EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000029322 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1398 bases
Position: chrGL873525.1:7245334-7246731
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000019177	Ribosomal_S24e	PF01282.19	1.3e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000030807	-	384	-	ENSOGAP00000019177	128 (aa)	-	H0XST5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000029322	-	97	89.922	ENSOGAG00000011005	-	100	89.922
ENSOGAG00000029322	-	100	86.466	ENSOGAG00000026791	-	100	86.466
ENSOGAG00000029322	-	100	87.970	ENSOGAG00000029689	-	100	87.970
ENSOGAG00000029322	-	100	84.962	ENSOGAG00000028675	-	100	84.962
ENSOGAG00000029322	-	100	82.707	ENSOGAG00000031870	-	100	82.707
ENSOGAG00000029322	-	98	83.846	ENSOGAG00000027077	-	98	83.846
ENSOGAG00000029322	-	99	63.636	ENSOGAG00000024579	-	90	68.067

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSG00000138326	RPS24	100	90.000	Homo_sapiens
ENSOGAG00000029322	-	99	84.848	ENSAPOG00000017167	rps24	100	84.848	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000029322	-	95	50.806	ENSAMEG00000004411	-	98	50.806	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029322	-	100	73.684	ENSAMEG00000020112	-	84	73.684	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029322	-	98	65.649	ENSAMEG00000018661	-	99	66.154	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029322	-	97	89.922	ENSAMEG00000017818	-	96	89.922	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029322	-	99	85.606	ENSAMEG00000002054	-	99	85.606	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029322	-	98	84.733	ENSACIG00000019169	rps24	100	84.733	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000029322	-	100	83.459	ENSAOCG00000022136	rps24	93	83.459	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000029322	-	98	84.733	ENSAPEG00000011423	rps24	100	84.733	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000029322	-	99	84.848	ENSATEG00000003561	rps24	100	84.848	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000029322	-	97	89.147	ENSAPLG00000016258	-	99	89.147	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000029322	-	97	89.922	ENSACAG00000007960	-	97	89.922	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000029322	-	98	89.231	ENSANAG00000004458	-	100	89.231	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	100	78.947	ENSANAG00000029004	-	100	80.000	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	98	87.692	ENSANAG00000005058	-	100	87.692	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	98	85.496	ENSANAG00000031530	-	100	85.496	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	100	77.444	ENSANAG00000028191	-	100	77.444	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	98	83.721	ENSANAG00000021188	-	100	83.721	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	84	88.288	ENSANAG00000014093	-	99	89.091	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	98	85.385	ENSANAG00000018323	-	100	85.385	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	98	86.154	ENSANAG00000031445	-	100	86.154	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	98	86.260	ENSANAG00000019821	-	100	86.260	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	98	87.023	ENSANAG00000020076	-	100	87.023	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	98	86.923	ENSANAG00000028273	-	99	86.923	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	98	86.154	ENSANAG00000019712	-	100	86.154	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	100	77.444	ENSANAG00000036365	-	100	77.444	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	100	86.466	ENSANAG00000019367	-	100	86.466	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029322	-	99	84.091	ENSACLG00000013068	rps24	94	84.746	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000029322	-	100	80.451	ENSAMXG00000012469	rps24	95	79.528	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000029322	-	98	90.000	ENSBTAG00000013264	RPS24	100	90.000	Bos_taurus
ENSOGAG00000029322	-	98	63.359	WBGene00004493	rps-24	100	63.359	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSCJAG00000012512	-	100	88.722	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029322	-	98	89.231	ENSCJAG00000022071	-	100	89.231	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029322	-	100	87.218	ENSCJAG00000038191	-	100	87.218	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029322	-	98	88.462	ENSCJAG00000021760	-	100	88.462	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029322	-	100	86.466	ENSCJAG00000044516	-	100	86.466	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029322	-	100	83.459	ENSCJAG00000043516	-	86	83.459	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029322	-	98	88.550	ENSCJAG00000041361	-	100	88.550	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029322	-	100	87.970	ENSCJAG00000044037	-	99	88.636	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029322	-	98	90.000	ENSCAFG00000015605	RPS24	100	90.000	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029322	-	99	88.636	ENSCAFG00000029710	-	100	88.636	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029322	-	80	64.815	ENSCAFG00000032091	-	79	64.815	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029322	-	87	71.552	ENSCAFG00000001121	-	100	71.552	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029322	-	99	82.308	ENSCAFG00000017927	-	100	82.308	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029322	-	98	77.863	ENSCAFG00000010663	-	99	77.863	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029322	-	89	85.714	ENSCAFG00000004266	-	85	85.714	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029322	-	99	81.061	ENSCAFG00000017495	-	100	81.061	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029322	-	98	77.273	ENSCAFG00000001168	-	100	73.485	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029322	-	99	85.606	ENSCAFG00000018956	-	100	85.606	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029322	-	99	83.333	ENSCAFG00000000662	-	100	83.333	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029322	-	99	89.394	ENSCAFG00000008336	-	100	89.394	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029322	-	99	88.636	ENSCAFG00000029419	-	100	88.636	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000029322	-	98	88.462	ENSCAFG00020026675	-	100	88.462	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSCHIG00000020169	-	99	89.394	Capra_hircus
ENSOGAG00000029322	-	99	87.121	ENSCHIG00000010668	-	100	87.121	Capra_hircus
ENSOGAG00000029322	-	99	88.636	ENSCHIG00000000315	-	100	89.313	Capra_hircus
ENSOGAG00000029322	-	99	78.030	ENSTSYG00000030958	-	99	78.030	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029322	-	99	89.394	ENSTSYG00000006715	-	100	90.000	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029322	-	99	88.636	ENSCAPG00000000956	-	100	89.922	Cavia_aperea
ENSOGAG00000029322	-	85	84.821	ENSCAPG00000007143	-	100	84.821	Cavia_aperea
ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSCPOG00000020096	-	100	90.000	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000029322	-	91	81.967	ENSCPOG00000023496	-	98	81.967	Cavia_porcellus
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ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSCCAG00000033731	-	100	90.000	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029322	-	98	87.023	ENSCCAG00000029146	-	97	87.023	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029322	-	95	80.952	ENSCCAG00000033320	-	99	80.952	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029322	-	95	89.683	ENSCCAG00000033200	-	100	85.714	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029322	-	98	86.154	ENSCATG00000001678	-	100	86.154	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029322	-	95	82.114	ENSCATG00000039613	-	100	78.462	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029322	-	95	90.476	ENSCATG00000039281	-	100	86.466	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSCATG00000042439	-	100	90.000	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029322	-	96	85.156	ENSCATG00000021751	-	100	85.156	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSCLAG00000013936	-	100	90.000	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000029322	-	100	65.891	ENSCLAG00000016769	-	100	65.891	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000029322	-	98	90.000	ENSCSAG00000009299	-	100	90.000	Chlorocebus_sabaeus
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ENSOGAG00000029322	-	97	89.922	ENSCHOG00000002638	-	99	89.922	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000029322	-	98	90.000	ENSCPBG00000002109	-	100	90.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000029322	-	98	71.212	ENSCING00000005817	-	100	71.212	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000029322	-	98	67.424	ENSCSAVG00000009125	-	100	67.424	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000029322	-	100	85.714	ENSCANG00000021167	-	100	85.714	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000029322	-	100	87.970	ENSCANG00000014855	-	100	87.970	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000029322	-	100	87.218	ENSCANG00000038391	-	99	87.218	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSCANG00000043392	-	100	90.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000029322	-	95	89.683	ENSCANG00000013546	-	100	85.714	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000029322	-	100	81.955	ENSCANG00000040308	-	100	81.955	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000029322	-	100	87.970	ENSCANG00000009736	-	100	87.970	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000029322	-	98	87.692	ENSCANG00000013987	-	100	87.692	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000029322	-	98	81.538	ENSCGRG00001011527	-	100	81.538	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSCGRG00001012180	Rps24	100	90.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000029322	-	98	81.538	ENSCGRG00000020064	-	100	81.538	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000029322	-	99	88.636	ENSCGRG00000001745	-	100	89.922	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000029322	-	99	84.091	ENSCSEG00000004921	rps24	100	83.969	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000029322	-	99	84.848	ENSCVAG00000015208	rps24	100	84.848	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000029322	-	99	81.818	ENSDARG00000039347	rps24	100	81.818	Danio_rerio
ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSDORG00000000189	-	100	90.000	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000029322	-	100	75.573	ENSDORG00000023240	-	95	75.573	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000029322	-	95	68.504	FBgn0261596	RpS24	97	68.504	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000029322	-	99	87.879	ENSETEG00000007481	-	100	87.879	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000029322	-	98	73.485	ENSEBUG00000001969	rps24	84	73.485	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000029322	-	73	75.258	ENSEASG00005021836	-	75	75.258	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000029322	-	73	75.258	ENSEASG00005018402	-	75	75.258	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000029322	-	82	81.481	ENSEASG00005015529	-	100	81.481	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000029322	-	89	90.598	ENSECAG00000016939	-	97	90.598	Equus_caballus
ENSOGAG00000029322	-	99	83.333	ENSELUG00000024339	RS24	100	83.333	Esox_lucius
ENSOGAG00000029322	-	98	73.077	ENSFCAG00000027336	-	96	73.077	Felis_catus
ENSOGAG00000029322	-	70	90.323	ENSFCAG00000031750	-	85	90.323	Felis_catus
ENSOGAG00000029322	-	69	79.121	ENSFCAG00000033099	-	80	79.121	Felis_catus
ENSOGAG00000029322	-	98	90.000	ENSFCAG00000000849	-	100	90.000	Felis_catus
ENSOGAG00000029322	-	85	71.429	ENSFCAG00000030023	-	91	71.429	Felis_catus
ENSOGAG00000029322	-	97	89.922	ENSFALG00000006903	-	98	89.922	Ficedula_albicollis
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ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSFDAG00000009522	-	100	90.000	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000029322	-	99	84.848	ENSFHEG00000021722	rps24	100	84.848	Fundulus_heteroclitus
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ENSOGAG00000029322	-	98	86.154	ENSLOCG00000004926	rps24	95	86.154	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000029322	-	94	83.200	ENSLAFG00000026936	-	94	83.200	Loxodonta_africana
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ENSOGAG00000029322	-	99	87.121	ENSMMUG00000014412	-	100	87.121	Macaca_mulatta
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ENSOGAG00000029322	-	98	88.462	ENSMMUG00000002704	-	100	88.462	Macaca_mulatta
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ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSMMUG00000030562	RPS24	100	89.313	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000029322	-	95	89.683	ENSMMUG00000029534	-	95	89.683	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000029322	-	95	90.476	ENSMMUG00000032410	-	100	86.466	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000029322	-	98	86.923	ENSMNEG00000026922	-	100	86.923	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000029322	-	95	89.683	ENSMNEG00000003904	-	100	85.714	Macaca_nemestrina
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ENSOGAG00000029322	-	100	86.466	ENSMNEG00000014810	-	100	88.462	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000029322	-	95	88.095	ENSMNEG00000041448	-	100	84.211	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000029322	-	99	79.545	ENSMNEG00000035562	-	100	79.545	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000029322	-	98	90.000	ENSMLEG00000038576	-	98	90.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000029322	-	95	90.476	ENSMLEG00000031389	-	100	86.466	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000029322	-	96	86.719	ENSMLEG00000039937	-	93	86.719	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSMLEG00000037657	-	100	90.000	Mandrillus_leucophaeus
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ENSOGAG00000029322	-	98	84.733	ENSMAMG00000021309	rps24	77	84.733	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000029322	-	99	84.091	ENSMZEG00005027603	rps24	94	84.746	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000029322	-	98	90.000	ENSMGAG00000005697	RPS24	98	90.000	Meleagris_gallopavo
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ENSOGAG00000029322	-	100	85.714	ENSMICG00000026990	-	100	85.714	Microcebus_murinus
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ENSOGAG00000029322	-	98	89.313	ENSMODG00000025091	-	65	89.313	Monodelphis_domestica
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ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	MGP_CAROLIEiJ_G0019017	Rps24	100	90.741	Mus_caroli
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ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	MGP_PahariEiJ_G0030030	Rps24	100	90.000	Mus_pahari
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ENSOGAG00000029322	-	96	82.031	ENSMPUG00000017976	-	96	80.469	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000029322	-	97	89.922	ENSMPUG00000010470	-	97	89.922	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000029322	-	95	83.465	ENSMPUG00000012620	-	98	83.465	Mustela_putorius_furo
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ENSOGAG00000029322	-	97	75.385	ENSMLUG00000027108	-	98	75.385	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000029322	-	99	84.091	ENSMLUG00000028909	-	100	84.091	Myotis_lucifugus
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ENSOGAG00000029322	-	99	87.879	ENSMLUG00000028038	-	99	88.550	Myotis_lucifugus
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ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSNGAG00000016361	-	100	88.722	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000029322	-	91	84.874	ENSNBRG00000018688	rps24	99	84.874	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000029322	-	100	88.722	ENSNLEG00000010524	-	100	90.000	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000029322	-	100	85.714	ENSNLEG00000018960	-	100	85.714	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000029322	-	100	78.462	ENSNLEG00000030199	-	100	78.462	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000029322	-	69	89.247	ENSMEUG00000007278	-	100	89.247	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000029322	-	98	86.923	ENSODEG00000018847	-	100	86.923	Octodon_degus
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ENSOGAG00000029322	-	99	88.636	ENSTTRG00000007845	RPS24	100	88.636	Tursiops_truncatus
ENSOGAG00000029322	-	98	89.313	ENSUAMG00000011455	-	100	89.313	Ursus_americanus
ENSOGAG00000029322	-	90	89.831	ENSUMAG00000013927	-	98	91.379	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000029322	-	97	57.364	ENSVPAG00000003287	-	100	57.364	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000029322	-	98	80.916	ENSVVUG00000008173	-	100	80.916	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000029322	-	98	83.077	ENSVVUG00000013878	-	99	83.077	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000029322	-	95	81.102	ENSVVUG00000005608	-	86	81.102	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000029322	-	98	84.615	ENSVVUG00000023081	-	100	84.615	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000029322	-	88	91.379	ENSVVUG00000025527	-	92	91.379	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000029322	-	98	90.000	ENSXETG00000018137	rps24	99	89.313	Xenopus_tropicalis
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ENSOGAG00000029322	-	99	84.848	ENSXMAG00000003162	rps24	94	85.593	Xiphophorus_maculatus