EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000029360 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 776 bases
Position: chrGL873521.1:21451748-21452523
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000017872	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	1.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000026017	-	720	-	ENSOGAP00000017872	239 (aa)	-	H0XP31

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000029360	-	88	52.137	ENSOGAG00000001254	-	94	52.988
ENSOGAG00000029360	-	95	58.400	ENSOGAG00000014027	-	98	56.322
ENSOGAG00000029360	-	95	55.378	ENSOGAG00000007682	-	98	53.640
ENSOGAG00000029360	-	88	43.723	ENSOGAG00000001957	-	94	43.723

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000029360	-	95	57.600	ENSAPLG00000005247	RPL7A	97	55.556	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000029360	-	57	66.176	ENSANAG00000021362	-	89	66.176	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029360	-	98	50.593	ENSANAG00000035965	-	96	50.593	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029360	-	95	53.200	ENSAMXG00000012525	rpl7a	98	51.341	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000029360	-	60	59.091	ENSBTAG00000047286	-	68	59.091	Bos_taurus
ENSOGAG00000029360	-	89	52.766	ENSCJAG00000048127	-	98	52.290	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029360	-	54	66.406	ENSCJAG00000039516	-	85	66.406	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029360	-	61	64.384	ENSCJAG00000044259	-	96	64.384	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029360	-	51	69.672	ENSCJAG00000014827	-	58	69.672	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029360	-	57	66.912	ENSCJAG00000040821	-	93	66.912	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029360	-	98	51.406	ENSCHIG00000023018	-	95	51.406	Capra_hircus
ENSOGAG00000029360	-	57	57.353	ENSTSYG00000029336	-	93	57.353	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029360	-	99	51.751	ENSCCAG00000033718	-	98	51.751	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029360	-	54	42.537	ENSCCAG00000035068	-	89	42.537	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029360	-	57	66.176	ENSCATG00000031343	-	90	66.176	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029360	-	57	67.647	ENSCATG00000032659	-	93	67.647	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029360	-	95	56.972	ENSCSAG00000019115	-	94	56.972	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029360	-	93	48.571	ENSCSAG00000018485	-	98	50.769	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029360	-	95	55.600	ENSCSAG00000018506	-	98	53.640	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029360	-	92	52.632	ENSCSAG00000005053	-	94	53.937	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029360	-	95	58.000	ENSCPBG00000021161	-	98	55.939	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000029360	-	89	55.411	ENSCGRG00001020617	-	95	57.317	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000029360	-	95	56.148	ENSCGRG00000003429	-	98	54.331	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000029360	-	95	54.183	ENSDARG00000019230	rpl7a	98	52.490	Danio_rerio
ENSOGAG00000029360	-	99	45.188	ENSDNOG00000030713	-	98	45.188	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000029360	-	69	60.227	ENSDORG00000027559	-	74	60.227	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000029360	-	99	40.000	ENSEBUG00000015826	rpl7a	97	40.000	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000029360	-	95	53.785	ENSELUG00000023023	rpl7a	98	52.490	Esox_lucius
ENSOGAG00000029360	-	64	54.248	ENSFCAG00000026737	-	95	54.248	Felis_catus
ENSOGAG00000029360	-	62	47.799	ENSFCAG00000029566	-	75	47.799	Felis_catus
ENSOGAG00000029360	-	95	57.600	ENSFALG00000001502	-	86	55.556	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000029360	-	95	58.000	ENSGAGG00000010277	-	94	55.939	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000029360	-	57	66.667	ENSGGOG00000025516	-	90	66.667	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000029360	-	57	66.176	ENSGGOG00000023680	-	89	66.176	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000029360	-	95	54.583	ENSGGOG00000026585	-	98	52.140	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000029360	-	95	49.160	ENSHGLG00000018482	-	98	47.200	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000029360	-	95	57.600	ENSHGLG00000013590	RPL7A	98	55.556	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000029360	-	95	48.627	ENSHGLG00000012167	-	97	46.992	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000029360	-	95	48.627	ENSHGLG00100007133	-	97	46.992	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000029360	-	95	49.160	ENSHGLG00100004197	-	98	47.200	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000029360	-	95	57.600	ENSHGLG00100007783	RPL7A	98	55.556	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000029360	-	95	52.569	ENSIPUG00000008146	rpl7a	98	50.758	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000029360	-	95	53.680	ENSSTOG00000031997	-	98	51.867	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000029360	-	94	45.494	ENSJJAG00000012899	-	99	45.494	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000029360	-	99	47.843	ENSJJAG00000022569	-	98	47.843	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000029360	-	95	55.466	ENSJJAG00000014376	-	98	53.488	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000029360	-	94	54.783	ENSJJAG00000024026	-	94	54.274	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000029360	-	60	60.417	ENSJJAG00000016802	-	99	60.417	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000029360	-	95	54.000	ENSLACG00000018224	rpl7a	95	52.107	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000029360	-	95	58.000	ENSLAFG00000006436	-	97	55.939	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000029360	-	95	58.000	ENSMFAG00000027988	-	98	55.939	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000029360	-	95	57.613	ENSMFAG00000044607	-	98	55.512	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000029360	-	57	66.912	ENSMMUG00000012379	-	89	66.912	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000029360	-	95	58.025	ENSMMUG00000049182	-	89	66.912	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000029360	-	95	56.327	ENSMNEG00000025946	-	98	54.688	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000029360	-	57	67.647	ENSMNEG00000037496	-	93	67.647	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000029360	-	95	59.363	ENSMNEG00000005027	-	98	57.471	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000029360	-	93	51.626	ENSMLEG00000012582	-	98	53.640	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000029360	-	57	61.765	ENSMAUG00000019197	-	90	61.765	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000029360	-	57	66.912	ENSMICG00000026491	-	89	66.912	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000029360	-	95	56.972	ENSMOCG00000008541	-	98	54.962	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000029360	-	51	68.852	ENSMPUG00000012398	-	88	68.852	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000029360	-	88	45.415	ENSMPUG00000012594	-	93	46.502	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000029360	-	93	41.870	ENSMPUG00000009401	-	96	40.385	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000029360	-	95	53.414	ENSMPUG00000017429	-	93	53.414	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000029360	-	95	49.799	ENSMPUG00000003699	-	93	49.799	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000029360	-	93	50.407	ENSNLEG00000030063	-	98	52.490	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000029360	-	95	58.000	ENSNLEG00000030504	-	98	55.939	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000029360	-	61	62.329	ENSNLEG00000030901	-	96	62.329	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000029360	-	95	57.200	ENSMEUG00000014550	-	98	55.172	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000029360	-	82	51.613	ENSOANG00000007060	-	92	51.250	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000029360	-	88	47.619	ENSOCUG00000025450	-	100	47.619	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000029360	-	81	49.761	ENSOCUG00000027027	-	94	49.761	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000029360	-	95	55.242	ENSOCUG00000022874	-	98	53.282	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000029360	-	95	53.360	ENSOARG00000003677	-	98	51.515	Ovis_aries
ENSOGAG00000029360	-	98	55.253	ENSOARG00000004560	-	96	55.253	Ovis_aries
ENSOGAG00000029360	-	99	53.333	ENSPPAG00000030172	-	93	65.035	Pan_paniscus
ENSOGAG00000029360	-	95	52.941	ENSPPAG00000029689	-	96	52.941	Pan_paniscus
ENSOGAG00000029360	-	95	54.583	ENSPPAG00000037938	-	92	63.281	Pan_paniscus
ENSOGAG00000029360	-	57	66.176	ENSPPAG00000035063	-	89	66.176	Pan_paniscus
ENSOGAG00000029360	-	57	54.015	ENSPPRG00000008233	-	89	54.015	Panthera_pardus
ENSOGAG00000029360	-	57	66.176	ENSPTRG00000049410	-	89	66.176	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000029360	-	89	56.170	ENSPTRG00000029310	-	98	55.939	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000029360	-	54	59.286	ENSPTRG00000044655	-	77	59.286	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000029360	-	95	52.941	ENSPTRG00000047886	-	96	52.941	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000029360	-	95	54.656	ENSPTRG00000051913	-	98	52.918	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000029360	-	57	66.176	ENSPANG00000034498	-	93	66.176	Papio_anubis
ENSOGAG00000029360	-	57	68.382	ENSPANG00000003750	-	90	68.382	Papio_anubis
ENSOGAG00000029360	-	57	67.647	ENSPEMG00000013592	-	93	67.647	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSOGAG00000029360	-	98	52.439	ENSPCIG00000026434	-	96	52.439	Phascolarctos_cinereus
ENSOGAG00000029360	-	95	58.159	ENSPCOG00000004337	-	98	56.000	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000029360	-	95	51.587	ENSPNAG00000029194	rpl7a	99	60.690	Pygocentrus_nattereri
ENSOGAG00000029360	-	99	56.371	ENSRNOG00000029423	AABR07052519.1	97	56.371	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000029360	-	99	52.778	ENSRNOG00000014425	AABR07054456.1	99	52.778	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000029360	-	99	52.756	ENSRNOG00000022718	AC094246.2	98	52.756	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000029360	-	95	58.400	ENSRNOG00000033652	AABR07045321.1	98	56.322	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000029360	-	95	56.972	ENSRNOG00000031532	AABR07018167.1	98	55.172	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000029360	-	95	56.574	ENSRNOG00000028826	AC128901.1	98	54.580	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000029360	-	95	53.968	ENSRNOG00000029310	AABR07049918.1	98	52.091	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000029360	-	95	55.378	ENSRNOG00000029130	AABR07057586.1	94	55.378	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000029360	-	95	56.680	ENSRNOG00000031902	AABR07027819.1	98	54.440	Rattus_norvegicus
ENSOGAG00000029360	-	56	65.926	ENSRBIG00000007002	-	87	65.926	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000029360	-	83	50.224	ENSRBIG00000037343	-	96	50.215	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000029360	-	95	56.746	ENSRBIG00000010998	-	98	54.753	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000029360	-	57	66.176	ENSRROG00000035341	-	89	66.176	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000029360	-	83	50.224	ENSRROG00000041577	-	96	50.215	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000029360	-	89	43.913	ENSSBOG00000033255	-	94	45.565	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000029360	-	95	57.600	ENSTGUG00000005463	-	97	55.556	Taeniopygia_guttata
ENSOGAG00000029360	-	95	54.800	ENSTNIG00000007501	rpl7a	97	52.874	Tetraodon_nigroviridis
ENSOGAG00000029360	-	56	55.556	ENSTBEG00000003344	-	89	55.556	Tupaia_belangeri