EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000028850 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2951 bases
Position: chrGL873541.1:23094231-23097181
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000019155	ResIII	PF04851.15	8.2e-08	1	1
ENSOGAP00000019155	DEAD	PF00270.29	2.1e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000031654	-	1459	-	ENSOGAP00000019155	429 (aa)	-	H0XSR3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000028850	-	85	37.978	ENSOGAG00000007495	-	88	37.978
ENSOGAG00000028850	-	91	32.419	ENSOGAG00000011783	-	81	32.419
ENSOGAG00000028850	-	99	81.308	ENSOGAG00000029626	-	99	81.308
ENSOGAG00000028850	-	91	32.593	ENSOGAG00000001962	-	80	32.593
ENSOGAG00000028850	-	92	36.456	ENSOGAG00000008132	-	95	36.456
ENSOGAG00000028850	-	100	90.443	ENSOGAG00000010280	-	100	90.676
ENSOGAG00000028850	-	99	33.256	ENSOGAG00000007978	DDX6	88	33.256
ENSOGAG00000028850	-	84	90.400	ENSOGAG00000009067	-	100	97.231
ENSOGAG00000028850	-	99	80.047	ENSOGAG00000025638	-	99	80.047
ENSOGAG00000028850	-	81	32.759	ENSOGAG00000003748	DDX47	76	32.759
ENSOGAG00000028850	-	89	30.612	ENSOGAG00000008259	DDX49	80	30.612
ENSOGAG00000028850	-	86	38.544	ENSOGAG00000010729	EIF4A2	90	38.544
ENSOGAG00000028850	-	85	37.705	ENSOGAG00000026206	-	88	37.705
ENSOGAG00000028850	-	86	30.526	ENSOGAG00000013409	DDX25	82	30.713

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSG00000198563	DDX39B	100	98.621	Homo_sapiens
ENSOGAG00000028850	-	100	98.834	ENSAMEG00000009508	DDX39B	99	98.834	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000028850	-	99	92.290	ENSACIG00000004534	ddx39b	98	92.290	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000028850	-	100	91.917	ENSATEG00000012366	ddx39b	100	91.917	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000028850	-	100	95.814	ENSACAG00000012240	DDX39B	100	95.814	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSANAG00000030372	DDX39B	100	98.601	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000028850	-	99	89.425	ENSACLG00000018759	ddx39b	99	89.425	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000028850	-	100	91.533	ENSAMXG00000017837	ddx39b	100	91.533	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.368	ENSBTAG00000014490	DDX39B	100	98.368	Bos_taurus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSCJAG00000003152	DDX39B	100	98.601	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSCAFG00000000509	DDX39B	100	98.714	Canis_familiaris
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSCAFG00020020530	DDX39B	100	98.601	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000028850	-	100	98.368	ENSCHIG00000004579	DDX39B	100	98.368	Capra_hircus
ENSOGAG00000028850	-	100	84.848	ENSTSYG00000029741	-	91	87.678	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSTSYG00000010226	-	100	98.601	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000028850	-	100	98.368	ENSCAPG00000010066	DDX39B	100	98.368	Cavia_aperea
ENSOGAG00000028850	-	100	98.368	ENSCPOG00000002335	DDX39B	100	98.368	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSCCAG00000027897	DDX39B	100	98.601	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000028850	-	99	89.202	ENSCATG00000043709	DDX39B	99	89.202	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000028850	-	100	98.368	ENSCLAG00000014555	DDX39B	100	98.368	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000028850	-	99	98.357	ENSCSAG00000008517	DDX39B	100	98.357	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000028850	-	64	99.267	ENSCPBG00000014671	-	100	99.267	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSCANG00000041217	DDX39B	100	98.601	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000028850	-	57	97.561	ENSCGRG00001017315	-	95	97.101	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000028850	-	83	83.287	ENSCGRG00001021916	-	89	83.287	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000028850	-	57	97.561	ENSCGRG00000012479	-	76	97.561	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000028850	-	100	91.284	ENSDARG00000036069	ddx39b	100	91.514	Danio_rerio
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSDNOG00000010215	DDX39B	100	98.601	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000028850	-	87	98.933	ENSDORG00000004985	Ddx39b	100	98.933	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000028850	-	87	85.600	ENSETEG00000009649	DDX39B	87	85.600	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSEASG00005017156	DDX39B	100	98.601	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSECAG00000007750	DDX39B	100	98.601	Equus_caballus
ENSOGAG00000028850	-	100	91.435	ENSELUG00000017904	ddx39b	100	91.435	Esox_lucius
ENSOGAG00000028850	-	100	98.834	ENSFCAG00000004497	DDX39B	100	98.834	Felis_catus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.368	ENSFDAG00000011074	DDX39B	100	98.368	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000028850	-	74	98.423	ENSGAGG00000001300	-	80	98.423	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSGGOG00000005989	DDX39B	100	98.601	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000028850	-	100	97.902	ENSHGLG00000019248	DDX39B	100	97.902	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000028850	-	100	97.902	ENSHGLG00100011850	DDX39B	100	97.902	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000028850	-	100	90.389	ENSIPUG00000015733	DDX39B	94	90.847	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.135	ENSSTOG00000012838	DDX39B	100	98.135	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000028850	-	100	97.902	ENSJJAG00000005660	-	100	97.902	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000028850	-	99	78.066	ENSLBEG00000012254	ddx39b	99	78.066	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000028850	-	66	78.445	ENSLBEG00000017177	-	81	78.445	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000028850	-	100	88.736	ENSLACG00000002110	DDX39B	100	88.736	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000028850	-	100	98.368	ENSLAFG00000014202	DDX39B	100	98.368	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSMFAG00000034233	DDX39B	100	98.601	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSMMUG00000008839	DDX39B	100	98.601	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSMNEG00000041059	DDX39B	100	98.601	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSMLEG00000043791	DDX39B	100	98.601	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000028850	-	99	89.425	ENSMZEG00005017654	ddx39b	99	89.425	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000028850	-	100	97.902	ENSMAUG00000008059	Ddx39b	100	97.902	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSMICG00000017349	DDX39B	100	98.601	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.135	ENSMOCG00000011169	Ddx39b	100	98.135	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000028850	-	88	98.408	ENSMODG00000015791	DDX39B	88	98.408	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000028850	-	100	98.135	ENSMUSG00000019432	Ddx39b	100	98.658	Mus_musculus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.135	MGP_PahariEiJ_G0020513	Ddx39b	100	98.658	Mus_pahari
ENSOGAG00000028850	-	100	98.135	MGP_SPRETEiJ_G0022424	Ddx39b	100	98.135	Mus_spretus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.834	ENSMPUG00000011407	DDX39B	100	98.834	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000028850	-	73	98.718	ENSMLUG00000001681	DDX39B	100	98.718	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSNGAG00000022948	Ddx39b	100	98.601	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000028850	-	83	99.293	ENSNLEG00000006094	DDX39B	100	99.293	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000028850	-	85	99.099	ENSMEUG00000008264	DDX39B	86	99.099	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000028850	-	100	98.834	ENSOPRG00000011923	DDX39B	100	98.834	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000028850	-	100	98.135	ENSODEG00000018083	DDX39B	100	98.135	Octodon_degus
ENSOGAG00000028850	-	100	90.531	ENSONIG00000004740	ddx39b	100	90.531	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000028850	-	55	97.479	ENSOANG00000008361	DDX39B	95	97.479	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000028850	-	100	95.270	ENSOCUG00000024126	DDX39B	100	95.270	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.368	ENSOARG00000008787	DDX39B	98	98.368	Ovis_aries
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSPPAG00000043072	DDX39B	100	98.601	Pan_paniscus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.834	ENSPPRG00000001913	DDX39B	100	98.834	Panthera_pardus
ENSOGAG00000028850	-	100	97.902	ENSPTIG00000017669	DDX39B	100	97.902	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSPTRG00000032509	DDX39B	100	98.601	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSPANG00000018609	DDX39B	100	98.601	Papio_anubis
ENSOGAG00000028850	-	100	89.954	ENSPKIG00000011324	ddx39b	100	90.639	Paramormyrops_kingsleyae
ENSOGAG00000028850	-	100	97.902	ENSPEMG00000016905	Ddx39b	100	97.902	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSPCIG00000017572	DDX39B	100	98.601	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSPPYG00000016433	DDX39B	100	98.601	Pongo_abelii
ENSOGAG00000028850	-	66	98.592	ENSPCAG00000003484	DDX39B	100	98.592	Procavia_capensis
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSPCOG00000018656	DDX39B	100	98.601	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000028850	-	100	98.135	ENSPVAG00000004653	DDX39B	100	98.135	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000028850	-	98	81.647	ENSPNYG00000010382	ddx39b	98	81.542	Pundamilia_nyererei
ENSOGAG00000028850	-	100	91.304	ENSPNAG00000026926	ddx39b	100	91.304	Pygocentrus_nattereri
ENSOGAG00000028850	-	100	98.135	ENSRNOG00000000841	Ddx39b	100	98.135	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000028850	-	100	88.345	ENSRBIG00000031309	DDX39B	100	88.345	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSRROG00000039517	DDX39B	100	98.601	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000028850	-	100	88.345	ENSSBOG00000035513	-	100	88.345	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSSHAG00000003209	DDX39B	100	98.601	Sarcophilus_harrisii
ENSOGAG00000028850	-	100	89.726	ENSSFOG00015016107	ddx39b	100	90.411	Scleropages_formosus
ENSOGAG00000028850	-	100	92.379	ENSSDUG00000011557	ddx39b	100	92.610	Seriola_dumerili
ENSOGAG00000028850	-	100	92.148	ENSSLDG00000015763	ddx39b	100	92.379	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSOGAG00000028850	-	87	86.933	ENSSARG00000005245	DDX39B	100	86.933	Sorex_araneus
ENSOGAG00000028850	-	100	96.503	ENSSPUG00000012805	DDX39B	100	96.503	Sphenodon_punctatus
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSSSCG00000001400	DDX39B	100	98.847	Sus_scrofa
ENSOGAG00000028850	-	100	75.758	ENSTBEG00000003721	DDX39B	100	75.758	Tupaia_belangeri
ENSOGAG00000028850	-	100	90.069	ENSTTRG00000014074	DDX39B	100	90.069	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000028850	-	100	85.814	ENSUAMG00000027335	DDX39B	100	85.814	Ursus_americanus
ENSOGAG00000028850	-	100	89.977	ENSUMAG00000015124	DDX39B	100	89.977	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000028850	-	61	98.230	ENSVPAG00000009167	-	74	98.230	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000028850	-	100	98.601	ENSVVUG00000019518	DDX39B	99	98.601	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000028850	-	100	82.599	ENSXETG00000002498	ddx39b	100	81.628	Xenopus_tropicalis