	ENSCVAG00000018617	-	82	90.686	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000025950	-	78	89.706	ENSDARG00000057691	srsf1a	99	87.958	Danio_rerio
ENSOGAG00000025950	-	99	96.735	ENSDARG00000017843	srsf1b	99	96.735	Danio_rerio
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSDNOG00000011737	-	97	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSDORG00000015082	Srsf1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000025950	-	97	79.245	ENSETEG00000005349	-	88	85.603	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSEASG00005002922	-	97	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSECAG00000016654	SRSF1	100	100.000	Equus_caballus
ENSOGAG00000025950	-	97	85.115	ENSEEUG00000009255	-	88	88.281	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000025950	-	78	93.299	ENSELUG00000021646	srsf1a	81	90.244	Esox_lucius
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSFCAG00000002250	-	97	100.000	Felis_catus
ENSOGAG00000025950	-	99	81.707	ENSFALG00000005062	-	97	81.707	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSFDAG00000010646	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000025950	-	78	92.228	ENSFHEG00000003174	srsf1a	87	90.686	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000025950	-	80	89.394	ENSGMOG00000014787	-	85	86.765	Gadus_morhua
ENSOGAG00000025950	-	100	98.790	ENSGALG00000005525	SRSF1	100	98.790	Gallus_gallus
ENSOGAG00000025950	-	79	86.802	ENSGACG00000020621	srsf1b	84	85.577	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000025950	-	99	98.780	ENSGAGG00000022965	-	97	98.780	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSGGOG00000004386	SRSF1	99	98.611	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000025950	-	78	91.710	ENSHBUG00000016788	srsf1a	85	90.196	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000025950	-	87	100.000	ENSHGLG00000000600	-	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000025950	-	87	100.000	ENSHGLG00000000669	-	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSHGLG00100016906	-	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000025950	-	78	87.310	ENSHCOG00000018918	srsf1a	81	88.462	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000025950	-	100	95.968	ENSIPUG00000008750	srsf1b	100	95.968	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000025950	-	94	91.213	ENSIPUG00000017039	srsf1a	83	93.810	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSSTOG00000000243	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000025950	-	51	92.126	ENSJJAG00000014464	-	95	88.189	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSJJAG00000000102	-	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000025950	-	78	92.228	ENSKMAG00000019232	srsf1a	83	89.216	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000025950	-	79	84.500	ENSLBEG00000015294	-	85	86.256	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000025950	-	78	91.192	ENSLBEG00000020864	-	87	89.706	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000025950	-	78	94.845	ENSLACG00000014160	srsf1a	77	91.220	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000025950	-	100	97.177	ENSLOCG00000005994	srsf1a	100	97.177	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSLAFG00000025743	SRSF1	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSMFAG00000040003	-	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSMMUG00000004725	SRSF1	99	98.611	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000025950	-	99	97.154	ENSMMUG00000003260	-	97	97.154	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSMNEG00000027680	-	99	98.611	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000025950	-	99	96.748	ENSMNEG00000015983	-	97	96.748	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSMLEG00000040509	SRSF1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000025950	-	99	94.309	ENSMLEG00000015243	-	97	94.309	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000025950	-	78	92.228	ENSMAMG00000018454	-	82	90.686	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000025950	-	79	94.924	ENSMAMG00000019691	-	86	92.308	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000025950	-	79	90.355	ENSMAMG00000019687	-	92	81.498	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSMAUG00000021845	Srsf1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSMICG00000013639	-	99	98.611	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSMOCG00000001996	Srsf1	100	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000025950	-	78	90.674	ENSMMOG00000014354	srsf1a	87	89.216	Mola_mola
ENSOGAG00000025950	-	97	79.310	ENSMODG00000014781	-	88	84.109	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000025950	-	78	91.710	ENSMALG00000017129	-	96	75.294	Monopterus_albus
ENSOGAG00000025950	-	82	77.941	ENSMALG00000007763	-	84	79.808	Monopterus_albus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016943	Srsf1	100	100.000	Mus_caroli
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSMUSG00000018379	Srsf1	100	100.000	Mus_musculus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0018074	Srsf1	100	100.000	Mus_pahari
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0017790	Srsf1	100	100.000	Mus_spretus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSMPUG00000015369	SRSF1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSMLUG00000011040	SRSF1	100	100.000	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000025950	-	82	90.640	ENSMLUG00000023995	-	83	89.423	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSNGAG00000011395	Srsf1	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000025950	-	100	79.839	ENSNBRG00000008041	srsf1b	84	83.654	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSNLEG00000008088	-	99	98.611	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000025950	-	51	98.425	ENSMEUG00000002783	-	100	98.425	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000025950	-	74	100.000	ENSOPRG00000001234	-	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000025950	-	100	99.597	ENSODEG00000011481	-	100	99.597	Octodon_degus
ENSOGAG00000025950	-	78	91.710	ENSONIG00000013160	-	82	90.196	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000025950	-	96	90.717	ENSONIG00000004860	-	85	90.865	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000025950	-	100	70.238	ENSOCUG00000010894	-	80	71.078	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000025950	-	78	92.228	ENSORLG00000004580	srsf1a	82	90.686	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000025950	-	78	92.228	ENSORLG00020009456	srsf1a	87	90.686	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000025950	-	78	92.228	ENSORLG00015014384	srsf1a	87	90.686	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000025950	-	71	90.341	ENSOMEG00000004106	srsf1a	76	88.770	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000025950	-	100	95.161	ENSOARG00000008323	SRSF1	100	95.161	Ovis_aries
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSPPAG00000043403	-	100	100.000	Pan_paniscus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSPPRG00000004238	-	100	100.000	Panthera_pardus
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSPTRG00000049077	SRSF1	99	98.611	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000025950	-	100	75.806	ENSPANG00000030275	-	76	96.899	Papio_anubis
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSPANG00000022305	-	99	98.611	Papio_anubis
ENSOGAG00000025950	-	100	95.968	ENSPKIG00000012857	srsf1b	100	95.968	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000025950	-	99	95.102	ENSPKIG00000007204	srsf1a	99	95.102	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000025950	-	79	90.955	ENSPSIG00000009000	-	100	92.391	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000025950	-	96	84.937	ENSPMGG00000005467	-	92	77.778	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOGAG00000025950	-	78	89.394	ENSPMGG00000013112	-	83	91.866	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSOGAG00000025950	-	50	89.431	ENSPMEG00000020607	-	98	87.805	Poecilia_mexicana
ENSOGAG00000025950	-	79	89.899	ENSPMEG00000002388	-	84	89.320	Poecilia_mexicana
ENSOGAG00000025950	-	78	92.228	ENSPREG00000009667	srsf1a	82	90.686	Poecilia_reticulata
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ENSOGAG00000025950	-	80	76.733	ENSPCOG00000025736	-	95	76.531	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000025950	-	75	100.000	ENSPVAG00000000519	-	75	100.000	Pteropus_vampyrus
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ENSOGAG00000025950	-	94	93.162	ENSPNAG00000022241	srsf1a	83	90.732	Pygocentrus_nattereri
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSRNOG00000050323	Srsf1	100	100.000	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSRBIG00000034445	-	99	98.611	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSRROG00000041506	-	100	100.000	Rhinopithecus_roxellana
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ENSOGAG00000025950	-	99	96.356	ENSSFOG00015004800	srsf1a	99	96.356	Scleropages_formosus
ENSOGAG00000025950	-	94	87.083	ENSSMAG00000009719	-	84	86.977	Scophthalmus_maximus
ENSOGAG00000025950	-	78	90.674	ENSSMAG00000007018	-	82	88.725	Scophthalmus_maximus
ENSOGAG00000025950	-	78	91.192	ENSSDUG00000011303	-	87	89.706	Seriola_dumerili
ENSOGAG00000025950	-	100	76.494	ENSSDUG00000003929	-	88	84.762	Seriola_dumerili
ENSOGAG00000025950	-	78	91.192	ENSSLDG00000010543	-	82	89.706	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOGAG00000025950	-	95	76.695	ENSSLDG00000016895	-	85	77.512	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOGAG00000025950	-	79	83.838	ENSSLDG00000016868	-	91	78.070	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOGAG00000025950	-	97	85.115	ENSSARG00000010949	-	88	88.281	Sorex_araneus
ENSOGAG00000025950	-	99	98.780	ENSSPUG00000000804	-	97	98.780	Sphenodon_punctatus
ENSOGAG00000025950	-	79	88.038	ENSSPAG00000014152	-	85	87.727	Stegastes_partitus
ENSOGAG00000025950	-	78	92.746	ENSSPAG00000022562	-	83	91.176	Stegastes_partitus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSSSCG00000017626	-	100	100.000	Sus_scrofa
ENSOGAG00000025950	-	74	98.370	ENSTGUG00000008416	-	100	98.370	Taeniopygia_guttata
ENSOGAG00000025950	-	78	91.192	ENSTRUG00000003691	srsf1a	82	89.706	Takifugu_rubripes
ENSOGAG00000025950	-	78	91.192	ENSTNIG00000016223	srsf1a	82	89.706	Tetraodon_nigroviridis
ENSOGAG00000025950	-	97	87.500	ENSTBEG00000015378	-	88	87.500	Tupaia_belangeri
ENSOGAG00000025950	-	74	100.000	ENSTTRG00000007310	SRSF1	100	100.000	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000025950	-	100	100.000	ENSUAMG00000009858	SRSF1	100	100.000	Ursus_americanus
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSUMAG00000000455	-	97	100.000	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000025950	-	100	99.597	ENSVPAG00000010094	SRSF1	100	99.597	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000025950	-	99	100.000	ENSVVUG00000011882	-	97	100.000	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000025950	-	100	95.968	ENSXETG00000008954	srsf1	100	91.386	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000025950	-	78	92.228	ENSXMAG00000011766	srsf1a	82	90.686	Xiphophorus_maculatus