EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000029367 (Gene tree)
Gene ID: 100942771
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: RNA binding motif protein 47
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 32158 bases
Position: chrGL873700.1:1473221-1505378
Accession: 100942771
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000018765	RRM_1	PF00076.22	4.2e-38	1	3
ENSOGAP00000018765	RRM_1	PF00076.22	4.2e-38	2	3
ENSOGAP00000018765	RRM_1	PF00076.22	4.2e-38	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000025003	-	2337	XM_023519594	ENSOGAP00000018765	591 (aa)	XP_023375362	H0XRM3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000029367	-	52	54.516	ENSOGAG00000001721	SYNCRIP	68	47.586
ENSOGAG00000029367	-	51	74.000	ENSOGAG00000005647	RBM46	56	74.000
ENSOGAG00000029367	-	100	88.832	ENSOGAG00000025193	-	100	88.832
ENSOGAG00000029367	-	52	56.129	ENSOGAG00000009179	-	71	46.035
ENSOGAG00000029367	-	73	57.965	ENSOGAG00000012884	A1CF	74	58.129

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000029367	-	100	97.306	ENSG00000163694	RBM47	100	98.618	Homo_sapiens
ENSOGAG00000029367	-	100	77.554	ENSAPOG00000011062	rbm47	93	84.789	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000029367	-	100	96.801	ENSAMEG00000009672	RBM47	100	96.801	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029367	-	100	76.421	ENSACIG00000011531	rbm47	100	75.084	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000029367	-	100	77.387	ENSAOCG00000022245	rbm47	93	84.789	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000029367	-	100	77.219	ENSAPEG00000018304	rbm47	93	84.789	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000029367	-	100	76.307	ENSATEG00000018400	rbm47	94	77.163	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000029367	-	100	88.702	ENSAPLG00000013974	RBM47	100	88.364	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000029367	-	100	86.144	ENSACAG00000011833	RBM47	100	85.643	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000029367	-	100	97.306	ENSANAG00000029440	RBM47	100	97.306	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029367	-	100	76.393	ENSACLG00000016902	rbm47	94	85.634	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000029367	-	100	74.715	ENSAMXG00000021794	rbm47	95	77.375	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000029367	-	100	97.306	ENSBTAG00000002356	RBM47	100	97.306	Bos_taurus
ENSOGAG00000029367	-	100	96.975	ENSCJAG00000019385	RBM47	100	96.975	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029367	-	96	95.439	ENSCAFG00000015898	RBM47	100	94.108	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029367	-	83	96.341	ENSCAFG00020010558	RBM47	94	94.960	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029367	-	100	97.306	ENSCHIG00000026214	RBM47	100	97.306	Capra_hircus
ENSOGAG00000029367	-	86	81.460	ENSTSYG00000033612	RBM47	95	92.593	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029367	-	100	88.215	ENSCAPG00000008426	RBM47	100	88.384	Cavia_aperea
ENSOGAG00000029367	-	100	95.960	ENSCPOG00000014100	RBM47	100	95.960	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000029367	-	100	97.143	ENSCCAG00000030129	-	100	97.143	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029367	-	99	67.340	ENSCCAG00000024397	-	99	66.162	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029367	-	100	97.475	ENSCATG00000042064	RBM47	100	97.475	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029367	-	100	94.276	ENSCLAG00000001684	RBM47	100	94.937	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000029367	-	100	97.475	ENSCSAG00000017060	RBM47	100	97.475	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029367	-	88	91.139	ENSCHOG00000011731	RBM47	88	90.315	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000029367	-	100	89.649	ENSCPBG00000013831	RBM47	100	89.316	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000029367	-	100	97.306	ENSCANG00000019997	RBM47	100	97.306	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000029367	-	100	93.603	ENSCGRG00001000623	-	100	93.434	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000029367	-	100	66.779	ENSCGRG00001020102	-	100	72.007	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000029367	-	100	92.761	ENSCGRG00000007762	-	100	94.304	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000029367	-	100	66.442	ENSCGRG00000014760	-	100	71.669	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000029367	-	100	74.833	ENSCSEG00000004545	rbm47	100	73.500	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000029367	-	100	75.712	ENSCVAG00000020144	rbm47	93	85.311	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000029367	-	100	76.683	ENSDARG00000061985	rbm47	95	78.299	Danio_rerio
ENSOGAG00000029367	-	100	93.255	ENSDNOG00000046854	RBM47	100	93.929	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000029367	-	100	96.147	ENSDORG00000010144	Rbm47	100	96.147	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000029367	-	100	95.477	ENSETEG00000009194	RBM47	100	95.477	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000029367	-	99	57.096	ENSEBUG00000011912	rbm47	95	59.445	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000029367	-	100	97.138	ENSEASG00005008443	RBM47	100	97.138	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000029367	-	100	97.138	ENSECAG00000004400	RBM47	100	97.138	Equus_caballus
ENSOGAG00000029367	-	75	96.104	ENSEEUG00000001194	RBM47	75	96.104	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000029367	-	99	74.709	ENSELUG00000006148	rbm47	93	86.351	Esox_lucius
ENSOGAG00000029367	-	100	96.796	ENSFCAG00000012399	RBM47	100	96.796	Felis_catus
ENSOGAG00000029367	-	100	90.436	ENSFALG00000002861	RBM47	100	89.933	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000029367	-	100	93.266	ENSFDAG00000016326	RBM47	100	92.593	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000029367	-	100	76.756	ENSFHEG00000007938	rbm47	100	74.247	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000029367	-	100	74.634	ENSGMOG00000014802	rbm47	94	76.736	Gadus_morhua
ENSOGAG00000029367	-	63	92.021	ENSGALG00000014267	RBM47	99	92.021	Gallus_gallus
ENSOGAG00000029367	-	63	83.200	ENSGAFG00000020571	rbm47	98	81.867	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000029367	-	100	73.779	ENSGACG00000016223	rbm47	93	83.380	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000029367	-	100	89.816	ENSGAGG00000020051	RBM47	100	89.482	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000029367	-	100	97.475	ENSGGOG00000001367	RBM47	100	97.475	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000029367	-	100	76.307	ENSHBUG00000003520	rbm47	94	85.634	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000029367	-	84	87.200	ENSHGLG00000016914	RBM47	100	96.203	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000029367	-	100	95.439	ENSHGLG00100014028	-	100	96.203	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000029367	-	100	85.110	ENSHGLG00100003071	-	100	85.110	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000029367	-	99	76.127	ENSHCOG00000002074	rbm47	93	85.352	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000029367	-	100	77.219	ENSIPUG00000004743	rbm47	97	78.534	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000029367	-	100	96.807	ENSSTOG00000004727	RBM47	100	96.835	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000029367	-	100	95.960	ENSJJAG00000013823	Rbm47	100	95.960	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000029367	-	100	77.667	ENSKMAG00000000084	rbm47	93	85.070	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000029367	-	100	76.087	ENSLBEG00000008436	rbm47	93	83.099	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000029367	-	100	85.092	ENSLACG00000007196	RBM47	100	84.087	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000029367	-	100	81.742	ENSLOCG00000012966	rbm47	95	80.737	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000029367	-	100	95.286	ENSLAFG00000011998	RBM47	100	94.108	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000029367	-	100	97.475	ENSMFAG00000037967	RBM47	100	97.475	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000029367	-	100	97.475	ENSMMUG00000012036	RBM47	100	98.446	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000029367	-	100	97.475	ENSMNEG00000040774	RBM47	100	97.475	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000029367	-	100	98.413	ENSMLEG00000041432	RBM47	100	98.413	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000029367	-	100	75.777	ENSMAMG00000019143	rbm47	94	81.867	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000029367	-	100	76.393	ENSMZEG00005023659	rbm47	95	77.682	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000029367	-	100	90.150	ENSMGAG00000012226	RBM47	100	89.649	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000029367	-	100	94.604	ENSMAUG00000006493	Rbm47	100	94.435	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000029367	-	100	89.882	ENSMICG00000026417	RBM47	96	92.918	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000029367	-	100	95.101	ENSMOCG00000021170	Rbm47	100	95.101	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000029367	-	100	76.471	ENSMMOG00000007260	rbm47	95	77.202	Mola_mola
ENSOGAG00000029367	-	100	81.282	ENSMODG00000020561	-	100	80.776	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000029367	-	52	82.372	ENSMODG00000015426	-	97	82.637	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000029367	-	100	91.568	ENSMODG00000007003	RBM47	100	91.062	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000029367	-	100	76.628	ENSMALG00000005167	rbm47	94	85.070	Monopterus_albus
ENSOGAG00000029367	-	100	94.426	MGP_CAROLIEiJ_G0027258	Rbm47	100	94.426	Mus_caroli
ENSOGAG00000029367	-	100	94.932	ENSMUSG00000070780	Rbm47	100	94.932	Mus_musculus
ENSOGAG00000029367	-	100	94.932	MGP_PahariEiJ_G0017040	Rbm47	100	94.932	Mus_pahari
ENSOGAG00000029367	-	100	94.426	MGP_SPRETEiJ_G0028253	Rbm47	100	94.426	Mus_spretus
ENSOGAG00000029367	-	100	97.800	ENSMPUG00000006177	RBM47	94	97.800	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000029367	-	100	92.929	ENSMLUG00000000889	RBM47	100	93.098	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000029367	-	100	95.447	ENSNGAG00000003325	Rbm47	100	95.278	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000029367	-	100	76.596	ENSNBRG00000015092	rbm47	95	77.893	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000029367	-	100	97.138	ENSNLEG00000017151	RBM47	100	97.138	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000029367	-	72	87.588	ENSMEUG00000009516	-	99	87.736	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000029367	-	75	95.851	ENSOPRG00000016507	-	75	95.851	Ochotona_princeps
ENSOGAG00000029367	-	100	94.613	ENSODEG00000004873	RBM47	100	94.781	Octodon_degus
ENSOGAG00000029367	-	100	75.367	ENSONIG00000009061	rbm47	94	76.298	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000029367	-	100	87.312	ENSOANG00000008978	RBM47	100	87.813	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000029367	-	100	96.128	ENSOCUG00000012034	RBM47	100	96.128	Oryctolagus_cuniculus
ENSOGAG00000029367	-	100	76.294	ENSORLG00000005847	rbm47	94	84.225	Oryzias_latipes
ENSOGAG00000029367	-	100	76.461	ENSORLG00020005154	rbm47	94	84.225	Oryzias_latipes_hni
ENSOGAG00000029367	-	100	76.795	ENSORLG00015000066	rbm47	94	84.507	Oryzias_latipes_hsok
ENSOGAG00000029367	-	100	78.261	ENSOMEG00000010730	rbm47	100	75.585	Oryzias_melastigma
ENSOGAG00000029367	-	100	89.412	ENSOARG00000012711	RBM47	100	89.412	Ovis_aries
ENSOGAG00000029367	-	100	97.306	ENSPPAG00000029763	RBM47	100	97.306	Pan_paniscus
ENSOGAG00000029367	-	100	93.592	ENSPPRG00000012873	RBM47	100	93.592	Panthera_pardus
ENSOGAG00000029367	-	85	93.028	ENSPTIG00000017046	RBM47	100	91.036	Panthera_tigris_altaica
ENSOGAG00000029367	-	100	97.475	ENSPTRG00000016006	RBM47	100	97.475	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000029367	-	100	97.475	ENSPANG00000005980	RBM47	100	97.475	Papio_anubis
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ENSOGAG00000029367	-	96	75.390	ENSPKIG00000013431	RBM47	92	87.288	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSOGAG00000029367	-	88	82.933	ENSXCOG00000000780	rbm47	100	81.600	Xiphophorus_couchianus
ENSOGAG00000029367	-	100	76.756	ENSXMAG00000009874	rbm47	93	85.028	Xiphophorus_maculatus