EuRBPDB

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000029379 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1863 bases
Position: chrGL873582.1:7902777-7904639
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000017689	tRNA_anti-codon	PF01336.25	3.5e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000029113	-	1422	-	ENSOGAP00000017689	473 (aa)	-	H0XNJ8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000029379	-	100	98.246	ENSOGAG00000005581	-	94	98.246

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000029379	-	98	74.725	ENSAPOG00000011658	rpa1	75	74.725	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000029379	-	90	64.444	ENSAPOG00000019409	RPA1	67	64.444	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000029379	-	98	92.105	ENSAMEG00000007706	RPA1	93	84.838	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029379	-	93	55.769	ENSACIG00000007277	rpa1	73	55.769	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000029379	-	94	51.331	ENSACIG00000012881	RPA1	94	51.331	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000029379	-	98	75.410	ENSAOCG00000023376	rpa1	75	75.410	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000029379	-	99	65.000	ENSAOCG00000009003	RPA1	81	65.000	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000029379	-	99	65.000	ENSAPEG00000019132	RPA1	82	65.000	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000029379	-	98	75.410	ENSAPEG00000008634	rpa1	75	75.410	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000029379	-	99	65.241	ENSATEG00000006443	RPA1	78	65.241	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000029379	-	92	75.275	ENSATEG00000022024	rpa1	74	75.275	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000029379	-	97	75.510	ENSAPLG00000012442	RPA1	69	75.510	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000029379	-	97	63.793	ENSACAG00000014490	RPA1	74	63.934	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000029379	-	97	86.029	ENSANAG00000023456	RPA1	94	86.029	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029379	-	90	75.824	ENSACLG00000006640	rpa1	73	75.824	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000029379	-	99	63.874	ENSACLG00000005223	RPA1	77	63.874	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000029379	-	97	70.286	ENSAMXG00000008418	rpa1	76	69.780	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000029379	-	100	88.772	ENSBTAG00000009711	RPA1	94	88.772	Bos_taurus
ENSOGAG00000029379	-	100	86.316	ENSCJAG00000001848	RPA1	94	86.316	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029379	-	100	85.263	ENSCAFG00000019249	RPA1	94	85.263	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029379	-	100	85.263	ENSCAFG00020009847	RPA1	94	85.263	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029379	-	100	88.070	ENSCHIG00000026308	RPA1	94	88.070	Capra_hircus
ENSOGAG00000029379	-	100	93.122	ENSTSYG00000003482	-	94	87.762	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029379	-	100	82.807	ENSCPOG00000000035	RPA1	94	82.807	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000029379	-	81	87.879	ENSCCAG00000010981	RPA1	94	86.667	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029379	-	100	84.127	ENSCLAG00000015045	-	81	84.127	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000029379	-	99	85.263	ENSCLAG00000005185	-	94	85.263	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000029379	-	81	87.879	ENSCSAG00000013833	RPA1	69	87.879	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029379	-	63	91.534	ENSCHOG00000009454	-	92	89.815	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000029379	-	94	91.534	ENSCHOG00000013540	-	94	81.323	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000029379	-	99	82.979	ENSCPBG00000020377	RPA1	93	73.333	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000029379	-	98	40.074	ENSCING00000023482	-	89	40.074	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000029379	-	98	80.435	ENSCANG00000030911	RPA1	94	80.435	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000029379	-	99	83.904	ENSCGRG00001008197	Rpa1	94	83.904	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000029379	-	76	78.453	ENSCGRG00000000582	Rpa1	93	78.453	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000029379	-	98	69.231	ENSCSEG00000013066	rpa1	75	69.231	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000029379	-	97	63.277	ENSCSEG00000012726	RPA1	74	63.277	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000029379	-	93	63.871	ENSCVAG00000013446	-	74	63.871	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000029379	-	98	76.111	ENSCVAG00000019431	rpa1	75	76.111	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000029379	-	99	71.978	ENSDARG00000003938	rpa1	76	71.978	Danio_rerio
ENSOGAG00000029379	-	98	93.085	ENSDNOG00000017218	RPA1	93	87.004	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000029379	-	100	88.070	ENSDORG00000006199	Rpa1	94	88.070	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000029379	-	98	42.759	FBgn0010173	RpA-70	74	43.103	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000029379	-	81	85.567	ENSETEG00000017608	RPA1	62	85.567	Echinops_telfairi
ENSOGAG00000029379	-	97	93.651	ENSEASG00005009372	RPA1	94	89.706	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000029379	-	100	93.651	ENSECAG00000023886	RPA1	94	90.175	Equus_caballus
ENSOGAG00000029379	-	59	89.947	ENSEEUG00000002186	-	62	89.888	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000029379	-	97	74.566	ENSELUG00000021071	rpa1	76	72.727	Esox_lucius
ENSOGAG00000029379	-	84	63.830	ENSELUG00000006136	RPA1	72	63.830	Esox_lucius
ENSOGAG00000029379	-	100	88.360	ENSFCAG00000006306	RPA1	94	86.014	Felis_catus
ENSOGAG00000029379	-	100	78.836	ENSFALG00000006575	RPA1	94	70.280	Ficedula_albicollis
ENSOGAG00000029379	-	99	93.048	ENSFDAG00000007720	RPA1	94	83.158	Fukomys_damarensis
ENSOGAG00000029379	-	97	74.576	ENSFHEG00000003580	rpa1	75	74.576	Fundulus_heteroclitus
ENSOGAG00000029379	-	98	76.374	ENSGMOG00000010382	rpa1	74	76.374	Gadus_morhua
ENSOGAG00000029379	-	100	76.190	ENSGALG00000003072	RPA1	94	71.329	Gallus_gallus
ENSOGAG00000029379	-	98	65.730	ENSGAFG00000020953	RPA1	77	65.730	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000029379	-	97	75.419	ENSGAFG00000012916	rpa1	75	75.419	Gambusia_affinis
ENSOGAG00000029379	-	98	74.033	ENSGACG00000010856	rpa1	76	74.033	Gasterosteus_aculeatus
ENSOGAG00000029379	-	99	71.930	ENSGAGG00000013611	RPA1	94	71.930	Gopherus_agassizii
ENSOGAG00000029379	-	100	80.000	ENSGGOG00000014186	RPA1	94	80.000	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000029379	-	98	75.275	ENSHBUG00000017773	rpa1	75	75.275	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000029379	-	95	60.733	ENSHBUG00000009348	RPA1	74	60.733	Haplochromis_burtoni
ENSOGAG00000029379	-	99	84.912	ENSHGLG00000008846	RPA1	94	84.912	Heterocephalus_glaber_female
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ENSOGAG00000029379	-	100	76.491	ENSHGLG00100000799	-	94	76.491	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000029379	-	99	84.912	ENSHGLG00100017755	-	94	84.912	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000029379	-	98	71.271	ENSHCOG00000001401	rpa1	75	71.271	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000029379	-	93	50.311	ENSHCOG00000000351	RPA1	69	50.311	Hippocampus_comes
ENSOGAG00000029379	-	97	72.571	ENSIPUG00000004400	rpa1	76	71.978	Ictalurus_punctatus
ENSOGAG00000029379	-	97	83.333	ENSSTOG00000022475	RPA1	92	77.857	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSOGAG00000029379	-	94	86.381	ENSJJAG00000000876	Rpa1	92	86.381	Jaculus_jaculus
ENSOGAG00000029379	-	96	76.471	ENSKMAG00000005605	rpa1	97	55.282	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000029379	-	98	63.483	ENSKMAG00000000234	RPA1	75	63.483	Kryptolebias_marmoratus
ENSOGAG00000029379	-	97	73.864	ENSLBEG00000021604	rpa1	76	73.370	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000029379	-	99	48.187	ENSLBEG00000002281	RPA1	94	48.187	Labrus_bergylta
ENSOGAG00000029379	-	75	63.095	ENSLACG00000007210	RPA1	70	63.095	Latimeria_chalumnae
ENSOGAG00000029379	-	99	60.000	ENSLOCG00000006397	rpa1	98	60.000	Lepisosteus_oculatus
ENSOGAG00000029379	-	99	89.840	ENSLAFG00000015354	RPA1	94	85.223	Loxodonta_africana
ENSOGAG00000029379	-	77	86.131	ENSMFAG00000036138	-	93	87.636	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000029379	-	100	84.656	ENSMMUG00000002442	-	76	84.656	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000029379	-	98	86.496	ENSMMUG00000011604	-	94	88.000	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000029379	-	85	89.333	ENSMNEG00000029837	-	93	89.333	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000029379	-	100	79.649	ENSMNEG00000031632	-	94	81.119	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000029379	-	97	78.545	ENSMLEG00000038768	-	94	80.072	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000029379	-	99	62.827	ENSMAMG00000020097	RPA1	81	62.827	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000029379	-	98	73.626	ENSMAMG00000017993	rpa1	75	73.626	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000029379	-	99	63.874	ENSMZEG00005024731	RPA1	77	63.874	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000029379	-	98	75.824	ENSMZEG00005007551	rpa1	75	75.824	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000029379	-	99	76.720	ENSMGAG00000005315	RPA1	93	71.326	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000029379	-	97	85.766	ENSMAUG00000010474	Rpa1	94	85.766	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000029379	-	100	89.474	ENSMICG00000012867	RPA1	94	89.474	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000029379	-	99	89.247	ENSMOCG00000013019	Rpa1	94	84.669	Microtus_ochrogaster
ENSOGAG00000029379	-	99	71.123	ENSMMOG00000014292	rpa1	75	71.123	Mola_mola
ENSOGAG00000029379	-	97	61.257	ENSMMOG00000010868	RPA1	75	61.257	Mola_mola
ENSOGAG00000029379	-	99	79.649	ENSMODG00000010549	RPA1	94	79.649	Monodelphis_domestica
ENSOGAG00000029379	-	96	75.862	ENSMALG00000011453	rpa1	93	55.319	Monopterus_albus
ENSOGAG00000029379	-	91	63.478	ENSMALG00000001208	RPA1	60	63.478	Monopterus_albus
ENSOGAG00000029379	-	99	89.785	MGP_CAROLIEiJ_G0016734	Rpa1	94	83.448	Mus_caroli
ENSOGAG00000029379	-	99	89.247	ENSMUSG00000000751	Rpa1	94	78.716	Mus_musculus
ENSOGAG00000029379	-	99	91.398	MGP_PahariEiJ_G0017871	Rpa1	94	82.935	Mus_pahari
ENSOGAG00000029379	-	99	89.247	MGP_SPRETEiJ_G0017577	Rpa1	94	78.788	Mus_spretus
ENSOGAG00000029379	-	100	89.418	ENSMPUG00000013119	RPA1	94	86.316	Mustela_putorius_furo
ENSOGAG00000029379	-	100	85.172	ENSMLUG00000006113	RPA1	94	85.172	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000029379	-	94	82.692	ENSNGAG00000004522	Rpa1	89	82.692	Nannospalax_galili
ENSOGAG00000029379	-	91	75.275	ENSNBRG00000020595	rpa1	73	75.275	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000029379	-	95	54.974	ENSNBRG00000009672	RPA1	72	54.974	Neolamprologus_brichardi
ENSOGAG00000029379	-	100	85.263	ENSNLEG00000017149	RPA1	94	86.713	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000029379	-	97	77.289	ENSMEUG00000006714	RPA1	93	77.289	Notamacropus_eugenii
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ENSOGAG00000029379	-	100	79.365	ENSOCUG00000001504	RPA1	94	79.365	Oryctolagus_cuniculus
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ENSOGAG00000029379	-	99	49.320	ENSORLG00020015284	RPA1	94	49.320	Oryzias_latipes_hni
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