EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000029441 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 483 bases
Position: chrGL873721.1:1969234-1969716
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000019373	Ribosomal_L21e	PF01157.18	2.4e-50	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000025044	-	483	-	ENSOGAP00000019373	160 (aa)	-	H0XTD1

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000029441	-	93	81.081	ENSOGAG00000025213	-	100	81.081
ENSOGAG00000029441	-	100	78.750	ENSOGAG00000032866	-	100	78.750
ENSOGAG00000029441	-	97	76.774	ENSOGAG00000012452	-	97	76.774
ENSOGAG00000029441	-	100	75.000	ENSOGAG00000033936	-	100	75.000
ENSOGAG00000029441	-	100	88.750	ENSOGAG00000034076	-	100	88.750
ENSOGAG00000029441	-	100	97.500	ENSOGAG00000033479	-	100	97.500
ENSOGAG00000029441	-	100	92.500	ENSOGAG00000027159	-	100	92.500
ENSOGAG00000029441	-	98	90.385	ENSOGAG00000027182	-	98	90.385
ENSOGAG00000029441	-	93	81.879	ENSOGAG00000034423	-	93	81.879
ENSOGAG00000029441	-	97	76.774	ENSOGAG00000034390	-	100	76.774
ENSOGAG00000029441	-	92	91.156	ENSOGAG00000000212	-	100	91.156
ENSOGAG00000029441	-	100	90.000	ENSOGAG00000026698	-	100	90.000
ENSOGAG00000029441	-	99	71.779	ENSOGAG00000000555	-	99	71.779
ENSOGAG00000029441	-	83	72.932	ENSOGAG00000032000	-	98	68.182
ENSOGAG00000029441	-	93	91.892	ENSOGAG00000010179	-	100	91.892
ENSOGAG00000029441	-	93	75.817	ENSOGAG00000032711	-	100	75.817
ENSOGAG00000029441	-	100	86.875	ENSOGAG00000030151	-	98	86.875
ENSOGAG00000029441	-	100	88.750	ENSOGAG00000026636	-	100	88.750
ENSOGAG00000029441	-	98	87.821	ENSOGAG00000030812	-	98	87.821
ENSOGAG00000029441	-	93	77.027	ENSOGAG00000033882	-	100	77.027
ENSOGAG00000029441	-	100	89.375	ENSOGAG00000030115	-	100	89.375
ENSOGAG00000029441	-	95	63.816	ENSOGAG00000031179	-	94	63.816
ENSOGAG00000029441	-	100	93.750	ENSOGAG00000024836	-	100	93.750
ENSOGAG00000029441	-	82	96.947	ENSOGAG00000008181	-	100	96.947
ENSOGAG00000029441	-	80	92.188	ENSOGAG00000034285	-	100	92.188

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000029441	-	100	96.875	ENSG00000122026	RPL21	100	97.541	Homo_sapiens
ENSOGAG00000029441	-	100	83.125	ENSAPOG00000024402	rpl21	100	83.125	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000029441	-	51	93.827	ENSAMEG00000016455	-	96	92.941	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029441	-	100	93.750	ENSAMEG00000018663	RPL21	98	93.750	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029441	-	100	77.640	ENSAMEG00000004710	-	100	77.640	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029441	-	100	60.248	ENSAMEG00000004632	-	100	60.248	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029441	-	100	85.000	ENSACIG00000021885	rpl21	100	85.000	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000029441	-	100	83.125	ENSAOCG00000017829	rpl21	100	83.125	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000029441	-	100	83.125	ENSAPEG00000019936	rpl21	100	83.125	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000029441	-	100	85.000	ENSATEG00000010524	rpl21	100	85.000	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000029441	-	100	91.250	ENSAPLG00000005641	RPL21	98	91.250	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000029441	-	100	91.250	ENSACAG00000003169	RPL21	100	91.250	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000029441	-	100	91.875	ENSANAG00000019962	-	100	91.875	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029441	-	100	94.375	ENSANAG00000020005	-	100	94.375	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029441	-	97	96.129	ENSANAG00000012283	-	100	96.129	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029441	-	100	95.000	ENSANAG00000031513	-	100	95.000	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029441	-	100	94.375	ENSANAG00000006331	-	100	94.375	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029441	-	100	96.875	ENSANAG00000023031	-	100	96.875	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029441	-	100	95.625	ENSANAG00000031230	-	100	95.625	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029441	-	100	85.000	ENSACLG00000026444	rpl21	100	85.000	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000029441	-	100	83.125	ENSAMXG00000041892	rpl21	100	83.125	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000029441	-	100	95.625	ENSBTAG00000001648	RPL21	100	95.625	Bos_taurus
ENSOGAG00000029441	-	51	90.123	ENSBTAG00000048537	-	84	90.123	Bos_taurus
ENSOGAG00000029441	-	100	93.750	ENSBTAG00000038379	-	100	93.750	Bos_taurus
ENSOGAG00000029441	-	100	62.112	WBGene00004433	rpl-21	100	62.112	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000029441	-	100	78.125	ENSCJAG00000044730	-	100	78.125	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029441	-	67	78.505	ENSCJAG00000041707	-	98	78.505	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029441	-	100	90.000	ENSCJAG00000019734	-	100	90.000	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029441	-	100	95.625	ENSCJAG00000038205	-	100	95.625	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029441	-	100	96.250	ENSCJAG00000043116	-	100	96.250	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029441	-	88	91.429	ENSCJAG00000044684	-	98	91.429	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029441	-	92	96.599	ENSCJAG00000039102	-	100	96.599	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029441	-	100	68.125	ENSCJAG00000044477	-	100	68.125	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029441	-	76	92.562	ENSCAFG00000015533	-	88	92.562	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029441	-	100	95.679	ENSCAFG00000006810	RPL21	100	95.679	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029441	-	100	95.625	ENSCAFG00000032537	-	100	95.625	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029441	-	100	94.375	ENSCAFG00000015987	-	100	94.375	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029441	-	96	65.806	ENSCAFG00000018881	-	97	65.806	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029441	-	99	67.722	ENSCAFG00000024055	-	99	67.722	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029441	-	99	88.050	ENSCAFG00000001564	-	99	88.050	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029441	-	73	94.872	ENSCAFG00000029659	-	99	94.872	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029441	-	100	96.250	ENSCAFG00000008805	-	100	96.250	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029441	-	100	95.625	ENSCAFG00000028744	-	100	95.625	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000029441	-	100	95.625	ENSCAFG00020011527	-	100	95.625	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029441	-	100	95.625	ENSCAFG00020008146	-	100	95.625	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029441	-	100	94.375	ENSCAFG00020020914	-	100	94.375	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029441	-	100	96.250	ENSCAFG00020024181	-	100	96.250	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029441	-	100	95.000	ENSCAFG00020026205	-	100	95.000	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029441	-	100	96.875	ENSCAFG00020025313	-	100	96.875	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029441	-	100	95.625	ENSCAFG00020012834	-	100	95.625	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029441	-	100	96.875	ENSCAFG00020024203	-	100	96.875	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029441	-	100	96.250	ENSCAFG00020005317	-	100	96.250	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029441	-	100	94.375	ENSCAFG00020012095	-	100	94.375	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000029441	-	100	89.375	ENSCHIG00000008368	-	100	89.375	Capra_hircus
ENSOGAG00000029441	-	100	94.375	ENSCHIG00000006564	-	100	94.375	Capra_hircus
ENSOGAG00000029441	-	100	95.625	ENSCHIG00000019833	-	100	95.625	Capra_hircus
ENSOGAG00000029441	-	64	74.757	ENSCHIG00000012074	-	87	74.757	Capra_hircus
ENSOGAG00000029441	-	100	95.625	ENSCHIG00000021720	RPL21	100	95.625	Capra_hircus
ENSOGAG00000029441	-	100	91.250	ENSCHIG00000009094	-	100	91.250	Capra_hircus
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ENSOGAG00000029441	-	100	83.750	ENSTSYG00000026484	-	100	83.750	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000029441	-	51	91.358	ENSTSYG00000036592	-	92	91.358	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029441	-	100	96.875	ENSTSYG00000034405	-	100	96.875	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029441	-	100	93.125	ENSTSYG00000028179	-	100	93.125	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029441	-	100	92.500	ENSTSYG00000026380	-	100	92.500	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000029441	-	100	93.750	ENSCAPG00000010803	-	100	93.750	Cavia_aperea
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ENSOGAG00000029441	-	100	86.957	ENSCPOG00000023041	-	100	86.957	Cavia_porcellus
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ENSOGAG00000029441	-	99	96.226	ENSCCAG00000009412	-	96	96.226	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000029441	-	100	88.125	ENSCCAG00000033290	-	100	88.125	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000029441	-	100	91.250	ENSCLAG00000017893	-	100	91.250	Chinchilla_lanigera
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ENSOGAG00000029441	-	100	84.375	ENSOMEG00000007496	rpl21	100	84.375	Oryzias_melastigma
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