EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000030300 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 2598 bases
Position: chrGL873658.1:3269869-3272466
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000021125	APOBEC_N	PF08210.11	2.8e-72	1	2
ENSOGAP00000021125	APOBEC_N	PF08210.11	2.8e-72	2	2
ENSOGAP00000021125	APOBEC_C	PF05240.14	1.1e-40	1	2
ENSOGAP00000021125	APOBEC_C	PF05240.14	1.1e-40	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000032016	-	1053	-	ENSOGAP00000021125	351 (aa)	-	H0XYD2

Gene Model

Click here to download ENSOGAG00000030300's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSOGAG00000030300's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000030300	-	55	43.421	ENSOGAG00000026415	APOBEC1	54	43.421
ENSOGAG00000030300	-	98	76.602	ENSOGAG00000033404	-	99	76.602
ENSOGAG00000030300	-	93	30.303	ENSOGAG00000002632	APOBEC2	80	30.303
ENSOGAG00000030300	-	99	47.568	ENSOGAG00000032498	-	99	47.568
ENSOGAG00000030300	-	96	32.973	ENSOGAG00000032518	-	97	32.973
ENSOGAG00000030300	-	97	38.587	ENSOGAG00000024822	-	94	38.587
ENSOGAG00000030300	-	96	36.471	ENSOGAG00000026770	AICDA	95	36.471

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000030300	-	99	43.048	ENSG00000128394	APOBEC3F	99	43.048	Homo_sapiens
ENSOGAG00000030300	-	97	42.781	ENSG00000244509	APOBEC3C	98	42.781	Homo_sapiens
ENSOGAG00000030300	-	99	42.553	ENSG00000243811	APOBEC3D	99	43.284	Homo_sapiens
ENSOGAG00000030300	-	99	45.405	ENSANAG00000030088	-	96	45.405	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030300	-	67	46.774	ENSCJAG00000015317	-	95	46.774	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030300	-	98	41.053	ENSCAFG00020002615	-	100	41.053	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030300	-	93	49.457	ENSTSYG00000028254	-	99	49.457	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030300	-	96	46.961	ENSTSYG00000030036	-	99	46.961	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030300	-	99	47.312	ENSTSYG00000034260	-	99	47.312	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030300	-	98	47.027	ENSCCAG00000030932	-	86	47.027	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030300	-	99	45.578	ENSCATG00000033502	-	100	42.857	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030300	-	98	45.745	ENSCATG00000043226	APOBEC3C	99	45.745	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030300	-	99	45.503	ENSCSAG00000006382	APOBEC3F	99	45.503	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000030300	-	97	43.850	ENSCSAG00000006402	APOBEC3C	98	43.850	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000030300	-	99	45.503	ENSCANG00000031957	-	99	45.503	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030300	-	98	45.213	ENSCANG00000039177	APOBEC3C	99	45.213	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030300	-	99	43.700	ENSCANG00000033269	-	99	43.700	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030300	-	99	43.501	ENSCANG00000032904	-	99	43.501	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030300	-	97	34.615	ENSDNOG00000044642	-	100	34.615	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000030300	-	97	37.755	ENSEASG00005018641	-	96	37.755	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000030300	-	98	42.177	ENSECAG00000006071	-	100	39.459	Equus_caballus
ENSOGAG00000030300	-	99	42.971	ENSGGOG00000038678	APOBEC3F	99	42.971	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000030300	-	98	43.085	ENSGGOG00000036587	-	99	43.085	Gorilla_gorilla
ENSOGAG00000030300	-	98	38.587	ENSHGLG00000017315	-	90	38.587	Heterocephalus_glaber_female
ENSOGAG00000030300	-	98	38.587	ENSHGLG00100003105	-	93	38.587	Heterocephalus_glaber_male
ENSOGAG00000030300	-	97	43.850	ENSMFAG00000016792	APOBEC3C	98	43.850	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000030300	-	99	44.974	ENSMFAG00000002331	-	99	44.974	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000030300	-	99	42.781	ENSMFAG00000004037	APOBEC3F	99	42.781	Macaca_fascicularis
ENSOGAG00000030300	-	99	44.974	ENSMMUG00000004017	APOBEC3F	99	44.974	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000030300	-	96	43.407	ENSMMUG00000004018	APOBEC3C	94	43.407	Macaca_mulatta
ENSOGAG00000030300	-	97	44.385	ENSMNEG00000045196	APOBEC3C	98	44.385	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000030300	-	99	44.974	ENSMNEG00000043316	APOBEC3D	99	44.974	Macaca_nemestrina
ENSOGAG00000030300	-	98	45.745	ENSMLEG00000036992	APOBEC3C	99	45.745	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000030300	-	99	42.440	ENSMLEG00000029642	APOBEC3F	99	42.440	Mandrillus_leucophaeus
ENSOGAG00000030300	-	97	51.075	ENSMICG00000042615	-	89	51.075	Microcebus_murinus
ENSOGAG00000030300	-	99	40.722	ENSMLUG00000023676	-	95	40.722	Myotis_lucifugus
ENSOGAG00000030300	-	97	44.253	ENSNLEG00000028392	APOBEC3C	98	44.253	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000030300	-	99	37.696	ENSNLEG00000035811	-	99	37.696	Nomascus_leucogenys
ENSOGAG00000030300	-	99	44.149	ENSPPAG00000028218	-	98	44.920	Pan_paniscus
ENSOGAG00000030300	-	97	42.781	ENSPPAG00000014118	APOBEC3C	98	42.781	Pan_paniscus
ENSOGAG00000030300	-	97	38.150	ENSPPRG00000003726	-	97	38.150	Panthera_pardus
ENSOGAG00000030300	-	98	44.560	ENSPTRG00000014385	APOBEC3C	99	44.560	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000030300	-	99	44.149	ENSPTRG00000041588	APOBEC3D	99	44.776	Pan_troglodytes
ENSOGAG00000030300	-	99	44.681	ENSPANG00000010775	APOBEC3F	99	44.681	Papio_anubis
ENSOGAG00000030300	-	97	43.316	ENSPPYG00000011832	APOBEC3C	98	43.316	Pongo_abelii
ENSOGAG00000030300	-	70	50.794	ENSPCOG00000022067	-	100	50.794	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000030300	-	66	56.000	ENSPCOG00000018072	-	95	56.000	Propithecus_coquereli
ENSOGAG00000030300	-	77	40.120	ENSPVAG00000009461	-	68	40.120	Pteropus_vampyrus
ENSOGAG00000030300	-	99	46.032	ENSRBIG00000030834	-	99	46.114	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000030300	-	98	46.809	ENSRBIG00000030323	-	99	46.809	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000030300	-	99	40.921	ENSRBIG00000042297	-	99	45.513	Rhinopithecus_bieti
ENSOGAG00000030300	-	99	46.032	ENSRROG00000028557	-	99	46.114	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000030300	-	99	40.650	ENSRROG00000029996	-	99	40.650	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000030300	-	98	46.809	ENSRROG00000029045	APOBEC3C	99	46.809	Rhinopithecus_roxellana
ENSOGAG00000030300	-	98	45.455	ENSSBOG00000032780	-	99	45.455	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSOGAG00000030300	-	96	37.222	ENSUAMG00000004433	-	99	37.222	Ursus_americanus
ENSOGAG00000030300	-	99	36.471	ENSUMAG00000014441	-	94	36.471	Ursus_maritimus
ENSOGAG00000030300	-	72	41.781	ENSVVUG00000014628	-	89	41.259	Vulpes_vulpes