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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000026181 (Gene tree)
Gene ID: 100949881
Gene Symbol: RAB1A
Alias: -
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 38111 bases
Position: chrGL873543.1:22032636-22070746
Accession: 100949881
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000019576	MMR_HSR1	PF01926.23	1e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000025883	RAB1A-201	1840	-	ENSOGAP00000019576	205 (aa)	XP_003788014	H0XTY4

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000026181	RAB1A	85	52.299	ENSOGAG00000007642	RAB11A	81	52.299
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	42.574	ENSOGAG00000012973	RAB14	93	42.574
ENSOGAG00000026181	RAB1A	90	48.649	ENSOGAG00000002728	-	86	48.649
ENSOGAG00000026181	RAB1A	81	41.916	ENSOGAG00000014855	RAB31	84	41.916
ENSOGAG00000026181	RAB1A	75	37.419	ENSOGAG00000009123	-	65	37.419
ENSOGAG00000026181	RAB1A	95	37.879	ENSOGAG00000027043	RAB6A	94	37.879
ENSOGAG00000026181	RAB1A	81	36.095	ENSOGAG00000004034	MRAS	85	34.637
ENSOGAG00000026181	RAB1A	78	39.264	ENSOGAG00000007885	RAB7A	79	39.264
ENSOGAG00000026181	RAB1A	57	34.746	ENSOGAG00000030870	ARL8A	61	34.746
ENSOGAG00000026181	RAB1A	80	38.415	ENSOGAG00000028680	NRAS	86	38.415
ENSOGAG00000026181	RAB1A	76	39.623	ENSOGAG00000015082	RAB9B	79	39.623
ENSOGAG00000026181	RAB1A	57	31.933	ENSOGAG00000007283	ARL4A	59	31.933
ENSOGAG00000026181	RAB1A	95	43.077	ENSOGAG00000009456	RAB5C	89	43.077
ENSOGAG00000026181	RAB1A	95	34.419	ENSOGAG00000000096	RAB36	79	34.419
ENSOGAG00000026181	RAB1A	69	30.201	ENSOGAG00000029839	ARL4D	73	30.201
ENSOGAG00000026181	RAB1A	95	38.144	ENSOGAG00000015779	RAB22A	97	38.144
ENSOGAG00000026181	RAB1A	94	36.410	ENSOGAG00000005245	RAB6B	94	36.410
ENSOGAG00000026181	RAB1A	82	49.704	ENSOGAG00000028002	RAB12	90	46.032
ENSOGAG00000026181	RAB1A	81	50.602	ENSOGAG00000033189	RAB30	82	50.602
ENSOGAG00000026181	RAB1A	62	34.586	ENSOGAG00000033920	ARL14	65	34.586
ENSOGAG00000026181	RAB1A	57	33.058	ENSOGAG00000034816	-	61	33.058
ENSOGAG00000026181	RAB1A	89	33.333	ENSOGAG00000028133	RAB21	92	33.816
ENSOGAG00000026181	RAB1A	86	43.820	ENSOGAG00000025424	RAB39B	84	43.820
ENSOGAG00000026181	RAB1A	97	41.176	ENSOGAG00000016955	RAB25	95	41.176
ENSOGAG00000026181	RAB1A	83	43.182	ENSOGAG00000006778	RAB33B	77	43.182
ENSOGAG00000026181	RAB1A	90	45.946	ENSOGAG00000028015	RAB18	93	46.154
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	93.069	ENSOGAG00000028013	RAB1B	100	93.069
ENSOGAG00000026181	RAB1A	84	33.898	ENSOGAG00000024846	HRAS	93	33.898
ENSOGAG00000026181	RAB1A	80	46.386	ENSOGAG00000002443	RAB15	78	46.386
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	45.581	ENSOGAG00000003227	RAB11B	98	45.581
ENSOGAG00000026181	RAB1A	84	33.526	ENSOGAG00000005675	RAB23	73	33.526
ENSOGAG00000026181	RAB1A	57	31.092	ENSOGAG00000034868	ARL4C	61	31.092
ENSOGAG00000026181	RAB1A	76	39.623	ENSOGAG00000002868	RAB9A	79	39.623
ENSOGAG00000026181	RAB1A	83	41.899	ENSOGAG00000006951	-	81	41.899
ENSOGAG00000026181	RAB1A	80	37.805	ENSOGAG00000014812	KRAS	95	35.912
ENSOGAG00000026181	RAB1A	80	47.024	ENSOGAG00000033299	RAB33A	71	47.024
ENSOGAG00000026181	RAB1A	82	57.988	ENSOGAG00000016969	-	84	57.988

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	Bos_taurus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000026181	RAB1A	96	100.000	ENSCHIG00000014060	RAB1A	96	100.000	Capra_hircus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	98.049	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	99.512	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	99.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	97.561	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	97.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	84.466	FBgn0285937	Rab1	100	84.466	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	100.000	Equus_caballus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	100.000	Felis_catus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	97.537	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.537	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	99.512	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	99.512	Gallus_gallus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	99.512	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	99.512	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	97.549	ENSHGLG00100007994	RAB1A	99	97.549	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	96	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	96	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	98.537	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	98.537	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000026181	RAB1A	96	100.000	ENSMMUG00000021721	RAB1A	91	100.000	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000026181	RAB1A	95	99.485	ENSMNEG00000028414	-	97	99.485	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	96.040	ENSMZEG00005013959	-	100	96.040	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000026181	RAB1A	96	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	99.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	99.512	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	99.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	99.512	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	99.512	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	99.512	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	100.000	Mus_caroli
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	100.000	Mus_musculus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	100.000	Mus_pahari
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	96.040	ENSNBRG00000020492	-	100	96.040	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000026181	RAB1A	96	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000026181	RAB1A	94	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	93.627	ENSONIG00000006819	-	100	93.627	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	99.512	ENSOANG00000012438	RAB1A	100	99.512	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	100	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	96	100.000	ENSOARG00000019997	RAB1A	97	100.000	Ovis_aries
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	100.000	ENSPPAG00000030253	RAB1A	100	100.000	Pan_paniscus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	Panthera_pardus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	96	100.000	ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSPTRG00000011989	RAB1A	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSPANG00000010485	RAB1A	100	100.000	Papio_anubis
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	96.552	ENSPSIG00000008028	RAB1A	99	96.552	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	95.588	ENSPMGG00000021015	-	99	95.588	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSPEMG00000009340	Rab1a	100	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	93.137	ENSPFOG00000000498	-	99	93.137	Poecilia_formosa
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ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	96.040	ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	96.040	Seriola_dumerili
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ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSSSCG00000008359	RAB1A	100	100.000	Sus_scrofa
ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	97.073	ENSTGUG00000002328	RAB1A	100	97.073	Taeniopygia_guttata
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ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	ENSVVUG00000027588	RAB1A	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	94.554	ENSXMAG00000015776	-	100	94.554	Xiphophorus_maculatus