EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000029238 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 558 bases
Position: chrGL873643.1:225275-225832
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000020136	Ribosomal_L22	PF00237.19	7.2e-48	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000035057	-	558	-	ENSOGAP00000020136	185 (aa)	-	H0XVJ4

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000029238	-	99	78.836	ENSOGAG00000029577	-	100	78.836
ENSOGAG00000029238	-	98	92.308	ENSOGAG00000034707	-	84	95.758
ENSOGAG00000029238	-	100	95.135	ENSOGAG00000027732	-	100	95.135
ENSOGAG00000029238	-	100	96.216	ENSOGAG00000029904	-	100	96.216
ENSOGAG00000029238	-	99	90.164	ENSOGAG00000031017	-	99	90.164
ENSOGAG00000029238	-	77	79.021	ENSOGAG00000027211	-	88	79.021
ENSOGAG00000029238	-	99	89.130	ENSOGAG00000029301	-	89	95.152
ENSOGAG00000029238	-	100	89.730	ENSOGAG00000029654	-	96	89.730
ENSOGAG00000029238	-	100	97.838	ENSOGAG00000032836	-	100	97.838
ENSOGAG00000029238	-	90	83.133	ENSOGAG00000026741	-	93	83.030
ENSOGAG00000029238	-	100	90.811	ENSOGAG00000034665	-	100	90.811
ENSOGAG00000029238	-	100	95.161	ENSOGAG00000032473	-	100	95.161
ENSOGAG00000029238	-	90	89.820	ENSOGAG00000030558	-	90	89.759

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000029238	-	99	97.826	ENSG00000265681	RPL17	100	98.630	Homo_sapiens
ENSOGAG00000029238	-	99	97.826	ENSG00000215472	RPL17-C18orf32	100	97.826	Homo_sapiens
ENSOGAG00000029238	-	99	94.565	ENSAPOG00000018953	rpl17	100	94.565	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000029238	-	89	69.091	ENSAMEG00000004612	-	88	69.091	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029238	-	100	97.838	ENSAMEG00000009498	RPL17	99	97.838	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029238	-	99	70.109	ENSAMEG00000009513	-	100	70.109	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029238	-	79	84.932	ENSAMEG00000010993	-	100	84.932	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029238	-	99	83.152	ENSAMEG00000018893	-	100	83.152	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029238	-	100	75.269	ENSAMEG00000005035	-	96	75.269	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029238	-	89	84.242	ENSACIG00000020062	rpl17	99	93.056	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000029238	-	92	94.152	ENSAOCG00000014751	rpl17	75	94.545	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000029238	-	100	94.595	ENSAPEG00000024012	rpl17	100	94.565	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000029238	-	99	94.022	ENSATEG00000023387	rpl17	100	94.022	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000029238	-	100	97.838	ENSAPLG00000008451	-	99	97.838	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000029238	-	99	92.935	ENSANAG00000019389	-	100	92.935	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029238	-	99	90.761	ENSANAG00000028566	-	100	90.761	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029238	-	98	79.558	ENSANAG00000032131	-	88	78.182	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029238	-	94	87.356	ENSANAG00000020029	-	87	87.273	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029238	-	99	88.043	ENSANAG00000026004	-	100	88.043	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029238	-	99	94.022	ENSANAG00000008692	-	100	94.022	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029238	-	99	97.826	ENSANAG00000038237	RPL17	100	97.826	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029238	-	99	87.701	ENSACLG00000009583	rpl17	100	87.701	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000029238	-	100	93.514	ENSAMXG00000001082	rpl17	100	87.500	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000029238	-	91	73.810	ENSBTAG00000053051	-	62	73.939	Bos_taurus
ENSOGAG00000029238	-	77	83.803	ENSBTAG00000032382	-	100	83.803	Bos_taurus
ENSOGAG00000029238	-	95	86.286	ENSBTAG00000000425	-	99	85.795	Bos_taurus
ENSOGAG00000029238	-	99	95.109	ENSBTAG00000034973	-	100	95.109	Bos_taurus
ENSOGAG00000029238	-	92	97.076	ENSBTAG00000022902	-	100	97.076	Bos_taurus
ENSOGAG00000029238	-	89	90.909	ENSBTAG00000027015	-	86	90.909	Bos_taurus
ENSOGAG00000029238	-	86	94.969	ENSBTAG00000030490	-	94	94.969	Bos_taurus
ENSOGAG00000029238	-	95	87.429	ENSBTAG00000025764	-	99	86.932	Bos_taurus
ENSOGAG00000029238	-	89	90.303	ENSBTAG00000030199	-	87	90.303	Bos_taurus
ENSOGAG00000029238	-	99	95.652	ENSBTAG00000024839	-	100	95.652	Bos_taurus
ENSOGAG00000029238	-	100	90.270	ENSBTAG00000030941	-	99	89.189	Bos_taurus
ENSOGAG00000029238	-	96	66.292	WBGene00004429	rpl-17	88	68.293	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000029238	-	99	97.283	ENSCJAG00000041339	-	100	97.283	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029238	-	99	96.739	ENSCJAG00000043620	-	100	96.739	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029238	-	99	97.826	ENSCJAG00000004779	RPL17	100	97.826	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029238	-	89	92.683	ENSCJAG00000012969	-	93	92.683	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029238	-	99	97.283	ENSCAFG00000007572	-	100	97.283	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029238	-	99	90.164	ENSCAFG00000030361	-	100	90.164	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029238	-	99	96.196	ENSCAFG00000028960	-	100	96.196	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029238	-	99	96.739	ENSCAFG00000008273	-	100	96.739	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029238	-	98	70.718	ENSCAFG00000001059	-	85	72.185	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029238	-	98	76.796	ENSCAFG00000003489	-	85	76.687	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029238	-	90	78.313	ENSCAFG00000016420	-	99	77.297	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029238	-	99	97.826	ENSCAFG00000019044	RPL17	100	97.826	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029238	-	99	90.217	ENSCAFG00000008290	-	100	90.217	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029238	-	99	94.022	ENSCAFG00000009852	-	100	94.022	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029238	-	99	64.324	ENSCAFG00000014751	-	89	67.879	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029238	-	99	94.022	ENSCAFG00000003241	-	95	94.022	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000029238	-	99	96.196	ENSCAFG00020002362	-	100	96.196	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000029238	-	57	95.238	ENSCAFG00020011340	-	88	95.238	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000029238	-	76	93.571	ENSCHIG00000019809	-	85	93.571	Capra_hircus
ENSOGAG00000029238	-	99	95.652	ENSCHIG00000007367	-	100	95.652	Capra_hircus
ENSOGAG00000029238	-	99	92.391	ENSCHIG00000000713	-	100	92.391	Capra_hircus
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ENSOGAG00000029238	-	92	93.567	ENSCHIG00000011677	-	90	93.567	Capra_hircus
ENSOGAG00000029238	-	52	86.458	ENSCHIG00000018629	-	66	86.458	Capra_hircus
ENSOGAG00000029238	-	92	95.906	ENSCHIG00000010984	-	96	95.758	Capra_hircus
ENSOGAG00000029238	-	99	89.130	ENSCHIG00000026273	-	100	89.130	Capra_hircus
ENSOGAG00000029238	-	74	83.212	ENSTSYG00000027231	-	100	83.212	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029238	-	94	84.393	ENSTSYG00000026297	-	95	84.242	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029238	-	99	97.826	ENSTSYG00000007402	RPL17	100	97.826	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029238	-	99	90.710	ENSTSYG00000036299	-	98	90.710	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029238	-	99	89.674	ENSTSYG00000033995	-	100	89.674	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029238	-	74	83.212	ENSTSYG00000027387	-	100	83.212	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000029238	-	77	99.296	ENSCAPG00000000001	-	97	99.296	Cavia_aperea
ENSOGAG00000029238	-	77	99.296	ENSCPOG00000023476	-	97	99.296	Cavia_porcellus
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ENSOGAG00000029238	-	99	94.565	ENSCCAG00000031634	-	100	94.565	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000029238	-	99	92.350	ENSCCAG00000032514	-	84	92.350	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029238	-	95	82.857	ENSCATG00000039091	-	99	82.857	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029238	-	100	95.676	ENSCATG00000021927	-	99	95.676	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029238	-	99	95.109	ENSCATG00000019515	-	100	95.109	Cercocebus_atys
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ENSOGAG00000029238	-	99	89.674	ENSCATG00000011413	-	100	89.674	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029238	-	99	95.652	ENSCATG00000022237	-	100	95.652	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029238	-	99	97.826	ENSCATG00000043658	RPL17	100	97.826	Cercocebus_atys
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ENSOGAG00000029238	-	99	92.935	ENSCLAG00000005979	-	100	92.935	Chinchilla_lanigera
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ENSOGAG00000029238	-	99	86.957	ENSCSAG00000012018	-	100	86.957	Chlorocebus_sabaeus
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ENSOGAG00000029238	-	84	68.590	ENSSTOG00000034590	-	85	68.590	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSOGAG00000029238	-	99	94.565	ENSMLEG00000032222	-	98	94.565	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000029238	-	88	82.099	ENSMLEG00000035869	-	75	82.099	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000029238	-	99	78.804	ENSMLEG00000037902	-	94	78.804	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000029238	-	99	94.565	ENSMAMG00000012465	rpl17	100	94.565	Mastacembelus_armatus
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ENSOGAG00000029238	-	100	97.297	ENSMGAG00000001342	-	100	97.826	Meleagris_gallopavo
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ENSOGAG00000029238	-	99	94.565	ENSMALG00000008740	rpl17	100	94.565	Monopterus_albus
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ENSOGAG00000029238	-	99	98.370	ENSMUSG00000062328	Rpl17	100	98.370	Mus_musculus
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ENSOGAG00000029238	-	99	71.351	ENSMLUG00000029253	-	100	68.649	Myotis_lucifugus
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ENSOGAG00000029238	-	99	94.565	ENSNBRG00000006026	rpl17	100	94.565	Neolamprologus_brichardi
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ENSOGAG00000029238	-	99	96.196	ENSNLEG00000028051	-	100	96.196	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000029238	-	59	98.182	ENSMEUG00000016709	-	93	98.182	Notamacropus_eugenii
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ENSOGAG00000029238	-	99	97.826	ENSODEG00000019717	-	100	97.826	Octodon_degus
ENSOGAG00000029238	-	99	98.370	ENSODEG00000020430	-	100	98.370	Octodon_degus
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ENSOGAG00000029238	-	99	94.565	ENSONIG00000012509	rpl17	100	94.565	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000029238	-	99	98.370	ENSOANG00000002910	-	100	98.370	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000029238	-	99	96.739	ENSOCUG00000021956	-	100	96.739	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000029238	-	99	97.826	ENSOCUG00000022150	-	100	97.826	Oryctolagus_cuniculus
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