EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000029974 (Gene tree)
Gene ID: 100967121
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1715 bases
Position: chrGL873632.1:4686884-4688598
Accession: 100967121
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000021367	RRM_1	PF00076.22	2.7e-25	1	2
ENSOGAP00000021367	RRM_1	PF00076.22	2.7e-25	2	2
ENSOGAP00000021367	HnRNPA1	PF11627.8	4.4e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000033284	-	1715	-	ENSOGAP00000021367	316 (aa)	XP_003797301	H0XZ24

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000029974	-	75	86.611	ENSOGAG00000029707	-	95	74.085
ENSOGAG00000029974	-	94	45.483	ENSOGAG00000031950	-	94	44.816
ENSOGAG00000029974	-	54	32.558	ENSOGAG00000024995	-	67	31.500
ENSOGAG00000029974	-	62	76.263	ENSOGAG00000028132	HNRNPA3	89	60.882
ENSOGAG00000029974	-	74	47.009	ENSOGAG00000025754	HNRNPA0	83	53.061
ENSOGAG00000029974	-	61	69.072	ENSOGAG00000025948	-	91	69.767
ENSOGAG00000029974	-	53	35.294	ENSOGAG00000030251	HNRNPAB	58	33.668
ENSOGAG00000029974	-	91	77.003	ENSOGAG00000026163	-	99	77.003
ENSOGAG00000029974	-	95	63.787	ENSOGAG00000031644	-	93	67.667
ENSOGAG00000029974	-	62	70.408	ENSOGAG00000030687	-	95	60.129
ENSOGAG00000029974	-	58	58.378	ENSOGAG00000025284	-	95	50.162
ENSOGAG00000029974	-	57	34.066	ENSOGAG00000005621	MSI2	58	35.165
ENSOGAG00000029974	-	53	39.412	ENSOGAG00000004075	HNRNPD	50	37.912
ENSOGAG00000029974	-	95	82.883	ENSOGAG00000027042	-	74	89.796
ENSOGAG00000029974	-	58	74.317	ENSOGAG00000032165	-	93	66.667
ENSOGAG00000029974	-	50	40.000	ENSOGAG00000029550	CIRBP	58	37.624
ENSOGAG00000029974	-	75	35.345	ENSOGAG00000003847	MSI1	50	38.798
ENSOGAG00000029974	-	93	78.125	ENSOGAG00000033554	-	92	78.125
ENSOGAG00000029974	-	96	76.699	ENSOGAG00000017179	-	93	56.291
ENSOGAG00000029974	-	53	32.941	ENSOGAG00000031703	-	78	32.240

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000029974	-	94	90.661	ENSG00000224578	HNRNPA1P48	93	90.661	Homo_sapiens
ENSOGAG00000029974	-	95	88.079	ENSG00000139675	HNRNPA1L2	94	88.079	Homo_sapiens
ENSOGAG00000029974	-	95	90.397	ENSG00000135486	HNRNPA1	100	91.150	Homo_sapiens
ENSOGAG00000029974	-	54	52.326	ENSAMEG00000005593	-	82	53.143	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029974	-	59	79.259	ENSAMEG00000014782	-	100	74.545	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029974	-	75	88.703	ENSAMEG00000000717	-	96	69.748	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029974	-	91	82.699	ENSAMEG00000004289	-	100	82.699	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029974	-	92	63.725	ENSAMEG00000002760	-	100	47.987	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029974	-	94	72.000	ENSAMEG00000000439	-	93	73.913	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029974	-	91	64.822	ENSAMEG00000006409	-	94	67.984	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029974	-	59	79.459	ENSAMEG00000006838	-	80	77.895	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000029974	-	58	80.000	ENSACIG00000012946	hnrnpa1b	95	65.529	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000029974	-	77	61.475	ENSACIG00000020389	HNRNPA1P48	93	63.356	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000029974	-	68	85.185	ENSACAG00000007169	-	92	72.059	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000029974	-	66	50.000	ENSANAG00000017626	-	85	45.806	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029974	-	59	86.772	ENSANAG00000034842	-	94	83.775	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029974	-	95	77.888	ENSANAG00000033687	-	94	76.568	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029974	-	95	84.768	ENSANAG00000026142	-	94	84.768	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029974	-	62	76.020	ENSANAG00000038017	-	87	70.934	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029974	-	95	89.735	ENSANAG00000023645	-	94	89.735	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029974	-	95	82.450	ENSANAG00000025460	-	94	82.450	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029974	-	94	75.490	ENSANAG00000035982	-	100	83.221	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029974	-	95	83.775	ENSANAG00000033447	-	94	83.444	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029974	-	59	75.661	ENSANAG00000034286	-	95	64.972	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000029974	-	58	56.180	ENSAMXG00000024951	-	96	48.443	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000029974	-	95	88.079	ENSBTAG00000021755	-	94	88.079	Bos_taurus
ENSOGAG00000029974	-	95	88.411	ENSBTAG00000006815	-	94	88.411	Bos_taurus
ENSOGAG00000029974	-	57	87.879	ENSBTAG00000052568	-	76	87.879	Bos_taurus
ENSOGAG00000029974	-	95	90.397	ENSBTAG00000001553	HNRNPA1	94	90.397	Bos_taurus
ENSOGAG00000029974	-	81	81.356	ENSBTAG00000024964	-	87	81.356	Bos_taurus
ENSOGAG00000029974	-	75	84.519	ENSCJAG00000045231	-	92	78.571	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029974	-	95	89.735	ENSCJAG00000018864	-	94	89.735	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029974	-	94	68.946	ENSCJAG00000045179	-	100	68.079	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029974	-	95	86.093	ENSCJAG00000023392	-	94	86.093	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029974	-	95	88.079	ENSCJAG00000047153	-	94	88.079	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029974	-	94	87.204	ENSCJAG00000041725	-	87	87.204	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029974	-	95	88.411	ENSCJAG00000003245	-	82	88.411	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000029974	-	66	73.077	ENSCAFG00000005307	-	87	73.134	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	100	80.374	ENSCAFG00000032455	-	94	81.848	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	95	76.974	ENSCAFG00000003493	-	94	82.566	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	90	82.578	ENSCAFG00000000687	-	94	84.014	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	95	79.470	ENSCAFG00000006663	-	94	79.470	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	95	76.577	ENSCAFG00000025274	-	74	83.673	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	94	90.708	ENSCAFG00000030052	-	82	90.393	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	95	75.490	ENSCAFG00000013303	-	92	61.589	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	95	78.689	ENSCAFG00000005164	-	92	79.344	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	97	76.577	ENSCAFG00000006036	-	76	87.755	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000029974	-	80	57.312	ENSCAFG00000006110	-	69	62.722	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	95	76.821	ENSCAFG00000000389	-	94	76.821	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	75	86.975	ENSCAFG00000006580	-	90	81.481	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	94	65.147	ENSCAFG00000017316	-	93	77.926	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	95	71.171	ENSCAFG00000018580	-	73	74.510	Canis_familiaris
ENSOGAG00000029974	-	89	82.562	ENSCAFG00020021537	-	97	83.276	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029974	-	89	85.765	ENSCAFG00020018495	-	93	86.102	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029974	-	76	82.988	ENSCAFG00020003361	-	96	67.559	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029974	-	94	81.940	ENSCAFG00020010583	-	87	81.570	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000029974	-	95	90.066	ENSCHIG00000008322	-	94	90.066	Capra_hircus
ENSOGAG00000029974	-	60	83.770	ENSCHIG00000015099	-	84	83.770	Capra_hircus
ENSOGAG00000029974	-	95	84.106	ENSCHIG00000020945	-	94	84.106	Capra_hircus
ENSOGAG00000029974	-	93	65.484	ENSCHIG00000017826	-	89	67.427	Capra_hircus
ENSOGAG00000029974	-	95	90.397	ENSCHIG00000025214	-	94	90.397	Capra_hircus
ENSOGAG00000029974	-	95	90.066	ENSCHIG00000011858	-	94	90.066	Capra_hircus
ENSOGAG00000029974	-	96	69.637	ENSTSYG00000033637	-	94	61.783	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029974	-	95	63.123	ENSTSYG00000030815	-	94	61.462	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029974	-	95	90.397	ENSTSYG00000012949	-	94	90.397	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000029974	-	100	66.771	ENSTSYG00000033322	-	94	64.784	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000029974	-	95	87.417	ENSCAPG00000002678	-	94	87.417	Cavia_aperea
ENSOGAG00000029974	-	95	78.146	ENSCPOG00000021077	-	94	84.437	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000029974	-	75	63.713	ENSCPOG00000037875	-	90	65.560	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000029974	-	95	73.510	ENSCPOG00000020972	-	93	73.510	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000029974	-	54	85.465	ENSCCAG00000025169	-	94	61.867	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029974	-	95	80.795	ENSCCAG00000029939	-	94	81.126	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029974	-	51	86.420	ENSCCAG00000026582	-	95	66.197	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000029974	-	95	88.411	ENSCCAG00000001588	-	94	88.411	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000029974	-	95	84.106	ENSCCAG00000006246	-	92	82.781	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000029974	-	95	90.397	ENSCATG00000043560	-	94	90.397	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029974	-	85	70.260	ENSCATG00000021833	-	90	67.123	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029974	-	95	83.113	ENSCATG00000041877	-	94	83.113	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029974	-	100	79.811	ENSCATG00000001588	-	96	81.940	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029974	-	90	75.439	ENSCATG00000040418	-	95	71.572	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000029974	-	95	89.073	ENSCLAG00000011502	-	94	89.073	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000029974	-	61	77.835	ENSCLAG00000007977	-	94	62.799	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000029974	-	93	72.973	ENSCLAG00000008626	-	94	73.986	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000029974	-	95	82.450	ENSCSAG00000018870	-	94	82.450	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029974	-	95	88.742	ENSCSAG00000000627	-	94	88.742	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029974	-	95	83.444	ENSCSAG00000019724	-	94	83.444	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029974	-	88	84.229	ENSCSAG00000010220	-	90	84.229	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029974	-	62	76.531	ENSCSAG00000014797	-	93	69.896	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029974	-	95	86.755	ENSCSAG00000018616	-	94	85.430	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000029974	-	97	75.405	ENSCPBG00000022326	-	95	78.378	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000029974	-	91	73.422	ENSCPBG00000018623	-	95	74.675	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000029974	-	95	84.437	ENSCANG00000039350	-	94	84.437	Colobus_angolensis_palliatus
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