EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000030115 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 483 bases
Position: chrGL873588.1:1005396-1005878
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000017523	Ribosomal_L21e	PF01157.18	1.2e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000029424	-	483	-	ENSOGAP00000017523	160 (aa)	-	H0XN32

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000030115	-	95	60.526	ENSOGAG00000031179	-	94	60.526
ENSOGAG00000030115	-	93	72.297	ENSOGAG00000033882	-	100	72.297
ENSOGAG00000030115	-	83	69.173	ENSOGAG00000032000	-	98	64.286
ENSOGAG00000030115	-	99	77.848	ENSOGAG00000032866	-	99	77.848
ENSOGAG00000030115	-	82	90.076	ENSOGAG00000008181	-	100	90.076
ENSOGAG00000030115	-	100	89.375	ENSOGAG00000029441	-	100	89.375
ENSOGAG00000030115	-	80	87.500	ENSOGAG00000034285	-	100	87.500
ENSOGAG00000030115	-	93	76.351	ENSOGAG00000025213	-	100	76.351
ENSOGAG00000030115	-	100	86.250	ENSOGAG00000024836	-	100	86.250
ENSOGAG00000030115	-	100	90.625	ENSOGAG00000033479	-	100	90.625
ENSOGAG00000030115	-	97	70.323	ENSOGAG00000012452	-	97	70.323
ENSOGAG00000030115	-	98	85.256	ENSOGAG00000027182	-	98	85.256
ENSOGAG00000030115	-	97	71.613	ENSOGAG00000034390	-	100	71.613
ENSOGAG00000030115	-	100	71.250	ENSOGAG00000033936	-	100	71.250
ENSOGAG00000030115	-	93	85.811	ENSOGAG00000010179	-	100	85.811
ENSOGAG00000030115	-	98	84.615	ENSOGAG00000030812	-	98	84.615
ENSOGAG00000030115	-	100	83.750	ENSOGAG00000026636	-	100	83.750
ENSOGAG00000030115	-	99	68.098	ENSOGAG00000000555	-	99	68.098
ENSOGAG00000030115	-	100	85.000	ENSOGAG00000026698	-	100	83.750
ENSOGAG00000030115	-	100	82.500	ENSOGAG00000030151	-	98	82.500
ENSOGAG00000030115	-	92	85.034	ENSOGAG00000000212	-	100	85.034
ENSOGAG00000030115	-	93	79.195	ENSOGAG00000034423	-	93	79.195
ENSOGAG00000030115	-	93	73.856	ENSOGAG00000032711	-	100	73.856
ENSOGAG00000030115	-	100	83.125	ENSOGAG00000034076	-	100	83.125
ENSOGAG00000030115	-	100	86.875	ENSOGAG00000027159	-	100	86.875

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000030115	-	100	91.250	ENSG00000122026	RPL21	100	91.250	Homo_sapiens
ENSOGAG00000030115	-	100	78.750	ENSAPOG00000024402	rpl21	100	78.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000030115	-	51	87.654	ENSAMEG00000016455	-	96	88.235	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030115	-	100	74.534	ENSAMEG00000004710	-	100	74.534	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030115	-	100	88.125	ENSAMEG00000018663	RPL21	98	88.125	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030115	-	100	55.000	ENSAMEG00000004632	-	100	55.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030115	-	100	81.250	ENSACIG00000021885	rpl21	100	81.250	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000030115	-	100	78.750	ENSAOCG00000017829	rpl21	100	78.750	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000030115	-	100	78.750	ENSAPEG00000019936	rpl21	100	78.750	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000030115	-	100	80.625	ENSATEG00000010524	rpl21	100	80.625	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000030115	-	100	85.625	ENSAPLG00000005641	RPL21	98	85.625	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000030115	-	100	85.000	ENSACAG00000003169	RPL21	100	85.000	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000030115	-	100	88.750	ENSANAG00000006331	-	100	88.750	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSANAG00000031230	-	100	90.000	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030115	-	100	91.250	ENSANAG00000023031	-	100	91.250	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030115	-	97	90.323	ENSANAG00000012283	-	100	90.323	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030115	-	100	86.250	ENSANAG00000019962	-	100	86.250	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030115	-	100	89.375	ENSANAG00000020005	-	100	89.375	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSANAG00000031513	-	100	90.000	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030115	-	100	80.625	ENSACLG00000026444	rpl21	100	80.625	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000030115	-	100	78.125	ENSAMXG00000041892	rpl21	100	78.125	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000030115	-	100	88.125	ENSBTAG00000038379	-	100	88.125	Bos_taurus
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSBTAG00000001648	RPL21	100	90.000	Bos_taurus
ENSOGAG00000030115	-	51	82.716	ENSBTAG00000048537	-	84	82.716	Bos_taurus
ENSOGAG00000030115	-	100	59.006	WBGene00004433	rpl-21	100	59.006	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000030115	-	67	71.963	ENSCJAG00000041707	-	98	71.963	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030115	-	100	67.500	ENSCJAG00000044477	-	100	67.500	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030115	-	83	88.722	ENSCJAG00000044684	-	93	88.722	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030115	-	92	90.476	ENSCJAG00000039102	-	100	90.476	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030115	-	100	75.000	ENSCJAG00000044730	-	100	75.000	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030115	-	100	90.625	ENSCJAG00000043116	-	100	90.625	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030115	-	100	84.375	ENSCJAG00000019734	-	100	84.375	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSCJAG00000038205	-	100	90.000	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030115	-	100	88.750	ENSCAFG00000015987	-	100	88.750	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030115	-	100	90.123	ENSCAFG00000006810	RPL21	100	90.123	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030115	-	99	63.291	ENSCAFG00000024055	-	99	62.658	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030115	-	73	90.598	ENSCAFG00000029659	-	99	90.598	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030115	-	76	88.525	ENSCAFG00000015533	-	88	88.525	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSCAFG00000032537	-	100	90.000	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030115	-	99	82.390	ENSCAFG00000001564	-	99	82.390	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030115	-	100	90.625	ENSCAFG00000008805	-	100	90.625	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSCAFG00000028744	-	100	90.000	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030115	-	96	60.000	ENSCAFG00000018881	-	97	60.000	Canis_familiaris
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ENSOGAG00000030115	-	100	90.625	ENSCAFG00020024181	-	100	90.625	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030115	-	100	91.250	ENSCAFG00020025313	-	100	91.250	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030115	-	100	90.625	ENSCAFG00020005317	-	100	90.625	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSCAFG00020012834	-	100	90.000	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030115	-	100	88.750	ENSCAFG00020012095	-	100	88.750	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030115	-	100	91.250	ENSCAFG00020004535	-	100	91.250	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSCAFG00020008146	-	100	90.000	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030115	-	100	91.250	ENSCAFG00020024203	-	100	91.250	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSCAFG00020011527	-	100	90.000	Canis_lupus_dingo
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ENSOGAG00000030115	-	51	82.927	ENSCHIG00000012074	-	69	82.927	Capra_hircus
ENSOGAG00000030115	-	100	85.625	ENSCHIG00000009094	-	100	85.625	Capra_hircus
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSCHIG00000021720	RPL21	100	90.000	Capra_hircus
ENSOGAG00000030115	-	100	88.750	ENSCHIG00000006564	-	100	88.750	Capra_hircus
ENSOGAG00000030115	-	100	87.500	ENSCHIG00000010112	-	100	87.500	Capra_hircus
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSCHIG00000019833	-	100	90.000	Capra_hircus
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ENSOGAG00000030115	-	100	91.250	ENSTSYG00000034405	-	100	91.250	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000030115	-	100	86.875	ENSTSYG00000030129	-	100	86.875	Carlito_syrichta
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ENSOGAG00000030115	-	92	77.551	ENSCPOG00000022769	-	100	77.551	Cavia_porcellus
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ENSOGAG00000030115	-	100	82.609	ENSCPOG00000023041	-	100	82.609	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSCCAG00000000258	-	100	90.000	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030115	-	100	82.500	ENSCCAG00000033290	-	100	82.500	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030115	-	100	91.250	ENSCCAG00000031101	-	100	91.250	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030115	-	99	90.566	ENSCCAG00000009412	-	96	90.566	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000030115	-	85	78.676	ENSMMOG00000002967	rpl21	95	78.676	Mola_mola
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ENSOGAG00000030115	-	86	78.261	ENSMALG00000021841	rpl21	87	78.261	Monopterus_albus
ENSOGAG00000030115	-	96	78.571	MGP_CAROLIEiJ_G0018949	-	97	78.571	Mus_caroli
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ENSOGAG00000030115	-	94	58.278	ENSMPUG00000014974	-	87	62.590	Mustela_putorius_furo
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ENSOGAG00000030115	-	96	89.610	ENSNLEG00000029937	-	100	89.610	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000030115	-	100	91.250	ENSNLEG00000000327	-	100	91.250	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000030115	-	100	85.000	ENSNLEG00000035696	-	100	85.000	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000030115	-	100	90.000	ENSNLEG00000032959	-	100	90.000	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000030115	-	100	89.375	ENSNLEG00000029858	-	100	89.375	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000030115	-	100	89.375	ENSNLEG00000030635	-	100	89.375	Nomascus_leucogenys
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ENSOGAG00000030115	-	100	90.625	ENSNLEG00000033807	-	100	90.625	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000030115	-	55	89.773	ENSMEUG00000006895	-	100	89.773	Notamacropus_eugenii
ENSOGAG00000030115	-	91	42.857	ENSMEUG00000002672	-	93	42.857	Notamacropus_eugenii
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ENSOGAG00000030115	-	100	80.625	ENSONIG00000014130	rpl21	100	80.625	Oreochromis_niloticus
ENSOGAG00000030115	-	100	88.750	ENSOANG00000009054	-	100	88.750	Ornithorhynchus_anatinus
ENSOGAG00000030115	-	94	88.742	ENSOCUG00000021475	-	100	88.742	Oryctolagus_cuniculus
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ENSOGAG00000030115	-	100	86.875	ENSOCUG00000027750	-	100	86.875	Oryctolagus_cuniculus
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ENSOGAG00000030115	-	100	80.000	ENSORLG00020014331	rpl21	100	80.000	Oryzias_latipes_hni
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ENSOGAG00000030115	-	63	74.257	ENSOARG00000011403	-	88	74.257	Ovis_aries
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