EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000030151 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 722 bases
Position: chrGL873888.1:196783-197504
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000018591	Ribosomal_L21e	PF01157.18	1.9e-36	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000030674	-	468	-	ENSOGAP00000018591	156 (aa)	-	H0XR49

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000030151	-	91	71.333	ENSOGAG00000033882	-	100	71.333
ENSOGAG00000030151	-	90	78.082	ENSOGAG00000032866	-	92	78.082
ENSOGAG00000030151	-	91	83.108	ENSOGAG00000010179	-	100	83.108
ENSOGAG00000030151	-	98	88.125	ENSOGAG00000033479	-	100	88.125
ENSOGAG00000030151	-	80	85.827	ENSOGAG00000034285	-	99	85.827
ENSOGAG00000030151	-	96	83.974	ENSOGAG00000027182	-	98	83.974
ENSOGAG00000030151	-	97	65.031	ENSOGAG00000000555	-	99	65.031
ENSOGAG00000030151	-	99	69.753	ENSOGAG00000012452	-	100	69.753
ENSOGAG00000030151	-	90	64.336	ENSOGAG00000031179	-	91	64.336
ENSOGAG00000030151	-	79	87.023	ENSOGAG00000008181	-	100	87.023
ENSOGAG00000030151	-	98	85.625	ENSOGAG00000024836	-	100	85.625
ENSOGAG00000030151	-	90	84.354	ENSOGAG00000000212	-	100	84.354
ENSOGAG00000030151	-	98	85.000	ENSOGAG00000027159	-	100	85.000
ENSOGAG00000030151	-	98	83.019	ENSOGAG00000026698	-	100	83.019
ENSOGAG00000030151	-	98	86.875	ENSOGAG00000029441	-	100	86.875
ENSOGAG00000030151	-	98	72.956	ENSOGAG00000033936	-	100	72.956
ENSOGAG00000030151	-	81	71.429	ENSOGAG00000032000	-	100	67.308
ENSOGAG00000030151	-	98	82.500	ENSOGAG00000030115	-	100	82.500
ENSOGAG00000030151	-	98	82.500	ENSOGAG00000026636	-	100	82.500
ENSOGAG00000030151	-	95	74.194	ENSOGAG00000034390	-	100	74.194
ENSOGAG00000030151	-	91	70.588	ENSOGAG00000032711	-	100	70.588
ENSOGAG00000030151	-	91	78.231	ENSOGAG00000034423	-	92	78.231
ENSOGAG00000030151	-	98	81.875	ENSOGAG00000034076	-	100	81.875
ENSOGAG00000030151	-	91	77.027	ENSOGAG00000025213	-	100	77.027
ENSOGAG00000030151	-	96	83.333	ENSOGAG00000030812	-	98	83.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSG00000122026	RPL21	100	88.750	Homo_sapiens
ENSOGAG00000030151	-	98	76.250	ENSAPOG00000024402	rpl21	100	76.250	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000030151	-	98	54.430	ENSAMEG00000004632	-	100	54.430	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030151	-	100	87.730	ENSAMEG00000018663	RPL21	100	87.730	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030151	-	51	85.185	ENSAMEG00000016455	-	96	85.882	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030151	-	98	72.671	ENSAMEG00000004710	-	100	72.671	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030151	-	98	78.125	ENSACIG00000021885	rpl21	100	78.125	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000030151	-	98	76.250	ENSAOCG00000017829	rpl21	100	76.250	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000030151	-	98	76.250	ENSAPEG00000019936	rpl21	100	76.250	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000030151	-	98	78.125	ENSATEG00000010524	rpl21	100	78.125	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000030151	-	99	81.481	ENSAPLG00000005641	RPL21	99	83.333	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000030151	-	98	80.625	ENSACAG00000003169	RPL21	100	82.500	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSANAG00000023031	-	100	88.750	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030151	-	98	88.125	ENSANAG00000031230	-	100	88.125	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030151	-	98	86.875	ENSANAG00000031513	-	100	86.875	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030151	-	95	88.387	ENSANAG00000012283	-	100	88.387	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030151	-	98	86.250	ENSANAG00000006331	-	100	86.250	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030151	-	98	86.875	ENSANAG00000020005	-	100	86.875	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030151	-	98	83.750	ENSANAG00000019962	-	100	83.750	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030151	-	98	78.125	ENSACLG00000026444	rpl21	100	78.125	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000030151	-	98	75.000	ENSAMXG00000041892	rpl21	100	75.000	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000030151	-	98	87.500	ENSBTAG00000001648	RPL21	100	87.500	Bos_taurus
ENSOGAG00000030151	-	98	87.500	ENSBTAG00000038379	-	100	87.500	Bos_taurus
ENSOGAG00000030151	-	98	55.901	WBGene00004433	rpl-21	100	55.901	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000030151	-	98	82.500	ENSCJAG00000019734	-	100	82.500	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030151	-	98	68.153	ENSCJAG00000044477	-	100	68.153	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030151	-	90	88.435	ENSCJAG00000039102	-	100	88.435	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030151	-	85	82.143	ENSCJAG00000044684	-	98	82.143	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030151	-	54	76.667	ENSCJAG00000041707	-	83	76.667	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030151	-	98	75.484	ENSCJAG00000044730	-	100	75.484	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030151	-	98	88.125	ENSCJAG00000038205	-	100	88.125	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030151	-	98	88.125	ENSCJAG00000043116	-	100	88.125	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030151	-	98	87.654	ENSCAFG00000006810	RPL21	100	87.654	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030151	-	91	65.986	ENSCAFG00000024055	-	92	65.986	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030151	-	74	90.598	ENSCAFG00000029659	-	99	90.598	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030151	-	98	87.500	ENSCAFG00000032537	-	100	87.500	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030151	-	97	82.390	ENSCAFG00000001564	-	99	82.390	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030151	-	98	88.125	ENSCAFG00000008805	-	100	88.125	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030151	-	77	88.525	ENSCAFG00000015533	-	88	88.525	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030151	-	94	57.718	ENSCAFG00000018881	-	97	61.589	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030151	-	98	87.500	ENSCAFG00000028744	-	100	87.500	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030151	-	98	86.250	ENSCAFG00000015987	-	100	86.250	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSCAFG00020024203	-	100	88.750	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030151	-	98	86.250	ENSCAFG00020020914	-	100	86.250	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030151	-	98	87.500	ENSCAFG00020011527	-	100	87.500	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030151	-	98	87.500	ENSCAFG00020012834	-	100	87.500	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030151	-	98	88.125	ENSCAFG00020026205	-	100	88.125	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSCAFG00020005317	-	100	88.750	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030151	-	98	88.125	ENSCAFG00020008146	-	100	88.125	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030151	-	98	89.375	ENSCAFG00020024181	-	100	89.375	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSCAFG00020025313	-	100	88.750	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSCAFG00020004535	-	100	88.750	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030151	-	98	85.625	ENSCAFG00020012095	-	100	85.625	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030151	-	98	87.500	ENSCHIG00000006564	-	100	87.500	Capra_hircus
ENSOGAG00000030151	-	98	87.500	ENSCHIG00000021720	RPL21	100	87.500	Capra_hircus
ENSOGAG00000030151	-	98	84.375	ENSCHIG00000010112	-	100	84.375	Capra_hircus
ENSOGAG00000030151	-	62	65.049	ENSCHIG00000012074	-	87	65.049	Capra_hircus
ENSOGAG00000030151	-	98	85.256	ENSCHIG00000008368	-	100	85.256	Capra_hircus
ENSOGAG00000030151	-	98	85.000	ENSCHIG00000009094	-	100	85.000	Capra_hircus
ENSOGAG00000030151	-	98	87.500	ENSCHIG00000019833	-	100	87.500	Capra_hircus
ENSOGAG00000030151	-	98	84.375	ENSTSYG00000030129	-	100	84.375	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030151	-	98	84.375	ENSTSYG00000028179	-	100	84.375	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030151	-	98	76.101	ENSTSYG00000033985	-	100	76.101	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030151	-	97	86.164	ENSTSYG00000026380	-	99	86.164	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030151	-	98	74.375	ENSTSYG00000029069	-	100	74.375	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSTSYG00000034405	-	100	88.750	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030151	-	98	80.128	ENSTSYG00000026484	-	100	80.128	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSTSYG00000007868	-	100	88.750	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030151	-	98	86.250	ENSCAPG00000002203	-	100	86.250	Cavia_aperea
ENSOGAG00000030151	-	51	80.233	ENSCAPG00000015195	-	80	80.233	Cavia_aperea
ENSOGAG00000030151	-	90	79.021	ENSCAPG00000009722	-	100	79.021	Cavia_aperea
ENSOGAG00000030151	-	98	76.250	ENSCAPG00000012463	-	100	78.882	Cavia_aperea
ENSOGAG00000030151	-	98	85.625	ENSCAPG00000010803	-	100	85.625	Cavia_aperea
ENSOGAG00000030151	-	98	76.730	ENSCAPG00000009066	-	100	76.730	Cavia_aperea
ENSOGAG00000030151	-	98	76.250	ENSCPOG00000023041	-	100	78.882	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSCPOG00000008784	RPL21	100	88.750	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000030151	-	90	79.021	ENSCPOG00000022769	-	100	79.021	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000030151	-	98	87.500	ENSCCAG00000000258	-	100	87.500	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030151	-	98	81.761	ENSCCAG00000033290	-	100	81.761	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030151	-	98	88.125	ENSCCAG00000009412	-	96	88.125	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSCCAG00000031101	-	100	88.750	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSCATG00000032591	-	100	88.750	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030151	-	98	86.875	ENSCATG00000020347	-	100	86.875	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030151	-	98	83.125	ENSCATG00000038195	-	100	83.125	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030151	-	98	85.000	ENSCATG00000005782	-	100	85.000	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030151	-	98	87.500	ENSCATG00000000491	-	100	87.500	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030151	-	98	87.500	ENSCATG00000003873	-	100	87.500	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030151	-	98	85.625	ENSCATG00000006297	-	100	85.625	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030151	-	98	88.125	ENSCATG00000018702	-	100	88.125	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSCLAG00000003656	Rpl21	100	88.750	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000030151	-	98	65.584	ENSCLAG00000001174	-	100	65.584	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000030151	-	98	78.205	ENSCLAG00000009584	-	100	78.205	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000030151	-	98	84.906	ENSCLAG00000017893	-	100	84.906	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000030151	-	98	73.548	ENSCLAG00000009326	-	100	73.548	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000030151	-	98	88.750	ENSCSAG00000019017	-	100	88.750	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000030151	-	54	89.655	ENSCHOG00000009484	-	100	89.655	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000030151	-	98	58.125	ENSCHOG00000007867	-	100	58.125	Choloepus_hoffmanni
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ENSOGAG00000030151	-	83	76.471	ENSMALG00000021841	rpl21	86	76.471	Monopterus_albus
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