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Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000026415 (Gene tree)
Gene ID: 100946425
Gene Symbol: APOBEC1
Alias: -
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4817 bases
Position: chrGL873623.1:454143-458959
Accession: 100946425
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000020110	APOBEC_N	PF08210.11	6.7e-28	1	1
ENSOGAP00000020110	APOBEC_C	PF05240.14	3.5e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000031395	APOBEC1-201	711	XM_012809327	ENSOGAP00000020110	236 (aa)	XP_012664781	H0XVG8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	54	43.421	ENSOGAG00000030300	-	55	43.421
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	56	39.416	ENSOGAG00000032498	-	54	39.416
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	53	35.385	ENSOGAG00000026770	AICDA	65	35.385
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	67	39.286	ENSOGAG00000033404	-	65	39.286

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	81.385	ENSG00000111701	APOBEC1	98	81.385	Homo_sapiens
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	100	80.508	ENSAMEG00000007098	APOBEC1	100	80.508	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	72	41.143	ENSACAG00000028578	-	93	41.143	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	79.654	ENSANAG00000027743	APOBEC1	93	79.654	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	69.697	ENSBTAG00000014683	APOBEC1	98	69.697	Bos_taurus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	94	78.281	ENSCJAG00000005398	APOBEC1	100	78.281	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	99	77.682	ENSCAFG00000013901	APOBEC1	99	77.682	Canis_familiaris
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	96	77.876	ENSCAFG00020003511	APOBEC1	95	77.876	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	100	69.915	ENSCHIG00000011898	APOBEC1	98	69.915	Capra_hircus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	59	79.286	ENSTSYG00000029141	APOBEC1	99	79.286	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	91	69.159	ENSCAPG00000015882	-	99	69.159	Cavia_aperea
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	67.672	ENSCPOG00000033068	APOBEC1	98	67.672	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	79.654	ENSCCAG00000022258	APOBEC1	98	79.654	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	81.818	ENSCATG00000021613	APOBEC1	93	81.818	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	96	71.239	ENSCLAG00000014645	APOBEC1	98	71.239	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	81	80.000	ENSCSAG00000009817	APOBEC1	99	80.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	77	44.624	ENSCPBG00000017398	-	82	44.624	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	89	44.076	ENSCPBG00000014328	-	90	44.076	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	83	47.449	ENSCPBG00000014329	-	54	47.449	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	89	37.559	ENSCPBG00000014327	-	78	43.750	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	77	45.109	ENSCPBG00000014335	-	74	45.109	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	93	41.518	ENSCPBG00000014331	-	90	41.518	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	97	80.786	ENSCANG00000038359	APOBEC1	99	80.786	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	97	69.869	ENSCGRG00001011130	Apobec1	100	69.869	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	97	69.869	ENSCGRG00000008644	Apobec1	100	69.869	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	76.293	ENSDNOG00000010926	APOBEC1	98	76.293	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	90	64.486	ENSDORG00000023717	Apobec1	100	64.486	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	97	75.217	ENSETEG00000004867	APOBEC1	97	75.217	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	100	79.661	ENSEASG00005015951	APOBEC1	99	79.661	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	81	79.474	ENSECAG00000017163	APOBEC1	99	79.474	Equus_caballus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	86	56.373	ENSEEUG00000007530	-	97	56.373	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	92	67.890	ENSEEUG00000009112	-	97	67.890	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	99	80.258	ENSFCAG00000009350	APOBEC1	99	80.258	Felis_catus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	60	48.951	ENSFALG00000007257	-	70	48.951	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	88	58.937	ENSFDAG00000018470	APOBEC1	99	58.937	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	68	48.765	ENSGAGG00000004947	-	76	54.098	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	88	45.933	ENSGAGG00000011837	-	91	50.000	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	87	43.204	ENSGAGG00000021744	-	78	43.204	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	78	39.572	ENSGAGG00000021745	-	69	39.572	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	78	45.652	ENSGAGG00000006624	-	65	45.652	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	64.655	ENSHGLG00000001495	APOBEC1	98	64.655	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	64.224	ENSHGLG00100002187	APOBEC1	98	64.224	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	91	63.256	ENSSTOG00000021971	APOBEC1	100	77.551	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	96	71.239	ENSJJAG00000022108	Apobec1	99	71.239	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	94	78.027	ENSLAFG00000030837	APOBEC1	100	78.027	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	81.385	ENSMFAG00000000277	APOBEC1	99	80.526	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	81.818	ENSMNEG00000029670	APOBEC1	98	81.818	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	81.818	ENSMLEG00000036301	APOBEC1	98	81.818	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	92	70.370	ENSMAUG00000022167	Apobec1	97	70.370	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	86.580	ENSMICG00000043645	APOBEC1	98	86.580	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	99	67.382	ENSMODG00000018004	APOBEC1	99	67.382	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	97	70.614	ENSMUSG00000040613	Apobec1	99	70.614	Mus_musculus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	97	69.298	MGP_PahariEiJ_G0022580	-	99	69.298	Mus_pahari
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	97	70.614	MGP_SPRETEiJ_G0029857	Apobec1	99	70.614	Mus_spretus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	99	77.253	ENSMPUG00000017532	APOBEC1	99	77.253	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	95	69.643	ENSNGAG00000022607	Apobec1	98	69.643	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	81.818	ENSNLEG00000005342	APOBEC1	98	81.818	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	67.532	ENSMEUG00000013406	APOBEC1	98	67.532	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	76	62.222	ENSOPRG00000009508	-	99	62.222	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	72.294	ENSOCUG00000025736	APOBEC1	87	72.294	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	70.130	ENSOARG00000002072	APOBEC1	97	70.130	Ovis_aries
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	100	76.271	ENSPPAG00000027657	APOBEC1	100	76.271	Pan_paniscus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	99	80.687	ENSPPRG00000012182	APOBEC1	99	80.687	Panthera_pardus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	99	80.687	ENSPTIG00000020280	APOBEC1	99	80.687	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	80.952	ENSPTRG00000004614	APOBEC1	98	80.952	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	81.385	ENSPANG00000021027	APOBEC1	98	81.385	Papio_anubis
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	92	41.743	ENSPSIG00000012568	-	91	41.743	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	53	48.571	ENSPSIG00000012791	-	70	48.571	Pelodiscus_sinensis
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	97	69.869	ENSPEMG00000023841	Apobec1	100	69.869	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	69.697	ENSPCIG00000023973	APOBEC1	98	69.697	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	80.519	ENSPPYG00000004228	APOBEC1	93	80.519	Pongo_abelii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	79	78.075	ENSPCAG00000008733	APOBEC1	100	78.075	Procavia_capensis
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	94	86.036	ENSPCOG00000013957	APOBEC1	98	86.036	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	62.771	ENSPVAG00000010709	APOBEC1	98	62.771	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	97	68.860	ENSRNOG00000015411	Apobec1	99	68.860	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	80.519	ENSRBIG00000031161	APOBEC1	98	80.519	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	80.519	ENSRROG00000033576	APOBEC1	98	80.519	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	73	78.613	ENSSBOG00000030587	APOBEC1	98	78.613	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	96	70.925	ENSSHAG00000008925	APOBEC1	99	70.925	Sarcophilus_harrisii
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	56	74.046	ENSSARG00000011972	-	99	74.046	Sorex_araneus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	73	67.442	ENSSARG00000000032	-	100	67.442	Sorex_araneus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	90	42.661	ENSSPUG00000009044	-	83	42.661	Sphenodon_punctatus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	75.758	ENSSSCG00000000668	APOBEC1	98	75.758	Sus_scrofa
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	61	48.611	ENSTGUG00000013118	-	99	48.611	Taeniopygia_guttata
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	94	73.756	ENSTBEG00000010043	APOBEC1	94	73.756	Tupaia_belangeri
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	77	72.527	ENSTTRG00000014015	APOBEC1	97	72.527	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	100	80.085	ENSUAMG00000011636	APOBEC1	97	80.085	Ursus_americanus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	100	80.085	ENSUMAG00000016552	APOBEC1	97	80.085	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	98	73.160	ENSVPAG00000001343	APOBEC1	98	73.160	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000026415	APOBEC1	99	78.541	ENSVVUG00000010522	APOBEC1	99	78.541	Vulpes_vulpes