EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000030106 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 471 bases
Position: chrGL873529.1:16045550-16046020
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000019584	Ribosomal_L23	PF00276.20	7.9e-14	1	1
ENSOGAP00000019584	Ribosomal_L23eN	PF03939.13	9e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000028959	-	471	-	ENSOGAP00000019584	156 (aa)	-	H0XTZ2

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000030106	-	80	81.600	ENSOGAG00000034190	-	100	81.410
ENSOGAG00000030106	-	83	88.372	ENSOGAG00000029401	-	100	89.744
ENSOGAG00000030106	-	81	83.594	ENSOGAG00000027700	-	81	83.594
ENSOGAG00000030106	-	81	81.746	ENSOGAG00000029608	-	100	82.692
ENSOGAG00000030106	-	83	86.154	ENSOGAG00000031776	-	82	85.827
ENSOGAG00000030106	-	79	77.419	ENSOGAG00000031307	-	80	76.984
ENSOGAG00000030106	-	100	87.179	ENSOGAG00000033163	-	100	87.179
ENSOGAG00000030106	-	75	89.744	ENSOGAG00000024407	-	100	90.385
ENSOGAG00000030106	-	100	89.103	ENSOGAG00000029717	-	100	89.103
ENSOGAG00000030106	-	75	85.470	ENSOGAG00000030736	-	80	85.833

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000030106	-	83	90.698	ENSG00000198242	RPL23A	100	92.857	Homo_sapiens
ENSOGAG00000030106	-	100	85.350	ENSAPOG00000008770	rpl23a	91	76.282	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000030106	-	83	90.698	ENSAMEG00000004684	RPL23A	100	90.385	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030106	-	61	70.526	ENSAMEG00000017534	-	81	61.111	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030106	-	63	73.737	ENSAMEG00000018533	-	93	73.737	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030106	-	99	65.161	ENSAMEG00000010669	-	80	62.698	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030106	-	83	70.229	ENSAMEG00000011777	-	81	70.866	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030106	-	100	65.605	ENSAMEG00000013394	-	100	65.605	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030106	-	83	68.217	ENSAMEG00000009758	-	80	67.460	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030106	-	99	78.571	ENSAMEG00000019431	-	99	78.571	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030106	-	99	85.256	ENSACIG00000002878	rpl23a	92	76.129	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000030106	-	100	85.350	ENSAOCG00000007918	rpl23a	91	76.282	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000030106	-	100	85.350	ENSAPEG00000023469	rpl23a	100	76.282	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000030106	-	100	85.987	ENSATEG00000021517	rpl23a	100	76.923	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000030106	-	83	90.000	ENSAPLG00000000604	RPL23A	81	90.476	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000030106	-	100	87.261	ENSACAG00000005311	RPL23A	100	78.205	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000030106	-	81	83.582	ENSANAG00000011108	-	100	85.366	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030106	-	81	87.302	ENSANAG00000019559	-	100	88.462	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030106	-	82	77.099	ENSANAG00000025336	-	100	77.099	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030106	-	100	88.462	ENSANAG00000022026	-	95	88.462	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030106	-	81	88.095	ENSANAG00000029957	-	82	88.095	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	ENSANAG00000035778	-	100	91.026	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030106	-	100	84.713	ENSAMXG00000041598	rpl23a	100	75.641	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000030106	-	83	90.698	ENSBTAG00000046394	-	85	90.476	Bos_taurus
ENSOGAG00000030106	-	81	87.302	ENSBTAG00000032775	-	100	88.462	Bos_taurus
ENSOGAG00000030106	-	100	56.410	ENSBTAG00000011830	-	75	63.636	Bos_taurus
ENSOGAG00000030106	-	81	87.302	ENSBTAG00000022498	-	99	88.462	Bos_taurus
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	ENSBTAG00000022278	-	99	91.026	Bos_taurus
ENSOGAG00000030106	-	83	89.922	ENSBTAG00000032432	-	99	89.744	Bos_taurus
ENSOGAG00000030106	-	81	89.683	ENSCJAG00000047682	-	100	90.385	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030106	-	81	85.714	ENSCJAG00000039429	-	100	87.179	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030106	-	81	89.683	ENSCJAG00000042604	-	100	90.385	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030106	-	83	88.372	ENSCJAG00000046769	-	82	88.095	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030106	-	83	90.698	ENSCJAG00000013126	-	100	91.026	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030106	-	100	89.744	ENSCJAG00000042808	-	100	89.744	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030106	-	81	88.889	ENSCJAG00000045857	-	100	88.462	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030106	-	78	83.471	ENSCAFG00000000014	-	77	83.471	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	100	78.846	ENSCAFG00000030051	-	100	78.846	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	81	89.683	ENSCAFG00000024427	-	81	89.683	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	83	82.946	ENSCAFG00000031555	-	100	83.974	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	81	80.159	ENSCAFG00000002410	-	100	82.051	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	99	79.221	ENSCAFG00000003753	-	99	79.221	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	71	61.538	ENSCAFG00000007718	-	100	66.667	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	ENSCAFG00000031731	-	100	91.026	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	100	77.564	ENSCAFG00000007256	-	100	77.564	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	81	89.683	ENSCAFG00000015394	-	100	90.385	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	81	89.683	ENSCAFG00000024043	-	100	90.385	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	83	90.698	ENSCAFG00000001968	-	100	91.026	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	81	74.603	ENSCAFG00000017753	-	100	78.205	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	81	75.397	ENSCAFG00000030594	-	79	75.397	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	99	73.248	ENSCAFG00000017678	-	99	73.248	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	83	77.519	ENSCAFG00000017449	-	81	76.984	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	81	74.603	ENSCAFG00000003047	-	100	77.564	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	ENSCAFG00000002548	-	100	91.026	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	83	71.538	ENSCAFG00000001011	-	80	70.866	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000030106	-	83	73.077	ENSCAFG00000018232	-	100	75.000	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	ENSCAFG00000016268	-	100	91.026	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000030106	-	81	89.683	ENSCAFG00000004003	-	83	89.683	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	83	87.597	ENSCAFG00000020044	-	100	89.103	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	90	73.759	ENSCAFG00000019297	-	84	75.397	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	82	82.031	ENSCAFG00000004933	-	83	81.600	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	ENSCAFG00000018784	-	100	91.026	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	97	59.211	ENSCAFG00000003985	-	80	58.400	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030106	-	59	86.957	ENSCAFG00020002891	-	76	86.957	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	ENSCAFG00020016887	-	100	91.026	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030106	-	83	84.496	ENSCAFG00020016375	-	84	84.496	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030106	-	79	73.810	ENSCAFG00020018238	-	98	73.810	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030106	-	83	87.597	ENSCAFG00020002207	-	100	89.103	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030106	-	81	89.683	ENSCAFG00020011446	-	86	90.385	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030106	-	83	90.698	ENSCAFG00020009210	-	100	90.385	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	ENSCAFG00020024719	-	100	91.026	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030106	-	81	89.683	ENSCAFG00020011988	-	100	90.385	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030106	-	99	78.571	ENSCAFG00020009948	-	80	78.571	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030106	-	83	89.147	ENSCAFG00020023174	-	100	89.147	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030106	-	81	88.095	ENSCHIG00000007457	-	100	89.103	Capra_hircus
ENSOGAG00000030106	-	100	88.462	ENSCHIG00000003100	-	100	88.462	Capra_hircus
ENSOGAG00000030106	-	81	89.683	ENSCHIG00000009652	-	100	90.385	Capra_hircus
ENSOGAG00000030106	-	100	66.667	ENSCHIG00000014765	-	82	66.667	Capra_hircus
ENSOGAG00000030106	-	81	88.889	ENSCHIG00000000917	-	100	89.744	Capra_hircus
ENSOGAG00000030106	-	81	91.270	ENSCHIG00000019330	-	100	91.667	Capra_hircus
ENSOGAG00000030106	-	81	88.889	ENSCHIG00000021757	-	88	89.744	Capra_hircus
ENSOGAG00000030106	-	100	79.487	ENSCHIG00000017863	-	100	79.487	Capra_hircus
ENSOGAG00000030106	-	100	69.231	ENSCHIG00000009123	-	100	69.231	Capra_hircus
ENSOGAG00000030106	-	81	87.302	ENSCHIG00000000748	-	100	88.462	Capra_hircus
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	ENSTSYG00000009575	-	100	92.857	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000030106	-	92	78.472	ENSTSYG00000032223	-	100	78.472	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000030106	-	87	58.088	ENSCAPG00000009125	-	73	53.846	Cavia_aperea
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ENSOGAG00000030106	-	87	58.088	ENSCPOG00000030336	-	73	53.846	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000030106	-	83	87.597	ENSCCAG00000024844	-	96	87.597	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030106	-	81	88.889	ENSCCAG00000031842	-	99	89.744	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030106	-	81	89.683	ENSCCAG00000027934	-	98	90.385	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030106	-	69	89.815	ENSCCAG00000030438	-	99	90.580	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000030106	-	100	78.846	ENSMLEG00000028385	-	76	79.365	Mandrillus_leucophaeus
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ENSOGAG00000030106	-	100	85.256	ENSMAMG00000019724	rpl23a	91	76.923	Mastacembelus_armatus
ENSOGAG00000030106	-	100	85.987	ENSMZEG00005019026	rpl23a	91	76.923	Maylandia_zebra
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	ENSMGAG00000012800	RPL23A	83	90.476	Meleagris_gallopavo
ENSOGAG00000030106	-	100	72.611	ENSMAUG00000005208	-	100	72.611	Mesocricetus_auratus
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ENSOGAG00000030106	-	83	88.372	ENSMAUG00000009790	-	100	88.462	Mesocricetus_auratus
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ENSOGAG00000030106	-	81	74.603	ENSMAUG00000000784	-	100	76.282	Mesocricetus_auratus
ENSOGAG00000030106	-	81	89.683	ENSMICG00000047647	-	100	90.385	Microcebus_murinus
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ENSOGAG00000030106	-	99	84.615	ENSMMOG00000018811	rpl23a	70	75.484	Mola_mola
ENSOGAG00000030106	-	99	68.387	ENSMODG00000023931	-	81	71.429	Monodelphis_domestica
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ENSOGAG00000030106	-	100	84.713	ENSMALG00000007502	rpl23a	91	75.641	Monopterus_albus
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	MGP_CAROLIEiJ_G0016793	Rpl23a	100	91.026	Mus_caroli
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	ENSMUSG00000058546	Rpl23a	100	91.026	Mus_musculus
ENSOGAG00000030106	-	81	90.476	MGP_PahariEiJ_G0017930	Rpl23a	100	91.026	Mus_pahari
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ENSOGAG00000030106	-	81	91.270	MGP_SPRETEiJ_G0017636	-	100	91.667	Mus_spretus
ENSOGAG00000030106	-	92	64.583	ENSMPUG00000008595	-	77	64.228	Mustela_putorius_furo
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ENSOGAG00000030106	-	100	54.777	ENSMLUG00000030371	-	78	50.794	Myotis_lucifugus
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