EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000026698 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 920 bases
Position: chrGL873554.1:6267164-6268083
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000015724	Ribosomal_L21e	PF01157.18	1.9e-50	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000031617	-	468	-	ENSOGAP00000015724	156 (aa)	-	H0XHY4

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000026698	-	93	62.416	ENSOGAG00000031179	-	92	62.416
ENSOGAG00000026698	-	100	92.500	ENSOGAG00000033479	-	100	92.500
ENSOGAG00000026698	-	92	73.026	ENSOGAG00000032711	-	100	73.026
ENSOGAG00000026698	-	92	87.075	ENSOGAG00000000212	-	100	87.075
ENSOGAG00000026698	-	100	73.750	ENSOGAG00000033936	-	100	73.750
ENSOGAG00000026698	-	83	72.180	ENSOGAG00000032000	-	98	67.532
ENSOGAG00000026698	-	92	72.603	ENSOGAG00000033882	-	100	72.603
ENSOGAG00000026698	-	100	90.000	ENSOGAG00000027159	-	100	90.000
ENSOGAG00000026698	-	79	85.938	ENSOGAG00000034285	-	100	85.938
ENSOGAG00000026698	-	97	86.538	ENSOGAG00000030812	-	98	86.538
ENSOGAG00000026698	-	100	85.625	ENSOGAG00000034076	-	100	85.625
ENSOGAG00000026698	-	99	75.316	ENSOGAG00000032866	-	99	75.316
ENSOGAG00000026698	-	93	77.181	ENSOGAG00000034423	-	93	77.181
ENSOGAG00000026698	-	92	77.027	ENSOGAG00000025213	-	100	77.027
ENSOGAG00000026698	-	100	83.019	ENSOGAG00000030151	-	98	83.019
ENSOGAG00000026698	-	100	85.625	ENSOGAG00000026636	-	100	85.625
ENSOGAG00000026698	-	99	68.323	ENSOGAG00000000555	-	99	68.323
ENSOGAG00000026698	-	97	73.548	ENSOGAG00000012452	-	97	73.548
ENSOGAG00000026698	-	97	85.897	ENSOGAG00000027182	-	98	85.897
ENSOGAG00000026698	-	100	87.500	ENSOGAG00000024836	-	100	89.375
ENSOGAG00000026698	-	100	83.750	ENSOGAG00000030115	-	100	85.000
ENSOGAG00000026698	-	100	90.000	ENSOGAG00000029441	-	100	90.000
ENSOGAG00000026698	-	97	78.065	ENSOGAG00000034390	-	100	78.065
ENSOGAG00000026698	-	81	92.366	ENSOGAG00000008181	-	100	92.366
ENSOGAG00000026698	-	92	87.838	ENSOGAG00000010179	-	100	87.838

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000026698	-	100	93.125	ENSG00000122026	RPL21	100	93.125	Homo_sapiens
ENSOGAG00000026698	-	100	80.000	ENSAPOG00000024402	rpl21	100	80.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000026698	-	100	90.000	ENSAMEG00000018663	RPL21	98	90.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000026698	-	100	59.494	ENSAMEG00000004632	-	100	59.494	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000026698	-	100	73.913	ENSAMEG00000004710	-	100	73.913	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000026698	-	100	81.875	ENSACIG00000021885	rpl21	100	81.875	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000026698	-	100	80.000	ENSAOCG00000017829	rpl21	100	80.000	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000026698	-	100	80.000	ENSAPEG00000019936	rpl21	100	80.000	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000026698	-	100	81.875	ENSATEG00000010524	rpl21	100	81.875	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000026698	-	100	84.375	ENSAPLG00000005641	RPL21	98	87.500	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000026698	-	100	83.125	ENSACAG00000003169	RPL21	100	86.875	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000026698	-	100	91.250	ENSANAG00000031513	-	100	91.250	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026698	-	51	72.152	ENSANAG00000032255	-	89	72.152	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026698	-	100	90.625	ENSANAG00000006331	-	100	90.625	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026698	-	100	93.125	ENSANAG00000023031	-	100	93.125	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026698	-	51	84.810	ENSANAG00000024239	-	90	84.810	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026698	-	97	92.258	ENSANAG00000012283	-	100	92.258	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026698	-	100	91.250	ENSANAG00000031230	-	100	91.250	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026698	-	51	87.342	ENSANAG00000036314	-	90	87.342	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026698	-	100	90.625	ENSANAG00000020005	-	100	90.625	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026698	-	100	88.750	ENSANAG00000019962	-	100	88.750	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000026698	-	100	81.875	ENSACLG00000026444	rpl21	100	81.875	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000026698	-	100	79.375	ENSAMXG00000041892	rpl21	100	79.375	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000026698	-	52	88.889	ENSBTAG00000048537	-	84	88.889	Bos_taurus
ENSOGAG00000026698	-	51	93.671	ENSBTAG00000054555	-	87	93.671	Bos_taurus
ENSOGAG00000026698	-	100	91.250	ENSBTAG00000038379	-	100	91.250	Bos_taurus
ENSOGAG00000026698	-	51	82.278	ENSBTAG00000055209	-	93	82.278	Bos_taurus
ENSOGAG00000026698	-	51	88.608	ENSBTAG00000051077	-	86	88.608	Bos_taurus
ENSOGAG00000026698	-	100	91.875	ENSBTAG00000001648	RPL21	100	91.875	Bos_taurus
ENSOGAG00000026698	-	100	57.143	WBGene00004433	rpl-21	100	57.143	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000026698	-	87	87.143	ENSCJAG00000044684	-	98	87.143	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000026698	-	100	65.625	ENSCJAG00000044477	-	100	65.625	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000026698	-	100	91.875	ENSCJAG00000038205	-	100	91.875	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000026698	-	69	77.570	ENSCJAG00000041707	-	98	77.570	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000026698	-	100	87.500	ENSCJAG00000019734	-	100	87.500	Callithrix_jacchus
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ENSOGAG00000026698	-	100	93.125	ENSCAFG00020004535	-	100	93.125	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000026698	-	100	88.125	ENSCHIG00000010112	-	100	88.125	Capra_hircus
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ENSOGAG00000026698	-	96	75.325	ENSSTOG00000012575	-	99	75.325	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSOGAG00000026698	-	100	81.366	ENSMMUG00000009554	-	100	82.609	Macaca_mulatta
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ENSOGAG00000026698	-	100	93.125	ENSMNEG00000034115	RPL21	100	93.125	Macaca_nemestrina
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ENSOGAG00000026698	-	100	93.125	ENSMNEG00000038090	-	100	93.125	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000026698	-	100	90.000	ENSMNEG00000024050	-	100	90.000	Macaca_nemestrina
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ENSOGAG00000026698	-	98	87.898	ENSMNEG00000029252	-	99	87.898	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000026698	-	100	91.250	ENSMLEG00000010018	-	100	91.250	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000026698	-	100	83.750	ENSMLEG00000033458	-	99	83.750	Mandrillus_leucophaeus
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ENSOGAG00000026698	-	100	81.366	ENSMLEG00000030476	-	100	82.609	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000026698	-	100	78.125	ENSMLEG00000039003	-	100	78.125	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000026698	-	100	81.875	ENSMAMG00000001006	rpl21	100	81.875	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000026698	-	100	81.875	ENSMZEG00005021908	rpl21	100	81.875	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000026698	-	100	85.000	ENSMGAG00000015105	RPL21	100	88.125	Meleagris_gallopavo
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ENSOGAG00000026698	-	100	78.882	ENSMAUG00000009701	-	100	78.882	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000026698	-	100	93.125	ENSMICG00000043664	-	100	93.125	Microcebus_murinus
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ENSOGAG00000026698	-	100	91.875	ENSMICG00000042687	-	100	91.875	Microcebus_murinus
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ENSOGAG00000026698	-	100	92.500	ENSMOCG00000002721	-	100	92.500	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000026698	-	86	78.261	ENSMMOG00000002967	rpl21	97	78.261	Mola_mola
ENSOGAG00000026698	-	100	91.875	ENSMODG00000023247	-	98	91.875	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000026698	-	100	92.500	ENSMODG00000008923	-	100	92.500	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000026698	-	85	78.676	ENSMALG00000021841	rpl21	86	78.676	Monopterus_albus
ENSOGAG00000026698	-	100	92.500	MGP_CAROLIEiJ_G0028029	-	100	92.500	Mus_caroli
ENSOGAG00000026698	-	96	82.667	MGP_CAROLIEiJ_G0018949	-	97	82.667	Mus_caroli
ENSOGAG00000026698	-	100	92.500	ENSMUSG00000041453	Rpl21	100	92.500	Mus_musculus
ENSOGAG00000026698	-	100	92.500	MGP_PahariEiJ_G0024595	Rpl21	100	92.500	Mus_pahari
ENSOGAG00000026698	-	53	89.157	MGP_SPRETEiJ_G0029027	-	53	89.157	Mus_spretus
ENSOGAG00000026698	-	100	73.750	ENSMPUG00000006604	-	100	73.750	Mustela_putorius_furo
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ENSOGAG00000026698	-	100	86.875	ENSNGAG00000008848	-	100	86.875	Nannospalax_galili
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ENSOGAG00000026698	-	51	92.405	ENSNLEG00000033610	-	91	92.405	Nomascus_leucogenys
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ENSOGAG00000026698	-	100	90.625	ENSNLEG00000029858	-	100	90.625	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000026698	-	54	86.364	ENSMEUG00000006895	-	100	86.364	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000026698	-	91	47.183	ENSMEUG00000002672	-	93	47.183	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000026698	-	100	92.500	ENSODEG00000020476	-	100	92.500	Octodon_degus
ENSOGAG00000026698	-	51	83.544	ENSODEG00000009242	-	90	83.544	Octodon_degus
ENSOGAG00000026698	-	100	88.750	ENSODEG00000004351	-	100	88.750	Octodon_degus
ENSOGAG00000026698	-	51	73.750	ENSODEG00000014893	-	92	73.750	Octodon_degus
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