EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000027159 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 483 bases
Position: chrGL873530.1:12601669-12602151
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000015931	Ribosomal_L21e	PF01157.18	2.3e-50	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000032559	-	483	-	ENSOGAP00000015931	160 (aa)	-	H0XIJ1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000027159	-	100	86.875	ENSOGAG00000030115	-	100	86.875
ENSOGAG00000027159	-	100	77.500	ENSOGAG00000032866	-	100	77.500
ENSOGAG00000027159	-	83	72.180	ENSOGAG00000032000	-	98	68.182
ENSOGAG00000027159	-	93	73.856	ENSOGAG00000032711	-	100	73.856
ENSOGAG00000027159	-	95	61.842	ENSOGAG00000031179	-	94	61.842
ENSOGAG00000027159	-	82	96.183	ENSOGAG00000008181	-	100	96.183
ENSOGAG00000027159	-	100	94.375	ENSOGAG00000033479	-	100	94.375
ENSOGAG00000027159	-	100	85.000	ENSOGAG00000030151	-	98	85.000
ENSOGAG00000027159	-	80	89.844	ENSOGAG00000034285	-	100	89.844
ENSOGAG00000027159	-	100	89.375	ENSOGAG00000034076	-	100	89.375
ENSOGAG00000027159	-	99	71.875	ENSOGAG00000000555	-	99	71.875
ENSOGAG00000027159	-	93	77.333	ENSOGAG00000033882	-	100	77.333
ENSOGAG00000027159	-	93	79.054	ENSOGAG00000025213	-	100	79.054
ENSOGAG00000027159	-	97	77.419	ENSOGAG00000034390	-	100	77.419
ENSOGAG00000027159	-	97	73.548	ENSOGAG00000012452	-	97	73.548
ENSOGAG00000027159	-	100	89.375	ENSOGAG00000024836	-	100	89.375
ENSOGAG00000027159	-	98	87.821	ENSOGAG00000027182	-	98	87.821
ENSOGAG00000027159	-	100	92.500	ENSOGAG00000029441	-	100	92.500
ENSOGAG00000027159	-	93	80.537	ENSOGAG00000034423	-	93	80.537
ENSOGAG00000027159	-	100	90.000	ENSOGAG00000026698	-	100	90.000
ENSOGAG00000027159	-	98	88.462	ENSOGAG00000030812	-	98	88.462
ENSOGAG00000027159	-	92	91.156	ENSOGAG00000000212	-	100	91.156
ENSOGAG00000027159	-	93	89.865	ENSOGAG00000010179	-	100	89.865
ENSOGAG00000027159	-	100	87.500	ENSOGAG00000026636	-	100	87.500
ENSOGAG00000027159	-	100	76.875	ENSOGAG00000033936	-	100	76.875

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000027159	-	100	95.000	ENSG00000122026	RPL21	100	96.721	Homo_sapiens
ENSOGAG00000027159	-	100	81.250	ENSAPOG00000024402	rpl21	100	81.250	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000027159	-	100	91.875	ENSAMEG00000018663	RPL21	98	91.875	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000027159	-	51	91.358	ENSAMEG00000016455	-	96	91.765	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000027159	-	100	60.000	ENSAMEG00000004632	-	100	60.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000027159	-	100	76.398	ENSAMEG00000004710	-	100	76.398	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000027159	-	100	83.125	ENSACIG00000021885	rpl21	100	83.125	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000027159	-	100	81.250	ENSAOCG00000017829	rpl21	100	81.250	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000027159	-	100	81.250	ENSAPEG00000019936	rpl21	100	81.250	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000027159	-	100	83.125	ENSATEG00000010524	rpl21	100	83.125	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000027159	-	100	89.375	ENSAPLG00000005641	RPL21	98	89.375	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000027159	-	100	88.750	ENSACAG00000003169	RPL21	100	88.750	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000027159	-	100	93.750	ENSANAG00000031230	-	100	93.750	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027159	-	100	90.000	ENSANAG00000019962	-	100	90.000	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027159	-	100	92.500	ENSANAG00000020005	-	100	92.500	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027159	-	97	94.194	ENSANAG00000012283	-	100	94.194	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027159	-	100	93.750	ENSANAG00000006331	-	100	93.750	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027159	-	100	93.125	ENSANAG00000031513	-	100	93.125	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027159	-	100	95.000	ENSANAG00000023031	-	100	95.000	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027159	-	100	83.125	ENSACLG00000026444	rpl21	100	83.125	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000027159	-	100	80.625	ENSAMXG00000041892	rpl21	100	80.625	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000027159	-	100	93.750	ENSBTAG00000001648	RPL21	100	93.750	Bos_taurus
ENSOGAG00000027159	-	100	93.125	ENSBTAG00000038379	-	100	93.125	Bos_taurus
ENSOGAG00000027159	-	51	88.889	ENSBTAG00000048537	-	84	88.889	Bos_taurus
ENSOGAG00000027159	-	100	59.627	WBGene00004433	rpl-21	100	59.627	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000027159	-	67	77.570	ENSCJAG00000041707	-	98	77.570	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027159	-	100	93.750	ENSCJAG00000038205	-	100	93.750	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027159	-	86	92.701	ENSCJAG00000044684	-	96	92.701	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027159	-	92	94.558	ENSCJAG00000039102	-	100	94.558	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027159	-	100	76.250	ENSCJAG00000044730	-	100	76.250	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027159	-	100	67.500	ENSCJAG00000044477	-	100	67.500	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027159	-	100	94.375	ENSCJAG00000043116	-	100	94.375	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027159	-	100	88.750	ENSCJAG00000019734	-	100	88.750	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027159	-	100	93.750	ENSCAFG00000028744	-	100	93.750	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027159	-	100	91.875	ENSCAFG00000015987	-	100	91.875	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027159	-	100	93.750	ENSCAFG00000032537	-	100	93.750	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027159	-	100	93.827	ENSCAFG00000006810	RPL21	100	93.827	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027159	-	96	61.146	ENSCAFG00000018881	-	97	61.783	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027159	-	76	90.164	ENSCAFG00000015533	-	88	90.164	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000027159	-	100	94.375	ENSCAFG00000008805	-	100	94.375	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000027159	-	100	93.750	ENSCAFG00020011527	-	100	93.750	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027159	-	100	94.375	ENSCAFG00020005317	-	100	94.375	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027159	-	100	92.500	ENSCAFG00020026205	-	100	92.500	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027159	-	100	95.625	ENSCAFG00020024181	-	100	95.625	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000027159	-	100	93.750	ENSCAFG00020008146	-	100	93.750	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027159	-	100	95.000	ENSCAFG00020004535	-	100	95.000	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000027159	-	100	92.500	ENSCAFG00020020914	-	100	92.500	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000027159	-	100	93.750	ENSCHIG00000019833	-	100	93.750	Capra_hircus
ENSOGAG00000027159	-	100	90.625	ENSCHIG00000010112	-	100	90.625	Capra_hircus
ENSOGAG00000027159	-	100	93.750	ENSCHIG00000021720	RPL21	100	93.750	Capra_hircus
ENSOGAG00000027159	-	100	87.500	ENSCHIG00000008368	-	100	87.500	Capra_hircus
ENSOGAG00000027159	-	51	91.358	ENSCHIG00000012074	-	68	91.358	Capra_hircus
ENSOGAG00000027159	-	100	92.500	ENSCHIG00000006564	-	100	92.500	Capra_hircus
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ENSOGAG00000027159	-	100	80.625	ENSTSYG00000033985	-	100	80.625	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000027159	-	100	85.714	ENSCPOG00000023041	-	100	85.714	Cavia_porcellus
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ENSOGAG00000027159	-	92	82.313	ENSCPOG00000022769	-	100	82.313	Cavia_porcellus
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ENSOGAG00000027159	-	100	72.500	ENSCLAG00000001174	-	100	72.500	Chinchilla_lanigera
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ENSOGAG00000027159	-	100	95.000	ENSMFAG00000016548	-	100	95.000	Macaca_fascicularis
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ENSOGAG00000027159	-	100	95.000	ENSMMUG00000028889	-	100	95.000	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000027159	-	100	94.375	ENSMMUG00000029598	-	100	94.375	Macaca_mulatta
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ENSOGAG00000027159	-	100	93.125	ENSMMUG00000029342	-	100	93.125	Macaca_mulatta
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ENSOGAG00000027159	-	100	80.000	ENSMLEG00000039003	-	100	80.000	Mandrillus_leucophaeus
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ENSOGAG00000027159	-	100	95.000	ENSMLEG00000024280	-	100	95.000	Mandrillus_leucophaeus
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ENSOGAG00000027159	-	86	80.435	ENSMMOG00000002967	rpl21	97	80.435	Mola_mola
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ENSOGAG00000027159	-	100	93.750	ENSMODG00000023247	-	98	93.750	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000027159	-	85	80.882	ENSMALG00000021841	rpl21	86	80.882	Monopterus_albus
ENSOGAG00000027159	-	100	94.375	MGP_CAROLIEiJ_G0028029	-	100	94.375	Mus_caroli
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ENSOGAG00000027159	-	100	88.750	ENSMLUG00000030390	-	100	88.750	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000027159	-	100	81.250	ENSNGAG00000017377	-	100	81.250	Nannospalax_galili
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ENSOGAG00000027159	-	100	83.125	ENSNBRG00000023147	rpl21	100	83.125	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000027159	-	100	92.500	ENSNLEG00000029671	-	100	92.500	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000027159	-	100	90.000	ENSNLEG00000036147	-	100	90.000	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000027159	-	100	93.125	ENSNLEG00000033807	-	100	93.125	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000027159	-	100	93.125	ENSNLEG00000028241	-	100	93.125	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000027159	-	100	93.125	ENSNLEG00000030635	-	100	93.125	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000027159	-	100	93.750	ENSNLEG00000032959	-	100	93.750	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000027159	-	100	88.750	ENSNLEG00000035696	-	100	88.750	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000027159	-	100	92.500	ENSNLEG00000029858	-	100	92.500	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000027159	-	96	94.156	ENSNLEG00000029937	-	100	94.156	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000027159	-	100	95.000	ENSNLEG00000000327	-	100	95.000	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000027159	-	100	94.375	ENSNLEG00000033142	-	100	94.375	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000027159	-	55	93.182	ENSMEUG00000006895	-	100	93.182	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000027159	-	74	48.333	ENSMEUG00000002672	-	78	48.333	Notamacropus_eugenii
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ENSOGAG00000027159	-	100	93.125	ENSODEG00000018656	-	100	93.125	Octodon_degus
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ENSOGAG00000027159	-	100	93.125	ENSODEG00000019353	-	100	93.125	Octodon_degus
ENSOGAG00000027159	-	100	83.125	ENSONIG00000014130	rpl21	100	83.125	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000027159	-	100	91.875	ENSOANG00000009054	-	100	91.875	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSOGAG00000027159	-	100	95.000	ENSOCUG00000002506	RPL21	100	95.000	Oryctolagus_cuniculus
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ENSOGAG00000027159	-	99	88.050	ENSOCUG00000025464	-	99	88.050	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000027159	-	100	83.125	ENSORLG00000008802	rpl21	100	83.125	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000027159	-	100	83.125	ENSORLG00020014331	rpl21	100	83.125	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000027159	-	100	83.125	ENSORLG00015014231	rpl21	100	83.125	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000027159	-	100	82.500	ENSOMEG00000007496	rpl21	100	82.500	Oryzias_melastigma
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