EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSOGAG00000033955 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Otolemur_garnettii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 903 bases
Position: chrGL873528.1:2272511-2273413
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSOGAP00000016116	Ribosomal_L6e_N	PF03868.15	7e-11	1	1
ENSOGAP00000016116	Ribosomal_L6e	PF01159.19	5.3e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSOGAT00000027933	-	552	-	ENSOGAP00000016116	184 (aa)	-	H0XJ26

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSOGAG00000033955	-	99	43.367	ENSOGAG00000031518	-	59	48.780
ENSOGAG00000033955	-	100	84.492	ENSOGAG00000033143	-	67	82.888
ENSOGAG00000033955	-	100	87.701	ENSOGAG00000027452	-	63	86.096
ENSOGAG00000033955	-	100	80.214	ENSOGAG00000034274	-	65	78.610
ENSOGAG00000033955	-	100	86.631	ENSOGAG00000026633	-	63	86.631
ENSOGAG00000033955	-	100	86.631	ENSOGAG00000030708	-	63	86.631
ENSOGAG00000033955	-	86	71.429	ENSOGAG00000000347	-	69	71.429

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSOGAG00000033955	-	100	81.818	ENSG00000089009	RPL6	100	84.127	Homo_sapiens
ENSOGAG00000033955	-	100	67.368	ENSAPOG00000004958	rpl6	71	68.984	Acanthochromis_polyacanthus
ENSOGAG00000033955	-	100	81.283	ENSAMEG00000008510	RPL6	64	81.818	Ailuropoda_melanoleuca
ENSOGAG00000033955	-	100	70.053	ENSACIG00000018214	rpl6	66	68.984	Amphilophus_citrinellus
ENSOGAG00000033955	-	100	67.368	ENSAOCG00000003204	rpl6	71	68.984	Amphiprion_ocellaris
ENSOGAG00000033955	-	100	67.368	ENSAPEG00000017318	rpl6	71	68.984	Amphiprion_percula
ENSOGAG00000033955	-	100	72.193	ENSATEG00000020783	rpl6	71	70.588	Anabas_testudineus
ENSOGAG00000033955	-	100	73.797	ENSAPLG00000015787	RPL6	66	72.727	Anas_platyrhynchos
ENSOGAG00000033955	-	100	73.797	ENSACAG00000003060	-	71	72.193	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000033955	-	96	51.124	ENSACAG00000028136	-	69	50.943	Anolis_carolinensis
ENSOGAG00000033955	-	100	59.358	ENSANAG00000029781	-	58	59.893	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000033955	-	100	62.903	ENSANAG00000021562	-	63	62.903	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000033955	-	100	82.258	ENSANAG00000019768	-	64	82.258	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000033955	-	98	80.978	ENSANAG00000030114	-	65	80.978	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000033955	-	100	70.430	ENSANAG00000023986	-	63	70.968	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000033955	-	99	74.457	ENSANAG00000025701	-	62	74.457	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000033955	-	100	81.283	ENSANAG00000031468	-	64	81.818	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000033955	-	100	74.731	ENSANAG00000024362	-	63	75.269	Aotus_nancymaae
ENSOGAG00000033955	-	100	69.519	ENSACLG00000011054	rpl6	72	68.449	Astatotilapia_calliptera
ENSOGAG00000033955	-	100	68.984	ENSAMXG00000012854	rpl6	71	66.845	Astyanax_mexicanus
ENSOGAG00000033955	-	100	80.749	ENSBTAG00000031723	RPL6	64	81.283	Bos_taurus
ENSOGAG00000033955	-	77	84.722	ENSBTAG00000045568	-	69	85.417	Bos_taurus
ENSOGAG00000033955	-	78	48.684	WBGene00004417	rpl-6	66	48.684	Caenorhabditis_elegans
ENSOGAG00000033955	-	78	73.469	ENSCJAG00000008987	-	65	73.469	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000033955	-	100	80.749	ENSCJAG00000040547	-	64	81.283	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000033955	-	100	81.818	ENSCJAG00000048686	-	64	82.353	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000033955	-	100	80.214	ENSCJAG00000012531	-	64	80.749	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000033955	-	100	81.818	ENSCJAG00000044547	-	62	82.353	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000033955	-	74	80.435	ENSCJAG00000012450	-	56	81.618	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000033955	-	100	80.214	ENSCJAG00000039405	-	62	80.749	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000033955	-	100	82.353	ENSCJAG00000040378	-	64	82.888	Callithrix_jacchus
ENSOGAG00000033955	-	99	65.054	ENSCAFG00000014768	-	75	65.054	Canis_familiaris
ENSOGAG00000033955	-	100	80.749	ENSCAFG00000016065	-	64	81.283	Canis_familiaris
ENSOGAG00000033955	-	100	75.401	ENSCAFG00000007816	-	64	74.332	Canis_familiaris
ENSOGAG00000033955	-	100	80.749	ENSCAFG00000008873	-	64	81.283	Canis_familiaris
ENSOGAG00000033955	-	99	65.957	ENSCAFG00000030598	-	59	71.779	Canis_familiaris
ENSOGAG00000033955	-	100	75.401	ENSCAFG00020026706	-	64	74.332	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000033955	-	82	74.510	ENSCAFG00020000537	-	64	73.203	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000033955	-	100	80.214	ENSCAFG00020017565	-	64	80.749	Canis_lupus_dingo
ENSOGAG00000033955	-	100	77.540	ENSCHIG00000015166	-	64	77.540	Capra_hircus
ENSOGAG00000033955	-	91	56.548	ENSCHIG00000022577	-	60	55.172	Capra_hircus
ENSOGAG00000033955	-	100	78.075	ENSCHIG00000007802	-	64	75.936	Capra_hircus
ENSOGAG00000033955	-	79	81.757	ENSCHIG00000013022	-	65	81.757	Capra_hircus
ENSOGAG00000033955	-	89	64.458	ENSCHIG00000020703	-	62	63.855	Capra_hircus
ENSOGAG00000033955	-	90	60.714	ENSTSYG00000032076	-	59	60.714	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000033955	-	100	79.679	ENSTSYG00000030853	-	66	83.099	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000033955	-	82	65.789	ENSTSYG00000037417	-	61	63.125	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000033955	-	91	67.857	ENSTSYG00000031950	-	59	67.857	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000033955	-	100	81.818	ENSTSYG00000009492	-	64	82.353	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000033955	-	81	77.632	ENSTSYG00000035897	-	70	77.632	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000033955	-	97	73.626	ENSTSYG00000033900	-	66	73.718	Carlito_syrichta
ENSOGAG00000033955	-	100	75.401	ENSCAPG00000014808	RPL6	63	75.936	Cavia_aperea
ENSOGAG00000033955	-	100	81.818	ENSCPOG00000013526	RPL6	63	82.353	Cavia_porcellus
ENSOGAG00000033955	-	90	82.840	ENSCCAG00000028209	-	64	83.432	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000033955	-	100	79.679	ENSCCAG00000020450	-	64	80.214	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000033955	-	100	81.283	ENSCCAG00000000364	-	64	81.818	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000033955	-	100	75.269	ENSCCAG00000020523	-	63	75.269	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000033955	-	100	77.297	ENSCCAG00000025580	-	63	76.757	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000033955	-	98	63.934	ENSCCAG00000027020	-	60	63.934	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000033955	-	100	68.984	ENSCCAG00000022082	-	63	69.519	Cebus_capucinus
ENSOGAG00000033955	-	100	71.658	ENSCATG00000037140	-	61	72.193	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000033955	-	100	81.283	ENSCATG00000001750	-	64	81.818	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000033955	-	100	79.144	ENSCATG00000012653	-	64	79.679	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000033955	-	89	76.048	ENSCATG00000034834	-	60	75.926	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000033955	-	100	78.495	ENSCATG00000035215	-	63	77.957	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000033955	-	100	81.818	ENSCATG00000039239	-	69	82.353	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000033955	-	100	77.005	ENSCATG00000036801	-	65	77.540	Cercocebus_atys
ENSOGAG00000033955	-	100	62.903	ENSCLAG00000003114	-	65	62.366	Chinchilla_lanigera
ENSOGAG00000033955	-	100	66.845	ENSCLAG00000010760	-	69	67.380	Chinchilla_lanigera
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ENSOGAG00000033955	-	100	71.505	ENSCSAG00000013104	-	65	71.505	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000033955	-	100	80.214	ENSCSAG00000013863	-	63	80.749	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000033955	-	100	79.679	ENSCSAG00000019405	-	64	80.214	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000033955	-	100	80.214	ENSCSAG00000018863	-	64	80.214	Chlorocebus_sabaeus
ENSOGAG00000033955	-	100	81.283	ENSCHOG00000002917	RPL6	64	80.214	Choloepus_hoffmanni
ENSOGAG00000033955	-	100	75.936	ENSCPBG00000006608	RPL6	70	73.797	Chrysemys_picta_bellii
ENSOGAG00000033955	-	100	55.676	ENSCING00000000730	-	60	62.914	Ciona_intestinalis
ENSOGAG00000033955	-	100	80.108	ENSCANG00000003698	-	64	80.108	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000033955	-	100	80.214	ENSCANG00000037946	-	64	80.749	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000033955	-	100	80.214	ENSCANG00000038334	-	64	80.749	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000033955	-	100	81.283	ENSCANG00000040326	-	64	81.818	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000033955	-	98	69.565	ENSCANG00000041975	-	67	70.109	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000033955	-	100	61.622	ENSCANG00000006164	-	61	61.622	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000033955	-	100	81.283	ENSCANG00000017153	-	64	81.818	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000033955	-	100	80.749	ENSCANG00000016353	-	64	81.283	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000033955	-	91	79.532	ENSCANG00000033462	-	62	79.532	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000033955	-	84	77.500	ENSCANG00000036055	-	64	78.125	Colobus_angolensis_palliatus
ENSOGAG00000033955	-	94	70.455	ENSCGRG00001023709	-	71	69.886	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000033955	-	100	77.128	ENSCGRG00001005673	-	63	76.596	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000033955	-	100	69.189	ENSCGRG00001007659	-	63	68.649	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000033955	-	100	81.383	ENSCGRG00001017511	-	64	80.851	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000033955	-	100	81.383	ENSCGRG00001007014	-	65	80.851	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000033955	-	100	69.149	ENSCGRG00001013976	-	66	68.617	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSOGAG00000033955	-	100	81.383	ENSCGRG00000013732	-	64	80.851	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000033955	-	100	81.383	ENSCGRG00000018950	-	65	80.851	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000033955	-	100	69.189	ENSCGRG00000015746	-	63	68.649	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000033955	-	100	77.128	ENSCGRG00000010279	-	63	76.596	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000033955	-	100	69.149	ENSCGRG00000001427	-	61	68.617	Cricetulus_griseus_crigri
ENSOGAG00000033955	-	100	69.519	ENSCSEG00000019765	rpl6	58	68.449	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000033955	-	100	68.984	ENSCSEG00000012238	rpl6	67	67.914	Cynoglossus_semilaevis
ENSOGAG00000033955	-	100	72.193	ENSCVAG00000018272	rpl6	71	71.658	Cyprinodon_variegatus
ENSOGAG00000033955	-	100	63.918	ENSDARG00000058451	rpl6	56	72.185	Danio_rerio
ENSOGAG00000033955	-	100	73.656	ENSDNOG00000031565	-	64	73.656	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000033955	-	100	82.353	ENSDNOG00000033451	-	64	81.283	Dasypus_novemcinctus
ENSOGAG00000033955	-	100	81.283	ENSDORG00000005793	Rpl6	63	81.818	Dipodomys_ordii
ENSOGAG00000033955	-	95	44.886	FBgn0039857	RpL6	56	47.619	Drosophila_melanogaster
ENSOGAG00000033955	-	82	67.550	ENSEBUG00000010510	rpl6	52	67.550	Eptatretus_burgeri
ENSOGAG00000033955	-	100	82.888	ENSEASG00005009610	-	58	81.818	Equus_asinus_asinus
ENSOGAG00000033955	-	100	82.888	ENSECAG00000017514	RPL6	61	81.818	Equus_caballus
ENSOGAG00000033955	-	73	81.618	ENSEEUG00000000281	-	76	81.618	Erinaceus_europaeus
ENSOGAG00000033955	-	100	68.984	ENSELUG00000009354	rpl6	71	67.380	Esox_lucius
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ENSOGAG00000033955	-	100	72.193	ENSFALG00000008951	RPL6	63	72.193	Ficedula_albicollis
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ENSOGAG00000033955	-	100	71.123	ENSMAMG00000014219	rpl6	71	70.745	Mastacembelus_armatus
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ENSOGAG00000033955	-	55	77.049	ENSMAUG00000008637	-	51	73.770	Mesocricetus_auratus
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ENSOGAG00000033955	-	100	76.344	ENSOANG00000004808	RPL6	64	75.806	Ornithorhynchus_anatinus
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