EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000029343 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10181 bases
Position: chrGL873819.1:401458-411638
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	1	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	2	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	3	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	4	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	5	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	6	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	7	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	8	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	9	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	10	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	11	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	12	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	13	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	14	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	15	16
ENSOGAP00000019928	zf-C2H2	PF00096.26	3.9e-99	16	16
ENSOGAP00000019928	zf-met	PF12874.7	2.5e-05	1	2
ENSOGAP00000019928	zf-met	PF12874.7	2.5e-05	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000033059	-	2601	-	ENSOGAP00000019928	867 (aa)	-	H0XUY6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000029343	-	85	52.473	ENSOGAG00000001912	ZNF233	81	51.181
ENSOGAG00000029343	-	99	49.524	ENSOGAG00000012069	ZNF225	99	49.524
ENSOGAG00000029343	-	73	45.062	ENSOGAG00000008879	GFI1B	59	45.062
ENSOGAG00000029343	-	81	39.286	ENSOGAG00000029406	ZNF865	81	31.440
ENSOGAG00000029343	-	99	50.000	ENSOGAG00000001907	-	100	49.563
ENSOGAG00000029343	-	100	48.608	ENSOGAG00000014983	ZNF81	99	48.608
ENSOGAG00000029343	-	75	40.000	ENSOGAG00000010500	-	61	40.000
ENSOGAG00000029343	-	99	53.846	ENSOGAG00000002111	-	99	53.846
ENSOGAG00000029343	-	99	52.869	ENSOGAG00000001902	ZFP1	99	52.869
ENSOGAG00000029343	-	82	52.266	ENSOGAG00000025131	ZNF121	99	52.266
ENSOGAG00000029343	-	99	48.544	ENSOGAG00000011129	ZNF317	90	48.544
ENSOGAG00000029343	-	73	39.506	ENSOGAG00000029101	ZNF784	81	36.416
ENSOGAG00000029343	-	100	42.424	ENSOGAG00000029163	-	75	46.429
ENSOGAG00000029343	-	74	30.568	ENSOGAG00000027905	PATZ1	55	32.314
ENSOGAG00000029343	-	78	31.962	ENSOGAG00000031877	ZNF526	86	31.956
ENSOGAG00000029343	-	78	42.857	ENSOGAG00000034730	ZNF628	61	42.512
ENSOGAG00000029343	-	82	31.319	ENSOGAG00000030944	ZNF574	93	34.043
ENSOGAG00000029343	-	81	40.000	ENSOGAG00000027487	ZNF236	80	44.444
ENSOGAG00000029343	-	76	46.023	ENSOGAG00000027913	GFI1	57	46.023
ENSOGAG00000029343	-	99	58.108	ENSOGAG00000003693	ZNF205	51	57.848
ENSOGAG00000029343	-	76	32.323	ENSOGAG00000029813	ZNF423	94	32.323
ENSOGAG00000029343	-	99	43.158	ENSOGAG00000024538	-	73	43.158
ENSOGAG00000029343	-	78	54.182	ENSOGAG00000033980	ZNF768	62	51.825
ENSOGAG00000029343	-	72	35.769	ENSOGAG00000014589	GTF3A	82	34.737
ENSOGAG00000029343	-	54	41.176	ENSOGAG00000016496	OVOL1	53	41.176
ENSOGAG00000029343	-	79	35.593	ENSOGAG00000009996	PRDM5	83	37.870
ENSOGAG00000029343	-	99	50.551	ENSOGAG00000029772	-	93	50.195
ENSOGAG00000029343	-	79	56.863	ENSOGAG00000007268	ZSCAN2	68	56.863
ENSOGAG00000029343	-	56	31.818	ENSOGAG00000013799	SALL4	55	48.980
ENSOGAG00000029343	-	73	36.735	ENSOGAG00000000419	SNAI3	52	38.519
ENSOGAG00000029343	-	79	48.093	ENSOGAG00000004779	ZNF564	99	48.093
ENSOGAG00000029343	-	98	60.396	ENSOGAG00000025289	-	99	60.396
ENSOGAG00000029343	-	99	63.889	ENSOGAG00000014360	ZNF829	100	67.470
ENSOGAG00000029343	-	85	37.854	ENSOGAG00000003269	ZNF319	91	37.550
ENSOGAG00000029343	-	75	37.809	ENSOGAG00000034080	ZNF408	60	37.809
ENSOGAG00000029343	-	94	54.711	ENSOGAG00000013758	ZNF774	74	54.711
ENSOGAG00000029343	-	89	43.077	ENSOGAG00000001561	ZNF425	90	43.077
ENSOGAG00000029343	-	82	54.332	ENSOGAG00000015980	-	99	54.332

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000029343	-	75	35.677	ENSAPOG00000001097	-	59	34.595	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000029343	-	75	34.946	ENSATEG00000014755	-	65	38.129	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000029343	-	95	51.026	ENSCSAG00000001938	ZNF845	99	52.117	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029343	-	85	45.345	ENSCSAVG00000001989	-	100	48.227	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000029343	-	83	40.840	ENSCSAVG00000007589	-	100	40.840	Ciona_savignyi
ENSOGAG00000029343	-	81	50.733	ENSCANG00000038794	ZNF845	92	52.496	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000029343	-	99	54.930	ENSCGRG00001024630	-	96	54.930	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000029343	-	85	50.847	ENSEBUG00000008852	ZNF845	79	54.195	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000029343	-	80	48.921	ENSEBUG00000012628	ZNF845	82	48.921	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000029343	-	79	52.797	ENSEBUG00000007308	ZNF845	99	48.336	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000029343	-	82	52.308	ENSEBUG00000008988	ZNF845	85	52.218	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000029343	-	78	34.783	ENSHBUG00000009720	-	64	34.783	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000029343	-	99	50.383	ENSMLEG00000044333	ZNF845	99	52.741	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000029343	-	76	34.026	ENSMAMG00000018536	-	62	34.158	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000029343	-	77	38.389	ENSMZEG00005020085	-	88	38.389	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000029343	-	99	55.449	ENSMAUG00000014247	-	100	55.449	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000029343	-	99	58.291	ENSMOCG00000002167	Zfp712	99	61.034	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000029343	-	75	34.375	ENSMALG00000013321	-	73	34.393	Monopterus_albus
ENSOGAG00000029343	-	99	51.119	MGP_CAROLIEiJ_G0018661	Zfp759	100	51.119	Mus_caroli
ENSOGAG00000029343	-	99	49.766	ENSMUSG00000095432	Zfp748	100	49.766	Mus_musculus
ENSOGAG00000029343	-	99	50.947	ENSMUSG00000057396	Zfp759	100	50.947	Mus_musculus
ENSOGAG00000029343	-	99	51.291	MGP_PahariEiJ_G0015741	Zfp759	99	51.291	Mus_pahari
ENSOGAG00000029343	-	99	49.922	MGP_PahariEiJ_G0015756	Zfp748	100	49.922	Mus_pahari
ENSOGAG00000029343	-	99	50.258	MGP_SPRETEiJ_G0019544	Zfp759	100	50.258	Mus_spretus
ENSOGAG00000029343	-	99	49.766	MGP_SPRETEiJ_G0019560	Zfp748	100	49.766	Mus_spretus
ENSOGAG00000029343	-	99	50.880	ENSNLEG00000006172	ZNF845	99	50.880	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000029343	-	75	34.286	ENSORLG00000028851	-	65	33.911	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000029343	-	75	34.908	ENSOMEG00000010300	-	88	34.500	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000029343	-	99	51.780	ENSPTRG00000050668	ZNF845	99	51.780	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000029343	-	99	59.308	ENSPEMG00000021548	Zfp712	99	60.456	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000029343	-	99	52.989	ENSPEMG00000020934	-	100	52.989	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000029343	-	78	33.509	ENSPFOG00000010474	-	99	35.235	Poecilia_formosa
ENSOGAG00000029343	-	78	33.245	ENSPLAG00000017843	-	91	34.564	Poecilia_latipinna
ENSOGAG00000029343	-	75	33.509	ENSPMEG00000017809	-	66	32.880	Poecilia_mexicana
ENSOGAG00000029343	-	78	35.054	ENSPNYG00000021795	-	64	35.054	Pundamilia_nyererei
ENSOGAG00000029343	-	99	57.042	ENSRNOG00000049259	LOC102549842	100	57.042	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000029343	-	99	46.901	ENSRBIG00000035402	-	98	48.287	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000029343	-	99	54.149	ENSSBOG00000028573	-	99	54.149	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000029343	-	78	33.679	ENSSDUG00000010305	-	58	32.888	Seriola_dumerili
ENSOGAG00000029343	-	80	34.197	ENSSPAG00000010470	-	60	33.243	Stegastes_partitus