EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000030962 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 744 bases
Position: chrGL873523.1:36923862-36924605
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000015608	Ribosomal_L30_N	PF08079.12	9.1e-26	1	1
ENSOGAP00000015608	Ribosomal_L30	PF00327.20	5.7e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000030329	-	744	-	ENSOGAP00000015608	247 (aa)	-	H0XHL8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000030962	-	98	89.712	ENSOGAG00000003903	-	98	89.712
ENSOGAG00000030962	-	100	81.855	ENSOGAG00000027148	-	100	81.855
ENSOGAG00000030962	-	100	89.113	ENSOGAG00000033477	-	100	89.113
ENSOGAG00000030962	-	88	76.923	ENSOGAG00000009944	-	99	76.923
ENSOGAG00000030962	-	100	53.815	ENSOGAG00000024088	-	92	53.815
ENSOGAG00000030962	-	100	65.726	ENSOGAG00000033158	-	100	65.726
ENSOGAG00000030962	-	87	82.870	ENSOGAG00000030290	-	88	82.870
ENSOGAG00000030962	-	96	76.471	ENSOGAG00000008370	-	99	76.113
ENSOGAG00000030962	-	100	85.887	ENSOGAG00000031172	-	91	85.887
ENSOGAG00000030962	-	90	40.090	ENSOGAG00000029637	-	100	41.921
ENSOGAG00000030962	-	91	81.858	ENSOGAG00000030191	-	100	81.858
ENSOGAG00000030962	-	100	88.306	ENSOGAG00000033059	-	100	88.306
ENSOGAG00000030962	-	100	78.226	ENSOGAG00000024431	-	100	78.226
ENSOGAG00000030962	-	100	41.700	ENSOGAG00000012671	-	100	41.700

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000030962	-	100	88.710	ENSG00000147604	RPL7	100	88.942	Homo_sapiens
ENSOGAG00000030962	-	98	41.152	ENSG00000146223	RPL7L1	95	41.152	Homo_sapiens
ENSOGAG00000030962	-	100	43.725	ENSAPOG00000006262	rpl7l1	100	43.725	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000030962	-	99	72.131	ENSAPOG00000002965	rpl7	99	72.131	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000030962	-	98	87.654	ENSAMEG00000001821	-	94	87.654	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030962	-	100	41.296	ENSAMEG00000012791	RPL7L1	100	41.296	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030962	-	84	68.116	ENSAMEG00000001370	-	98	68.116	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030962	-	100	83.871	ENSAMEG00000002828	-	93	83.871	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000030962	-	98	75.519	ENSACIG00000000602	rpl7	99	89.474	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000030962	-	100	45.344	ENSACIG00000010957	rpl7l1	100	45.344	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000030962	-	100	42.915	ENSAOCG00000013813	rpl7l1	100	42.915	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000030962	-	99	71.721	ENSAOCG00000013452	rpl7	99	75.962	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000030962	-	99	71.721	ENSAPEG00000021581	RPL7	100	73.303	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000030962	-	99	71.721	ENSAPEG00000022091	rpl7	100	73.303	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000030962	-	100	42.915	ENSAPEG00000004499	rpl7l1	100	42.915	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000030962	-	98	71.605	ENSATEG00000013417	rpl7	99	71.605	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000030962	-	100	45.344	ENSATEG00000014469	rpl7l1	100	45.817	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000030962	-	98	77.366	ENSAPLG00000005601	-	99	77.366	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000030962	-	98	45.228	ENSAPLG00000013503	RPL7L1	93	45.228	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000030962	-	100	77.328	ENSACAG00000014396	RPL7	94	77.328	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000030962	-	100	43.145	ENSACAG00000029623	RPL7L1	100	43.145	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000030962	-	99	76.423	ENSANAG00000023767	-	94	76.423	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	98	40.741	ENSANAG00000024167	-	95	40.741	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	97	42.500	ENSANAG00000024327	-	97	42.500	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	98	78.189	ENSANAG00000032525	-	84	78.189	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	100	79.032	ENSANAG00000035228	-	100	79.032	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	70	42.197	ENSANAG00000033475	-	96	41.284	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	98	87.967	ENSANAG00000023865	-	97	87.967	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	70	43.353	ENSANAG00000037202	-	77	43.353	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	84	80.769	ENSANAG00000028144	-	100	80.769	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	96	84.874	ENSANAG00000036501	-	98	84.362	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	98	39.506	ENSANAG00000037180	-	99	39.506	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	98	34.979	ENSANAG00000021742	-	95	34.979	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	84	74.519	ENSANAG00000034346	-	88	74.519	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000030962	-	98	74.074	ENSACLG00000024449	rpl7	99	89.474	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000030962	-	100	44.130	ENSACLG00000017975	rpl7l1	87	44.130	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000030962	-	100	44.130	ENSAMXG00000042591	rpl7l1	100	44.130	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000030962	-	96	71.429	ENSAMXG00000008499	rpl7	95	71.667	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000030962	-	99	82.787	ENSBTAG00000005395	-	99	82.787	Bos_taurus
ENSOGAG00000030962	-	57	44.366	ENSBTAG00000054190	-	92	44.366	Bos_taurus
ENSOGAG00000030962	-	98	39.918	ENSBTAG00000018478	RPL7L1	99	39.834	Bos_taurus
ENSOGAG00000030962	-	98	84.298	ENSBTAG00000019994	-	97	84.298	Bos_taurus
ENSOGAG00000030962	-	98	80.992	ENSBTAG00000006397	-	93	80.992	Bos_taurus
ENSOGAG00000030962	-	100	88.710	ENSBTAG00000020139	RPL7	100	88.710	Bos_taurus
ENSOGAG00000030962	-	100	87.500	ENSBTAG00000020550	-	100	87.500	Bos_taurus
ENSOGAG00000030962	-	97	52.301	WBGene00004418	rpl-7	98	52.301	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000030962	-	98	39.095	ENSCJAG00000023295	-	87	39.095	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030962	-	100	88.306	ENSCJAG00000007686	-	100	88.306	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030962	-	98	83.951	ENSCJAG00000035175	-	99	83.951	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030962	-	98	87.603	ENSCJAG00000039031	-	99	87.603	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030962	-	98	88.066	ENSCJAG00000048312	-	97	88.066	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030962	-	99	82.114	ENSCJAG00000016367	-	99	82.114	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030962	-	98	41.803	ENSCJAG00000022076	-	89	41.803	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030962	-	98	40.741	ENSCJAG00000004637	-	95	40.741	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030962	-	100	88.306	ENSCJAG00000045387	-	100	88.306	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030962	-	100	88.664	ENSCJAG00000045886	-	100	88.664	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000030962	-	98	74.380	ENSCAFG00000001592	-	100	74.380	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030962	-	84	57.971	ENSCAFG00000003536	-	100	57.971	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030962	-	100	72.581	ENSCAFG00000009806	-	100	72.581	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030962	-	100	40.486	ENSCAFG00000001728	-	100	40.486	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030962	-	81	63.682	ENSCAFG00000031677	-	99	63.682	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030962	-	100	87.903	ENSCAFG00000008021	RPL7	100	87.903	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030962	-	100	79.839	ENSCAFG00000017323	-	100	79.839	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030962	-	98	38.683	ENSCAFG00000012801	-	99	38.683	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030962	-	100	85.830	ENSCAFG00000012624	-	100	85.830	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030962	-	99	76.016	ENSCAFG00000013319	-	99	76.016	Canis_familiaris
ENSOGAG00000030962	-	100	40.081	ENSCAFG00020010586	RPL7L1	99	40.650	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030962	-	98	79.253	ENSCAFG00020020086	-	87	79.253	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030962	-	100	86.694	ENSCAFG00020017800	-	96	86.694	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030962	-	100	86.235	ENSCAFG00020008863	-	89	86.235	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000030962	-	99	80.162	ENSCHIG00000019636	-	91	80.162	Capra_hircus
ENSOGAG00000030962	-	96	88.655	ENSCHIG00000020888	-	96	87.705	Capra_hircus
ENSOGAG00000030962	-	100	85.081	ENSCHIG00000004863	-	100	85.081	Capra_hircus
ENSOGAG00000030962	-	98	86.420	ENSCHIG00000017520	-	98	86.420	Capra_hircus
ENSOGAG00000030962	-	98	39.419	ENSCHIG00000018263	-	99	39.419	Capra_hircus
ENSOGAG00000030962	-	100	85.887	ENSCHIG00000012399	-	100	85.887	Capra_hircus
ENSOGAG00000030962	-	89	34.091	ENSCHIG00000021712	-	92	34.091	Capra_hircus
ENSOGAG00000030962	-	98	39.918	ENSCHIG00000010307	-	99	39.918	Capra_hircus
ENSOGAG00000030962	-	98	88.889	ENSCHIG00000008256	-	96	89.121	Capra_hircus
ENSOGAG00000030962	-	99	80.738	ENSCHIG00000019721	-	93	80.738	Capra_hircus
ENSOGAG00000030962	-	98	78.512	ENSCHIG00000021291	-	90	78.512	Capra_hircus
ENSOGAG00000030962	-	82	83.744	ENSTSYG00000029576	-	99	83.744	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030962	-	98	40.329	ENSTSYG00000034839	-	96	40.329	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030962	-	84	69.712	ENSTSYG00000035343	-	100	69.712	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030962	-	81	39.512	ENSTSYG00000035034	-	95	39.512	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030962	-	89	78.281	ENSTSYG00000035728	-	100	78.281	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030962	-	99	37.705	ENSTSYG00000028303	-	93	37.705	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030962	-	99	71.837	ENSTSYG00000027148	-	93	72.428	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030962	-	100	87.449	ENSTSYG00000006100	-	100	88.115	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030962	-	98	40.329	ENSTSYG00000004848	-	95	40.329	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030962	-	98	75.519	ENSTSYG00000031719	-	96	75.833	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000030962	-	80	35.354	ENSCAPG00000012737	RPL7L1	96	35.354	Cavia_aperea
ENSOGAG00000030962	-	83	81.373	ENSCAPG00000012202	-	97	81.373	Cavia_aperea
ENSOGAG00000030962	-	100	35.628	ENSCPOG00000021189	RPL7L1	100	35.628	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000030962	-	83	88.725	ENSCPOG00000004140	-	97	88.725	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000030962	-	94	84.052	ENSCCAG00000022670	-	92	84.052	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030962	-	98	38.934	ENSCCAG00000035419	-	99	38.934	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030962	-	85	76.555	ENSCCAG00000000389	-	90	76.555	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030962	-	100	84.615	ENSCCAG00000018927	-	100	84.615	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030962	-	96	85.232	ENSCCAG00000015833	-	100	85.141	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030962	-	98	41.152	ENSCCAG00000026245	-	95	41.152	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000030962	-	94	72.103	ENSCCAG00000027303	-	100	72.691	Cebus_capucinus
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ENSOGAG00000030962	-	89	86.878	MGP_CAROLIEiJ_G0013965	Rpl7	79	86.878	Mus_caroli
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