EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000026047 (Gene tree)
Gene ID: 100957932
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: polyadenylate-binding protein 1-like 2
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 603 bases
Position: chrAAQR03193715.1:14-616
Accession: 100952812
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000022461	RRM_1	PF00076.22	3.2e-43	1	2
ENSOGAP00000022461	RRM_1	PF00076.22	3.2e-43	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000024509	-	603	XM_003803625	ENSOGAP00000022461	200 (aa)	XP_003803673	H0XPU6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000026047	-	98	63.265	ENSOGAG00000007921	-	62	63.265
ENSOGAG00000026047	-	98	58.333	ENSOGAG00000006882	PABPC5	93	58.673
ENSOGAG00000026047	-	99	69.036	ENSOGAG00000032999	PABPC1L	59	69.036
ENSOGAG00000026047	-	98	55.102	ENSOGAG00000026166	PABPC4L	98	55.102
ENSOGAG00000026047	-	79	32.203	ENSOGAG00000011417	TIAL1	74	32.203
ENSOGAG00000026047	-	85	32.895	ENSOGAG00000012877	ELAVL1	94	32.895
ENSOGAG00000026047	-	82	35.106	ENSOGAG00000026654	RBM3	60	35.106
ENSOGAG00000026047	-	98	70.918	ENSOGAG00000033115	-	56	70.918
ENSOGAG00000026047	-	98	74.490	ENSOGAG00000033369	-	61	74.490
ENSOGAG00000026047	-	100	100.000	ENSOGAG00000029513	-	100	100.000
ENSOGAG00000026047	-	98	75.510	ENSOGAG00000025522	-	57	75.510
ENSOGAG00000026047	-	99	76.650	ENSOGAG00000004067	PABPC4	57	76.650

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSG00000184388	PABPC1L2B	100	99.000	Homo_sapiens
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSG00000186288	PABPC1L2A	100	99.000	Homo_sapiens
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSAPOG00000015105	pabpc1a	58	80.102	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000026047	-	98	79.592	ENSAPOG00000017776	pabpc1b	61	79.592	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000026047	-	100	99.500	ENSAMEG00000019441	-	100	99.500	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSACIG00000004685	pabpc1a	58	80.102	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000026047	-	98	78.571	ENSACIG00000018366	pabpc1b	60	78.571	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSAOCG00000011656	pabpc1a	58	80.102	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSAOCG00000019839	pabpc1b	59	80.102	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSAPEG00000010435	pabpc1b	59	80.102	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSAPEG00000006963	pabpc1a	58	80.102	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000026047	-	98	79.082	ENSATEG00000012917	pabpc1b	59	79.082	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSATEG00000024852	pabpc1a	58	80.102	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSANAG00000019431	-	100	99.000	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSANAG00000019429	-	100	99.000	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSACLG00000009399	pabpc1a	68	78.889	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000026047	-	98	78.061	ENSACLG00000014335	pabpc1b	59	78.061	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000026047	-	98	79.592	ENSAMXG00000008599	pabpc1b	59	79.592	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000026047	-	100	100.000	ENSBTAG00000052491	-	94	100.000	Bos_taurus
ENSOGAG00000026047	-	100	99.500	ENSBTAG00000050902	-	95	99.500	Bos_taurus
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSCJAG00000041326	-	100	99.000	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000026047	-	100	99.500	ENSCAFG00020002052	-	96	99.500	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000026047	-	100	99.500	ENSCHIG00000011138	-	100	99.500	Capra_hircus
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSCHIG00000006283	-	100	99.000	Capra_hircus
ENSOGAG00000026047	-	100	99.500	ENSTSYG00000001775	-	100	99.500	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSCPOG00000009525	-	100	99.000	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSCCAG00000031524	-	100	99.000	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSCATG00000042826	-	100	99.000	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSCATG00000043125	-	100	99.000	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000026047	-	100	96.500	ENSCLAG00000017409	-	100	96.500	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000026047	-	100	96.500	ENSCLAG00000017412	-	100	96.500	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSCSAG00000000102	-	100	99.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000026047	-	99	93.467	ENSCGRG00001023387	-	98	93.467	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSCSEG00000013324	pabpc1a	58	80.102	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000026047	-	98	79.082	ENSCSEG00000015241	-	58	79.082	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000026047	-	98	79.592	ENSCVAG00000005489	pabpc1b	58	79.592	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSCVAG00000021872	pabpc1a	58	80.102	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000026047	-	98	79.592	ENSDARG00000017219	pabpc1a	58	79.592	Danio_rerio
ENSOGAG00000026047	-	98	79.082	ENSDARG00000021140	pabpc1b	92	86.885	Danio_rerio
ENSOGAG00000026047	-	100	97.500	ENSDNOG00000030926	-	100	97.500	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000026047	-	100	97.500	ENSDORG00000011362	-	100	97.500	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000026047	-	100	100.000	ENSEASG00005010399	-	95	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000026047	-	100	100.000	ENSECAG00000002620	-	95	100.000	Equus_caballus
ENSOGAG00000026047	-	100	94.500	ENSEEUG00000008203	-	100	94.500	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSELUG00000015062	-	58	80.102	Esox_lucius
ENSOGAG00000026047	-	98	79.592	ENSELUG00000003614	pabpc1a	60	79.592	Esox_lucius
ENSOGAG00000026047	-	93	55.615	ENSELUG00000005389	-	78	55.615	Esox_lucius
ENSOGAG00000026047	-	100	99.500	ENSFCAG00000039701	-	100	99.500	Felis_catus
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSFDAG00000005484	-	100	99.000	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSFHEG00000018979	pabpc1a	58	80.102	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000026047	-	98	79.082	ENSFHEG00000008186	pabpc1b	58	79.082	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000026047	-	98	79.592	ENSGMOG00000002448	-	59	79.592	Gadus_morhua
ENSOGAG00000026047	-	98	79.592	ENSGMOG00000013448	pabpc1a	58	79.592	Gadus_morhua
ENSOGAG00000026047	-	98	79.592	ENSGAFG00000010193	pabpc1b	60	79.592	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSGAFG00000019750	pabpc1a	61	80.102	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000026047	-	98	80.612	ENSGACG00000003771	pabpc1b	65	80.612	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSGACG00000003572	pabpc1a	58	80.102	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSGGOG00000038606	-	100	99.000	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSGGOG00000043933	-	100	99.000	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSHBUG00000020487	pabpc1a	68	78.889	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000026047	-	98	78.061	ENSHBUG00000002075	pabpc1b	61	78.061	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000026047	-	100	97.000	ENSHGLG00000019762	-	100	97.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000026047	-	100	97.000	ENSHGLG00000019668	-	100	97.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000026047	-	100	97.000	ENSHGLG00100020854	-	100	97.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSHCOG00000013502	pabpc1a	58	80.102	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000026047	-	95	68.783	ENSHCOG00000003175	pabpc1b	69	67.347	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000026047	-	98	79.592	ENSIPUG00000008848	pabpc1a	59	79.592	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000026047	-	98	79.592	ENSIPUG00000010791	-	61	79.592	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000026047	-	98	60.309	ENSIPUG00000021244	-	52	60.309	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000026047	-	100	98.500	ENSSTOG00000022096	-	100	98.500	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000026047	-	100	98.500	ENSSTOG00000026028	-	100	98.500	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000026047	-	100	98.000	ENSJJAG00000007037	-	100	98.000	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000026047	-	98	79.082	ENSKMAG00000008049	pabpc1b	63	79.082	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSKMAG00000000605	pabpc1a	58	80.102	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSLBEG00000024002	-	58	80.102	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSLBEG00000026845	pabpc1b	59	80.102	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000026047	-	99	96.985	ENSLAFG00000023096	-	99	96.985	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000026047	-	100	98.507	ENSMFAG00000028878	-	100	98.507	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSMMUG00000037681	-	100	99.000	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSMMUG00000039929	-	100	99.000	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSMMUG00000009740	-	100	99.000	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSMNEG00000037732	-	100	99.000	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSMLEG00000027495	-	100	99.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSMAMG00000004502	-	68	78.889	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000026047	-	98	79.082	ENSMAMG00000014610	pabpc1b	60	79.082	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000026047	-	98	78.061	ENSMZEG00005026745	pabpc1b	59	78.061	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSMZEG00005025416	pabpc1a	68	78.889	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000026047	-	100	100.000	ENSMICG00000047642	-	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSMMOG00000018009	pabpc1b	63	80.102	Mola_mola
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSMMOG00000018044	pabpc1a	68	78.889	Mola_mola
ENSOGAG00000026047	-	98	73.980	ENSMODG00000013156	-	58	73.980	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000026047	-	98	67.179	ENSMODG00000015024	-	57	67.179	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000026047	-	98	79.082	ENSMALG00000006066	pabpc1b	64	79.082	Monopterus_albus
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSMALG00000013020	-	62	80.102	Monopterus_albus
ENSOGAG00000026047	-	100	97.500	ENSNGAG00000012688	-	100	97.500	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSNBRG00000003068	-	68	78.889	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000026047	-	98	78.061	ENSNBRG00000013737	pabpc1b	63	78.061	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000026047	-	100	99.000	ENSNLEG00000018128	-	100	99.000	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000026047	-	100	96.500	ENSODEG00000018540	-	100	96.500	Octodon_degus
ENSOGAG00000026047	-	98	78.061	ENSONIG00000002717	pabpc1b	59	78.061	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSONIG00000006871	-	58	80.102	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000026047	-	100	99.500	ENSOCUG00000002565	-	100	99.500	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000026047	-	98	80.102	ENSORLG00000002691	pabpc1a	68	78.889	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000026047	-	98	77.041	ENSORLG00000003008	-	58	77.041	Oryzias_latipes
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ENSOGAG00000026047	-	98	77.041	ENSORLG00020022259	-	58	77.041	Oryzias_latipes_hni
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