EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000027700 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 477 bases
Position: chrGL873829.1:409174-409650
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000017769	Ribosomal_L23	PF00276.20	1.7e-14	1	1
ENSOGAP00000017769	Ribosomal_L23eN	PF03939.13	2.5e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000030352	-	477	-	ENSOGAP00000017769	158 (aa)	-	H0XNS8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000027700	-	81	83.594	ENSOGAG00000030106	-	81	83.594
ENSOGAG00000027700	-	83	85.496	ENSOGAG00000033163	-	81	85.156
ENSOGAG00000027700	-	80	82.677	ENSOGAG00000034190	-	80	82.677
ENSOGAG00000027700	-	83	86.260	ENSOGAG00000029401	-	81	85.938
ENSOGAG00000027700	-	74	83.761	ENSOGAG00000030736	-	78	83.761
ENSOGAG00000027700	-	74	88.034	ENSOGAG00000024407	-	81	86.719
ENSOGAG00000027700	-	81	78.125	ENSOGAG00000029608	-	80	78.125
ENSOGAG00000027700	-	79	74.400	ENSOGAG00000031307	-	80	74.219
ENSOGAG00000027700	-	83	83.969	ENSOGAG00000031776	-	82	83.594
ENSOGAG00000027700	-	83	86.260	ENSOGAG00000029717	-	81	85.938

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000027700	-	83	87.023	ENSG00000198242	RPL23A	100	91.429	Homo_sapiens
ENSOGAG00000027700	-	100	81.646	ENSAPOG00000008770	rpl23a	74	84.375	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000027700	-	98	66.452	ENSAMEG00000010669	-	80	62.500	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000027700	-	83	65.649	ENSAMEG00000009758	-	80	64.844	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000027700	-	84	68.421	ENSAMEG00000011777	-	81	68.992	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000027700	-	59	76.596	ENSAMEG00000018533	-	89	76.596	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000027700	-	100	59.756	ENSAMEG00000013394	-	80	58.955	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000027700	-	59	73.404	ENSAMEG00000017534	-	63	73.404	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000027700	-	99	74.359	ENSAMEG00000019431	-	74	78.261	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000027700	-	83	87.023	ENSAMEG00000004684	RPL23A	81	86.719	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000027700	-	96	83.444	ENSACIG00000002878	rpl23a	75	85.039	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000027700	-	100	81.646	ENSAOCG00000007918	rpl23a	74	84.375	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000027700	-	100	81.646	ENSAPEG00000023469	rpl23a	81	84.375	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000027700	-	100	81.646	ENSATEG00000021517	rpl23a	81	84.375	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000027700	-	93	86.486	ENSAPLG00000000604	RPL23A	81	86.719	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000027700	-	100	84.177	ENSACAG00000005311	RPL23A	81	87.500	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000027700	-	65	71.154	ENSANAG00000025336	-	76	71.287	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027700	-	81	84.375	ENSANAG00000029957	-	82	84.375	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027700	-	100	84.177	ENSANAG00000022026	-	77	84.375	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027700	-	81	86.719	ENSANAG00000035778	-	81	86.719	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027700	-	81	85.156	ENSANAG00000019559	-	81	85.156	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027700	-	81	79.412	ENSANAG00000011108	-	82	79.412	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000027700	-	100	81.646	ENSAMXG00000041598	rpl23a	81	83.594	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000027700	-	81	85.156	ENSBTAG00000022498	-	80	85.156	Bos_taurus
ENSOGAG00000027700	-	81	86.719	ENSBTAG00000022278	-	80	86.719	Bos_taurus
ENSOGAG00000027700	-	83	86.260	ENSBTAG00000032432	-	80	85.938	Bos_taurus
ENSOGAG00000027700	-	83	87.023	ENSBTAG00000046394	-	85	86.719	Bos_taurus
ENSOGAG00000027700	-	100	57.595	ENSBTAG00000011830	-	78	66.019	Bos_taurus
ENSOGAG00000027700	-	81	85.156	ENSBTAG00000032775	-	81	85.156	Bos_taurus
ENSOGAG00000027700	-	81	85.938	ENSCJAG00000047682	-	81	85.938	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027700	-	83	87.023	ENSCJAG00000013126	-	81	86.719	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027700	-	81	82.812	ENSCJAG00000039429	-	81	82.812	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027700	-	83	86.260	ENSCJAG00000042808	-	81	85.938	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027700	-	81	87.500	ENSCJAG00000042604	-	81	87.500	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027700	-	83	84.733	ENSCJAG00000046769	-	82	84.375	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027700	-	81	85.156	ENSCJAG00000045857	-	81	85.156	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000027700	-	81	85.938	ENSCAFG00000024427	-	81	85.938	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	83	83.206	ENSCAFG00000020044	-	81	82.812	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	81	71.875	ENSCAFG00000003047	-	74	75.214	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	99	73.077	ENSCAFG00000017678	-	79	72.222	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	81	86.719	ENSCAFG00000018784	-	81	86.719	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	81	86.719	ENSCAFG00000031731	-	81	86.719	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	81	86.719	ENSCAFG00000016268	-	81	86.719	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	71	61.345	ENSCAFG00000007718	-	68	78.049	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	100	74.684	ENSCAFG00000030051	-	80	73.438	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	84	71.970	ENSCAFG00000018232	-	74	75.214	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	81	86.719	ENSCAFG00000004003	-	83	86.719	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	99	60.510	ENSCAFG00000003274	-	67	69.697	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	81	86.719	ENSCAFG00000002548	-	81	86.719	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	100	73.418	ENSCAFG00000007256	-	79	71.875	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	81	74.219	ENSCAFG00000030594	-	79	74.219	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	99	75.641	ENSCAFG00000003753	-	77	74.603	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	84	67.669	ENSCAFG00000005724	-	74	77.064	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	82	77.692	ENSCAFG00000004933	-	83	77.165	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	83	80.916	ENSCAFG00000031555	-	81	81.250	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	83	69.173	ENSCAFG00000001011	-	80	68.462	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	81	71.875	ENSCAFG00000017753	-	80	71.875	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	83	87.023	ENSCAFG00000001968	-	81	86.719	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	81	85.156	ENSCAFG00000024043	-	81	85.156	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	97	59.091	ENSCAFG00000003985	-	80	56.693	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	81	86.719	ENSCAFG00000015394	-	81	86.719	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	92	70.548	ENSCAFG00000019297	-	84	71.875	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	78	79.675	ENSCAFG00000000014	-	73	82.609	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	84	72.727	ENSCAFG00000017449	-	81	72.656	Canis_familiaris
ENSOGAG00000027700	-	81	76.562	ENSCAFG00000002410	-	80	76.562	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000027700	-	81	86.719	ENSCAFG00020016887	-	81	86.719	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027700	-	99	75.000	ENSCAFG00020009948	-	63	73.810	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027700	-	66	85.577	ENSCAFG00020023174	-	77	85.149	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027700	-	83	87.023	ENSCAFG00020009210	-	81	86.719	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027700	-	83	83.206	ENSCAFG00020002207	-	81	82.812	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027700	-	58	85.870	ENSCAFG00020002891	-	87	79.048	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027700	-	83	80.916	ENSCAFG00020016375	-	64	81.188	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027700	-	81	85.938	ENSCAFG00020011988	-	81	85.938	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027700	-	81	86.719	ENSCAFG00020011446	-	69	86.719	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000027700	-	100	63.924	ENSCHIG00000014765	-	82	62.500	Capra_hircus
ENSOGAG00000027700	-	81	86.719	ENSCHIG00000007457	-	81	86.719	Capra_hircus
ENSOGAG00000027700	-	81	84.375	ENSCHIG00000000748	-	81	84.375	Capra_hircus
ENSOGAG00000027700	-	100	85.443	ENSCHIG00000003100	-	81	85.156	Capra_hircus
ENSOGAG00000027700	-	81	84.375	ENSCHIG00000021757	-	71	84.375	Capra_hircus
ENSOGAG00000027700	-	81	85.156	ENSCHIG00000000917	-	81	85.156	Capra_hircus
ENSOGAG00000027700	-	81	87.500	ENSCHIG00000019330	-	81	87.500	Capra_hircus
ENSOGAG00000027700	-	100	74.051	ENSCHIG00000017863	-	79	71.875	Capra_hircus
ENSOGAG00000027700	-	100	68.987	ENSCHIG00000009123	-	78	66.406	Capra_hircus
ENSOGAG00000027700	-	81	85.938	ENSCHIG00000009652	-	81	85.938	Capra_hircus
ENSOGAG00000027700	-	81	86.719	ENSTSYG00000009575	-	100	91.429	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000027700	-	54	88.372	ENSCAPG00000015935	-	100	88.372	Cavia_aperea
ENSOGAG00000027700	-	81	87.500	ENSCPOG00000001452	-	81	87.500	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000027700	-	87	55.072	ENSCPOG00000030336	-	74	50.000	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000027700	-	66	80.769	ENSCCAG00000022890	-	76	80.198	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000027700	-	81	85.938	ENSCCAG00000027934	-	79	85.938	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000027700	-	70	86.364	ENSCCAG00000030438	-	77	86.364	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000027700	-	83	86.260	ENSCCAG00000036975	-	80	85.938	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000027700	-	89	75.000	ENSCCAG00000034359	-	79	76.364	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000027700	-	93	87.755	ENSMGAG00000012800	RPL23A	83	86.719	Meleagris_gallopavo
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ENSOGAG00000027700	-	96	82.119	ENSMMOG00000018811	rpl23a	57	83.465	Mola_mola
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ENSOGAG00000027700	-	100	82.278	ENSMODG00000016415	-	81	84.375	Monodelphis_domestica
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ENSOGAG00000027700	-	59	65.591	ENSMODG00000001044	-	99	65.591	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000027700	-	96	82.237	ENSMALG00000007502	rpl23a	74	83.594	Monopterus_albus
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