EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000030708 (Gene tree)
Gene ID: 100942386
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 873 bases
Position: chrGL873554.1:14018540-14019412
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000019775	Ribosomal_L6e_N	PF03868.15	5.7e-32	1	1
ENSOGAP00000019775	Ribosomal_L6e	PF01159.19	3.6e-40	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000027892	-	873	-	ENSOGAP00000019775	290 (aa)	-	H0XUI3

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000030708	-	86	46.875	ENSOGAG00000031518	-	96	50.196
ENSOGAG00000030708	-	63	86.631	ENSOGAG00000033955	-	100	86.631
ENSOGAG00000030708	-	78	80.088	ENSOGAG00000000347	-	88	85.075
ENSOGAG00000030708	-	100	87.931	ENSOGAG00000034274	-	100	87.931
ENSOGAG00000030708	-	100	97.931	ENSOGAG00000027452	-	100	97.931
ENSOGAG00000030708	-	100	87.241	ENSOGAG00000033143	-	100	85.862
ENSOGAG00000030708	-	100	98.621	ENSOGAG00000026633	-	100	98.621

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000030708	-	100	87.241	ENSG00000089009	RPL6	100	95.238	Homo_sapiens
ENSOGAG00000030708	-	85	78.049	ENSAPOG00000004958	rpl6	95	78.049	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000030708	-	100	86.552	ENSAMEG00000008510	RPL6	100	85.862	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030708	-	85	79.268	ENSACIG00000018214	rpl6	88	79.268	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000030708	-	85	78.862	ENSAOCG00000003204	rpl6	95	78.862	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000030708	-	85	78.862	ENSAPEG00000017318	rpl6	95	78.862	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000030708	-	85	80.488	ENSATEG00000020783	rpl6	95	80.488	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000030708	-	100	74.483	ENSAPLG00000015787	RPL6	99	75.089	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000030708	-	85	80.894	ENSACAG00000003060	-	95	80.894	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000030708	-	76	59.817	ENSACAG00000028136	-	90	60.804	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000030708	-	100	85.862	ENSANAG00000019768	-	100	86.207	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030708	-	100	82.069	ENSANAG00000030114	-	100	82.069	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030708	-	100	86.897	ENSANAG00000031468	-	100	86.897	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030708	-	100	80.345	ENSANAG00000024362	-	100	80.345	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030708	-	100	72.165	ENSANAG00000021562	-	100	72.165	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030708	-	100	75.517	ENSANAG00000025701	-	100	75.517	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030708	-	100	79.655	ENSANAG00000023986	-	100	79.655	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030708	-	100	72.069	ENSANAG00000029781	-	100	72.069	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030708	-	85	79.675	ENSACLG00000011054	rpl6	96	79.675	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000030708	-	85	77.236	ENSAMXG00000012854	rpl6	95	77.236	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000030708	-	71	83.575	ENSBTAG00000045568	-	97	83.575	Bos_taurus
ENSOGAG00000030708	-	100	83.103	ENSBTAG00000031723	RPL6	100	84.483	Bos_taurus
ENSOGAG00000030708	-	51	53.595	WBGene00004417	rpl-6	70	53.595	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000030708	-	96	86.380	ENSCJAG00000039405	-	94	85.663	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030708	-	72	77.143	ENSCJAG00000008987	-	94	77.143	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030708	-	100	86.207	ENSCJAG00000012531	-	100	85.517	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030708	-	85	91.463	ENSCJAG00000048686	-	100	85.517	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030708	-	100	71.379	ENSCJAG00000012450	-	100	70.690	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030708	-	100	87.586	ENSCJAG00000040378	-	100	86.897	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030708	-	100	86.552	ENSCJAG00000040547	-	100	85.862	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030708	-	96	87.814	ENSCJAG00000044547	-	94	87.097	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030708	-	85	65.041	ENSCAFG00000014768	-	100	64.228	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030708	-	100	86.207	ENSCAFG00000008873	-	100	85.517	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030708	-	94	72.364	ENSCAFG00000030598	-	90	75.806	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030708	-	100	86.207	ENSCAFG00000016065	-	100	85.517	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030708	-	100	79.655	ENSCAFG00000007816	-	99	78.966	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030708	-	100	85.862	ENSCAFG00020017565	-	100	85.172	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030708	-	74	76.852	ENSCAFG00020000537	-	91	75.926	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030708	-	100	79.655	ENSCAFG00020026706	-	100	78.966	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030708	-	94	56.569	ENSCHIG00000020703	-	94	56.204	Capra_hircus
ENSOGAG00000030708	-	100	56.014	ENSCHIG00000022577	-	100	58.076	Capra_hircus
ENSOGAG00000030708	-	100	82.069	ENSCHIG00000015166	-	100	83.448	Capra_hircus
ENSOGAG00000030708	-	100	80.690	ENSCHIG00000007802	-	100	82.069	Capra_hircus
ENSOGAG00000030708	-	60	78.736	ENSCHIG00000013022	-	86	73.148	Capra_hircus
ENSOGAG00000030708	-	100	62.414	ENSTSYG00000037417	-	100	63.103	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030708	-	74	78.605	ENSTSYG00000035897	-	100	79.167	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030708	-	100	86.552	ENSTSYG00000009492	-	100	87.241	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030708	-	100	64.483	ENSTSYG00000032076	-	100	65.172	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030708	-	100	78.621	ENSTSYG00000030853	-	100	80.000	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030708	-	100	74.483	ENSTSYG00000033900	-	100	75.517	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030708	-	87	70.635	ENSTSYG00000031950	-	100	67.586	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030708	-	100	80.412	ENSCAPG00000014808	RPL6	100	80.412	Cavia_aperea
ENSOGAG00000030708	-	100	84.880	ENSCPOG00000013526	RPL6	100	84.880	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000030708	-	100	85.862	ENSCCAG00000020450	-	100	85.517	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030708	-	100	70.000	ENSCCAG00000027020	-	100	69.310	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030708	-	100	86.897	ENSCCAG00000000364	-	100	86.207	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030708	-	100	78.621	ENSCCAG00000022082	-	100	77.931	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000030708	-	100	82.414	ENSCCAG00000025580	-	100	82.414	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030708	-	100	80.690	ENSCCAG00000020523	-	100	80.690	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030708	-	85	90.650	ENSCATG00000012653	-	100	85.172	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030708	-	100	86.207	ENSCATG00000001750	-	100	86.207	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030708	-	100	82.069	ENSCATG00000035215	-	100	81.724	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030708	-	94	86.813	ENSCATG00000039239	-	100	86.813	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030708	-	85	77.733	ENSCATG00000034834	-	92	76.000	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030708	-	100	81.724	ENSCATG00000036801	-	100	81.724	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030708	-	100	76.897	ENSCATG00000037140	-	100	76.897	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000030708	-	94	68.750	ENSCLAG00000010760	-	100	68.750	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000030708	-	99	62.329	ENSCLAG00000003114	-	99	61.986	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000030708	-	100	83.793	ENSCSAG00000018727	-	100	83.793	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000030708	-	100	84.483	ENSCSAG00000018863	-	100	84.483	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000030708	-	100	82.759	ENSCSAG00000019405	-	100	82.759	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000030708	-	100	73.793	ENSCSAG00000013104	-	100	73.793	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000030708	-	67	90.196	ENSCSAG00000002492	-	77	90.196	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000030708	-	97	85.409	ENSCSAG00000013863	-	96	85.409	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000030708	-	100	85.172	ENSCHOG00000002917	RPL6	100	85.172	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000030708	-	84	82.787	ENSCPBG00000006608	RPL6	93	82.520	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000030708	-	85	58.704	ENSCING00000000730	-	98	57.724	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000030708	-	100	85.862	ENSCANG00000037946	-	100	85.862	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030708	-	100	86.207	ENSCANG00000016353	-	100	86.207	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030708	-	100	72.069	ENSCANG00000006164	-	100	72.069	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030708	-	94	73.626	ENSCANG00000041975	-	100	73.626	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030708	-	100	86.552	ENSCANG00000017153	-	100	86.552	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030708	-	100	85.517	ENSCANG00000038334	-	100	85.517	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030708	-	100	76.552	ENSCANG00000033462	-	100	76.207	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030708	-	100	83.793	ENSCANG00000003698	-	100	84.483	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030708	-	77	79.372	ENSCANG00000036055	-	89	79.372	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000030708	-	100	86.552	ENSCANG00000040326	-	100	86.552	Colobus_angolensis_palliatus
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ENSOGAG00000030708	-	84	75.000	ENSCGRG00001007659	-	86	74.390	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000030708	-	98	83.158	ENSCGRG00001007014	-	100	83.509	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000030708	-	100	83.162	ENSCGRG00001017511	-	100	83.505	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000030708	-	85	74.089	ENSCGRG00001023709	-	95	74.494	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000030708	-	81	76.987	ENSCGRG00001013976	-	98	68.601	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000030708	-	84	75.000	ENSCGRG00000015746	-	86	74.390	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000030708	-	95	75.000	ENSCGRG00000010279	-	91	75.362	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000030708	-	100	71.186	ENSCGRG00000001427	-	98	70.169	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000030708	-	98	83.158	ENSCGRG00000018950	-	100	83.509	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000030708	-	100	82.818	ENSCGRG00000013732	-	100	83.162	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000030708	-	85	77.236	ENSCSEG00000012238	rpl6	90	77.236	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000030708	-	85	77.642	ENSCSEG00000019765	rpl6	77	77.642	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000030708	-	85	81.707	ENSCVAG00000018272	rpl6	95	81.707	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000030708	-	85	75.099	ENSDARG00000058451	rpl6	95	75.099	Danio_rerio
ENSOGAG00000030708	-	99	72.569	ENSDNOG00000031565	-	99	73.702	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000030708	-	100	82.534	ENSDNOG00000033451	-	100	83.849	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000030708	-	100	86.207	ENSDORG00000005793	Rpl6	100	86.207	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000030708	-	83	46.748	FBgn0039857	RpL6	92	47.561	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000030708	-	84	62.857	ENSEBUG00000010510	rpl6	86	62.857	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000030708	-	87	92.430	ENSEASG00005009610	-	97	80.906	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000030708	-	56	86.503	ENSECAG00000015459	-	76	73.364	Equus_caballus
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ENSOGAG00000030708	-	61	91.477	ENSEEUG00000000281	-	100	91.477	Erinaceus_europaeus
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ENSOGAG00000030708	-	100	84.483	ENSVPAG00000007000	RPL6	100	83.103	Vicugna_pacos
ENSOGAG00000030708	-	72	64.762	ENSVVUG00000015157	-	91	63.810	Vulpes_vulpes
ENSOGAG00000030708	-	68	84.694	ENSXETG00000004304	rpl6	93	83.163	Xenopus_tropicalis
ENSOGAG00000030708	-	85	80.081	ENSXCOG00000002123	rpl6	95	80.081	Xiphophorus_couchianus
ENSOGAG00000030708	-	85	81.301	ENSXMAG00000026838	rpl6	95	81.301	Xiphophorus_maculatus